Teoría

Agrupamiento o clustering es una técnica de aprendizaje automático no supervisado que agrupa datos en función de su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:

  • Segmentación de clientes
  • Detección de anormalidades
  • Categorización de documentos

Paso 1. Instalar paquetes y llamar librerías

#install.packages("cluster") # Análisis de Agrupamiento
library(cluster)
#install.packages("ggplot2") # Graficar
library(ggplot2)
#install.packages("data.table") # Manejo de muchos datos
library(data.table)
#install.packages("factoextra") # Gráfica optimización de número de clusters
library(factoextra)

Paso 2. Obtener los datos

df1 <- data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9)) 

Paso 3. Entender los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos

# Sólo si los datos no están en la misma escala.
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar número de grupos

# Siempre es un valor inicial "cualquiera", luego se optimiza.
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6. Generar los grupos

set.seed(123)
clusters1 <- kmeans(df1,grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el número de grupos

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
# El K.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejó en 7.
plot(optimizacion1, xlab="Número de clusters k", main="Optimización de Clusters")

# Se selecciona como óptimo el primer punto más alto.

Paso 8. Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9. Agregar Clusters a la Base de Datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster = clusters1$cluster)
head(df1_clusters)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       1
## 3 8  4       3
## 4 5  8       2
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.

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