Latihan ini bertujuan untuk memperkenalkan dasar-dasar visualisasi
data menggunakan ggplot2 melalui studi kasus
squirrel data. Mahasiswa diharapkan mampu:
ggplot2.x,
y, color, fill, dan
shape.library(tidyverse)
Gunakan file data squirrel dalam format .csv. Pastikan
file berada pada folder kerja yang sama dengan file R Markdown ini.
squirrels_url <- paste0("https://raw.githubusercontent.com/rfordatascience/tidytuesday/","master/data/2019/2019-10-29/nyc_squirrels.csv")
squirrel <- read.csv(squirrels_url)
glimpse(squirrel)
## Rows: 3,023
## Columns: 36
## $ long <dbl> -73.95613, -73.95704, -73.9…
## $ lat <dbl> 40.79408, 40.79485, 40.7667…
## $ unique_squirrel_id <chr> "37F-PM-1014-03", "37E-PM-1…
## $ hectare <chr> "37F", "37E", "02E", "05D",…
## $ shift <chr> "PM", "PM", "AM", "PM", "AM…
## $ date <int> 10142018, 10062018, 1010201…
## $ hectare_squirrel_number <int> 3, 3, 3, 5, 1, 2, 2, 3, 9, …
## $ age <chr> NA, "Adult", "Adult", "Juve…
## $ primary_fur_color <chr> NA, "Gray", "Cinnamon", "Gr…
## $ highlight_fur_color <chr> NA, "Cinnamon", NA, NA, NA,…
## $ combination_of_primary_and_highlight_color <chr> "+", "Gray+Cinnamon", "Cinn…
## $ color_notes <chr> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,…
## $ location <chr> NA, "Ground Plane", "Above …
## $ above_ground_sighter_measurement <chr> NA, "FALSE", "4", "3", NA, …
## $ specific_location <chr> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,…
## $ running <lgl> FALSE, TRUE, FALSE, FALSE, …
## $ chasing <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ climbing <lgl> FALSE, FALSE, TRUE, TRUE, F…
## $ eating <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ foraging <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ other_activities <chr> NA, NA, NA, NA, "unknown", …
## $ kuks <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ quaas <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ moans <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ tail_flags <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ tail_twitches <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ approaches <lgl> FALSE, FALSE, FALSE, FALSE,…
## $ indifferent <lgl> FALSE, FALSE, TRUE, FALSE, …
## $ runs_from <lgl> FALSE, TRUE, FALSE, TRUE, F…
## $ other_interactions <chr> NA, "me", NA, NA, NA, NA, N…
## $ lat_long <chr> "POINT (-73.9561344937861 4…
## $ zip_codes <int> NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,…
## $ community_districts <int> 19, 19, 19, 19, 19, 19, 19,…
## $ borough_boundaries <int> 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, 4, …
## $ city_council_districts <int> 19, 19, 19, 19, 19, 19, 19,…
## $ police_precincts <int> 13, 13, 13, 13, 13, 13, 13,…
names(squirrel)
## [1] "long"
## [2] "lat"
## [3] "unique_squirrel_id"
## [4] "hectare"
## [5] "shift"
## [6] "date"
## [7] "hectare_squirrel_number"
## [8] "age"
## [9] "primary_fur_color"
## [10] "highlight_fur_color"
## [11] "combination_of_primary_and_highlight_color"
## [12] "color_notes"
## [13] "location"
## [14] "above_ground_sighter_measurement"
## [15] "specific_location"
## [16] "running"
## [17] "chasing"
## [18] "climbing"
## [19] "eating"
## [20] "foraging"
## [21] "other_activities"
## [22] "kuks"
## [23] "quaas"
## [24] "moans"
## [25] "tail_flags"
## [26] "tail_twitches"
## [27] "approaches"
## [28] "indifferent"
## [29] "runs_from"
## [30] "other_interactions"
## [31] "lat_long"
## [32] "zip_codes"
## [33] "community_districts"
## [34] "borough_boundaries"
## [35] "city_council_districts"
## [36] "police_precincts"
summary(squirrel)
## long lat unique_squirrel_id hectare
## Min. :-73.98 Min. :40.76 Length:3023 Length:3023
## 1st Qu.:-73.97 1st Qu.:40.77 Class :character Class :character
## Median :-73.97 Median :40.78 Mode :character Mode :character
## Mean :-73.97 Mean :40.78
## 3rd Qu.:-73.96 3rd Qu.:40.79
## Max. :-73.95 Max. :40.80
##
## shift date hectare_squirrel_number
## Length:3023 Min. :10062018 Min. : 1.000
## Class :character 1st Qu.:10082018 1st Qu.: 2.000
## Mode :character Median :10122018 Median : 3.000
## Mean :10119487 Mean : 4.124
## 3rd Qu.:10142018 3rd Qu.: 6.000
## Max. :10202018 Max. :23.000
##
## age primary_fur_color highlight_fur_color
## Length:3023 Length:3023 Length:3023
## Class :character Class :character Class :character
## Mode :character Mode :character Mode :character
##
##
##
##
## combination_of_primary_and_highlight_color color_notes
## Length:3023 Length:3023
## Class :character Class :character
## Mode :character Mode :character
##
##
##
##
## location above_ground_sighter_measurement specific_location
## Length:3023 Length:3023 Length:3023
## Class :character Class :character Class :character
## Mode :character Mode :character Mode :character
##
##
##
##
## running chasing climbing eating
## Mode :logical Mode :logical Mode :logical Mode :logical
## FALSE:2293 FALSE:2744 FALSE:2365 FALSE:2263
## TRUE :730 TRUE :279 TRUE :658 TRUE :760
##
##
##
##
## foraging other_activities kuks quaas
## Mode :logical Length:3023 Mode :logical Mode :logical
## FALSE:1588 Class :character FALSE:2921 FALSE:2973
## TRUE :1435 Mode :character TRUE :102 TRUE :50
##
##
##
##
## moans tail_flags tail_twitches approaches
## Mode :logical Mode :logical Mode :logical Mode :logical
## FALSE:3020 FALSE:2868 FALSE:2589 FALSE:2845
## TRUE :3 TRUE :155 TRUE :434 TRUE :178
##
##
##
##
## indifferent runs_from other_interactions lat_long
## Mode :logical Mode :logical Length:3023 Length:3023
## FALSE:1569 FALSE:2345 Class :character Class :character
## TRUE :1454 TRUE :678 Mode :character Mode :character
##
##
##
##
## zip_codes community_districts borough_boundaries city_council_districts
## Min. :10090 Min. :11 Min. :4 Min. :19.00
## 1st Qu.:12081 1st Qu.:19 1st Qu.:4 1st Qu.:19.00
## Median :12420 Median :19 Median :4 Median :19.00
## Mean :11828 Mean :19 Mean :4 Mean :19.07
## 3rd Qu.:12423 3rd Qu.:19 3rd Qu.:4 3rd Qu.:19.00
## Max. :12423 Max. :23 Max. :4 Max. :51.00
## NA's :3014
## police_precincts
## Min. :10
## 1st Qu.:13
## Median :13
## Mean :13
## 3rd Qu.:13
## Max. :18
##
Tuliskan penjelasan singkat mengenai struktur data.
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini. struktur data ini termasuk dalam sebuah dataframe, lalu juga ada beberapa tipe data, seperti numerik dan karakter. # 1. Distribusi Warna Bulu Tupai
Buat grafik batang untuk melihat warna bulu tupai yang paling banyak ditemukan.
ggplot(squirrel, aes(x = primary_fur_color)) +
geom_bar() +
labs(
title = "Distribution of Squirrel Fur Color",
x = "Fur Color",
y = "Count"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Warna bulu apa yang paling dominan?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini. Berdasarkan data, warna “Gray” atau abu abu adalah warna dengan kuantitas terbanyak # 2. Distribusi Lokasi Berdasarkan Koordinat X
Gunakan histogram untuk melihat penyebaran tupai berdasarkan koordinat X.
ggplot(squirrel, aes(x = long)) +
geom_histogram(bins = 30) +
labs(
title = "Distribution of Squirrel Location Based on X Coordinate",
x = "X Coordinate",
y = "Frequency"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Apakah lokasi pengamatan tupai terkonsentrasi pada area tertentu?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini.Lokasi tupai dengan pengamatan terbanyak terkonsentrasi pada area dengan X koordinat -73.97, hal tersebut dapat dikarenakan dengan habitat, jumlah makanan, dan lain lainnya
Buat scatter plot untuk menggambarkan lokasi tupai berdasarkan
koordinat x dan y.
ggplot(squirrel, aes(x = long, y = lat)) +
geom_point(alpha = 0.6) +
labs(
title = "Spatial Distribution of Squirrels",
x = "X Coordinate",
y = "Y Coordinate"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Bagaimana pola sebaran tupai secara spasial?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini. Berdasarkan data, dapat disimpulkan bahwa persebaran tupai yang memiliki kuantitas paling sedikit adalah -73.96 untuk kooordinat x dan 40.79 pada koordinat y, hal ini dapat dikarenakan faktor habitat, jumlah makanan
Tambahkan warna pada scatter plot berdasarkan
primary_fur_color.
ggplot(squirrel, aes(x = long, y = lat, color = primary_fur_color)) +
geom_point(alpha = 0.6) +
labs(
title = "Spatial Distribution of Squirrels by Fur Color",
x = "X Coordinate",
y = "Y Coordinate",
color = "Fur Color"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Apakah warna bulu tertentu cenderung muncul pada area tertentu?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini.Berdasarkan data, warna bulu tertentu seperti warna hitam muncul pada koordinat x -73.96 dan y 40.79, selain itu persebaran warna lainnya seperti biru, dan hijau. Mencakupi sisa area yang terdapat pada distribusi tersebut
Gunakan stacked proportional bar chart untuk melihat proporsi
perilaku chasing berdasarkan warna bulu.
ggplot(squirrel, aes(x = primary_fur_color, fill = chasing)) +
geom_bar(position = "fill") +
labs(
title = "Chasing Behavior by Fur Color",
x = "Fur Color",
y = "Proportion",
fill = "Chasing"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Apakah terdapat perbedaan proporsi perilaku chasing antar warna bulu?
**Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini.Berdasarkan data, terdapat beberapa perbedaan mengenai perilaku chasing dengan warna bulu. Contohnya warna gray/abu abu yang memiliki tingkat terbanyak untuk perilaku chasing yang diamati, diikuti dengan warna hitam/black yang memiliki kuantitas lebih sedikit untuk perilaku chasing yang terekam. Artinya warna bulu gray/abu abu memiliki tingkat aktivitias tertinggi dibandingkan yang lain**
Gunakan grafik batang proporsional untuk melihat perilaku makan berdasarkan kelompok umur.
ggplot(squirrel, aes(x = age, fill = eating)) +
geom_bar(position = "fill") +
labs(
title = "Eating Behavior by Age Group",
x = "Age Group",
y = "Proportion",
fill = "Eating"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Apakah perilaku makan berbeda antara adult dan juvenile squirrels?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini.Berdasarkan data, perilaku makan untuk Juvenile memiliki jumlah yang lebih banyak ditemui dalam data, hal ini dapat dikarenakan oleh faktor seperti habitat, jumlah makanan, dan sebagainya
Gunakan facet_wrap() untuk membandingkan sebaran lokasi
tupai berdasarkan umur.
ggplot(squirrel, aes(x = long, y = long)) +
geom_point(alpha = 0.5) +
facet_wrap(~ age) +
labs(
title = "Spatial Distribution of Squirrels by Age Group",
x = "X Coordinate",
y = "Y Coordinate"
) +
theme_minimal()
Pertanyaan:
Apakah adult dan juvenile squirrels memiliki pola lokasi yang berbeda?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini.Berdasarkan data, Adult dan Juvenile memiliki pola lokasi yang berbeda, dan lokasi tersebut juga tampak cukup jauh. Hal ini dapat dikarenakan dengan jumlah makanan, habitat, dan lain sebagainya
Gunakan color untuk warna bulu dan shape
untuk kelompok umur.
ggplot(squirrel, aes(
x = long,
y = lat,
color = primary_fur_color,
shape = age
)) +
geom_point(size = 2, alpha = 0.7) +
labs(
title = "Squirrel Location by Fur Color and Age",
x = "X Coordinate",
y = "Y Coordinate",
color = "Fur Color",
shape = "Age"
) +
theme_minimal()
## Warning: Removed 121 rows containing missing values or values outside the scale range
## (`geom_point()`).
Pertanyaan:
Informasi tambahan apa yang diperoleh ketika warna dan bentuk digunakan secara bersamaan?
Interpretasi:
Tuliskan jawaban Anda di sini. Berdasarkan data yang diberikan, dikarenakan bentuk dewasa direpresentasikan dengan segitiga, dan remaja/juvenile dipresentasikan dengan segiempat. Dapat disimpulkan bahwa persebaran untuk remaja dapat ditemukan pada x koordinat -73.96 sampai -73.95 lalu 40.79 sampai 40.80 untuk koordinat Y
Buat satu visualisasi tambahan berdasarkan pertanyaan analitis yang Anda susun sendiri.
Contoh pertanyaan:
# Scatter plot dengan facet untuk membandingkan perilaku makan
ggplot(squirrel, aes(x = long, y = lat, color = primary_fur_color)) +
geom_point(alpha = 0.6, size = 1.5) +
facet_wrap(~ eating) +
scale_color_manual(values = c("Gray" = "gray50", "Black" = "black", "Cinnamon" = "brown")) +
labs(
title = "Spatial Distribution of Squirrels: Eating vs Not Eating",
subtitle = "Comparison of squirrel locations based on eating behavior",
x = "Longitude (X Coordinate)",
y = "Latitude (Y Coordinate)",
color = "Fur Color",
caption = "Facet TRUE = eating observed, FALSE = no eating observed"
) +
theme_minimal() +
theme(
strip.background = element_rect(fill = "lightgray", color = NA),
strip.text = element_text(face = "bold")
)
Pertanyaan Analitis: 1 Apakah tupai yang sedang makan lebih sering terlihat di lokasi tertentu? 2 Apakah perilaku running berbeda antar kelompok umur?
Interpretasi: 1 Berdasarkan data yang tersedia, tupia yang sedang makan lebih sering muncul pada lokasi yang tampaknya tersedia persediaan makanan, yaitu di x koordinat -73.96 sampai -73.98 dan y koordinat 40.77 sampai 40.78 2 iya, berbeda dikarenakan juvenile memiliki tingkat keaktivan yang lebih tinggi dibandingkan dewasa
Tuliskan jawaban Anda di sini.
Tuliskan 3–5 insight utama yang diperoleh dari visualisasi squirrel data.
Kesimpulan:
Kumpulkan file dalam format HTML. Pastikan dokumen memuat: