#Importation des packages
library(tidyverse)
library(janitor)
library(sf)
library(mapview)
# Importation des données - Informations opération pêche
base_operation <-
readxl::read_xls(path = '~/Stage_M2_LR_BFC/Red_list_R_project/Red_list_fish/Liste_rouge_BFC/raw_data/RHP-RCS-RCO-REF DR 9.xls', sheet = "DONNEES SOURCE")
Dans la colonne du reseau, si = 1 alors 1 = “nom du reseau”
ope_clean <- base_operation %>% # Ctrl+shift+M
janitor::clean_names() %>%
mutate(
protocole = as.factor(protocole),
#reseaux = ifelse(str_detect(statut_observation, '^Pr'), yes = 'Présent', no = 'Absent')
)
summary(ope_clean$protocole)
## 1 electrode 2 electrodes points NA's
## 13 53 96 23
# Représentation cartographique du secteur d'étude et des stations correspondants
sites_geo <- ope_clean %>%
filter(!is.na(xaval_l93) & !is.na(yaval_l93)) %>%
dplyr::select(
code_station_bhp,
xaval_l93,
yaval_l93,
nom_sandre,
protocole,
mode_prospection,
annee_peche
) %>%
st_as_sf(coords = c("xaval_l93", "yaval_l93"), crs = 2154)
mapview(
sites_geo,
zcol = "protocole",
col.regions = c("darkseagreen3" , "purple4", "indianred1")
)