CARGA DE DATOS

CARGA DE DATOS

knitr::opts_chunk$set(
  echo = TRUE,                   # Muestra el código R en el reporte final.
  message = FALSE,
  warning = FALSE,               # Evita que se impriman alertas o mensajes de carga estorbosos en el HTML.
  fig.align = "center"           # Centra automáticamente todas las gráficas generadas.
)

datos <- read.csv("C:/Users/Martin/Desktop/Estadistica/CMDB_Data.csv", 
                  header = TRUE, # Indica que la primera fila contiene los nombres de las variables.
                  sep = ";",     # Define el punto y coma como separador.
                  dec = ".",     # Establece el punto como el operador decimal.
                  fileEncoding = "latin1")

# Limpieza básica para evitar valores en blanco
datos$CONTINENT[datos$CONTINENT == ""] <- "Desconocido"

# Verificación inicial del set de datos
str(datos)
## 'data.frame':    1366 obs. of  103 variables:
##  $ ï..LAB_ID            : chr  "C355417" "C360759" "C360762" "C360763" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID1     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID2     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID3     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ FIELD_ID             : chr  "RM0001" "RM0027" "RM0030" "RM0031" ...
##  $ JOB_ID               : chr  "MRP11968" "MRP12307" "MRP12307" "MRP12307" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID1     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID2     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID3     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ SUBMITTER            : chr  "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" ...
##  $ PROJECT_NAME         : chr  "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" ...
##  $ X0                   : chr  "30/6/2011" "31/8/2011" "31/8/2011" "31/8/2011" ...
##  $ COLLECTION           : chr  "Mackay-Keck Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" ...
##  $ COLLECTION_ID        : chr  "PHNC08_39_1183" "OD21441" "OD22811" "OD25716" ...
##  $ CONTINENT            : chr  "North America" "South America" "South America" "Africa" ...
##  $ COUNTRY              : chr  "United States" "Chile" "Chile" "South Africa" ...
##  $ STATE_PROVINCE       : chr  "Nevada" "Antofagasta" "Tarapacá" "Transvaal" ...
##  $ COUNTY               : chr  "Lyon" "El Loa" "El Tamarugal" "" ...
##  $ DISTRICT_NAME        : chr  "Yerington" "Chuquicamata" "Collahuasi/Quebrada Blanca" "" ...
##  $ DEPOSIT_NAME         : chr  "Pumpkin Hollow" "" "" "" ...
##  $ MINE_NAME            : chr  "Pumpkin Hollow" "Chuquicamata mine" "Collahuasi district" "" ...
##  $ DISTRICT_NAME_COLLECT: chr  "Yerington" "" "" "" ...
##  $ DEPOSIT_NAME_COLLECT : chr  "" "" "" "" ...
##  $ MINE_NAME_COLLECT    : chr  "Pumpkin Hollow" "Chuquicamata" "Poduosa mine" "Messina Mines Ltd." ...
##  $ LOCATE_DESC          : chr  "" "" "Level 25" "" ...
##  $ LATITUDE             : chr  "38,94021" "-22,2871" "-21,0309" "-24,7" ...
##  $ LONGITUDE            : chr  "-119,05178" "-68,8991" "-68,74951" "29,3" ...
##  $ DATUM                : chr  "WGS84" "WGS84" "WGS84" "" ...
##  $ LATITUDE_COLLECT     : chr  "38,92492" "22,28944" "" "" ...
##  $ LONGITUDE_COLLECT    : chr  "-119,1071" "-68,90111" "" "" ...
##  $ DATUM_COLLECT        : chr  "" "WGS84" "" "" ...
##  $ COORDINATES_QUAL     : chr  "100 m" "0m" "" "" ...
##  $ COORDINATES_SOURCE   : chr  "1) iTouchMap.com, approx, A. Orkild-Norton; 2) Mineral Resource Deposit Database Deposit ID 10174173, ore body, M. Granitto" "1) Mindat.org, approx, A. Orkild-Norton; 2) Open-File Report 2017-1079 ID 549, mine, M. Granitto" "1) No coordinates; 2) Mineral Resource Deposit Database Deposit ID 10057511, district, M. Granitto" "1) No coordinates; 2) Google Earth Pro, approx ctr of former province of Transvaal, M. Granitto" ...
##  $ PRIMARY_CLASS        : chr  "rock" "rock" "rock" "rock" ...
##  $ SYSTEM_TYPE          : chr  "IOA-IOCG" "Porphyry Cu-Mo-Au" "Porphyry Cu-Mo-Au" "IOA-IOCG" ...
##  $ DEPOSIT_TYPE         : chr  "IOCG" "Supergene Cu" "Porphyry Cu" "IOCG" ...
##  $ SAMPLE_DESC          : chr  "Nearly solid chalcopyrite mixed with small light brown irregular inclusions of unknown mineralogy; clouds of ma"| __truncated__ "Chalcocite-bronchatite-antlerite(?); highly microfractured igneous rock with green copper sulfates coating microfractures" "Bornite-chalcopyrite; mostly massive chalcopyrite with numerous inclusions of micro-chalcopyrite and widely sca"| __truncated__ "Massive chalcopyrite, IOCG in shear zone; mostly massive fine grain cuprite with widely distributed malachite t"| __truncated__ ...
##  $ Al_pct_AES_ST        : chr  "0,33" "6,65" "0,46" "0,7" ...
##  $ Ca_pct_AES_ST        : chr  "1,1" "0,4" "-0,1" "0,3" ...
##  $ Fe_pct_AES_ST        : chr  "42,4" "0,25" "6,98" "27,8" ...
##  $ K_pct_AES_ST         : chr  "-0,1" "6,1" "0,2" "-0,1" ...
##  $ Mg_pct_AES_ST        : chr  "0,57" "0,1" "0,01" "0,33" ...
##  $ Mn_pct_AES_ST        : chr  "0,02" "-0,01" "-0,01" "-0,01" ...
##  $ P_pct_AES_ST         : chr  "-0,01" "0,01" "0,05" "0,01" ...
##  $ S_pct_AES_ST         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Si_pct_AES_ST        : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Ti_pct_AES_ST        : chr  "0,01" "0,11" "-0,01" "-0,01" ...
##  $ F_pct_ISE_Fuse       : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Ag_ppm_MS_ST         : chr  "58" "6" "468" "16" ...
##  $ As_ppm_MS_ST         : chr  "-30" "-30" "90" "-30" ...
##  $ Au_ppm               : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Au_AM                : chr  "" "" "" "" ...
##  $ B_ppm_AES_ST         : int  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
##  $ Ba_ppm_AES_ST        : chr  "-0,5" "924" "121" "174" ...
##  $ Be_ppm_AES_ST        : int  -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 ...
##  $ Bi_ppm_MS_ST         : chr  "1,5" "3,6" "190" "0,4" ...
##  $ Cd_ppm_MS_ST         : chr  "3,6" "-0,2" "0,9" "-0,2" ...
##  $ Ce_ppm_MS_ST         : chr  "0,4" "8,8" "16,3" "3,5" ...
##  $ Co_ppm_MS_ST         : chr  "209" "-0,5" "1,3" "44,8" ...
##  $ Cr_ppm_AES_ST        : int  -10 -10 -10 30 20 20 60 40 20 10 ...
##  $ Cs_ppm_MS_ST         : chr  "0,5" "1,4" "0,2" "-0,1" ...
##  $ Cu_ppm_AES_ST        : chr  "50000,11111" "23300" "50000,11111" "50000,11111" ...
##  $ Dy_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,32" "1,38" "0,37" ...
##  $ Er_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,22" "0,77" "0,23" ...
##  $ Eu_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,14" "0,17" "0,1" ...
##  $ Ga_ppm_MS_ST         : chr  "5" "15" "6" "3" ...
##  $ Gd_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,45" "1,5" "0,39" ...
##  $ Ge_ppm_MS_ST         : int  -1 5 -1 -1 3 8 8 1 2 2 ...
##  $ Hf_ppm_MS_ST         : int  -1 4 -1 -1 5 13 12 2 3 6 ...
##  $ Ho_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,07" "0,25" "0,07" ...
##  $ In_ppm_MS_ST         : chr  "6,4" "-0,2" "3,7" "0,2" ...
##  $ La_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "4,6" "7,2" "1,7" ...
##  $ Li_ppm_AES_ST        : int  -10 -10 -10 -10 30 20 20 20 -10 20 ...
##  $ Lu_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "-0,05" "0,08" "-0,05" ...
##  $ Mo_ppm_MS_ST         : chr  "-2" "60" "3" "2" ...
##  $ Nb_ppm_MS_ST         : chr  "-1" "4" "-1" "-1" ...
##  $ Nd_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "3,8" "9,1" "1,7" ...
##  $ Ni_ppm_AES_ST        : chr  "144" "6" "-5" "48" ...
##  $ Pb_ppm_MS_ST         : chr  "23" "16" "188" "39" ...
##  $ Pd_ppm_FA_MS         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Pr_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "1,09" "2,21" "0,46" ...
##  $ Pt_ppm_FA_MS         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Rb_ppm_MS_ST         : chr  "1,2" "148" "7,1" "0,7" ...
##  $ Re_ppm_MS_HF         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Sb_ppm_MS_ST         : chr  "1,2" "2,4" "2,9" "0,3" ...
##  $ Sc_ppm_AES_ST        : int  -5 -5 -5 -5 11 6 15 10 5 6 ...
##  $ Se_ppm_MS_ST         : int  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
##  $ Sm_ppm_MS_ST         : chr  "-0,1" "0,6" "1,6" "0,4" ...
##  $ Sn_ppm_MS_ST         : chr  "2" "3" "106" "-1" ...
##  $ Sr_ppm_AES_ST        : chr  "26,6" "114" "22,5" "38,4" ...
##  $ Ta_ppm_MS_ST         : chr  "-0,5" "-0,5" "-0,5" "-0,5" ...
##  $ Tb_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,07" "0,23" "-0,05" ...
##  $ Te_ppm_MS_ST         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Th_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "9,7" "2,6" "0,2" ...
##  $ Tl_ppm_MS_ST         : chr  "-0,5" "0,5" "-0,5" "-0,5" ...
##  $ Tm_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "-0,05" "0,08" "-0,05" ...
##  $ U_ppm_MS_ST          : chr  "0,3" "1,75" "0,63" "34,8" ...
##  $ V_ppm_AES_ST         : int  51 24 -5 493 68 20 40 159 39 61 ...
##  $ W_ppm_MS_ST          : chr  "-1" "28" "22" "11" ...
##   [list output truncated]

Se cargaron correctamente los datos para el análisis de distribución geográfica por continentes

ANÁLISIS BÁSICO (DE VALORES)

ANÁLISIS POR CONTINENTE (DE VALORES)

# Cargar las librerías necesarias
library(dplyr)
library(gt)

# 1. CONTAR LAS MUESTRAS POR CONTINENTE (Datos crudos)
TDF_CONT_BASE <- table(datos$CONTINENT)

# 2. ORDENAR LOS CONTEOS EN UNA TABLA
tabla_agrupada <- as.data.frame(TDF_CONT_BASE)
colnames(tabla_agrupada) <- c("Continente", "ni")

# 3. CALCULAR PROPORCIONES Y PORCENTAJES
tabla_agrupada$hi <- tabla_agrupada$ni / sum(tabla_agrupada$ni)
tabla_agrupada$hi_porc <- round(tabla_agrupada$hi * 100, 2)

# 4. CREAR LA FILA DE TOTALES
Total <- data.frame(Continente = "TOTAL",
                    ni = sum(tabla_agrupada$ni),
                    hi = sum(tabla_agrupada$hi),
                    hi_porc = sum(tabla_agrupada$hi) * 100)

# 5. UNIR TODO EN UNA SOLA TABLA FINAL
tabla_final <- rbind(tabla_agrupada, Total)

# 6. MOSTRAR LA TABLA CON LA ESTÉTICA 'gt'
tabla_cont_gt <- tabla_final %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 1**"),
    subtitle = md("Distribución de muestras de minerales críticos por continente <br> (Desglose Original)")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  )

# Renderizar la tabla en el documento
tabla_cont_gt
Tabla N° 1
Distribución de muestras de minerales críticos por continente
(Desglose Original)
Continente ni hi hi_porc
Africa 28 0.0204978038 2.05
Asia 37 0.0270863836 2.71
Europe 54 0.0395314788 3.95
North America 1113 0.8147877013 81.48
Oceania 40 0.0292825769 2.93
South America 93 0.0680819912 6.81
unknown 1 0.0007320644 0.07
TOTAL 1366 1.0000000000 100.00
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

CLASIFICACIÓN UNIFICADA

CLASIFICACIÓN CON AMÉRICA UNIFICADA Y FILTRADO

# 1. CREAR UNA COLUMNA EN BLANCO COMO RESPALDO PARA LA UNIFICACIÓN
datos$CONTINENT_UNIF <- as.character(datos$CONTINENT)

# 2. UNIFICAR NORTEAMÉRICA Y SUDAMÉRICA EN "AMÉRICA"
datos$CONTINENT_UNIF[datos$CONTINENT_UNIF %in% c("North America", "South America")] <- "America"

# 3. CONTAR LAS MUESTRAS AHORA POR CONTINENTE UNIFICADO
TDFCONTINENT <- table(datos$CONTINENT_UNIF) 

# Filtrar "Desconocido" o "unknown" si existen para un análisis más limpio
TDFCONTINENT <- TDFCONTINENT[names(TDFCONTINENT) != "Desconocido" & names(TDFCONTINENT) != "unknown"]

# 4. ESTRUCTURAR LA NUEVA TABLA
tabla_continentes <- as.data.frame(TDFCONTINENT)
colnames(tabla_continentes) <- c("Continente", "ni")

# 5. CALCULAR PROPORCIONES Y PORCENTAJES
tabla_continentes$hi <- tabla_continentes$ni / sum(tabla_continentes$ni)
tabla_continentes$hi_porc <- round(tabla_continentes$hi * 100, 2)

# 6. FILA DE TOTALES GENERALES
Total_Cont <- data.frame(Continente = "TOTAL", 
                           ni = sum(tabla_continentes$ni), 
                           hi = sum(tabla_continentes$hi), 
                           hi_porc = sum(tabla_continentes$hi) * 100)

# 7. ACOPLAR Y MOSTRAR LA TABLA CON LA ESTÉTICA 'gt'
tabla_final_continentes <- rbind(tabla_continentes, Total_Cont)

tabla_unif_gt <- tabla_final_continentes %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 2**"),
    subtitle = md("Distribución unificada de muestras de minerales críticos <br> por Continente")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  )

# Renderizar la tabla en el documento
tabla_unif_gt
Tabla N° 2
Distribución unificada de muestras de minerales críticos
por Continente
Continente ni hi hi_porc
Africa 28 0.02051282 2.05
America 1206 0.88351648 88.35
Asia 37 0.02710623 2.71
Europe 54 0.03956044 3.96
Oceania 40 0.02930403 2.93
TOTAL 1365 1.00000000 100.00
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

VISUALIZACIÓN DE COMPARATIVAS BÁSICAS

GRÁFICA DE BARRAS LOCAL Y GLOBAL

# 1. PRIMERA GRÁFICA (LOCAL - ESCALA AJUSTADA AL MÁXIMO VALOR)
limite_y <- max(TDFCONTINENT) * 1.2

barplot(TDFCONTINENT, 
        main = "Gráfica 1: Muestras de Elementos Críticos (LOCAL)", 
        ylab = "Cantidad de depósitos",                               
        xlab = "Continente",                                          
        col = "pink", 
        las = 1,               
        cex.names = 0.7,       
        ylim = c(0, limite_y))    

# 2. SEGUNDA GRÁFICA (GLOBAL - EJE Y PERSONALIZADO)
barplot(TDFCONTINENT, 
        main = "Gráfica 2: Muestras de Elementos Críticos (GLOBAL)",
        ylab = "Cantidad de muestras",
        xlab = "Continente",
        col = "skyblue",
        las = 1,
        cex.names = 0.7,
        ylim = c(0, limite_y),
        yaxt = "n") 

# 3. Dibujar el eje Y personalizado
axis(2, at = seq(0, limite_y, length.out = 6), las = 1)

ANÁLISIS DE FRECUENCIA ABSOLUTA

ANÁLISIS DE FRECUENCIA ABSOLUTA

# 1. ASIGNAR LOS DATOS A UNA VARIABLE LOCAL
freq_abs <- TDFCONTINENT

# 2. DIBUJAR LA GRÁFICA Y GUARDAR SUS COORDENADAS
bar_centers <- barplot(freq_abs, 
                       main = "Gráfica 3: Distribución de Muestras por Continente",
                       ylab = "Cantidad",
                       xlab = "Continente",
                       col = "orange",
                       las = 1,          
                       cex.names = 0.7,  
                       ylim = c(0, max(freq_abs) * 1.2))

# 3. PONER LAS ETIQUETAS NUMÉRICAS ENCIMA DE LAS BARRAS
text(x = bar_centers,                    
     y = freq_abs,         
     labels = freq_abs,                  
     pos = 3,                            
     cex = 0.8,
     col = "black")

ANÁLISIS DE FRECUENCIA RELATIVA (PORCENTAJES)

ANÁLISIS DE FRECUENCIA RELATIVA (PORCENTAJES)

# 1. TRANSFORMAR LAS CANTIDADES EN PORCENTAJES
freq_rel <- prop.table(TDFCONTINENT)           
freq_rel_porc <- round(freq_rel * 100, 2)  

# 2. DIBUJAR LAS BARRAS Y PERSONALIZAR EL LIENZO
bar_centers_rel <- barplot(freq_rel_porc, 
                           main = "Gráfica 4: Distribución Porcentual Total", 
                           ylab = "Porcentaje (%)", 
                           xlab = "Continente", 
                           col = "orchid", 
                           las = 1, 
                           cex.names = 0.7,
                           ylim = c(0, 100), 
                           yaxt = "n",       
                           yaxs = "i")       

# 3. CONSTRUIR UN EJE Y PERSONALIZADO CON SÍMBOLO %
axis(2, at = seq(0, 100, by = 20), labels = paste0(seq(0, 100, by = 20), "%"), las = 1, cex.axis = 0.8) 

# 4. COLOCAR LAS ETIQUETAS CON EL SÍMBOLO "%" EN LAS BARRAS
text(x = bar_centers_rel, 
     y = freq_rel_porc, 
     labels = paste0(freq_rel_porc, "%"), 
     pos = 3, 
     cex = 0.8, 
     col = "black")

COMPOSICIÓN GLOBAL (GRÁFICA CIRCULAR)

GRÁFICA CIRCULAR

# 1. ALISTAR LOS DATOS DE LOS CONTINENTES
Grupo_cont <- TDFCONTINENT   
hi_cont_porc <- round(prop.table(Grupo_cont) * 100, 1) 
colores <- c("#66C2A5", "#FC8D62", "#8DA0CB", "#E78AC3", "#A6D854", "#FFD92F")
etiquetas_leyenda <- paste0(names(Grupo_cont), " (", hi_cont_porc, "%)")

# 2. AJUSTAR EL LIENZO DE TRABAJO
par(mar = c(2, 6, 3, 12), xpd = TRUE)

# 3. DIBUJAR LA GRÁFICA CIRCULAR 
pie(hi_cont_porc, 
    labels = NA,  
    col = colores, 
    main = "Gráfica 5: Distribución Porcentual por Continente", 
    radius = 0.9) 

# 4. MARCAR LAS COORDENADAS DEL CUADRO DE LEYENDA
x0 <- 1.0    # Límite izquierdo
x1 <- 2.5    # Límite derecho
y1 <- 0.9    # Techo del cuadro
y0 <- -0.5   # Piso del cuadro

# 5. DIBUJAR EL CUADRO BLANCO DE FONDO
rect(xleft = x0, ybottom = y0, xright = x1, ytop = y1, col = "white", border = "black")

# 6. PONER EL TÍTULO DENTRO DE LA TARJETA
text(x = (x0 + x1)/2, y = y1 - 0.15, labels = "Continentes", font = 2, cex = 1.0)

# 7. LLENAR LA TARJETA CON LOS COLORES Y PORCENTAJES
legend(x = (x0 + x1)/2,             
       y = y1 - 0.25,      
       legend = etiquetas_leyenda, 
       fill = colores, 
       cex = 0.8,          
       bty = "n",                    
       xjust = 0.5,                  
       y.intersp = 1.4)

CONCLUSIÓN

CONCLUSIÓN DE LA VARIABLE CONTINENT

La distribución de frecuencias a nivel global indica una alta concentración de datos geoquímicos provenientes de minas archivadas ubicadas en el continente de América (tras unificar las regiones del norte y sur). Esta concentración resulta estratégica, ya que el reprocesamiento de esta información histórica incrementa significativamente el potencial para revaluar y perfilar nuevos yacimientos de minerales críticos en la región americana frente al resto de continentes documentados.