Teoría

Agrupamiento o clustering es una técnica de aprendizaje automático no supervisado que agrupa datos en función de su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:

  • Segmentación de clientes
  • Detección de anormalidades
  • Categorización de documentos

Paso 1. Instalar paquetes y llamar librerías

#install.packages("cluster") # Análisis de Agrupamiento
library(cluster)
#install.packages("ggplot2") # Graficar
library(ggplot2)
#install.packages("data.table") # Manejo de muchos datos
library(data.table)
#install.packages("factoextra") # Gráfica optimización de número de clusters
library(factoextra)

Paso 2. Obtener los datos

df1 <- data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9)) 

Paso 3. Entender los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos

# Sólo si los datos no están en la misma escala.
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar número de grupos

# Siempre es un valor inicial "cualquiera", luego se optimiza.
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6. Generar los grupos

set.seed(123)
clusters1 <- kmeans(df1,grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el número de grupos

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
# El K.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejó en 7.
plot(optimizacion1, xlab="Número de clusters k", main="Optimización de Clusters")

# Se selecciona como óptimo el primer punto más alto.

Paso 8. Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9. Agregar Clusters a la Base de Datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster = clusters1$cluster)
head(df1_clusters)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       1
## 3 8  4       3
## 4 5  8       2
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.

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