Parcelas Divididas con Bloqueo
Santiago Diaz Sanchez
2026-05-19
1 Librerías usadas
##
## Adjuntando el paquete: 'dplyr'## The following objects are masked from 'package:stats':
##
## filter, lag## The following objects are masked from 'package:base':
##
## intersect, setdiff, setequal, union## Warning: package 'car' was built under R version 4.6.1## Cargando paquete requerido: carData##
## Adjuntando el paquete: 'car'## The following object is masked from 'package:dplyr':
##
## recode## Warning: package 'emmeans' was built under R version 4.6.1## Welcome to emmeans.
## Caution: You lose important information if you filter this package's results.
## See '? untidy'## Warning: package 'knitr' was built under R version 4.6.1###Diseño experimental
# 1. Creamos el dataset con tus factores específicos
variedad =
gl(n = 4, k =1, length = 80, labels =
c("Guineo", "Harton", "3 Filos", "Cacho de buey"))
Microorganismos=
gl(n=3,k=11,length = 80,labels=
c("Glomus mosseae","Bacillus subtilis","Control"))
Bloque=
gl(n=2,k=11,length = 80,labels=
c("2% de pendiente","10% de pendiente"))
datos_Platano=data.frame(variedad,Bloque,Microorganismos)
# 2. Generamos el árbol colapsable interactivo
collapsibleTree(
datos_Platano,
hierarchy = c("Bloque", "Microorganismos","variedad"), # El orden de tus factores
root = "Ensayo Platano", # Nodo raíz
zoomable = FALSE # Permite hacer zoom y arrastrarlo
)1.1 Adjuntando datos
1.1.1 Modelo estadístico
#modelo <- aov(resopuesta~factor_a*factor_b+error(Bloque/factor_a) )
# Renombrar columnas
names(datos.platano) <- c("bloque", "micorriza", "variedad", "planta", "kg_racimo")
# Convertir variables a factores
datos <- datos.platano %>%
mutate(
bloque = factor(bloque, levels = c("Pendiente 2%", "Pendiente 10%")),
micorriza = factor(micorriza, levels = c("Bacillus subtilis", "Glomus mosseae","Control")),
variedad = factor(variedad, levels = c("Guineo", "Hartón", "3 Filos", "Cacho de buey")),
planta = factor(planta),
kg_racimo = as.numeric(kg_racimo)
)
names(datos)## [1] "bloque" "micorriza" "variedad" "planta" "kg_racimo"## tibble [96 × 5] (S3: tbl_df/tbl/data.frame)
## $ bloque : Factor w/ 2 levels "Pendiente 2%",..: 1 2 2 2 1 1 2 2 1 1 ...
## $ micorriza: Factor w/ 3 levels "Bacillus subtilis",..: 3 3 3 3 3 3 3 3 1 3 ...
## $ variedad : Factor w/ 4 levels "Guineo","Hartón",..: 3 2 2 3 1 3 1 1 3 1 ...
## $ planta : Factor w/ 4 levels "P1","P2","P3",..: 2 4 3 4 1 1 1 3 1 3 ...
## $ kg_racimo: num [1:96] 8 8.8 9 9 10 10 11 11 12 12 ...2 Resultados
2.1 ANOVA
modelo_pd_submuestras <- aov(
kg_racimo ~ bloque + variedad * micorriza,
data = datos
)
anova_resultados <- summary(modelo_pd_submuestras)
anova_tabla <- anova_resultados[[1]]
anova_tabla## Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
## bloque 1 5.25 5.255 0.5128 0.47594
## variedad 3 454.32 151.439 14.7788 8.546e-08 ***
## micorriza 2 287.78 143.892 14.0422 5.586e-06 ***
## variedad:micorriza 6 120.89 20.149 1.9663 0.07976 .
## Residuals 83 850.51 10.247
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 12.1.1 Interpretacion Tradicional
# Extraer la tabla ANOVA
anova_tabla <- anova_resultados[[1]]
# Extraer F y p-valores
F_bloque <- anova_tabla["bloque", "F value"]
p_variedad <- anova_tabla[2, "Pr(>F)"]
p_micorriza <- anova_tabla["micorriza", "Pr(>F)"]
p_interaccion <- anova_tabla["variedad:micorriza", "Pr(>F)"]
#-------------------------------------------------------
# La eficiencia de Bloqueo
#-------------------------------------------------------
cat("BLOQUE\n")## BLOQUE## F = 0.513if(F_bloque > 1){
cat("Conclusión:\n")
cat("El valor F es mayor que 1.\n")
cat("El bloqueo fue eficiente, ya que explicó una proporción de la variabilidad mayor que el error experimental.\n")
}else{
cat("Conclusión:\n")
cat("El valor F es menor o igual a 1.\n")
cat("El bloqueo no fue eficiente, ya que no logró reducir la variabilidad experimental respecto al error.\n")
}## Conclusión:
## El valor F es menor o igual a 1.
## El bloqueo no fue eficiente, ya que no logró reducir la variabilidad experimental respecto al error.#-------------------------------------------------------
# Variedad
#-------------------------------------------------------
cat("VARIEDAD\n")## VARIEDAD## p = 8.546e-08if(is.na(p_variedad)){
cat("No fue posible encontrar el p-valor de Variedad.\n")
}else if(p_variedad < 0.05){
cat("Se rechaza H0.\n")
cat("Existen diferencias significativas entre variedades.\n")
cat("Se recomienda realizar la prueba de Tukey.\n\n")
}else{
cat("No se rechaza H0.\n")
cat("No existen diferencias significativas entre variedades.\n\n")
}## Se rechaza H0.
## Existen diferencias significativas entre variedades.
## Se recomienda realizar la prueba de Tukey.#-------------------------------------------------------
# Micorriza
#-------------------------------------------------------
cat("MICORRIZA\n")## MICORRIZA## p = 5.586e-06if(p_micorriza < 0.05){
cat("Se rechaza H0.\n")
cat("Existen diferencias significativas entre micorrizas.\n")
cat("Se recomienda realizar la prueba de Tukey.\n\n")
}else{
cat("No se rechaza H0.\n")
cat("No existen diferencias significativas entre micorrizas.\n\n")
}## Se rechaza H0.
## Existen diferencias significativas entre micorrizas.
## Se recomienda realizar la prueba de Tukey.#-------------------------------------------------------
# Interacción
#-------------------------------------------------------
cat("INTERACCIÓN (Variedad × Micorriza)\n")## INTERACCIÓN (Variedad × Micorriza)## p = 0.07976if(p_interaccion < 0.05){
cat("Se rechaza H0.\n")
cat("Existe interacción significativa entre variedad y micorriza.\n")
cat("Los efectos principales deben interpretarse con cautela y se recomienda analizar los efectos simples.\n")
}else{
cat("No se rechaza H0.\n")
cat("No existe interacción significativa entre variedad y micorriza.\n")
cat("Los efectos principales pueden interpretarse de forma independiente.\n")
}## No se rechaza H0.
## No existe interacción significativa entre variedad y micorriza.
## Los efectos principales pueden interpretarse de forma independiente.2.2 ANOVA Alternativo
2.2.1 Interpretacion Alternativa
3 Supuestos
3.1 Normalidad
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: residuales
## W = 0.98947, p-value = 0.64973.2 Homoceasticidad
datos$Tratamiento <- interaction(datos$micorriza,
datos$variedad)
leveneTest(kg_racimo ~ Tratamiento,
data = datos)## Levene's Test for Homogeneity of Variance (center = median)
## Df F value Pr(>F)
## group 11 2.2177 0.0206 *
## 84
## ---
## Signif. codes: 0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 13.3 Homogeneidad de varianzas
## Tukey multiple comparisons of means
## 95% family-wise confidence level
##
## Fit: aov(formula = kg_racimo ~ bloque + variedad * micorriza, data = datos)
##
## $bloque
## diff lwr upr p adj
## Pendiente 10%-Pendiente 2% -0.4679167 -1.767549 0.8317153 0.4759391
##
## $variedad
## diff lwr upr p adj
## Hartón-Guineo -3.09291667 -5.515717 -0.6701167 0.0066209
## 3 Filos-Guineo -5.15791667 -7.580717 -2.7351167 0.0000017
## Cacho de buey-Guineo -0.05416667 -2.476967 2.3686333 0.9999271
## 3 Filos-Hartón -2.06500000 -4.487800 0.3578000 0.1224308
## Cacho de buey-Hartón 3.03875000 0.615950 5.4615500 0.0079144
## Cacho de buey-3 Filos 5.10375000 2.680950 7.5265500 0.0000022
##
## $micorriza
## diff lwr upr p adj
## Glomus mosseae-Bacillus subtilis -0.2321875 -2.142027 1.677652 0.9546836
## Control-Bacillus subtilis -3.7834375 -5.693277 -1.873598 0.0000272
## Control-Glomus mosseae -3.5512500 -5.461089 -1.641411 0.0000818
##
## $`variedad:micorriza`
## diff
## Hartón:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -5.31250
## 3 Filos:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -7.32000
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -3.43000
## Guineo:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -1.68750
## Hartón:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -5.68750
## 3 Filos:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -7.30000
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -2.31625
## Guineo:Control-Guineo:Bacillus subtilis -8.14625
## Hartón:Control-Guineo:Bacillus subtilis -8.11250
## 3 Filos:Control-Guineo:Bacillus subtilis -10.68750
## Cacho de buey:Control-Guineo:Bacillus subtilis -4.25000
## 3 Filos:Bacillus subtilis-Hartón:Bacillus subtilis -2.00750
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-Hartón:Bacillus subtilis 1.88250
## Guineo:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis 3.62500
## Hartón:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis -0.37500
## 3 Filos:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis -1.98750
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis 2.99625
## Guineo:Control-Hartón:Bacillus subtilis -2.83375
## Hartón:Control-Hartón:Bacillus subtilis -2.80000
## 3 Filos:Control-Hartón:Bacillus subtilis -5.37500
## Cacho de buey:Control-Hartón:Bacillus subtilis 1.06250
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-3 Filos:Bacillus subtilis 3.89000
## Guineo:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 5.63250
## Hartón:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 1.63250
## 3 Filos:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 0.02000
## Cacho de buey:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 5.00375
## Guineo:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -0.82625
## Hartón:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -0.79250
## 3 Filos:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -3.36750
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Bacillus subtilis 3.07000
## Guineo:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis 1.74250
## Hartón:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis -2.25750
## 3 Filos:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis -3.87000
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis 1.11375
## Guineo:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -4.71625
## Hartón:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -4.68250
## 3 Filos:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -7.25750
## Cacho de buey:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -0.82000
## Hartón:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -4.00000
## 3 Filos:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -5.61250
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -0.62875
## Guineo:Control-Guineo:Glomus mosseae -6.45875
## Hartón:Control-Guineo:Glomus mosseae -6.42500
## 3 Filos:Control-Guineo:Glomus mosseae -9.00000
## Cacho de buey:Control-Guineo:Glomus mosseae -2.56250
## 3 Filos:Glomus mosseae-Hartón:Glomus mosseae -1.61250
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Hartón:Glomus mosseae 3.37125
## Guineo:Control-Hartón:Glomus mosseae -2.45875
## Hartón:Control-Hartón:Glomus mosseae -2.42500
## 3 Filos:Control-Hartón:Glomus mosseae -5.00000
## Cacho de buey:Control-Hartón:Glomus mosseae 1.43750
## Cacho de buey:Glomus mosseae-3 Filos:Glomus mosseae 4.98375
## Guineo:Control-3 Filos:Glomus mosseae -0.84625
## Hartón:Control-3 Filos:Glomus mosseae -0.81250
## 3 Filos:Control-3 Filos:Glomus mosseae -3.38750
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Glomus mosseae 3.05000
## Guineo:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -5.83000
## Hartón:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -5.79625
## 3 Filos:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -8.37125
## Cacho de buey:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -1.93375
## Hartón:Control-Guineo:Control 0.03375
## 3 Filos:Control-Guineo:Control -2.54125
## Cacho de buey:Control-Guineo:Control 3.89625
## 3 Filos:Control-Hartón:Control -2.57500
## Cacho de buey:Control-Hartón:Control 3.86250
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Control 6.43750
## lwr
## Hartón:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -10.6953497
## 3 Filos:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -12.7028497
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -8.8128497
## Guineo:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -7.0703497
## Hartón:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -11.0703497
## 3 Filos:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -12.6828497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -7.6990997
## Guineo:Control-Guineo:Bacillus subtilis -13.5290997
## Hartón:Control-Guineo:Bacillus subtilis -13.4953497
## 3 Filos:Control-Guineo:Bacillus subtilis -16.0703497
## Cacho de buey:Control-Guineo:Bacillus subtilis -9.6328497
## 3 Filos:Bacillus subtilis-Hartón:Bacillus subtilis -7.3903497
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-Hartón:Bacillus subtilis -3.5003497
## Guineo:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis -1.7578497
## Hartón:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis -5.7578497
## 3 Filos:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis -7.3703497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis -2.3865997
## Guineo:Control-Hartón:Bacillus subtilis -8.2165997
## Hartón:Control-Hartón:Bacillus subtilis -8.1828497
## 3 Filos:Control-Hartón:Bacillus subtilis -10.7578497
## Cacho de buey:Control-Hartón:Bacillus subtilis -4.3203497
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-3 Filos:Bacillus subtilis -1.4928497
## Guineo:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 0.2496503
## Hartón:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis -3.7503497
## 3 Filos:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis -5.3628497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis -0.3790997
## Guineo:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -6.2090997
## Hartón:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -6.1753497
## 3 Filos:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -8.7503497
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Bacillus subtilis -2.3128497
## Guineo:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis -3.6403497
## Hartón:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis -7.6403497
## 3 Filos:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis -9.2528497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis -4.2690997
## Guineo:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -10.0990997
## Hartón:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -10.0653497
## 3 Filos:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -12.6403497
## Cacho de buey:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -6.2028497
## Hartón:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -9.3828497
## 3 Filos:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -10.9953497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -6.0115997
## Guineo:Control-Guineo:Glomus mosseae -11.8415997
## Hartón:Control-Guineo:Glomus mosseae -11.8078497
## 3 Filos:Control-Guineo:Glomus mosseae -14.3828497
## Cacho de buey:Control-Guineo:Glomus mosseae -7.9453497
## 3 Filos:Glomus mosseae-Hartón:Glomus mosseae -6.9953497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Hartón:Glomus mosseae -2.0115997
## Guineo:Control-Hartón:Glomus mosseae -7.8415997
## Hartón:Control-Hartón:Glomus mosseae -7.8078497
## 3 Filos:Control-Hartón:Glomus mosseae -10.3828497
## Cacho de buey:Control-Hartón:Glomus mosseae -3.9453497
## Cacho de buey:Glomus mosseae-3 Filos:Glomus mosseae -0.3990997
## Guineo:Control-3 Filos:Glomus mosseae -6.2290997
## Hartón:Control-3 Filos:Glomus mosseae -6.1953497
## 3 Filos:Control-3 Filos:Glomus mosseae -8.7703497
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Glomus mosseae -2.3328497
## Guineo:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -11.2128497
## Hartón:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -11.1790997
## 3 Filos:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -13.7540997
## Cacho de buey:Control-Cacho de buey:Glomus mosseae -7.3165997
## Hartón:Control-Guineo:Control -5.3490997
## 3 Filos:Control-Guineo:Control -7.9240997
## Cacho de buey:Control-Guineo:Control -1.4865997
## 3 Filos:Control-Hartón:Control -7.9578497
## Cacho de buey:Control-Hartón:Control -1.5203497
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Control 1.0546503
## upr
## Hartón:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis 0.070349674
## 3 Filos:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis -1.937150326
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-Guineo:Bacillus subtilis 1.952849674
## Guineo:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis 3.695349674
## Hartón:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -0.304650326
## 3 Filos:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis -1.917150326
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Guineo:Bacillus subtilis 3.066599674
## Guineo:Control-Guineo:Bacillus subtilis -2.763400326
## Hartón:Control-Guineo:Bacillus subtilis -2.729650326
## 3 Filos:Control-Guineo:Bacillus subtilis -5.304650326
## Cacho de buey:Control-Guineo:Bacillus subtilis 1.132849674
## 3 Filos:Bacillus subtilis-Hartón:Bacillus subtilis 3.375349674
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-Hartón:Bacillus subtilis 7.265349674
## Guineo:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis 9.007849674
## Hartón:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis 5.007849674
## 3 Filos:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis 3.395349674
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Hartón:Bacillus subtilis 8.379099674
## Guineo:Control-Hartón:Bacillus subtilis 2.549099674
## Hartón:Control-Hartón:Bacillus subtilis 2.582849674
## 3 Filos:Control-Hartón:Bacillus subtilis 0.007849674
## Cacho de buey:Control-Hartón:Bacillus subtilis 6.445349674
## Cacho de buey:Bacillus subtilis-3 Filos:Bacillus subtilis 9.272849674
## Guineo:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 11.015349674
## Hartón:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 7.015349674
## 3 Filos:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 5.402849674
## Cacho de buey:Glomus mosseae-3 Filos:Bacillus subtilis 10.386599674
## Guineo:Control-3 Filos:Bacillus subtilis 4.556599674
## Hartón:Control-3 Filos:Bacillus subtilis 4.590349674
## 3 Filos:Control-3 Filos:Bacillus subtilis 2.015349674
## Cacho de buey:Control-3 Filos:Bacillus subtilis 8.452849674
## Guineo:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis 7.125349674
## Hartón:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis 3.125349674
## 3 Filos:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis 1.512849674
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Cacho de buey:Bacillus subtilis 6.496599674
## Guineo:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis 0.666599674
## Hartón:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis 0.700349674
## 3 Filos:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis -1.874650326
## Cacho de buey:Control-Cacho de buey:Bacillus subtilis 4.562849674
## Hartón:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae 1.382849674
## 3 Filos:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae -0.229650326
## Cacho de buey:Glomus mosseae-Guineo:Glomus mosseae 4.754099674
## Guineo:Control-Guineo:Glomus mosseae -1.075900326
## Hartón:Control-Guineo:Glomus mosseae -1.042150326
## 3 Filos:Control-Guineo:Glomus mosseae -3.617150326
## Cacho de buey:Control-Guineo:Glomus mosseae 2.820349674
## 3 Filos:Glomus mosseae-Hartón:Glomus mosseae 3.770349674
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## Guineo:Control-Hartón:Glomus mosseae 2.924099674
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