Teoría

Agrupamiento o clustering es una técnica de aprendizaje automático no supervisado que agrupa datos en función de su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:

  • Segmentación de clientes
  • Detección de anormalidades
  • Categorización de documentos

Paso 1. Instalar paquetes y llamar librerías

# install.packages("cluster") # Análisis de Agrupamiento
library(cluster)
# install.packages("ggplot2") # Graficar
library(ggplot2)
# install.packages("data.table") # Manejo de muchos datos
library(data.table)
# install.packages("factoextra") # Gráfica optimización de número de clusters
library(factoextra)

Paso 2. Obtener los datos

df1 <- data.frame(x = c(2, 2, 8, 5, 7, 6, 1, 4), y = c(10, 5, 4, 8, 5, 4, 2, 9))

Paso 3. Entender los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos

# Sólo si los datos no están en la misma escala.
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar número de grupos

# Siempre es un valor inicial "cualquiera", luego se optimiza.
plot(df1$x, df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6. Generar los grupos

set.seed(123)
clusters1 <- kmeans(df1, grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el número de grupos

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN = kmeans, nstart = 1, K.max = 7)
# El K.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejó en 7.
plot(optimizacion1, xlab = "Número de clusters k", main = "Optimización de Clusters")

# Se selecciona como óptimo el primer punto más alto.

Paso 8. Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data = df1)

Paso 9. Agregar Clusters a la Base de Datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster = clusters1$cluster)
head(df1_clusters)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       1
## 3 8  4       3
## 4 5  8       2
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.

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