CARGA DE DATOS Y LIBRERIAS

knitr::opts_chunk$set(
    echo = TRUE,                   # Muestra el código R en el reporte final.
    message = FALSE,
    warning = FALSE,               # Message y warning evitan que se impriman alertas o mensajes de carga estorbosos en el HTML.
    fig.align = "center"           # Centra automáticamente todas las gráficas generadas.
)

datos <- read.csv("C:/Users/Martin/Desktop/Estadistica/CMDB_Data.csv", 
                  header = TRUE, # Indica que la primera fila contienen los nombres de las variables.
                  sep = ";",     # Define que los puntos y comas es el separador de las columnas del archivo.
                  dec = ".",     # Establece el punto como el operador decimal para los números.
                  fileEncoding = "latin1")

# Verificación inicial del set de datos
str(datos)
## 'data.frame':    1366 obs. of  103 variables:
##  $ ï..LAB_ID            : chr  "C355417" "C360759" "C360762" "C360763" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID1     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID2     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID3     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ FIELD_ID             : chr  "RM0001" "RM0027" "RM0030" "RM0031" ...
##  $ JOB_ID               : chr  "MRP11968" "MRP12307" "MRP12307" "MRP12307" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID1     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID2     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID3     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ SUBMITTER            : chr  "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" ...
##  $ PROJECT_NAME         : chr  "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" ...
##  $ X0                   : chr  "30/6/2011" "31/8/2011" "31/8/2011" "31/8/2011" ...
##  $ COLLECTION           : chr  "Mackay-Keck Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" ...
##  $ COLLECTION_ID        : chr  "PHNC08_39_1183" "OD21441" "OD22811" "OD25716" ...
##  $ CONTINENT            : chr  "North America" "South America" "South America" "Africa" ...
##  $ COUNTRY              : chr  "United States" "Chile" "Chile" "South Africa" ...
##  $ STATE_PROVINCE       : chr  "Nevada" "Antofagasta" "Tarapacá" "Transvaal" ...
##  $ COUNTY               : chr  "Lyon" "El Loa" "El Tamarugal" "" ...
##  $ DISTRICT_NAME        : chr  "Yerington" "Chuquicamata" "Collahuasi/Quebrada Blanca" "" ...
##  $ DEPOSIT_NAME         : chr  "Pumpkin Hollow" "" "" "" ...
##  $ MINE_NAME            : chr  "Pumpkin Hollow" "Chuquicamata mine" "Collahuasi district" "" ...
##  $ DISTRICT_NAME_COLLECT: chr  "Yerington" "" "" "" ...
##  $ DEPOSIT_NAME_COLLECT : chr  "" "" "" "" ...
##  $ MINE_NAME_COLLECT    : chr  "Pumpkin Hollow" "Chuquicamata" "Poduosa mine" "Messina Mines Ltd." ...
##  $ LOCATE_DESC          : chr  "" "" "Level 25" "" ...
##  $ LATITUDE             : chr  "38,94021" "-22,2871" "-21,0309" "-24,7" ...
##  $ LONGITUDE            : chr  "-119,05178" "-68,8991" "-68,74951" "29,3" ...
##  $ DATUM                : chr  "WGS84" "WGS84" "WGS84" "" ...
##  $ LATITUDE_COLLECT     : chr  "38,92492" "22,28944" "" "" ...
##  $ LONGITUDE_COLLECT    : chr  "-119,1071" "-68,90111" "" "" ...
##  $ DATUM_COLLECT        : chr  "" "WGS84" "" "" ...
##  $ COORDINATES_QUAL     : chr  "100 m" "0m" "" "" ...
##  $ COORDINATES_SOURCE   : chr  "1) iTouchMap.com, approx, A. Orkild-Norton; 2) Mineral Resource Deposit Database Deposit ID 10174173, ore body, M. Granitto" "1) Mindat.org, approx, A. Orkild-Norton; 2) Open-File Report 2017-1079 ID 549, mine, M. Granitto" "1) No coordinates; 2) Mineral Resource Deposit Database Deposit ID 10057511, district, M. Granitto" "1) No coordinates; 2) Google Earth Pro, approx ctr of former province of Transvaal, M. Granitto" ...
##  $ PRIMARY_CLASS        : chr  "rock" "rock" "rock" "rock" ...
##  $ SYSTEM_TYPE          : chr  "IOA-IOCG" "Porphyry Cu-Mo-Au" "Porphyry Cu-Mo-Au" "IOA-IOCG" ...
##  $ DEPOSIT_TYPE         : chr  "IOCG" "Supergene Cu" "Porphyry Cu" "IOCG" ...
##  $ SAMPLE_DESC          : chr  "Nearly solid chalcopyrite mixed with small light brown irregular inclusions of unknown mineralogy; clouds of ma"| __truncated__ "Chalcocite-bronchatite-antlerite(?); highly microfractured igneous rock with green copper sulfates coating microfractures" "Bornite-chalcopyrite; mostly massive chalcopyrite with numerous inclusions of micro-chalcopyrite and widely sca"| __truncated__ "Massive chalcopyrite, IOCG in shear zone; mostly massive fine grain cuprite with widely distributed malachite t"| __truncated__ ...
##  $ Al_pct_AES_ST        : chr  "0,33" "6,65" "0,46" "0,7" ...
##  $ Ca_pct_AES_ST        : chr  "1,1" "0,4" "-0,1" "0,3" ...
##  $ Fe_pct_AES_ST        : chr  "42,4" "0,25" "6,98" "27,8" ...
##  $ K_pct_AES_ST         : chr  "-0,1" "6,1" "0,2" "-0,1" ...
##  $ Mg_pct_AES_ST        : chr  "0,57" "0,1" "0,01" "0,33" ...
##  $ Mn_pct_AES_ST        : chr  "0,02" "-0,01" "-0,01" "-0,01" ...
##  $ P_pct_AES_ST         : chr  "-0,01" "0,01" "0,05" "0,01" ...
##  $ S_pct_AES_ST         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Si_pct_AES_ST        : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Ti_pct_AES_ST        : chr  "0,01" "0,11" "-0,01" "-0,01" ...
##  $ F_pct_ISE_Fuse       : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Ag_ppm_MS_ST         : chr  "58" "6" "468" "16" ...
##  $ As_ppm_MS_ST         : chr  "-30" "-30" "90" "-30" ...
##  $ Au_ppm               : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Au_AM                : chr  "" "" "" "" ...
##  $ B_ppm_AES_ST         : int  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
##  $ Ba_ppm_AES_ST        : chr  "-0,5" "924" "121" "174" ...
##  $ Be_ppm_AES_ST        : int  -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 ...
##  $ Bi_ppm_MS_ST         : chr  "1,5" "3,6" "190" "0,4" ...
##  $ Cd_ppm_MS_ST         : chr  "3,6" "-0,2" "0,9" "-0,2" ...
##  $ Ce_ppm_MS_ST         : chr  "0,4" "8,8" "16,3" "3,5" ...
##  $ Co_ppm_MS_ST         : chr  "209" "-0,5" "1,3" "44,8" ...
##  $ Cr_ppm_AES_ST        : int  -10 -10 -10 30 20 20 60 40 20 10 ...
##  $ Cs_ppm_MS_ST         : chr  "0,5" "1,4" "0,2" "-0,1" ...
##  $ Cu_ppm_AES_ST        : chr  "50000,11111" "23300" "50000,11111" "50000,11111" ...
##  $ Dy_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,32" "1,38" "0,37" ...
##  $ Er_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,22" "0,77" "0,23" ...
##  $ Eu_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,14" "0,17" "0,1" ...
##  $ Ga_ppm_MS_ST         : chr  "5" "15" "6" "3" ...
##  $ Gd_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,45" "1,5" "0,39" ...
##  $ Ge_ppm_MS_ST         : int  -1 5 -1 -1 3 8 8 1 2 2 ...
##  $ Hf_ppm_MS_ST         : int  -1 4 -1 -1 5 13 12 2 3 6 ...
##  $ Ho_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,07" "0,25" "0,07" ...
##  $ In_ppm_MS_ST         : chr  "6,4" "-0,2" "3,7" "0,2" ...
##  $ La_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "4,6" "7,2" "1,7" ...
##  $ Li_ppm_AES_ST        : int  -10 -10 -10 -10 30 20 20 20 -10 20 ...
##  $ Lu_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "-0,05" "0,08" "-0,05" ...
##  $ Mo_ppm_MS_ST         : chr  "-2" "60" "3" "2" ...
##  $ Nb_ppm_MS_ST         : chr  "-1" "4" "-1" "-1" ...
##  $ Nd_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "3,8" "9,1" "1,7" ...
##  $ Ni_ppm_AES_ST        : chr  "144" "6" "-5" "48" ...
##  $ Pb_ppm_MS_ST         : chr  "23" "16" "188" "39" ...
##  $ Pd_ppm_FA_MS         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Pr_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "1,09" "2,21" "0,46" ...
##  $ Pt_ppm_FA_MS         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Rb_ppm_MS_ST         : chr  "1,2" "148" "7,1" "0,7" ...
##  $ Re_ppm_MS_HF         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Sb_ppm_MS_ST         : chr  "1,2" "2,4" "2,9" "0,3" ...
##  $ Sc_ppm_AES_ST        : int  -5 -5 -5 -5 11 6 15 10 5 6 ...
##  $ Se_ppm_MS_ST         : int  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
##  $ Sm_ppm_MS_ST         : chr  "-0,1" "0,6" "1,6" "0,4" ...
##  $ Sn_ppm_MS_ST         : chr  "2" "3" "106" "-1" ...
##  $ Sr_ppm_AES_ST        : chr  "26,6" "114" "22,5" "38,4" ...
##  $ Ta_ppm_MS_ST         : chr  "-0,5" "-0,5" "-0,5" "-0,5" ...
##  $ Tb_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,07" "0,23" "-0,05" ...
##  $ Te_ppm_MS_ST         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Th_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "9,7" "2,6" "0,2" ...
##  $ Tl_ppm_MS_ST         : chr  "-0,5" "0,5" "-0,5" "-0,5" ...
##  $ Tm_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "-0,05" "0,08" "-0,05" ...
##  $ U_ppm_MS_ST          : chr  "0,3" "1,75" "0,63" "34,8" ...
##  $ V_ppm_AES_ST         : int  51 24 -5 493 68 20 40 159 39 61 ...
##  $ W_ppm_MS_ST          : chr  "-1" "28" "22" "11" ...
##   [list output truncated]

Se cargaron los datos de todas las variables.

ANÁLISIS DE FRECUENCIAS: CONCENTRACIÓN DE POTASIO (K)

library(dplyr)
library(gt)

#----------------------- PROCESAMIENTO K_pct_AES_ST -----------------------

# 1. Limpieza y preparación de la variable
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))

# Separar registros con concentraciones válidas de los nulos/negativos
k_numerico <- datos$K_pct_AES_ST[datos$K_pct_AES_ST >= 0 & !is.na(datos$K_pct_AES_ST)]
n_sin_datos <- sum(is.na(datos$K_pct_AES_ST) | datos$K_pct_AES_ST < 0)

# 2. Tabla de Frecuencias de los valores geoquímicos reales
TDF_VALIDOS <- as.data.frame(table(k_numerico), stringsAsFactors = FALSE)
colnames(TDF_VALIDOS) <- c("CATEGORIA", "ni")

# Convertir categoría a numérico para ordenar de menor a mayor concentración (%)
TDF_VALIDOS$CATEGORIA <- as.numeric(TDF_VALIDOS$CATEGORIA)
TDF_VALIDOS <- TDF_VALIDOS[order(TDF_VALIDOS$CATEGORIA), ]

# Definición de horizontes cuantitativos
total_variable <- sum(TDF_VALIDOS$ni)        # Total de muestras con datos de K
total_general  <- total_variable + n_sin_datos # Total absoluto de la matriz

# 3. Agrupación: Top 10 valores de concentración más bajos + Otros
if(nrow(TDF_VALIDOS) > 10) {
  tabla_top <- head(TDF_VALIDOS, 10)
  sum_otros <- sum(TDF_VALIDOS$ni[11:nrow(TDF_VALIDOS)])
  fila_otros <- data.frame(CATEGORIA = "Otras Concentraciones", ni = sum_otros)
  tabla_final_base <- rbind(tabla_top, fila_otros)
} else {
  tabla_final_base <- TDF_VALIDOS
}

# Convertir CATEGORIA a carácter para permitir la unión de las filas de totales
tabla_final_base$CATEGORIA <- as.character(tabla_final_base$CATEGORIA)

# 4. Calcular frecuencias (hi) escaladas a 100 respecto al total general
tabla_final_base$hi <- round((tabla_final_base$ni / total_general) * 100, 4)

# 5. FILA DEL TOTAL EXCLUSIVO DE LA VARIABLE (Muestras con lecturas de K)
fila_total_var <- data.frame(
  CATEGORIA = "TOTAL VARIABLE (K)", 
  ni = total_variable,
  hi = round((total_variable / total_general) * 100, 4)
)

# 6. FILA DE CONTRASTE: REGISTROS SIN INFORMACIÓN ANALÍTICA
fila_sin_datos <- data.frame(
  CATEGORIA = "Sin Datos", 
  ni = n_sin_datos,
  hi = round((n_sin_datos / total_general) * 100, 4)
)

# 7. FILA DEL TOTAL GENERAL DEL PROYECTO
fila_total_general <- data.frame(
  CATEGORIA = "TOTAL GENERAL", 
  ni = total_general,
  hi = 100 # Forzado para cierre perfecto de balance estadístico
)

# Consolidar toda la matriz de datos en orden lógico estructurado
tabla_final <- rbind(tabla_final_base, fila_total_var, fila_sin_datos, fila_total_general)
colnames(tabla_final) <- c("Valor K (%)", "ni", "hi")

#----------------------- GENERAR SALIDA ESTÉTICA CON 'gt' -----------------------
tabla_k_completa_gt <- tabla_final %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 1**"), 
    subtitle = md("Distribución de frecuencias para concentraciones de Potasio (K)")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  )

# Renderizar la tabla en el documento
tabla_k_completa_gt
Tabla N° 1
Distribución de frecuencias para concentraciones de Potasio (K)
Valor K (%) ni hi
0.01 28 2.0498
0.02 32 2.3426
0.03 31 2.2694
0.04 21 1.5373
0.05 21 1.5373
0.06 13 0.9517
0.07 11 0.8053
0.08 6 0.4392
0.09 7 0.5124
0.1 47 3.4407
Otras Concentraciones 771 56.4422
TOTAL VARIABLE (K) 988 72.3280
Sin Datos 378 27.6720
TOTAL GENERAL 1366 100.0000
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

POLÍGONO DE FRECUENCIA

#----------------------- PROCESAMIENTO AUTOMÁTICO K_PCT_AES_ST -----------------------

# 1. Conversión de la variable a numérico y limpieza de datos
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))
K_VAR <- datos$K_pct_AES_ST[!is.na(datos$K_pct_AES_ST) & datos$K_pct_AES_ST >= 0]

#----------------------- EXTRACCIÓN METODOLÓGICA DE STURGES -----------------------

# 2. Calculamos los parámetros de Sturges
n_total <- length(K_VAR)
k_sturges <- floor(1 + 3.322 * log10(n_total)) 

# 3. Definimos los cortes de intervalos (breaks) usando el rango real del Potasio
rango_k <- max(K_VAR) - min(K_VAR)
amplitud_k <- rango_k / k_sturges
breaks_sturges <- seq(from = min(K_VAR), by = amplitud_k, length.out = k_sturges + 1)

# 4. CAPTURA DE DATOS OCULTOS: Dejamos que R agrupe y cuente en memoria (plot = FALSE)
hist_objeto <- hist(K_VAR, breaks = breaks_sturges, plot = FALSE, right = FALSE)

#----------------------- TRUCO ESTADÍSTICO: ANCLAJE A CERO -----------------------

# 5. Creamos las clases vacías a los extremos para que el polígono toque el eje X
mc_inicio <- hist_objeto$mids[1] - amplitud_k
mc_final  <- hist_objeto$mids[length(hist_objeto$mids)] + amplitud_k

# Unimos los puntos del mapa: Marcas de Clase (X) y Frecuencias absolutas n (Y)
marcas_clase_k <- c(mc_inicio, hist_objeto$mids, mc_final)
frecuencias_k  <- c(0, hist_objeto$counts, 0)

# Detectamos la frecuencia máxima real para el eje Y
max_y_k <- max(frecuencias_k)

#----------------------- GRAFICAR POLÍGONO DE FRECUENCIAS -----------------------
par(mar = c(5, 5, 4, 2))

# 6. Inicializar el lienzo con el zoom horizontal y vertical calibrados
plot(marcas_clase_k, frecuencias_k,
     type = "n",
     main = "Gráfica 1: Polígono de Frecuencias Absolutas de Potasio (K)",
     xlab = "Concentración de Potasio - K (%)",
     ylab = "Frecuencia Absoluta (n muestras)",
     xlim = c(min(breaks_sturges), max(breaks_sturges)), 
     ylim = c(0, max_y_k * 1.1),                        
     xaxt = "n", yaxt = "n",
     panel.first = grid(nx = NULL, ny = NULL, col = "gray90")) # Rejilla de fondo

# 7. Dibujar el polígono (Línea continua con puntos en cada marca de clase)
lines(marcas_clase_k, frecuencias_k, type = "b", pch = 19, col = "darkblue", lwd = 3)

# 8. Relleno translúcido bajo la curva para acabado profesional
polygon(marcas_clase_k, frecuencias_k, col = rgb(0, 0, 0.5, 0.12), border = NA)

#----------------------- PERSONALIZACIÓN DE EJES CONTINUOS -----------------------

# Eje X: Imprime los límites exactos de tu tabla redondeados a 3 decimales
axis(1, at = breaks_sturges, labels = round(breaks_sturges, 3), cex.axis = 0.75, las = 1)

# Eje Y: Muestra marcas redondas de guía y fuerza la impresión del pico
marcas_eje_y <- pretty(c(0, max_y_k))
marcas_eje_y <- marcas_eje_y[marcas_eje_y < (max_y_k * 0.9)] # Evita colisiones de texto
axis(2, at = c(marcas_eje_y, max_y_k), labels = c(marcas_eje_y, max_y_k), las = 1, cex.axis = 0.8)

ANÁLISIS GRÁFICO: HISTOGRAMA DISTRIBUCIÓN DE POTASIO

#----------------------- PROCESAMIENTO K_pct_AES_ST -----------------------

# 1. Conversión de K_pct_AES_ST a numérico 
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))

# Creamos variable de trabajo para las gráficas y FILTRAMOS los negativos
K_VAR <- datos$K_pct_AES_ST
K_VAR <- K_VAR[K_VAR >= 0 & !is.na(K_VAR)] 

#----------------------- TABLA DE FRECUENCIAS SIMPLIFICADA -----------------------
# Al ser continua, agrupamos por rangos automáticos (bins) para que la tabla sea legible

k_simplificado <- 5
breaks_s <- pretty(K_VAR, n = k_simplificado)
HistogramaK <- hist(K_VAR, breaks = breaks_s, plot = FALSE)

# 2. Generación del Histograma
hist(K_VAR,
     breaks = breaks_s,
     main = "Grafica 2: Distribucion de K_pct_AES_ST (Simplificada)",
     xlab = "Concentracion de K (%)",
     ylab = "Cantidad de muestras",
     col = "lightgreen",
     right = FALSE)

ANÁLISIS DESCRIPTIVO Y AGRUPACIÓN EN CLASES (STURGES) DEL POTASIO

library(dplyr)
library(gt)

#------------------------- PREPARACIÓN DE DATOS -------------------------
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))

# Creamos la variable de trabajo K asegurando que los datos estén limpios
K <- datos$K_pct_AES_ST[!is.na(datos$K_pct_AES_ST) & datos$K_pct_AES_ST >= 0]

#------------------------- ANÁLISIS DE CONCENTRACIÓN (ESTADÍSTICOS) -------------------------
cat("\n=======================================================\n")
## 
## =======================================================
cat("ANÁLISIS DE CONCENTRACIÓN (K_pct_AES_ST):\n")
## ANÁLISIS DE CONCENTRACIÓN (K_pct_AES_ST):
cat("La concentración promedio es: ", round(mean(K, na.rm = TRUE), 2), " % \n")
## La concentración promedio es:  1.7  %
cat("La concentración máxima detectada es: ", max(K, na.rm = TRUE), " % \n")
## La concentración máxima detectada es:  12.2  %
cat("Total de muestras analizadas: ", sum(!is.na(K)), " registros \n")
## Total de muestras analizadas:  988  registros
cat("=======================================================\n")
## =======================================================
#------------------------- TABLA DE FRECUENCIAS - STURGES -------------------------
# 1. Parámetros básicos: Rango, Número de clases (Sturges) y Amplitud
R <- max(K, na.rm = TRUE) - min(K, na.rm = TRUE)
k <- floor(1 + 3.322 * log10(length(K)))
A <- R / k

# 2. Definición de límites y Marcas de Clase (MC)
liminf <- seq(from = min(K, na.rm = TRUE), by = A, length.out = k)
limsup <- liminf + A
MC <- (liminf + limsup) / 2

# 3. Conteo de frecuencias absolutas por clase (n)
n <- numeric(k)
for (i in 1:k) {
  if (i == k) {
    n[i] <- sum(K >= liminf[i] & K <= limsup[i], na.rm = TRUE)
  } else {
    n[i] <- sum(K >= liminf[i] & K < limsup[i], na.rm = TRUE)
  }
}

# 4. Cálculos de frecuencias relativas y acumuladas
hi <- (n / sum(n)) * 100
Ni_asc <- cumsum(n)             # Frecuencia absoluta acumulada (ascendente)
Hi_asc <- cumsum(hi)            # Frecuencia relativa acumulada (ascendente)
Ni_desc <- rev(cumsum(rev(n)))  # Frecuencia absoluta acumulada (descendente)
Hi_desc <- rev(cumsum(rev(hi))) # Frecuencia relativa acumulada (descendente)

#------------------------- CONSTRUCCIÓN DE LA TABLA -------------------------
TablaK_Sturges <- data.frame(
  Clase = as.character(1:k), 
  liminf = round(liminf, 3),
  limsup = round(limsup, 3),
  MC = round(MC, 3),
  n = n,
  hi = round(hi, 2),
  Ni_asc = Ni_asc,
  Hi_asc = round(Hi_asc, 2),
  Ni_desc = Ni_desc,
  Hi_desc = round(Hi_desc, 2)
)

# Fila de TOTALES para cierre de tabla
fila_totales_K <- data.frame(
  Clase = "**TOTALES**",
  liminf = NA,
  limsup = NA,
  MC = NA,
  n = sum(n),
  hi = 100,
  Ni_asc = NA,
  Hi_asc = 100,
  Ni_desc = NA,
  Hi_desc = 100
)

# Unión de cuerpo y totales
TablaK_Final <- rbind(TablaK_Sturges, fila_totales_K)

#------------------------- MOSTRAR TABLA FINAL CON 'gt' -------------------------
tabla_sturges_k_gt <- TablaK_Final %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 2**"),
    subtitle = md("Distribución de frecuencias para concentraciones de Potasio (K_pct_AES_ST) <br> mediante Regla de Sturges")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  fmt_markdown(columns = Clase) %>% 
  cols_label(
    Clase = "Clase",
    liminf = "Linf (%)",
    limsup = "Lsup (%)",
    MC = "MC (%)",
    n = "n (abs)",
    hi = "hi (%)",
    Ni_asc = "Ni (↑)",
    Hi_asc = "Hi (↑)",
    Ni_desc = "Ni (↓)",
    Hi_desc = "Hi (↓)"
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  ) %>%
  sub_missing(
    columns = everything(),
    missing_text = "NA"
  )

# Renderizar la tabla en el reporte
tabla_sturges_k_gt
Tabla N° 2
Distribución de frecuencias para concentraciones de Potasio (K_pct_AES_ST)
mediante Regla de Sturges
Clase Linf (%) Lsup (%) MC (%) n (abs) hi (%) Ni (↑) Hi (↑) Ni (↓) Hi (↓)
1 0.010 1.229 0.619 594 60.18 594 60.18 987 100.00
2 1.229 2.448 1.838 132 13.37 726 73.56 393 39.82
3 2.448 3.667 3.057 92 9.32 818 82.88 261 26.44
4 3.667 4.886 4.276 74 7.50 892 90.37 169 17.12
5 4.886 6.105 5.495 42 4.26 934 94.63 95 9.63
6 6.105 7.324 6.714 18 1.82 952 96.45 53 5.37
7 7.324 8.543 7.933 19 1.93 971 98.38 35 3.55
8 8.543 9.762 9.152 8 0.81 979 99.19 16 1.62
9 9.762 10.981 10.371 3 0.30 982 99.49 8 0.81
10 10.981 12.200 11.590 5 0.51 987 100.00 5 0.51
TOTALES NA NA NA 987 100.00 NA 100.00 NA 100.00
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

HISTOGRAMA MEJORADO DE LA VARIABLE

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS -----------------------
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))
K_VAR <- datos$K_pct_AES_ST[!is.na(datos$K_pct_AES_ST) & datos$K_pct_AES_ST >= 0]

# Definimos intervalos manuales de 1 en 1, con límite de error estricto
breaks_entero <- seq(0, ceiling(max(K_VAR)) + 1, by = 1)

# Cálculo de la tabla de frecuencias para la Ojiva
h_data <- hist(K_VAR, breaks = breaks_entero, plot = FALSE)
MC <- h_data$mids
Ni_asc <- cumsum(h_data$counts)
Ni_desc <- rev(cumsum(rev(h_data$counts)))

#----------------------- 1. HISTOGRAMA MEJORADO -----------------------
# Aumentamos margen superior para que el título y los números tengan espacio
par(mar=c(5, 5, 5, 2))

h_plot <- hist(K_VAR, breaks = breaks_entero,
               main = "Gráfica 3: Distribución del Contenido de Potasio (%)",
               xlab = "Contenido de Potasio (%)",
               ylab = "Frecuencia (Cantidad)",
               col = "lightgreen", border = "darkgreen",
               xaxt = "n",  # Quitamos eje X para poner números enteros
               las = 1,
               ylim = c(0, max(h_data$counts) * 1.2)) # Espacio calculado automáticamente

# Eje X con números enteros claros
axis(1, at = breaks_entero, labels = breaks_entero, font = 2)

# Etiquetas con los valores exactos encima de las barras
text(h_plot$mids, h_plot$counts, labels = h_plot$counts,
     adj = c(0.5, -0.5), cex = 0.9, font = 2, col = "black")

ANÁLISIS VISUAL ACUMULADO: OJIVA ASCENDENTE Y DESCENDENTE

#----------------------- 2. OJIVA INTEGRADA Y PROFESIONAL -----------------------
par(mar=c(5, 5, 4, 2))

plot(MC, Ni_asc,
     main = "Gráfica 4: Ojiva Combinada de Frecuencias del Potasio (ni)",
     xlab = "Contenido de Potasio (%)",
     ylab = "Frecuencia Acumulada (N muestras)",
     type = "b", pch = 19, col = "blue", lwd = 3,
     xaxt = "n", las = 1,
     ylim = c(0, max(Ni_asc) * 1.05),
     panel.first = grid(nx = NULL, ny = NULL, col = "gray90")) 

# Segunda línea (Descendente)
lines(MC, Ni_desc, type = "b", pch = 17, col = "red", lwd = 3, lty = 2)

# Eje X con los intervalos exactos
axis(1, at = breaks_entero, labels = breaks_entero)

# Leyenda reubicada
legend("right",
       legend = c("Acumulada Menor que (Ascendente)", "Acumulada Mayor que (Descendente)"),
       col = c("blue", "red"),
       lty = c(1, 2),
       pch = c(19, 17),
       lwd = 2,
       title = "Tipo de Ojiva",
       bty = "n",  
       cex = 0.85)

#----------------------- OJIVA PROFESIONAL POTASIO - EN PORCENTAJES (Hi) -----------------------

MC_graficar     <- MC[!is.na(MC)]
Hi_asc_graficar <- Hi_asc[1:length(MC_graficar)]
Hi_desc_graficar <- Hi_desc[1:length(MC_graficar)]

# Definir los cortes del eje X uniendo el límite inferior de cada clase
breaks_k <- c(liminf[!is.na(liminf)], limsup[length(limsup) - 1])

par(mar=c(5, 5, 4, 2))

plot(MC_graficar, Hi_asc_graficar,
     main = "Gráfica 5 : Ojiva Acumulada de Frecuencias de Potasio (hi)",
     xlab = "Concentración de Potasio - K (%)",
     ylab = "Frecuencia Relativa Acumulada (%)", 
     type = "b", pch = 19, col = "blue", lwd = 3, 
     xaxt = "n", las = 1,
     ylim = c(0, 105), 
     panel.first = grid(nx = NULL, ny = NULL, col = "gray90")) 

lines(MC_graficar, Hi_desc_graficar, type = "b", pch = 17, col = "red", lwd = 3, lty = 2)

axis(1, at = breaks_k, labels = round(breaks_k, 2), cex.axis = 0.8)

legend("right",
       legend = c("Acumulada Menor que (Ascendente %)", "Acumulada Mayor que (Descendente %)"),
       col = c("blue", "red"),
       lty = c(1, 2),
       pch = c(19, 17),
       lwd = 2,
       title = "Tipo de Ojiva",
       bty = "n",  
       cex = 0.85)

ANÁLISIS VISUAL POR RANGOS DE K_pct_AES_ST

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS -----------------------
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))
K_VAR <- datos$K_pct_AES_ST[!is.na(datos$K_pct_AES_ST) & datos$K_pct_AES_ST >= 0]

# Definimos intervalos exactos para Potasio (+1 para margen de error nulo)
breaks_h <- seq(0, ceiling(max(K_VAR)) + 1, by = 1)
h_info <- hist(K_VAR, breaks = breaks_h, plot = FALSE)
intervalos <- paste0("[", h_info$breaks[-length(h_info$breaks)], " - ", h_info$breaks[-1], "]")

# Paleta viva
colores_hist <- rainbow(length(h_info$counts), start = 0.5, end = 0.8)

#----------------------- HISTOGRAMA: ESCALA Y TÍTULO OPTIMIZADOS -----------------------
par(mar=c(5, 5, 5, 8), xpd=TRUE)

hist(K_VAR, breaks = breaks_h,
     main = "Grafica 6: Distribucion de K_pct_AES_ST",
     xlab = "Contenido de Potasio (%)",
     ylab = "Frecuencia (Cantidad)",
     col = colores_hist,
     border = "white",
     labels = TRUE,
     right = FALSE,
     las = 1,
     xaxt = "n",       
     ylim = c(0, max(h_info$counts) * 1.2))

axis(1, at = breaks_h, labels = breaks_h, font = 2)

legend("topright", inset=c(-0.35, 0),
       legend = intervalos,
       fill = colores_hist,
       title = "Intervalos (%)",
       cex = 0.8, bty = "n")

BOXPLOT

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS (Potasio) -----------------------
datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))
K_VAR <- datos$K_pct_AES_ST[!is.na(datos$K_pct_AES_ST) & datos$K_pct_AES_ST > 0]

#----------------------- 2. BOXPLOT: ANÁLISIS DE VALORES ATÍPICOS -----------------------
par(mar=c(5, 6, 5, 2), xpd = FALSE)

# Cálculos estadísticos previos
stats_k <- boxplot.stats(K_VAR)
media_k  <- round(mean(K_VAR), 2)
mediana_k <- round(median(K_VAR), 2)
n_outliers <- length(stats_k$out)

# Generación del Boxplot
boxplot(K_VAR, horizontal = TRUE, col = "#E0E0E0", border = "#424242",
        main = " Gráfica 7: Análisis de Valores Atípicos (Potasio)", 
        xlab = "Concentración de K (%)",
        pch = 21, 
        bg = "red", 
        col.outline = "darkred", 
        frame = FALSE)

points(media_k, 1, col = "blue", pch = 18, cex = 2)

text(media_k, 1.25, labels = paste("Media:", media_k), col = "blue", font = 2, cex = 0.9)
text(mediana_k, 0.75, labels = paste("Mediana:", mediana_k), col = "#424242", font = 2, cex = 0.9)

legend("topright", 
       legend = paste("Atípicos detectados:", n_outliers),
       pch = 21, 
       pt.bg = "red", 
       bty = "n", 
       text.col = "darkred", 
       cex = 0.9)

#----------------------- 3. BOXPLOT: DISTRIBUCIÓN LIMPIA (POTASIO) -----------------------
par(mar=c(5, 6, 5, 2))

# Generación del Boxplot sin valores atípicos (outline = FALSE)
boxplot(K_VAR, 
        horizontal = TRUE, 
        outline = FALSE, 
        col = "#E0E0E0", 
        border = "#424242",
        main = "Gráfica 8: Distribución del Cuerpo Mineral (Sin Atípicos) - Potasio", 
        xlab = "Concentración de K (%)", 
        frame = FALSE)

grid(nx = NULL, ny = NA, col = "gray85", lty = "dashed")

points(media_k, 1, col = "#E65100", pch = 18, cex = 2)

text(media_k, 1.25, labels = paste("Media:", media_k), col = "#BF360C", font = 2, cex = 0.9)
text(mediana_k, 0.75, labels = paste("Mediana:", mediana_k), col = "#424242", font = 2, cex = 0.9)

RESUMEN DESCRIPTIVO

library(dplyr)
library(gt)
library(e1071) 

#----------------------- ANÁLISIS ESTADÍSTICO K_pct_AES_ST -----------------------

datos$K_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$K_pct_AES_ST))))
K_LIMPIA <- datos$K_pct_AES_ST[!is.na(datos$K_pct_AES_ST) & datos$K_pct_AES_ST >= 0]

# Cálculos estadísticos descriptivos consolidados
resumen_stats_K <- data.frame(
  Estadistico = c("Tamaño muestral (n)", 
                  "Mínimo (%)", 
                  "Máximo (%)", 
                  "Media (%)", 
                  "Mediana (%)",
                  "Desviación Estándar", 
                  "Coef. Variación (%)", 
                  "Asimetría", 
                  "Curtosis"),
  Valor = c(
    length(K_LIMPIA),
    min(K_LIMPIA),
    max(K_LIMPIA),
    mean(K_LIMPIA),
    median(K_LIMPIA),
    sd(K_LIMPIA),
    (sd(K_LIMPIA) / mean(K_LIMPIA)) * 100,
    skewness(K_LIMPIA, type = 2),
    kurtosis(K_LIMPIA)
  )
)

resumen_stats_K$Valor <- round(resumen_stats_K$Valor, 2)

#----------------------- SALIDA ESTÉTICA CON 'gt' -----------------------
tabla_stats_k_gt <- resumen_stats_K %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 3**"),
    subtitle = md("Estadística Descriptiva para Concentraciones de Potasio (K)")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  cols_label(
    Estadistico = "Parámetro Estadístico",
    Valor = "Resultado"
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  )

# Renderizar la tabla 
tabla_stats_k_gt
Tabla N° 3
Estadística Descriptiva para Concentraciones de Potasio (K)
Parámetro Estadístico Resultado
Tamaño muestral (n) 988.00
Mínimo (%) 0.01
Máximo (%) 12.20
Media (%) 1.70
Mediana (%) 0.60
Desviación Estándar 2.23
Coef. Variación (%) 131.47
Asimetría 1.84
Curtosis 3.43
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

CONCLUSION

El análisis descriptivo del potasio (K) sobre la base de datos depurada reporta un rango de concentraciones desde 0.01% hasta 12.20%, con una media de 1.70% y una mediana de 0.60%. Su coeficiente de variación (131.47%) y desviación estándar (2.23) reflejan una dispersión extremadamente alta, lo que indica un conjunto altamente heterogéneo en el yacimiento. Finalmente, los índices de forma muestran una asimetría fuertemente positiva (1.84) y una curtosis de 3.43, confirmando una distribución con acumulación marcada en las leyes geoquímicas bajas y la presencia de muestras atípicas de mayor concentración (outliers) que alteran la tendencia central.