1 Tujuan Latihan

Latihan ini bertujuan untuk memperkenalkan dasar-dasar visualisasi data menggunakan ggplot2 melalui studi kasus squirrel data. Mahasiswa diharapkan mampu:

  1. Membaca dan memahami struktur data.
  2. Membuat visualisasi sederhana menggunakan ggplot2.
  3. Menggunakan aesthetic mapping seperti x, y, color, fill, dan shape.
  4. Membandingkan pola antar kelompok menggunakan visualisasi.
  5. Menulis interpretasi berdasarkan grafik.

2 Persiapan Package

library(tidyverse)

3 Membaca Data

Gunakan file data squirrel dalam format .csv. Pastikan file berada pada folder kerja yang sama dengan file R Markdown ini.

squirrels_url <- paste0("https://raw.githubusercontent.com/rfordatascience/tidytuesday/","master/data/2019/2019-10-29/nyc_squirrels.csv")
squirrel <- read.csv(squirrels_url)

glimpse(squirrel)
## Rows: 3,023
## Columns: 36
## $ long                                       <dbl> -73.95613, -73.95704, -73.9…
## $ lat                                        <dbl> 40.79408, 40.79485, 40.7667…
## $ unique_squirrel_id                         <chr> "37F-PM-1014-03", "37E-PM-1…
## $ hectare                                    <chr> "37F", "37E", "02E", "05D",…
## $ shift                                      <chr> "PM", "PM", "AM", "PM", "AM…
## $ date                                       <int> 10142018, 10062018, 1010201…
## $ hectare_squirrel_number                    <int> 3, 3, 3, 5, 1, 2, 2, 3, 9, …
## $ age                                        <chr> NA, "Adult", "Adult", "Juve…
## $ primary_fur_color                          <chr> NA, "Gray", "Cinnamon", "Gr…
## $ highlight_fur_color                        <chr> NA, "Cinnamon", NA, NA, NA,…
## $ combination_of_primary_and_highlight_color <chr> "+", "Gray+Cinnamon", "Cinn…
## $ color_notes                                <chr> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,…
## $ location                                   <chr> NA, "Ground Plane", "Above …
## $ above_ground_sighter_measurement           <chr> NA, "FALSE", "4", "3", NA, …
## $ specific_location                          <chr> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,…
## $ running                                    <lgl> FALSE, TRUE, FALSE, FALSE, …
## $ chasing                                    <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ climbing                                   <lgl> FALSE, FALSE, TRUE, TRUE, F…
## $ eating                                     <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ foraging                                   <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ other_activities                           <chr> NA, NA, NA, NA, "unknown", …
## $ kuks                                       <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ quaas                                      <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ moans                                      <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ tail_flags                                 <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ tail_twitches                              <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ approaches                                 <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ indifferent                                <lgl> FALSE, FALSE, TRUE, FALSE, …
## $ runs_from                                  <lgl> FALSE, TRUE, FALSE, TRUE, F…
## $ other_interactions                         <chr> NA, "me", NA, NA, NA, NA, N…
## $ lat_long                                   <chr> "POINT (-73.9561344937861 4…
## $ zip_codes                                  <int> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,…
## $ community_districts                        <int> 19, 19, 19, 19, 19, 19, 19,…
## $ borough_boundaries                         <int> 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, …
## $ city_council_districts                     <int> 19, 19, 19, 19, 19, 19, 19,…
## $ police_precincts                           <int> 13, 13, 13, 13, 13, 13, 13,…

4 Pemeriksaan Awal Data

names(squirrel)
##  [1] "long"                                      
##  [2] "lat"                                       
##  [3] "unique_squirrel_id"                        
##  [4] "hectare"                                   
##  [5] "shift"                                     
##  [6] "date"                                      
##  [7] "hectare_squirrel_number"                   
##  [8] "age"                                       
##  [9] "primary_fur_color"                         
## [10] "highlight_fur_color"                       
## [11] "combination_of_primary_and_highlight_color"
## [12] "color_notes"                               
## [13] "location"                                  
## [14] "above_ground_sighter_measurement"          
## [15] "specific_location"                         
## [16] "running"                                   
## [17] "chasing"                                   
## [18] "climbing"                                  
## [19] "eating"                                    
## [20] "foraging"                                  
## [21] "other_activities"                          
## [22] "kuks"                                      
## [23] "quaas"                                     
## [24] "moans"                                     
## [25] "tail_flags"                                
## [26] "tail_twitches"                             
## [27] "approaches"                                
## [28] "indifferent"                               
## [29] "runs_from"                                 
## [30] "other_interactions"                        
## [31] "lat_long"                                  
## [32] "zip_codes"                                 
## [33] "community_districts"                       
## [34] "borough_boundaries"                        
## [35] "city_council_districts"                    
## [36] "police_precincts"
summary(squirrel)
##       long             lat        unique_squirrel_id   hectare         
##  Min.   :-73.98   Min.   :40.76   Length:3023        Length:3023       
##  1st Qu.:-73.97   1st Qu.:40.77   Class :character   Class :character  
##  Median :-73.97   Median :40.78   Mode  :character   Mode  :character  
##  Mean   :-73.97   Mean   :40.78                                        
##  3rd Qu.:-73.96   3rd Qu.:40.79                                        
##  Max.   :-73.95   Max.   :40.80                                        
##                                                                        
##     shift                date          hectare_squirrel_number
##  Length:3023        Min.   :10062018   Min.   : 1.000         
##  Class :character   1st Qu.:10082018   1st Qu.: 2.000         
##  Mode  :character   Median :10122018   Median : 3.000         
##                     Mean   :10119487   Mean   : 4.124         
##                     3rd Qu.:10142018   3rd Qu.: 6.000         
##                     Max.   :10202018   Max.   :23.000         
##                                                               
##      age            primary_fur_color  highlight_fur_color
##  Length:3023        Length:3023        Length:3023        
##  Class :character   Class :character   Class :character   
##  Mode  :character   Mode  :character   Mode  :character   
##                                                           
##                                                           
##                                                           
##                                                           
##  combination_of_primary_and_highlight_color color_notes       
##  Length:3023                                Length:3023       
##  Class :character                           Class :character  
##  Mode  :character                           Mode  :character  
##                                                               
##                                                               
##                                                               
##                                                               
##    location         above_ground_sighter_measurement specific_location 
##  Length:3023        Length:3023                      Length:3023       
##  Class :character   Class :character                 Class :character  
##  Mode  :character   Mode  :character                 Mode  :character  
##                                                                        
##                                                                        
##                                                                        
##                                                                        
##   running         chasing         climbing         eating       
##  Mode :logical   Mode :logical   Mode :logical   Mode :logical  
##  FALSE:2293      FALSE:2744      FALSE:2365      FALSE:2263     
##  TRUE :730       TRUE :279       TRUE :658       TRUE :760      
##                                                                 
##                                                                 
##                                                                 
##                                                                 
##   foraging       other_activities      kuks           quaas        
##  Mode :logical   Length:3023        Mode :logical   Mode :logical  
##  FALSE:1588      Class :character   FALSE:2921      FALSE:2973     
##  TRUE :1435      Mode  :character   TRUE :102       TRUE :50       
##                                                                    
##                                                                    
##                                                                    
##                                                                    
##    moans         tail_flags      tail_twitches   approaches     
##  Mode :logical   Mode :logical   Mode :logical   Mode :logical  
##  FALSE:3020      FALSE:2868      FALSE:2589      FALSE:2845     
##  TRUE :3         TRUE :155       TRUE :434       TRUE :178      
##                                                                 
##                                                                 
##                                                                 
##                                                                 
##  indifferent     runs_from       other_interactions   lat_long        
##  Mode :logical   Mode :logical   Length:3023        Length:3023       
##  FALSE:1569      FALSE:2345      Class :character   Class :character  
##  TRUE :1454      TRUE :678       Mode  :character   Mode  :character  
##                                                                       
##                                                                       
##                                                                       
##                                                                       
##    zip_codes     community_districts borough_boundaries city_council_districts
##  Min.   :10090   Min.   :11          Min.   :4          Min.   :19.00         
##  1st Qu.:12081   1st Qu.:19          1st Qu.:4          1st Qu.:19.00         
##  Median :12420   Median :19          Median :4          Median :19.00         
##  Mean   :11828   Mean   :19          Mean   :4          Mean   :19.07         
##  3rd Qu.:12423   3rd Qu.:19          3rd Qu.:4          3rd Qu.:19.00         
##  Max.   :12423   Max.   :23          Max.   :4          Max.   :51.00         
##  NA's   :3014                                                                 
##  police_precincts
##  Min.   :10      
##  1st Qu.:13      
##  Median :13      
##  Mean   :13      
##  3rd Qu.:13      
##  Max.   :18      
##

Tuliskan penjelasan singkat mengenai struktur data.

Interpretasi: Dalam dataset squirrels terdapat 36 kolom dan 3.029 baris.Data numerik: 9, Data kategori: 27

5 1. Distribusi Warna Bulu Tupai

Buat grafik batang untuk melihat warna bulu tupai yang paling banyak ditemukan.

ggplot(squirrel, aes(x = primary_fur_color)) +
  geom_bar() +
  labs(
    title = "Distribution of Squirrel Fur Color",
    x = "Fur Color",
    y = "Count"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Warna bulu apa yang paling dominan?

Interpretasi:

Berdasarkan grafik batang di atas, warna bulu tupai yang paling banyak adalah warna abu-abu.Dengan jumlah tupai abu-abu di atas 2000.

6 2. Distribusi Lokasi Berdasarkan Koordinat X

Gunakan histogram untuk melihat penyebaran tupai berdasarkan koordinat X.

ggplot(squirrel, aes(x = long)) +
  geom_histogram(bins = 30) +
  labs(
    title = "Distribution of Squirrel Location Based on X Coordinate",
    x = "X Coordinate",
    y = "Frequency"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Apakah lokasi pengamatan tupai terkonsentrasi pada area tertentu?

Interpretasi: Pada grafik histogram di atas menunjukkan bahwa pengamatan tupai terkonsentrasi di sekitar -73.97

7 3. Sebaran Spasial Tupai

Buat scatter plot untuk menggambarkan lokasi tupai berdasarkan koordinat x dan y.

ggplot(squirrel, aes(x = long, y = lat)) +
  geom_point(alpha = 0.6) +
  labs(
    title = "Spatial Distribution of Squirrels",
    x = "X Coordinate",
    y = "Y Coordinate"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Bagaimana pola sebaran tupai secara spasial?

Interpretasi: Berdasarkan scatter plot di atas, persebaran pola tupai di titik (-73.975, 40.785) mengalami keunikan. Mereka cenderung menghindari titik tersebut. Kemungkinan dalam kasus tersebut, daerah memiliki kubangan/danau yang tidak bisa dilewati oleh para tupai.

8 4. Sebaran Spasial Berdasarkan Warna Bulu

Tambahkan warna pada scatter plot berdasarkan primary_fur_color.

ggplot(squirrel, aes(x = long, y = lat, color = primary_fur_color)) +
  geom_point(alpha = 0.6) +
  labs(
    title = "Spatial Distribution of Squirrels by Fur Color",
    x = "X Coordinate",
    y = "Y Coordinate",
    color = "Fur Color"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Apakah warna bulu tertentu cenderung muncul pada area tertentu?

Interpretasi: Untuk tupai dengan warna bulu abu-abu dan cinnamon, mereka menyebar di seluruh wilayah. Namun, untuk tupai dengan warna bulu hitam cenderung berkumpul di bagian atas dan bawah wilayah.

9 5. Perbandingan Perilaku Chasing Berdasarkan Warna Bulu

Gunakan stacked proportional bar chart untuk melihat proporsi perilaku chasing berdasarkan warna bulu.

ggplot(squirrel, aes(x = primary_fur_color, fill = chasing)) +
  geom_bar(position = "fill") +
  labs(
    title = "Chasing Behavior by Fur Color",
    x = "Fur Color",
    y = "Proportion",
    fill = "Chasing"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Apakah terdapat perbedaan proporsi perilaku chasing antar warna bulu?

Interpretasi: Perbedaan proporsi perilaku chasing tidak terlalu signifikan untuk kelompok-kelompok tupai berdasarkan warna. Namun, tupai dengan warna bulu abu-abu memiliki perilaku chasing paling banyak dibandingkan dengan warna tupai lainnya.

10 6. Perilaku Eating Berdasarkan Kelompok Umur

Gunakan grafik batang proporsional untuk melihat perilaku makan berdasarkan kelompok umur.

ggplot(squirrel, aes(x = age, fill = eating)) +
  geom_bar(position = "fill") +
  labs(
    title = "Eating Behavior by Age Group",
    x = "Age Group",
    y = "Proportion",
    fill = "Eating"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Apakah perilaku makan berbeda antara adult dan juvenile squirrels?

Interpretasi: Dalam grafik batang tersebut, tupai dewasa dan tupai remaja lebih banyak yang tidak makan. Tetapi tupai remaja lebih banyak makan dibandingkan tupai dewasa

11 7. Faceting: Sebaran Spasial Berdasarkan Kelompok Umur

Gunakan facet_wrap() untuk membandingkan sebaran lokasi tupai berdasarkan umur.

ggplot(squirrel, aes(x = long, y = long)) +
  geom_point(alpha = 0.5) +
  facet_wrap(~ age) +
  labs(
    title = "Spatial Distribution of Squirrels by Age Group",
    x = "X Coordinate",
    y = "Y Coordinate"
  ) +
  theme_minimal()

Pertanyaan:

Apakah adult dan juvenile squirrels memiliki pola lokasi yang berbeda?

Interpretasi: Berdasarkan scatter plot di atas, tupai dewasa cenderung lebih menyebar dibandingkan tupai remaja yang cenderung tidak menempati lokasi tertentu.

12 8. Aesthetic Mapping: Warna dan Bentuk

Gunakan color untuk warna bulu dan shape untuk kelompok umur.

ggplot(squirrel, aes(
  x = long,
  y = lat,
  color = primary_fur_color,
  shape = age
)) +
  geom_point(size = 2, alpha = 0.7) +
  labs(
    title = "Squirrel Location by Fur Color and Age",
    x = "X Coordinate",
    y = "Y Coordinate",
    color = "Fur Color",
    shape = "Age"
  ) +
  theme_minimal()
## Warning: Removed 121 rows containing missing values or values outside the scale range
## (`geom_point()`).

Pertanyaan:

Informasi tambahan apa yang diperoleh ketika warna dan bentuk digunakan secara bersamaan?

Interpretasi:

Berdasarkan scatter plot di atas, tupai dewasa yang berbulu abu-abu cenderung lebih merata di seluruh wilayah.

13 9. Visualisasi Pilihan Mahasiswa

Buat satu visualisasi tambahan berdasarkan pertanyaan analitis yang Anda susun sendiri.

Contoh pertanyaan:

# Tulis kode visualisasi Anda di sini
tabel_makan <- table(squirrel$age, squirrel$eating)
barplot(tabel_makan, 
        beside = TRUE, 
        col = c("#999999", "#E69F00", "#56B4E9"),
        legend.text = rownames(tabel_makan),
        args.legend = list(x = "topright"),
        main = "Aktivitas Makan Tupai Berdasarkan Kelompok Umur",
        xlab = "Sedang Makan (FALSE / TRUE)", 
        ylab = "Jumlah Tupai")

Pertanyaan Analitis: Bagaimana aktivitas makan berdasarkan kelompok umur tupai?

Interpretasi: Berdasarkan grafik batang di atas, tupai dewasa cenderung banyak tidak makan dibandingkan tupai remaja.

14 10. Kesimpulan

Tuliskan 3–5 insight utama yang diperoleh dari visualisasi squirrel data.

Kesimpulan:

  1. Tupai cenderung menghindari suatu lokasi tertentu
  2. Jumlah tupai abu-abu lebih banyak dibandingkan tupai dengan warna bulu lain
  3. Kelompok tupai tertentu memiliki kecenderungan aktivitas tidak makan
  4. Tupai dengan warna bulu abu-abu memiliki perilaku chasing paling banyak dibandingkan dengan warna tupai lainnya.

15 Catatan Pengumpulan

Kumpulkan file dalam format HTML. Pastikan dokumen memuat:

  1. Kode R.
  2. Output grafik.
  3. Interpretasi setiap grafik.
  4. Kesimpulan akhir.
  5. [BONUS] Publish di Rpubs! Berikan link Rpubs Anda, dan saya akan berkunjung untuk melihat-lihat. Kalian bisa mulai dari sini: https://rpubs.com/about/getting-started.