CARGA DE DATOS

CARGA DE DATOS

knitr::opts_chunk$set(
    echo = TRUE,                   # Muestra el código R en el reporte final.
    message = FALSE,
    warning = FALSE,               # Message y warning evitan que se impriman alertas o mensajes de carga estorbosos en el HTML.
    fig.align = "center"           # Centra automáticamente todas las gráficas generadas.
)

datos <- read.csv("C:/Users/USER/Documents/PROYECTO ESTADISTICA/CMDB_Data.csv", 
                  header = TRUE, # Indica que la primera fila contienen los nombres de las variables.
                  sep = ";",     # Define que los puntos y comas es el separador de las columnas del archivo.
                  dec = ".",     # Establece el punto como el operador decimal para los números.
                  fileEncoding = "latin1")

# Verificación inicial del set de datos
str(datos)
## 'data.frame':    1366 obs. of  103 variables:
##  $ ï..LAB_ID            : chr  "C355417" "C360759" "C360762" "C360763" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID1     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID2     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_LAB_ID3     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ FIELD_ID             : chr  "RM0001" "RM0027" "RM0030" "RM0031" ...
##  $ JOB_ID               : chr  "MRP11968" "MRP12307" "MRP12307" "MRP12307" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID1     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID2     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ PREVIOUS_JOB_ID3     : chr  "" "" "" "" ...
##  $ SUBMITTER            : chr  "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" "Rare Metals Task" ...
##  $ PROJECT_NAME         : chr  "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" "Critical and Rare Metals" ...
##  $ DATE_SUBMITTED       : chr  "30/6/2011" "31/8/2011" "31/8/2011" "31/8/2011" ...
##  $ COLLECTION           : chr  "Mackay-Keck Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" "Mackay-Stanford Ore Deposits Collection" ...
##  $ COLLECTION_ID        : chr  "PHNC08_39_1183" "OD21441" "OD22811" "OD25716" ...
##  $ CONTINENT            : chr  "North America" "South America" "South America" "Africa" ...
##  $ COUNTRY              : chr  "United States" "Chile" "Chile" "South Africa" ...
##  $ STATE_PROVINCE       : chr  "Nevada" "Antofagasta" "Tarapacá" "Transvaal" ...
##  $ COUNTY               : chr  "Lyon" "El Loa" "El Tamarugal" "" ...
##  $ DISTRICT_NAME        : chr  "Yerington" "Chuquicamata" "Collahuasi/Quebrada Blanca" "" ...
##  $ DEPOSIT_NAME         : chr  "Pumpkin Hollow" "" "" "" ...
##  $ MINE_NAME            : chr  "Pumpkin Hollow" "Chuquicamata mine" "Collahuasi district" "" ...
##  $ DISTRICT_NAME_COLLECT: chr  "Yerington" "" "" "" ...
##  $ DEPOSIT_NAME_COLLECT : chr  "" "" "" "" ...
##  $ MINE_NAME_COLLECT    : chr  "Pumpkin Hollow" "Chuquicamata" "Poduosa mine" "Messina Mines Ltd." ...
##  $ LOCATE_DESC          : chr  "" "" "Level 25" "" ...
##  $ LATITUDE             : chr  "38,94021" "-22,2871" "-21,0309" "-24,7" ...
##  $ LONGITUDE            : chr  "-119,05178" "-68,8991" "-68,74951" "29,3" ...
##  $ DATUM                : chr  "WGS84" "WGS84" "WGS84" "" ...
##  $ LATITUDE_COLLECT     : chr  "38,92492" "22,28944" "" "" ...
##  $ LONGITUDE_COLLECT    : chr  "-119,1071" "-68,90111" "" "" ...
##  $ DATUM_COLLECT        : chr  "" "WGS84" "" "" ...
##  $ COORDINATES_QUAL     : chr  "100 m" "Exact" "" "" ...
##  $ COORDINATES_SOURCE   : chr  "1) iTouchMap.com, approx, A. Orkild-Norton; 2) Mineral Resource Deposit Database Deposit ID 10174173, ore body, M. Granitto" "1) Mindat.org, approx, A. Orkild-Norton; 2) Open-File Report 2017-1079 ID 549, mine, M. Granitto" "1) No coordinates; 2) Mineral Resource Deposit Database Deposit ID 10057511, district, M. Granitto" "1) No coordinates; 2) Google Earth Pro, approx ctr of former province of Transvaal, M. Granitto" ...
##  $ PRIMARY_CLASS        : chr  "rock" "rock" "rock" "rock" ...
##  $ SYSTEM_TYPE          : chr  "IOA-IOCG" "Porphyry Cu-Mo-Au" "Porphyry Cu-Mo-Au" "IOA-IOCG" ...
##  $ DEPOSIT_TYPE         : chr  "IOCG" "Supergene Cu" "Porphyry Cu" "IOCG" ...
##  $ SAMPLE_DESC          : chr  "Nearly solid chalcopyrite mixed with small light brown irregular inclusions of unknown mineralogy; clouds of ma"| __truncated__ "Chalcocite-bronchatite-antlerite(?); highly microfractured igneous rock with green copper sulfates coating microfractures" "Bornite-chalcopyrite; mostly massive chalcopyrite with numerous inclusions of micro-chalcopyrite and widely sca"| __truncated__ "Massive chalcopyrite, IOCG in shear zone; mostly massive fine grain cuprite with widely distributed malachite t"| __truncated__ ...
##  $ Al_pct_AES_ST        : chr  "0,33" "6,65" "0,46" "0,7" ...
##  $ Ca_pct_AES_ST        : chr  "1,1" "0,4" "-0,1" "0,3" ...
##  $ Fe_pct_AES_ST        : chr  "42,4" "0,25" "6,98" "27,8" ...
##  $ K_pct_AES_ST         : chr  "-0,1" "6,1" "0,2" "-0,1" ...
##  $ Mg_pct_AES_ST        : chr  "0,57" "0,1" "0,01" "0,33" ...
##  $ Mn_pct_AES_ST        : chr  "0,02" "-0,01" "-0,01" "-0,01" ...
##  $ P_pct_AES_ST         : chr  "-0,01" "0,01" "0,05" "0,01" ...
##  $ S_pct_AES_ST         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Si_pct_AES_ST        : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Ti_pct_AES_ST        : chr  "0,01" "0,11" "-0,01" "-0,01" ...
##  $ F_pct_ISE_Fuse       : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Ag_ppm_MS_ST         : chr  "58" "6" "468" "16" ...
##  $ As_ppm_MS_ST         : chr  "-30" "-30" "90" "-30" ...
##  $ Au_ppm               : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Au_AM                : chr  "" "" "" "" ...
##  $ B_ppm_AES_ST         : int  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
##  $ Ba_ppm_AES_ST        : chr  "-0,5" "924" "121" "174" ...
##  $ Be_ppm_AES_ST        : int  -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 -5 ...
##  $ Bi_ppm_MS_ST         : chr  "1,5" "3,6" "190" "0,4" ...
##  $ Cd_ppm_MS_ST         : chr  "3,6" "-0,2" "0,9" "-0,2" ...
##  $ Ce_ppm_MS_ST         : chr  "0,4" "8,8" "16,3" "3,5" ...
##  $ Co_ppm_MS_ST         : chr  "209" "-0,5" "1,3" "44,8" ...
##  $ Cr_ppm_AES_ST        : int  -10 -10 -10 30 20 20 60 40 20 10 ...
##  $ Cs_ppm_MS_ST         : chr  "0,5" "1,4" "0,2" "-0,1" ...
##  $ Cu_ppm_AES_ST        : chr  "50000,11111" "23300" "50000,11111" "50000,11111" ...
##  $ Dy_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,32" "1,38" "0,37" ...
##  $ Er_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,22" "0,77" "0,23" ...
##  $ Eu_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,14" "0,17" "0,1" ...
##  $ Ga_ppm_MS_ST         : chr  "5" "15" "6" "3" ...
##  $ Gd_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,45" "1,5" "0,39" ...
##  $ Ge_ppm_MS_ST         : int  -1 5 -1 -1 3 8 8 1 2 2 ...
##  $ Hf_ppm_MS_ST         : int  -1 4 -1 -1 5 13 12 2 3 6 ...
##  $ Ho_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,07" "0,25" "0,07" ...
##  $ In_ppm_MS_ST         : chr  "6,4" "-0,2" "3,7" "0,2" ...
##  $ La_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "4,6" "7,2" "1,7" ...
##  $ Li_ppm_AES_ST        : int  -10 -10 -10 -10 30 20 20 20 -10 20 ...
##  $ Lu_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "-0,05" "0,08" "-0,05" ...
##  $ Mo_ppm_MS_ST         : chr  "-2" "60" "3" "2" ...
##  $ Nb_ppm_MS_ST         : chr  "-1" "4" "-1" "-1" ...
##  $ Nd_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "3,8" "9,1" "1,7" ...
##  $ Ni_ppm_AES_ST        : chr  "144" "6" "-5" "48" ...
##  $ Pb_ppm_MS_ST         : chr  "23" "16" "188" "39" ...
##  $ Pd_ppm_FA_MS         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Pr_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "1,09" "2,21" "0,46" ...
##  $ Pt_ppm_FA_MS         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Rb_ppm_MS_ST         : chr  "1,2" "148" "7,1" "0,7" ...
##  $ Re_ppm_MS_HF         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Sb_ppm_MS_ST         : chr  "1,2" "2,4" "2,9" "0,3" ...
##  $ Sc_ppm_AES_ST        : int  -5 -5 -5 -5 11 6 15 10 5 6 ...
##  $ Se_ppm_MS_ST         : int  NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA ...
##  $ Sm_ppm_MS_ST         : chr  "-0,1" "0,6" "1,6" "0,4" ...
##  $ Sn_ppm_MS_ST         : chr  "2" "3" "106" "-1" ...
##  $ Sr_ppm_AES_ST        : chr  "26,6" "114" "22,5" "38,4" ...
##  $ Ta_ppm_MS_ST         : chr  "-0,5" "-0,5" "-0,5" "-0,5" ...
##  $ Tb_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "0,07" "0,23" "-0,05" ...
##  $ Te_ppm_MS_ST         : chr  "" "" "" "" ...
##  $ Th_ppm_MS_ST         : chr  "0,2" "9,7" "2,6" "0,2" ...
##  $ Tl_ppm_MS_ST         : chr  "-0,5" "0,5" "-0,5" "-0,5" ...
##  $ Tm_ppm_MS_ST         : chr  "-0,05" "-0,05" "0,08" "-0,05" ...
##  $ U_ppm_MS_ST          : chr  "0,3" "1,75" "0,63" "34,8" ...
##  $ V_ppm_AES_ST         : int  51 24 -5 493 68 20 40 159 39 61 ...
##  $ W_ppm_MS_ST          : chr  "-1" "28" "22" "11" ...
##   [list output truncated]

Se cargaron correctamente los datos de todas las variables

ANÁLISIS DE FRECUENCIAS: CONCENTRACIÓN DEL HIERRO (Fe)

ANÁLISIS DE FRECUENCIAS: CONCENTRACIÓN DEL HIERRO (Fe)

# Cargar las librerías necesarias
library(dplyr)
library(gt)

#----------------------- PROCESAMIENTO Fe_pct_AES_ST -----------------------

# 1. Limpieza y preparación de la variable (conversión de coma a punto)
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))

# Separar registros con concentraciones válidas (>= 0) de los nulos o negativos
fe_numerico <- datos$Fe_pct_AES_ST[datos$Fe_pct_AES_ST >= 0 & !is.na(datos$Fe_pct_AES_ST)]
n_sin_datos_fe <- sum(is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) | datos$Fe_pct_AES_ST < 0)

# 2. Tabla de Frecuencias de los valores geoquímicos reales
TDF_VALIDOS_FE <- as.data.frame(table(fe_numerico), stringsAsFactors = FALSE)
colnames(TDF_VALIDOS_FE) <- c("CATEGORIA", "ni")

# Convertir categoría a numérico para ordenar de menor a mayor concentración (%)
TDF_VALIDOS_FE$CATEGORIA <- as.numeric(TDF_VALIDOS_FE$CATEGORIA)
TDF_VALIDOS_FE <- TDF_VALIDOS_FE[order(TDF_VALIDOS_FE$CATEGORIA), ]

# Definición de horizontes cuantitativos para el balance unificado
total_variable_fe <- sum(TDF_VALIDOS_FE$ni)         # Total de muestras con lecturas de Fe
total_general_fe  <- total_variable_fe + n_sin_datos_fe # Total absoluto de la matriz (1366)

# 3. Agrupación: Top 10 valores de concentración más bajos + Otras Concentraciones
if(nrow(TDF_VALIDOS_FE) > 10) {
  tabla_top_fe <- head(TDF_VALIDOS_FE, 10)
  sum_otros_fe <- sum(TDF_VALIDOS_FE$ni[11:nrow(TDF_VALIDOS_FE)])
  fila_otros_fe <- data.frame(CATEGORIA = "Otras Concentraciones", ni = sum_otros_fe)
  tabla_final_base_fe <- rbind(tabla_top_fe, fila_otros_fe)
} else {
  tabla_final_base_fe <- TDF_VALIDOS_FE
}

# Convertir CATEGORIA a carácter para permitir el ensamblaje de texto formal
tabla_final_base_fe$CATEGORIA <- as.character(tabla_final_base_fe$CATEGORIA)

# 4. Calcular frecuencias relativas (hi) respecto al total general del proyecto
tabla_final_base_fe$hi <- round((tabla_final_base_fe$ni / total_general_fe) * 100, 4)

# 5. FILA DEL TOTAL EXCLUSIVO DE LA VARIABLE (Muestras con datos de Hierro)
fila_total_var_fe <- data.frame(
  CATEGORIA = "TOTAL VARIABLE (Fe)", 
  ni = total_variable_fe,
  hi = round((total_variable_fe / total_general_fe) * 100, 4)
)

# 6. FILA DE CONTRASTE: REGISTROS SIN INFORMACIÓN ANALÍTICA (NAs / Negativos)
fila_sin_datos_fe <- data.frame(
  CATEGORIA = "Sin Datos", 
  ni = n_sin_datos_fe,
  hi = round((n_sin_datos_fe / total_general_fe) * 100, 4)
)

# 7. FILA DEL TOTAL GENERAL DEL PROYECTO
fila_total_general_fe <- data.frame(
  CATEGORIA = "TOTAL GENERAL", 
  ni = total_general_fe,
  hi = 100 # Cierre perfecto del balance estadístico
)

# 8. Consolidar la matriz final en el orden metodológico formal
tabla_final_fe <- rbind(tabla_final_base_fe, fila_total_var_fe, fila_sin_datos_fe, fila_total_general_fe)
colnames(tabla_final_fe) <- c("Valor Fe (%)", "ni", "hi")

#----------------------- GENERAR SALIDA ESTÉTICA CON 'gt' -----------------------
tabla_hierro_completa_gt <- tabla_final_fe %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 1**"),
    subtitle = md("Distribución de frecuencias para concentraciones de Hierro (Fe)")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  cols_label(
    `Valor Fe (%)` = "Valor Fe (%)",
    ni = "n (abs)",
    hi = "hi (%)"
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  ) %>%
  sub_missing(
    columns = everything(),
    missing_text = "-"
  )

# Renderizar la tabla en el documento
tabla_hierro_completa_gt
Tabla N° 1
Distribución de frecuencias para concentraciones de Hierro (Fe)
Valor Fe (%) n (abs) hi (%)
0.01 1 0.0732
0.02 3 0.2196
0.03 5 0.3660
0.04 5 0.3660
0.05 5 0.3660
0.06 5 0.3660
0.07 4 0.2928
0.08 4 0.2928
0.09 7 0.5124
0.1 3 0.2196
Otras Concentraciones 1293 94.6559
TOTAL VARIABLE (Fe) 1335 97.7306
Sin Datos 31 2.2694
TOTAL GENERAL 1366 100.0000
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

POLÍGONO DE FRECUENCIA

POLÍGONO DE FRECUENCIAS ABSOLUTAS DEL HIERRO

#----------------------- PROCESAMIENTO AUTOMÁTICO Fe_pct_AES_ST -----------------------

# 1. Conversión de la variable a numérico y limpieza de datos (Hierro)
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))

# Mantenemos el criterio estadístico: valores reales mayores o iguales a cero
Fe_VAR <- datos$Fe_pct_AES_ST[!is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) & datos$Fe_pct_AES_ST >= 0]

#----------------------- EXTRACCIÓN METODOLÓGICA DE STURGES -----------------------

# 2. Calculamos los parámetros de Sturges para el Hierro automáticamente
n_total_fe <- length(Fe_VAR)
k_sturges_fe <- floor(1 + 3.322 * log10(n_total_fe)) 

# 3. Definimos los cortes de intervalos (breaks) usando el rango real del Hierro
rango_fe <- max(Fe_VAR) - min(Fe_VAR)
amplitud_fe <- rango_fe / k_sturges_fe
breaks_sturges_fe <- seq(from = min(Fe_VAR), by = amplitud_fe, length.out = k_sturges_fe + 1)

# 4. CAPTURA DE DATOS OCULTOS: Agrupación y conteo en memoria para Hierro
hist_objeto_fe <- hist(Fe_VAR, breaks = breaks_sturges_fe, plot = FALSE, right = FALSE)

#----------------------- ANCLAJE A CERO -----------------------

# 5. Creamos las clases vacías a los extremos para que el polígono cierre en el eje X
mc_inicio_fe <- hist_objeto_fe$mids[1] - amplitud_fe
mc_final_fe  <- hist_objeto_fe$mids[length(hist_objeto_fe$mids)] + amplitud_fe

# Unimos los vectores definitivos para el gráfico (Marcas de Clase y Frecuencias n)
marcas_clase_fe <- c(mc_inicio_fe, hist_objeto_fe$mids, mc_final_fe)
frecuencias_fe  <- c(0, hist_objeto_fe$counts, 0)

# Detectamos la frecuencia máxima real del hierro para el eje Y
max_y_fe <- max(frecuencias_fe)

#----------------------- GRAFICAR POLÍGONO DE FRECUENCIAS (Hierro) -----------------------
par(mar = c(5, 5, 4, 2))

# 6. Inicializar el lienzo con los límites calculados para el Hierro
plot(marcas_clase_fe, frecuencias_fe,
     type = "n",
     main = "Gráfica 1: Polígono de Frecuencias Absolutas de Hierro (Fe)",
     xlab = "Concentración de Hierro - Fe (%)",
     ylab = "Frecuencia Absoluta (n muestras)",
     xlim = c(min(breaks_sturges_fe), max(breaks_sturges_fe)), # Ajuste exacto a los límites de hierro
     ylim = c(0, max_y_fe * 1.1),                             # Margen del 10% superior libre
     xaxt = "n", yaxt = "n",
     panel.first = grid(nx = NULL, ny = NULL, col = "gray90")) 

# 7. Dibujar el polígono (Color rojo óxido/fuego para el Hierro)
lines(marcas_clase_fe, frecuencias_fe, type = "b", pch = 19, col = "firebrick", lwd = 3)

# 8. Relleno translúcido a juego debajo de la curva
polygon(marcas_clase_fe, frecuencias_fe, col = rgb(0.70, 0.13, 0.13, 0.12), border = NA)

#----------------------- PERSONALIZACIÓN DE EJES CONTINUOS -----------------------

# Eje X: Imprime los límites reales de Sturges para el hierro (3 decimales)
axis(1, at = breaks_sturges_fe, labels = round(breaks_sturges_fe, 3), cex.axis = 0.75, las = 1)

# Eje Y: Imprime marcas proporcionales y ancla el valor de n más alto detectado
marcas_eje_y_fe <- pretty(c(0, max_y_fe))
marcas_eje_y_fe <- marcas_eje_y_fe[marcas_eje_y_fe < (max_y_fe * 0.9)] 
axis(2, at = c(marcas_eje_y_fe, max_y_fe), labels = c(marcas_eje_y_fe, max_y_fe), las = 1, cex.axis = 0.8)

ANÁLISIS GRÁFICO: HISTOGRAMA DISTRIBUCIÓN DEL HIERRO

HISTOGRAMA DISTRIBUCIÓN DEL HIERRO

#----------------------- PROCESAMIENTO Fe_pct_AES_ST -----------------------

# 1. Conversión de Fe_pct_AES_ST a numérico (blindado contra comas y textos)
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))

# Creamos variable de trabajo para las gráficas y FILTRAMOS los negativos
Fe_VAR <- datos$Fe_pct_AES_ST
Fe_VAR <- Fe_VAR[Fe_VAR >= 0 & !is.na(Fe_VAR)] # Mantenemos solo valores >= 0

#----------------------- TABLA DE FRECUENCIAS SIMPLIFICADA -----------------------
# Al ser continua, agrupamos por rangos automáticos (bins) para que la gráfica sea legible

k_simplificado <- 5
# Usamos pretty para obtener cortes redondeados y estéticos
breaks_s <- pretty(Fe_VAR, n = k_simplificado)
HistogramaFe <- hist(Fe_VAR, breaks = breaks_s, plot = FALSE)

# 2. Generación del Histograma
# Mantenemos la lógica original aplicada ahora al Hierro filtrado
hist(Fe_VAR,
     breaks = breaks_s,
     main = "Gráfica 2: Distribución de Fe_pct_AES_ST (Simplificada)",
     xlab = "Concentración de Fe (%)",
     ylab = "Cantidad de muestras",
     col = "indianred",  # Color rojizo/óxido ajustado para el Hierro
     right = FALSE,
     ylim = c(0, 800))

ANÁLISIS DESCRIPTIVO Y AGRUPACIÓN EN CLASES (STRUGES) DEL HIERRO

ANÁLISIS DESCRIPTIVO Y AGRUPACIÓN EN CLASES (STRUGES) DEL HIERRO

# Cargar las librerías necesarias
library(dplyr)
library(gt)

#------------------------- PREPARACIÓN DE DATOS (Hierro) -------------------------
# Reemplazamos comas por puntos
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))

# Creamos la variable de trabajo HIERRO y FILTRAMOS LOS NEGATIVOS y NAs
HIERRO <- datos$Fe_pct_AES_ST
HIERRO <- HIERRO[HIERRO >= 0 & !is.na(HIERRO)]

#------------------------- ANÁLISIS ESTADÍSTICO -------------------------
cat("\n=======================================================\n")
## 
## =======================================================
cat("ANÁLISIS DE CONCENTRACIÓN (Fe_pct_AES_ST):\n")
## ANÁLISIS DE CONCENTRACIÓN (Fe_pct_AES_ST):
cat("La concentración promedio es: ", round(mean(HIERRO, na.rm = TRUE), 2), " % \n")
## La concentración promedio es:  13.76  %
cat("La concentración máxima detectada es: ", max(HIERRO, na.rm = TRUE), " % \n")
## La concentración máxima detectada es:  68.6  %
cat("Total de muestras analizadas: ", sum(!is.na(HIERRO)), " registros \n")
## Total de muestras analizadas:  1335  registros
cat("=======================================================\n\n")
## =======================================================
#------------------------- TABLA DE FRECUENCIAS - STURGES -------------------------
R <- max(HIERRO, na.rm = TRUE) - min(HIERRO, na.rm = TRUE)
k <- floor(1 + 3.3 * log10(length(HIERRO)))
A <- R / k

liminf <- seq(from = min(HIERRO, na.rm = TRUE), by = A, length.out = k)
limsup <- liminf + A
MC <- (liminf + limsup) / 2

n <- numeric(k)
for (i in 1:k) {
  if (i == k) {
    n[i] <- sum(HIERRO >= liminf[i] & HIERRO <= limsup[i], na.rm = TRUE)
  } else {
    n[i] <- sum(HIERRO >= liminf[i] & HIERRO < limsup[i], na.rm = TRUE)
  }
}

hi <- n / sum(n) * 100
Ni_asc <- cumsum(n)
Hi_asc <- cumsum(hi)
Ni_desc <- rev(cumsum(rev(n)))
Hi_desc <- rev(cumsum(rev(hi)))

#------------------------- CONSTRUCCIÓN DE LA TABLA -------------------------
TablaFe_Sturges <- data.frame(
  Clase = as.character(1:k), # Convertido a carácter para permitir unir la fila "**TOTALES**"
  liminf = round(liminf, 3),
  limsup = round(limsup, 3),
  MC = round(MC, 3),
  n = n,
  hi = round(hi, 2),
  Ni_asc = Ni_asc,
  Hi_asc = round(Hi_asc, 2),
  Ni_desc = Ni_desc,
  Hi_desc = round(Hi_desc, 2)
)

# Creamos la fila de TOTALES con formato de texto para el reporte
fila_totales <- data.frame(
  Clase = "**TOTALES**",
  liminf = NA,
  limsup = NA,
  MC = NA,
  n = sum(n),
  hi = sum(hi),
  Ni_asc = NA,
  Hi_asc = 100,
  Ni_desc = NA,
  Hi_desc = 100
)

# Unimos la tabla con los totales
TablaFe_Final <- rbind(TablaFe_Sturges, fila_totales)

#------------------------- MOSTRAR TABLA FINAL CON 'gt' -------------------------
tabla_sturges_fe_gt <- TablaFe_Final %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 2**"),
    subtitle = md("Distribución de frecuencias para concentraciones de Hierro (Fe) <br> mediante Regla de Sturges")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  fmt_markdown(columns = Clase) %>% # Permite renderizar las negritas en "**TOTALES**"
  cols_label(
    Clase = "Clase",
    liminf = "Linf (%)",
    limsup = "Lsup (%)",
    MC = "MC (%)",
    n = "n (abs)",
    hi = "hi (%)",
    Ni_asc = "Ni (↑)",
    Hi_asc = "Hi (↑)",
    Ni_desc = "Ni (↓)",
    Hi_desc = "Hi (↓)"
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  ) %>%
  sub_missing(
    columns = everything(),
    missing_text = "NA"
  )

# Renderizar la tabla en el documento
tabla_sturges_fe_gt
Tabla N° 2
Distribución de frecuencias para concentraciones de Hierro (Fe)
mediante Regla de Sturges
Clase Linf (%) Lsup (%) MC (%) n (abs) hi (%) Ni (↑) Hi (↑) Ni (↓) Hi (↓)
1 0.010 6.245 3.128 584 43.75 584 43.75 1335 100.00
2 6.245 12.481 9.363 228 17.08 812 60.82 751 56.25
3 12.481 18.716 15.599 145 10.86 957 71.69 523 39.18
4 18.716 24.952 21.834 97 7.27 1054 78.95 378 28.31
5 24.952 31.187 28.070 98 7.34 1152 86.29 281 21.05
6 31.187 37.423 34.305 52 3.90 1204 90.19 183 13.71
7 37.423 43.658 40.540 53 3.97 1257 94.16 131 9.81
8 43.658 49.894 46.776 35 2.62 1292 96.78 78 5.84
9 49.894 56.129 53.011 24 1.80 1316 98.58 43 3.22
10 56.129 62.365 59.247 11 0.82 1327 99.40 19 1.42
11 62.365 68.600 65.482 8 0.60 1335 100.00 8 0.60
TOTALES NA NA NA 1335 100.00 NA 100.00 NA 100.00
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

HISTOGRAMA MEJORADO DE LA VARIABLE

HISTOGRAMA MEJORADO

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS (Hierro) -----------------------
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))
HIERRO <- datos$Fe_pct_AES_ST[!is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) & datos$Fe_pct_AES_ST >= 0]

#----------------------- INTERVALOS AMPLIADOS PARA AGRUPACIÓN -----------------------
max_real <- max(HIERRO)

# Los datos llegan muy lejos, agrupamos de 5 en 5.
paso <- ifelse(max_real > 50, 5, ifelse(max_real > 15, 2, 1))

# Calculamos el límite superior garantizando que cubra todos los datos
limite_superior <- ceiling(max_real / paso) * paso
breaks_entero <- seq(0, limite_superior, by = paso)

# Cálculo de la tabla de frecuencias
h_data <- hist(HIERRO, breaks = breaks_entero, plot = FALSE)
MC <- h_data$mids
Ni_asc <- cumsum(h_data$counts)
Ni_desc <- rev(cumsum(rev(h_data$counts)))

#----------------------- 1. HISTOGRAMA AGRUPADO Y LIMPIO -----------------------
# Aumentamos ligeramente el ancho 
par(mar=c(5, 5, 5, 2))

h_plot <- hist(HIERRO, breaks = breaks_entero,
               main = "Gráfica 3: Distribución del Contenido de Hierro (%)",
               xlab = "Contenido de Hierro (%)",
               ylab = "Frecuencia (Cantidad)",
               col = "indianred", border = "darkred", 
               xaxt = "n",  
               las = 1,
               ylim = c(0, max(h_data$counts) * 1.15)) 

# Eje X con los nuevos cortes (de 5 en 5)
axis(1, at = breaks_entero, labels = breaks_entero, font = 2)

# Etiquetas con tamaño ajustado para evitar superposición
text(h_plot$mids, h_plot$counts, 
     labels = h_plot$counts,
     adj = c(0.5, -0.5), 
     cex = 0.8, 
     font = 2, 
     col = "black")

ANÁLISIS VISUAL ACUMULADO: OJIVA ASCENDENTE Y DESCENDENTE

OJIVAS ni y hi

#----------------------- 2. OJIVA INTEGRADA Y PROFESIONAL (Hierro) -----------------------
# Restauramos los márgenes a la normalidad ya que pondremos la leyenda adentro
par(mar=c(5, 5, 4, 2))

plot(MC, Ni_asc,
     main = "Gráfica 4: Ojiva Acumulada de Frecuencias de Hierro (ni)",
     xlab = "Contenido de Hierro (%)",
     ylab = "Frecuencia Acumulada (N muestras)",
     type = "b", pch = 19, col = "darkred", lwd = 3,
     xaxt = "n", las = 1,
     ylim = c(0, max(Ni_asc) * 1.05),
     panel.first = grid(nx = NULL, ny = NULL, col = "gray90")) # Rejilla de fondo

# Segunda línea (Descendente)
lines(MC, Ni_desc, type = "b", pch = 17, col = "steelblue", lwd = 3, lty = 2)

# Eje X con los intervalos (usando la variable breaks_entero calculada en el paso anterior)
axis(1, at = breaks_entero, labels = breaks_entero)

# Leyenda reubicada en el espacio vacío del lado derecho para una estética limpia
legend("right",
       legend = c("Acumulada Menor que (Ascendente)", "Acumulada Mayor que (Descendente)"),
       col = c("darkred", "steelblue"),
       lty = c(1, 2),
       pch = c(19, 17),
       lwd = 2,
       title = "Tipo de Ojiva",
       bty = "n",  # Sin caja de borde para que se fusione con el fondo
       cex = 0.85) # Tamaño de letra ajustado

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS (Hierro) -----------------------
# Conversión a numérico (reemplazo de comas por puntos)
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))

# Variable de trabajo limpia (valores mayores o iguales a cero)
Fe_VAR <- datos$Fe_pct_AES_ST[!is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) & datos$Fe_pct_AES_ST >= 0]

# Estructuración de intervalos (Sturges de forma automatizada)
n_total_fe <- length(Fe_VAR)
k_sturges_fe <- floor(1 + 3.322 * log10(n_total_fe)) 
rango_fe <- max(Fe_VAR) - min(Fe_VAR)
amplitud_fe <- rango_fe / k_sturges_fe
breaks_fe <- seq(from = min(Fe_VAR), by = amplitud_fe, length.out = k_sturges_fe + 1)

# Extracción en memoria de las frecuencias absolutas
h_data_fe <- hist(Fe_VAR, breaks = breaks_fe, plot = FALSE, right = FALSE)

# EL CAMBIO: Extracción de marcas de clase y cálculo de frecuencias relativas (hi)
MC_fe <- h_data_fe$mids
hi_fe <- (h_data_fe$counts / sum(h_data_fe$counts)) * 100

# Acumuladas en formato porcentual (Hi)
Hi_asc_fe  <- cumsum(hi_fe)
Hi_desc_fe <- rev(cumsum(rev(hi_fe)))


#-----------------------  OJIVA PROFESIONAL EN PORCENTAJES (Hierro) -----------------------
# Restauramos los márgenes a la normalidad
par(mar=c(5, 5, 4, 2))

plot(MC_fe, Hi_asc_fe,
     main = "Gráfica 5: Ojiva Acumulada de Frecuencias de Hierro (hi)",
     xlab = "Contenido de Hierro (%)",
     ylab = "Frecuencia Relativa Acumulada (%)",
     type = "b", pch = 19, col = "darkred", lwd = 3,
     xaxt = "n", las = 1,
     ylim = c(0, 105), # Escala fija de 0 a 105% ideal para frecuencias relativas
     panel.first = grid(nx = NULL, ny = NULL, col = "gray90")) # Rejilla de fondo

# Segunda línea (Descendente / Mayor que)
lines(MC_fe, Hi_desc_fe, type = "b", pch = 17, col = "steelblue", lwd = 3, lty = 2)

# Eje X con los intervalos exactos redondeados a 2 decimales
axis(1, at = breaks_fe, labels = round(breaks_fe, 2), cex.axis = 0.8)

# Leyenda adaptada a la escala de porcentajes
legend("right",
       legend = c("Acumulada Menor que (Ascendente %)", "Acumulada Mayor que (Descendente %)"),
       col = c("darkred", "steelblue"),
       lty = c(1, 2),
       pch = c(19, 17),
       lwd = 2,
       title = "Tipo de Ojiva",
       bty = "n",  # Sin caja de borde
       cex = 0.85) # Tamaño de letra ajustado

ANÁLISIS VISUAL POR RANGOS DE Fe_pct_AES_ST

ANÁLISI VISUAL POR RANGOS

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS (Hierro) -----------------------
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))
Fe_VAR <- datos$Fe_pct_AES_ST[!is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) & datos$Fe_pct_AES_ST >= 0]

#----------------------- CÁLCULO DE INTERVALOS (STURGES) -----------------------
k <- floor(1 + 3.322 * log10(length(Fe_VAR)))
R_rango <- max(Fe_VAR) - min(Fe_VAR)
A_amplitud <- R_rango / k

breaks_fe <- seq(from = min(Fe_VAR), by = A_amplitud, length.out = k + 1)
h_info <- hist(Fe_VAR, breaks = breaks_fe, plot = FALSE, right = FALSE)

intervalos <- paste0("[", round(h_info$breaks[-length(h_info$breaks)], 2), 
                     " - ", round(h_info$breaks[-1], 2), ")")

colores_hist <- colorRampPalette(c("#ef9a9a", "#b71c1c"))(length(h_info$counts))

#----------------------- HISTOGRAMA Y LEYENDA CORREGIDA -----------------------
# Aumentamos el margen inferior (7) para que los números verticales quepan bien
par(mar=c(7, 5, 5, 12), xpd=TRUE)

hist(Fe_VAR, breaks = breaks_fe,
     main = "Gráfica 6: Distribución de Fe_pct_AES_ST (Regla de Sturges)",
     xlab = "", # Quitamos el título general del eje X para que no choque con los números
     ylab = "Frecuencia (Cantidad)",
     col = colores_hist,
     border = "white",
     labels = TRUE,    
     right = FALSE,
     las = 1,
     xaxt = "n",       
     ylim = c(0, max(h_info$counts) * 1.15)) 

# Título del eje X desplazado hacia abajo
mtext("Contenido de Hierro (%)", side = 1, line = 5, font = 1)

# Eje X dinámico: Forzamos la rotación (las = 2) y ajustamos tamaño (cex.axis = 0.8)
axis(1, at = breaks_fe, 
     labels = round(breaks_fe, 2), 
     font = 2, 
     las = 1, 
     cex.axis = 0.8)

# Leyenda lateral con los intervalos matemáticos
legend("topright", inset=c(-0.25, 0),
       legend = intervalos,
       fill = colores_hist,
       title = "Intervalos (%)",
       cex = 0.85, bty = "n")

BOXPLOT

BOXPLOTS DE VALORES ATÍPICOS Y DISTRIBUCIÓN LIMPIA

#----------------------- PREPARACIÓN DE DATOS (Hierro) -----------------------
# Conversión a numérico y limpieza de valores nulos o en cero
datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))
Fe_VAR <- datos$Fe_pct_AES_ST[!is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) & datos$Fe_pct_AES_ST > 0]

#----------------------- 2. BOXPLOT: ANÁLISIS DE VALORES ATÍPICOS -----------------------
par(mar=c(5, 6, 5, 2), xpd = FALSE)

# Cálculos estadísticos previos
stats_fe <- boxplot.stats(Fe_VAR)
media_fe  <- round(mean(Fe_VAR), 2)
mediana_fe <- round(median(Fe_VAR), 2)
n_outliers <- length(stats_fe$out)

# Generación del Boxplot
boxplot(Fe_VAR, horizontal = TRUE, col = "indianred", border = "darkred",
        main = "Gráfica 7: Análisis de Valores Atípicos (Hierro)", 
        xlab = "Concentración de Hierro (%)",
        pch = 21, 
        bg = "red", 
        outcol = "darkred", # Parámetro correcto para el borde de los atípicos
        frame = FALSE)

# Punto de Media y etiquetas de texto mejor ubicadas
points(media_fe, 1, 
       col = "blue", 
       pch = 18, 
       cex = 2)

text(media_fe, 1.25, 
     labels = paste("Media:", media_fe), 
     col = "blue", 
     font = 2, 
     cex = 0.9)

text(mediana_fe, 0.75, 
     labels = paste("Mediana:", mediana_fe), 
     col = "darkred", 
     font = 2, 
     cex = 0.9)

# Leyenda
legend("topright", 
       legend = paste("Atípicos detectados:", n_outliers),
       pch = 21, 
       pt.bg = "red", 
       bty = "n", 
       text.col = "darkred", 
       cex = 0.9)

#----------------------- 3. BOXPLOT: DISTRIBUCIÓN LIMPIA (HIERRO) -----------------------
par(mar=c(5, 6, 5, 2))

# Generación del Boxplot sin valores atípicos (outline = FALSE)
boxplot(Fe_VAR, 
        horizontal = TRUE, 
        outline = FALSE, 
        col = "indianred", 
        border = "darkred",
        main = "Gráfica 8: Distribución del Hierro (Sin Atípicos)", 
        xlab = "Concentración de Hierro (%)", 
        frame = FALSE)

# Agregar cuadrícula de fondo para facilitar la lectura
grid(nx = NULL, 
     ny = NA, 
     col = "gray85", 
     lty = "dashed")

# Valores sobre la vista limpia (Media en azul y Mediana del color del borde)
points(media_fe, 1, 
       col = "blue", 
       pch = 18, 
       cex = 2)

text(media_fe, 1.25, 
     labels = paste("Media:", media_fe), 
     col = "blue", 
     font = 2, 
     cex = 0.9)

text(mediana_fe, 0.75, 
     labels = paste("Mediana:", mediana_fe), 
     col = "darkred", 
     font = 2, 
     cex = 0.9)

RESUMEN DESCRIPTIVO

RESUMEN DESCRIPTIVO

# Cargar las librerías necesarias
library(dplyr)
library(gt)
library(e1071) # Necesaria para los cálculos de Asimetría y Curtosis

#----------------------- ANÁLISIS ESTADÍSTICO Fe_pct_AES_ST -----------------------

# 0. Limpieza automática de nombres (elimina espacios invisibles)
colnames(datos) <- trimws(colnames(datos))

# 1. Preparación de la variable y cálculos estadísticos
if("Fe_pct_AES_ST" %in% colnames(datos)) {

  # Conversión a numérico (reemplazo de coma por punto)
  datos$Fe_pct_AES_ST <- suppressWarnings(as.numeric(gsub(",", ".", as.character(datos$Fe_pct_AES_ST))))

  # 2. Limpieza de valores nulos o negativos para el análisis real de Ley
  Fe_LIMPIA <- datos$Fe_pct_AES_ST[!is.na(datos$Fe_pct_AES_ST) & datos$Fe_pct_AES_ST >= 0]

  # 3. Matriz de parámetros estadísticos descriptivos
  resumen_stats_Fe <- data.frame(
    Estadistico = c("Tamaño muestral (n)", 
                    "Mínimo (%)", 
                    "Máximo (%)", 
                    "Media (%)", 
                    "Mediana (%)",
                    "Desviación Estándar", 
                    "Coef. Variación (%)", 
                    "Asimetría", 
                    "Curtosis"),
    Valor = c(
      length(Fe_LIMPIA),
      min(Fe_LIMPIA),
      max(Fe_LIMPIA),
      mean(Fe_LIMPIA),
      median(Fe_LIMPIA),
      sd(Fe_LIMPIA),
      (sd(Fe_LIMPIA) / mean(Fe_LIMPIA)) * 100,
      skewness(Fe_LIMPIA, type = 2),
      kurtosis(Fe_LIMPIA)
    )
  )

  # 4. Redondeo técnico uniforme a dos decimales
  resumen_stats_Fe$Valor <- round(resumen_stats_Fe$Valor, 2)
  
} else {
  stop("¡ERROR! La columna 'Fe_pct_AES_ST' no existe en el dataset. Verifique el nombre en su archivo de origen.")
}

#----------------------- SALIDA ESTÉTICA CON 'gt' -----------------------
tabla_stats_fe_gt <- resumen_stats_Fe %>%
  gt() %>%
  tab_header(
    title = md("**Tabla N° 3**"),
    subtitle = md("Estadística Descriptiva para Concentraciones de Hierro (Fe)")
  ) %>%
  tab_source_note(
    source_note = md("Autores: Grupo 1 <br> Semestre 2026 - 2026")
  ) %>%
  cols_label(
    Estadistico = "Parámetro Estadístico",
    Valor = "Resultado"
  ) %>%
  tab_options(
    table.border.top.color = "black",
    table.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.color = "black",
    heading.border.bottom.width = px(2),
    column_labels.border.top.color = "black",
    column_labels.border.bottom.color = "black",
    column_labels.border.bottom.width = px(2),
    table_body.hlines.color = "gray",
    table_body.border.bottom.color = "black",
    row.striping.include_table_body = TRUE
  )

# Renderizar la tabla final en el reporte
tabla_stats_fe_gt
Tabla N° 3
Estadística Descriptiva para Concentraciones de Hierro (Fe)
Parámetro Estadístico Resultado
Tamaño muestral (n) 1335.00
Mínimo (%) 0.01
Máximo (%) 68.60
Media (%) 13.76
Mediana (%) 8.36
Desviación Estándar 14.69
Coef. Variación (%) 106.74
Asimetría 1.30
Curtosis 1.00
Autores: Grupo 1
Semestre 2026 - 2026

CONCLUSIÓN

CONCLUSIÓN DE LA VARIABLE FE_pct_AES_ST

El estudio estadístico aplicado a 1335.00 muestras de hierro establece un rango de leyes entre 0.01% y 68.60%. El yacimiento registra una media de 13.76% y una mediana de 8.36%, denotando una importante heterogeneidad interna sustentada por una desviación estándar de 14.69 y un coeficiente de variación de 106.74%. Finalmente, los estadísticos de forma ratifican una distribución asimétrica positiva de 1.30 junto a una curtosis de 1.00, demostrando que el volumen de roca está compuesto mayoritariamente por leyes moderadas a bajas, alternadas puntualmente con zonas de enriquecimiento supérgeno o primario de alta ley.