Teoría

Agrupamiento o clustering es una técnica de aprendizaje automático no supervisado que agrupa datos en función de su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:

  • Segmentación de clientes
  • Detección de anormalidades
  • Categorización de documentos

Paso 1. Instalar paquetes y llamar librerías

#install.packages("cluster") # Análisis de Agrupamiento
library(cluster)
#install.packages("ggplot2") # Graficar
library(ggplot2)
#install.packages("data.table") # Manejo de muchos datos
library(data.table)
#install.packages("factoextra") # Gráfica optimización de número de clusters
library(factoextra)

Paso 2. Obtener los datos

df1 <- data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9)) 

Paso 3. Entender los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos

# Sólo si los datos no están en la misma escala.
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar número de grupos

# Siempre es un valor inicial "cualquiera", luego se optimiza.
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6. Generar los grupos

set.seed(123)
clusters1 <- kmeans(df1,grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el número de grupos

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
# El K.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejó en 7.
plot(optimizacion1, xlab="Número de clusters k", main="Optimización de Clusters")

# Se selecciona como óptimo el primer punto más alto.

Paso 8. Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9. Agregar Clusters a la Base de Datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster = clusters1$cluster)
head(df1_clusters)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       1
## 3 8  4       3
## 4 5  8       2
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.

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