El análisis se realizó comenzando por importar las librerias requeridas entre ellas readxl, nortest, ggplot2, dplyr, tidyverse, tableone, sandwich, lmtest, cowplot, gmodels, crosstable, haven, foreign y sandwich
Posteriormente se codificaron todas las variables correspondientes siendo edad, propofol, fentanilo, sangrado las variables cuantitativas numericas de tipo continuo y las variables de ASA, hipertensión, diabetes, hipotiroidismo, delirio y duración de la administración de la anestesia de tipo cualitativo.
Se aplicó la prueba de normalidad de Shapiro-Wilk a cada variable, debido a que la prueba de Kolmogorov-Smirnov en muestras grandes no es tan exacta y se opta por la prueba de lilliefors, en cambio para análisis estadisticos en R y Rstudio se recomienda emplear Shapiro-Wilk en muestras de 0-5mil observaciones. Se aprecia que las variables poseen una distribución libre.
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: edad
## W = 0.9442, p-value = 2.98e-05
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: propofol
## W = 0.87723, p-value = 3.471e-09
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: datos$fentanilo_mcg
## W = 0.9579, p-value = 0.0003631
##
## Shapiro-Wilk normality test
##
## data: datos$sangrado_ml
## W = 0.97186, p-value = 0.006732
Se realizó una tabla descriptiva que resume las caracteristicas
generales de la muestra estudiada asi como de las variables, las
variables cuantitativas se expresan en mediana (Q1-Q3) y las
proporciones en frecuencias (%).
| level | Overall | |
|---|---|---|
| n | 135 | |
| edad (median [IQR]) | 68.00 [63.00, 73.00] | |
| ASA (%) | ASA II | 82 (60.74) |
| ASA III | 53 (39.26) | |
| hipertension (%) | sin hipertensión | 61 (45.19) |
| Con hipertensión | 74 (54.81) | |
| diabetes_mellitus (%) | Sin diabetes tipo 2 | 82 (60.74) |
| Con diabetes tipo 2 | 53 (39.26) | |
| hipotiroidismo (%) | Sin hipotiroidismo | 127 (94.07) |
| Con hipotiroidismo | 8 ( 5.93) | |
| propofol_mg (median [IQR]) | 110.00 [100.00, 120.00] | |
| fentanilo_mcg (median [IQR]) | 825.00 [622.50, 998.00] | |
| sangrado_ml (median [IQR]) | 450.00 [390.00, 515.00] | |
| duracion_gt180 (%) | <180 minutos | 69 (51.11) |
| >180 minutos | 66 (48.89) | |
| delirio (%) | sin delirio | 110 (81.48) |
| con delirio | 25 (18.52) |
Se realizó la construcción de gráficos de cajas y brazos para cada
una de las variables cuantitativas y permitir observar su distribución.
Se construyeron adicionalmente gráficos de barras para observar la
distribución de las variables cualitativas.
Con motivo de efectuar una comparación entre grupos entre aquellos
individuos que presentaron delirio y aquellos que no, se realizaron
tablas cruzadas para conocer las frecuencias de cada variable
cualitativa en cada grupo y contando con una frecuencia menor de 5
aplicar la prueba exacta de Fisher y para una frecuencia mayor de 5 la
prueba de Chi-cuadrada de Pearson.
##
##
## Cell Contents
## |-------------------------|
## | N |
## | Expected N |
## |-------------------------|
##
##
## Total Observations in Table: 135
##
##
## | delirio
## ASA | sin delirio | con delirio | Row Total |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
## ASA II | 64 | 18 | 82 |
## | 66.815 | 15.185 | |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
## ASA III | 46 | 7 | 53 |
## | 43.185 | 9.815 | |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
## Column Total | 110 | 25 | 135 |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
##
##
## Statistics for All Table Factors
##
##
## Pearson's Chi-squared test
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 1.631092 d.f. = 1 p = 0.201552
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 1.103091 d.f. = 1 p = 0.2935887
##
##
##
##
## Cell Contents
## |-------------------------|
## | N |
## | Expected N |
## |-------------------------|
##
##
## Total Observations in Table: 135
##
##
## | delirio
## hipertensión | sin delirio | con delirio | Row Total |
## -----------------|-------------|-------------|-------------|
## sin hipertensión | 55 | 6 | 61 |
## | 49.704 | 11.296 | |
## -----------------|-------------|-------------|-------------|
## Con hipertensión | 55 | 19 | 74 |
## | 60.296 | 13.704 | |
## -----------------|-------------|-------------|-------------|
## Column Total | 110 | 25 | 135 |
## -----------------|-------------|-------------|-------------|
##
##
## Statistics for All Table Factors
##
##
## Pearson's Chi-squared test
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 5.559703 d.f. = 1 p = 0.01837853
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 4.559519 d.f. = 1 p = 0.03273626
##
##
##
##
## Cell Contents
## |-------------------------|
## | N |
## | Expected N |
## |-------------------------|
##
##
## Total Observations in Table: 135
##
##
## | delirio
## diabetes | sin delirio | con delirio | Row Total |
## --------------------|-------------|-------------|-------------|
## Sin diabetes tipo 2 | 67 | 15 | 82 |
## | 66.815 | 15.185 | |
## --------------------|-------------|-------------|-------------|
## Con diabetes tipo 2 | 43 | 10 | 53 |
## | 43.185 | 9.815 | |
## --------------------|-------------|-------------|-------------|
## Column Total | 110 | 25 | 135 |
## --------------------|-------------|-------------|-------------|
##
##
## Statistics for All Table Factors
##
##
## Pearson's Chi-squared test
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 0.007059783 d.f. = 1 p = 0.9330385
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 1.284923e-30 d.f. = 1 p = 1
##
##
##
##
## Cell Contents
## |-------------------------|
## | N |
## | Expected N |
## |-------------------------|
##
##
## Total Observations in Table: 135
##
##
## | delirio
## hipotiroidismo | sin delirio | con delirio | Row Total |
## -------------------|-------------|-------------|-------------|
## Sin hipotiroidismo | 103 | 24 | 127 |
## | 103.481 | 23.519 | |
## -------------------|-------------|-------------|-------------|
## Con hipotiroidismo | 7 | 1 | 8 |
## | 6.519 | 1.481 | |
## -------------------|-------------|-------------|-------------|
## Column Total | 110 | 25 | 135 |
## -------------------|-------------|-------------|-------------|
##
##
## Statistics for All Table Factors
##
##
## Pearson's Chi-squared test
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 0.2041428 d.f. = 1 p = 0.6513975
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 2.541387e-31 d.f. = 1 p = 1
##
##
##
##
## Cell Contents
## |-------------------------|
## | N |
## | Expected N |
## |-------------------------|
##
##
## Total Observations in Table: 135
##
##
## | delirio
## duracion | sin delirio | con delirio | Row Total |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
## <180 minutos | 61 | 8 | 69 |
## | 56.222 | 12.778 | |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
## >180 minutos | 49 | 17 | 66 |
## | 53.778 | 12.222 | |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
## Column Total | 110 | 25 | 135 |
## -------------|-------------|-------------|-------------|
##
##
## Statistics for All Table Factors
##
##
## Pearson's Chi-squared test
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 4.484639 d.f. = 1 p = 0.03420077
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
## ------------------------------------------------------------
## Chi^2 = 3.595109 d.f. = 1 p = 0.05794984
##
##
Los resultados de la prueba de normalidad indicaron una distribución libre por lo que las pruebas para comparación entre grupos se realizaron con la prueba U de Mann-Whitney exceptuando la prueba de homogeneidad de varianzas.
##
## Wilcoxon rank sum test with continuity correction
##
## data: edad by delirio
## W = 1539.5, p-value = 0.3521
## alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0
##
## Wilcoxon rank sum test with continuity correction
##
## data: propofol_mg by delirio
## W = 1656, p-value = 0.1046
## alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0
##
## Wilcoxon rank sum test with continuity correction
##
## data: fentanilo_mcg by delirio
## W = 1818, p-value = 0.01219
## alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0
##
## Wilcoxon rank sum test with continuity correction
##
## data: sangrado_ml by delirio
## W = 1311, p-value = 0.7189
## alternative hypothesis: true location shift is not equal to 0
Habiéndose detectado únicamente detectado una diferencia estadistícamente significativa en la variable de fentanilo (microgramos). Los resultados de la comparación entre grupos con la aplicación de la prueba Chi-cuadrada de Pearson y Exacta de Fisher con corrección de Yates se observan a continuación.
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
##
## data: ASA and delirio
## X-squared = 1.1031, df = 1, p-value = 0.2936
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
##
## data: hipertensión and delirio
## X-squared = 4.5595, df = 1, p-value = 0.03274
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
##
## data: diabetes and delirio
## X-squared = 1.2849e-30, df = 1, p-value = 1
##
## Fisher's Exact Test for Count Data
##
## data: hipotiroidismo and delirio
## p-value = 1
## alternative hypothesis: true odds ratio is not equal to 1
## 95 percent confidence interval:
## 0.01307026 5.16796254
## sample estimates:
## odds ratio
## 0.6150358
##
## Pearson's Chi-squared test with Yates' continuity correction
##
## data: duracion and delirio
## X-squared = 3.5951, df = 1, p-value = 0.05795
Para observar la distribución en ambos grupos de las variables cuantitativas y cualitativas se consturyeron gráficos de cajas comparandose por presencia y ausencia de delirio en la muestra estudiada, al igual que se construyeron gráficos de barras.
| level | sin delirio | con delirio | p | test | |
|---|---|---|---|---|---|
| n | 110 | 25 | |||
| edad (median [IQR]) | 68.00 [63.00, 73.00] | 66.00 [63.00, 71.00] | 0.351 | nonnorm | |
| ASA (%) | ASA II | 64 (58.18) | 18 (72.00) | 0.294 | |
| ASA III | 46 (41.82) | 7 (28.00) | |||
| hipertension (%) | sin hipertensión | 55 (50.00) | 6 (24.00) | 0.033 | |
| Con hipertensión | 55 (50.00) | 19 (76.00) | |||
| diabetes_mellitus (%) | Sin diabetes tipo 2 | 67 (60.91) | 15 (60.00) | 1.000 | |
| Con diabetes tipo 2 | 43 (39.09) | 10 (40.00) | |||
| hipotiroidismo (%) | Sin hipotiroidismo | 103 (93.64) | 24 (96.00) | 1.000 | |
| Con hipotiroidismo | 7 (6.36) | 1 (4.00) | |||
| propofol_mg (median [IQR]) | 110.00 [100.00, 120.00] | 100.00 [100.00, 110.00] | 0.104 | nonnorm | |
| fentanilo_mcg (median [IQR]) | 853.50 [648.25, 1034.25] | 669.00 [533.00, 856.00] | 0.012 | nonnorm | |
| sangrado_ml (median [IQR]) | 450.00 [390.00, 510.00] | 470.00 [400.00, 520.00] | 0.717 | nonnorm | |
| duracion_gt180 (%) | <180 minutos | 61 (55.45) | 8 (32.00) | 0.058 | |
| >180 minutos | 49 (44.55) | 17 (68.00) | |||
| delirio (%) | sin delirio | 110 (100.00) | 0 (0.00) | <0.001 | |
| con delirio | 0 (0.00) | 25 (100.00) |
Con motivo de realizar un análisis de regresión de Poisson se recodifico la variable delirio para seleccionar como dependiente la variable con el valor 1 que fue de aquellos en los que se observó delirio.
#recodificación para modelos de regresión
datos$delirio_num = as.numeric(datos$delirio) - 1
delirionum = datos$delirio_num
Ya con la variable codificada nuevamente se procedió a realizar la construcción de un análisis univariado con cada una de las variables.
## Variable RR LI LS p_valor
## Edad 0.967 0.898 1.040 0.3660
## Propofol 0.979 0.952 1.007 0.1328
## Fentanilo 0.998 0.996 1.000 0.0284
## Sangrado 1.001 0.996 1.006 0.7646
## ASA 0.602 0.251 1.441 0.2541
## Hipertension 2.610 1.043 6.536 0.0405
## Diabetes 1.031 0.463 2.296 0.9395
## Hipotiroidismo 0.661 0.089 4.889 0.6855
## Duracion 2.222 0.959 5.148 0.0626
Posteriormente se construyó un forest plot para observar el RR con su
respectivo intervalo de confianza al 95% de cada variable incluida en el
análisis de regresión, como se muestra acontinuación:
Nuevamente se construyeron modelos de regresión de Poisson, para ello se
debe mencionar que los resultados se expresan en RR y su respectivo
intervalo de confianza al 95%.
## RRa 2.5 % 97.5 % p_valor
## (Intercept) 7.381 0.036 1500.580 0.4610
## edad 0.959 0.891 1.033 0.2743
## ASAASA III 0.687 0.285 1.658 0.4039
## fentanilo_mcg 0.998 0.997 1.000 0.0371
## hipertensionCon hipertensión 2.314 0.914 5.857 0.0766
## RRa 2.5 % 97.5 % p_valor
## (Intercept) 0.366 0.087 1.547 0.1717
## fentanilo_mcg 0.998 0.997 1.000 0.0426
## hipertensionCon hipertensión 2.444 0.973 6.141 0.0572
## RRa LI LS p_valor
## (Intercept) 7.3814997 0.1003674 542.8708108 0.361975166
## edad 0.9594736 0.9026934 1.0198254 0.183769002
## ASAASA III 0.6873613 0.3142364 1.5035352 0.347844942
## fentanilo_mcg 0.9982458 0.9969926 0.9995006 0.006155303
## hipertensionCon hipertensión 2.3141215 0.9795739 5.4668239 0.055754792
En los modelos que se mostraron anteriormente, el primer modelo
corresponde al modelo de regresión en el que se emplearon variables
demográficas para su ajuste, posteriormente se tomaron unicamente las
dos variables de hipertensión y fentanilo, en el último modelo se
observa el modelo de regresión de Poisson ajustado por variables
demográficas ajustado para dar un RR más robusto utilizando el enfoque
sandwich.