Relatorio preliminar com anotacao SIRIUS
Projeto: Candida tropicalis - Bruno
Data: 2026-07-20
Analise: XCMS + GNPS + SIRIUS
Pergunta principal
Comparar ACN e MeOH como modos de extração e, de forma complementar, atribuir anotações químicas putativas às features mais relevantes.
Conclusão direta
Os resultados favorecem MeOH como modo de extração. MeOH apresentou maior número de features presentes e menor missing nas duas polaridades. O modo positivo apresentou maior cobertura geral. A busca GNPS não retornou library hits diretos, mas o SIRIUS gerou fórmulas e candidatos putativos para parte das features com MS/MS.
Figuras principais
Figura 1. Features presentes por condição
Figura 2. Missing por condição
Figura 3. Filtros e CV dos QCs
Figura 4. PCA - modo positivo
Figura 5. PCA - modo negativo
Resumo do processamento
| Polaridade | Amostras | Picos detectados | Features finais | Missing (%) |
|---|---|---|---|---|
| pos | 21 | 3808 | 461 | 41,6% |
| neg | 21 | 1202 | 128 | 42,7% |
QC e filtros
| Polaridade | Features totais | Filtro recomendado | Filtro estrito QC | CV mediano QC |
|---|---|---|---|---|
| pos | 461 | 277 | 252 | 24,6% |
| neg | 128 | 96 | 77 | 24,8% |
Analise exploratoria
| Polaridade | Features analisadas | ACN vs MeOH padj<0,05 | D vs S padj<0,05 |
|---|---|---|---|
| pos | 277 | 102 | 0 |
| neg | 96 | 22 | 2 |
Cobertura por condicao
| Polaridade | Condicao | Solvente | Features presentes mediana | Missing mediano |
|---|---|---|---|---|
| pos | ACN_D | ACN | 171,5 | 38,1% |
| pos | ACN_S | ACN | 153,0 | 44,8% |
| pos | MeOH_D | MeOH | 235,0 | 15,2% |
| pos | MeOH_S | MeOH | 234,5 | 15,3% |
| neg | ACN_D | ACN | 72,5 | 24,5% |
| neg | ACN_S | ACN | 64,5 | 32,8% |
| neg | MeOH_D | MeOH | 88,5 | 7,8% |
| neg | MeOH_S | MeOH | 87,5 | 8,9% |
GNPS
O GNPS Feature-Based Molecular Networking foi executado para as duas polaridades. A rede e os espectros foram gerados, mas nao houve library hits diretos nos resultados visualizados; portanto, o GNPS nao atribuiu nomes de compostos nesta etapa.
| Polaridade | Features na tabela GNPS | Espectros MS/MS | Features com MS/MS | Library hits diretos |
|---|---|---|---|---|
| pos | 90 | 82 | 82 | 0 |
| neg | 70 | 47 | 47 | 0 |
SIRIUS
O SIRIUS foi usado para gerar formulas moleculares e candidatos estruturais putativos para features com MS/MS priorizadas. Estes resultados devem ser tratados como anotacoes putativas, nao identificacoes confirmadas.
| Polaridade | Features avaliadas | Formula SIRIUS | Candidatos com nome | MS/MS + formula | Candidatos para relatorio |
|---|---|---|---|---|---|
| pos | 277 | 43 | 30 | 43 | 43 |
| neg | 96 | 32 | 10 | 32 | 32 |
Top candidatos putativos - modo positivo
| Feature | m/z | RT (min) | Anotacao putativa | Formula | Aduto | Zodiac | SIRIUS score | log2FC ACN/MeOH | padj |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FT235 | 381,1876 | 9,72 | tert-butyl N-[[(2R,3R)-3-azido-2-[(2-methylpropan-2-yl)oxycarbonyla… | C18H30O7 | [M + Na]+ | 0,411 | 0,606 | -10,94 | 0.0051 |
| FT330 | 502,3154 | 11,20 | (4E,8E)-3-hydroxy-2-[[(Z)-2-hydroxydodec-5-enoyl]amino]tetradeca-4,… | C29H43NO6 | [M + H]+ | 0,726 | 0,735 | -10,34 | 0.0051 |
| FT320 | 485,2885 | 11,19 | 6-[4-[3-[4-(5-Carboxy-5-methylhexyl)-5-oxocyclopenta-1,3-dien-1-yl]… | C29H40O6 | [M + H]+ | 0,917 | 0,910 | -7,92 | 0.0051 |
| FT278 | 419,1505 | 1,71 | 1,2-Bis(quinoline-2-carboxamido)benzene | C26H18N4O2 | [M + H]+ | 0,992 | 0,021 | 7,54 | 0.0051 |
| FT114 | 272,2578 | 8,46 | 2-[Cyclododecyl(2-hydroxyethyl)amino]ethanol | C16H33NO2 | [M + H]+ | 1,000 | 1,000 | -6,64 | 0.0051 |
| FT297 | 441,1325 | 1,69 | 1,2-Bis(quinoline-2-carboxamido)benzene | C26H18N4O2 | [M + Na]+ | 1,000 | 0,192 | 1,70 | 0.0051 |
| FT173 | 318,2994 | 8,34 | PEG-3 lauramine | C18H39NO3 | [M + H]+ | 1,000 | 1,000 | -1,60 | 0.0051 |
| FT281 | 420,3465 | 9,82 | N-(2’,3’-Dihydroxypropyl)-10,12-tricosadiynamide | C26H45NO3 | [M + H]+ | 0,973 | 0,982 | NA | 0.0051 |
| FT389 | 650,2040 | 1,67 | 2-(4-(Bis(carboxymethyl)amino)-3-(2-(2-(bis(carboxymethyl)amino)-5-… | C30H35NO15 | [M + H]+ | 0,050 | 0,188 | 5,42 | 0.0239 |
| FT111 | 265,1110 | 1,50 | 2-[3-[(4-amino-2-methylpyrimidin-5-yl)methyl]-4-(113C)methyl-(4,5-1… | C12H16N4OS | [M + H]+ | 0,924 | 0,931 | 1,34 | 0.0239 |
| FT430 | 846,4396 | 9,40 | [(4R)-4-amino-5-[[(2R)-1-[[2-[[(2R)-1-[[(2R,3R)-1-[[2-[[2-[[(2R)-1-… | C40H55N13O8 | [M + H]+ | 0,853 | 0,854 | -0,42 | 0.0239 |
| FT273 | 415,2104 | 9,39 | (1R)-1-[(2R,4S,4aR,6R,8aR)-2,6-bis(3,4-dimethylphenyl)-4,4a,8,8a-te… | C24H30O6 | [M + H]+ | 0,969 | 0,843 | -0,37 | 0.0239 |
Top candidatos putativos - modo negativo
| Feature | m/z | RT (min) | Anotacao putativa | Formula | Aduto | Zodiac | SIRIUS score | log2FC ACN/MeOH | padj |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| FT044 | 316,9472 | 1,47 | N-(5-Mercapto-[1,3,4]thiadiazol-2-yl)-2-nitro-benzenesulfonamide | C8H6N4O4S3 | [M - H]- | 0,030 | 0,129 | -1,87 | 0.0134 |
| FT055 | 343,1392 | 6,88 | 2-{[1-hydroxy-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]oxy}-6-(hydroxymethyl)… | C16H24O8 | [M - H]- | 0,976 | 0,987 | -1,41 | 0.0233 |
| FT114 | 681,2958 | 11,93 | (2R,3S,4R,6R)-3-[(2R,4R,5S)-4,5-dihydroxy-6-methyloxan-2-yl]oxy-4,5… | C30H50O17 | [M - H]- | 0,746 | 0,871 | -0,70 | 0.0272 |
| FT032 | 293,1750 | 8,91 | Gingerol | C17H26O4 | [M - H]- | 1,000 | 1,000 | -0,50 | 0.0821 |
| FT085 | 439,1184 | 1,65 | Boc-D-Cys(1)-OH.Boc-D-Cys(1)-OH | C23H16N6O4 | [M - H]- | 0,071 | 0,193 | 1,49 | 0.094 |
| FT112 | 653,3010 | 11,09 | 3-[5-[(4-Aminophenyl)sulfonyl-(3-methylbutyl)amino]-6-hydroxyhexyl]… | C29H50O16 | [M - H]- | 0,410 | 0,519 | -0,39 | 0.231 |
| FT041 | 311,1679 | 9,92 | 4-(undecan-5-yl)benzene-1-sulfonic acid | C17H28O3S | [M - H]- | 0,590 | 0,490 | -0,23 | 0.396 |
| FT047 | 325,1836 | 10,40 | 4-dodecylbenzene-1-sulfonic acid | C18H30O3S | [M - H]- | 0,572 | 0,026 | 0,18 | 0.679 |
| FT051 | 339,1993 | 10,89 | Benzenesulfonic acid, tridecyl- | C19H32O3S | [M - H]- | 0,605 | 0,569 | 0,01 | 0.885 |
| FT050 | 337,2047 | 10,95 | Hexadecoxy hydrogen sulfate | C16H34O5S | [M - H]- | 0,999 | 0,993 | 0,15 | 0.958 |
| FT088 | 447,1337 | 8,41 | Formula putativa: C15H28O15 | C15H28O15 | [M - H]- | 0,201 | 0,416 | -4,32 | 0.01 |
| FT017 | 215,0319 | 1,60 | Formula putativa: C7H8N2O6 | C7H8N2O6 | [M - H]- | 0,394 | 0,397 | -2,90 | 0.01 |
Interpretacao
A diferenca ACN vs MeOH foi mais forte do que a diferenca D vs S. MeOH apresentou maior recuperacao global de sinais, menor missing e melhor cobertura de features. Isso sustenta MeOH como metodo preferencial de extracao para este conjunto de dados.
As anotacoes SIRIUS adicionam contexto quimico preliminar, mas
algumas estruturas candidatas podem representar compostos isomericos,
analogos ou candidatos de baixa especificidade. Assim, recomenda-se
reportar como candidato putativo ou
formula/classe putativa, evitando linguagem de
identificacao definitiva.
Limitacoes
- GNPS nao retornou library hits diretos para nomeacao automatica.
- SIRIUS/CSI:FingerID fornece candidatos putativos, dependentes dos bancos e modelos utilizados.
- Confirmacao definitiva exigiria padrao analitico e comparacao direcionada de MS/MS/RT.
- Para decisao de extracao, a anotacao quimica e complementar; a escolha de MeOH e sustentada principalmente por cobertura, missing e QC.