Guía de Prácticas - Unidad 5

Utilitarios e Inteligencia Artificial para Bioquímica

Informática - Bioquímica. Dr. Danilo Ceschin


Introducción y Objetivos

La Nueva Caja de Herramientas Digital

Como futuros bioquímicos, necesitan dominar dos tipos de herramientas:

  1. Utilitarios básicos: Para gestionar documentos, imágenes y formatos
  2. Inteligencia Artificial: Para análisis, investigación y redacción asistida

Objetivos (1 hora de práctica)

Al finalizar, serán capaces de:

✅ Crear y editar documentos PDF profesionales
✅ Realizar capturas de pantalla de calidad
✅ Convertir entre formatos de archivos
✅ Usar ChatGPT, Claude, Gemini o DeepSeek efectivamente
✅ Escribir prompts para análisis bioquímico
✅ Reconocer limitaciones éticas de la IA


Gestión de Archivos PDF

¿Por qué PDF en el Laboratorio?

El formato PDF es estándar para:

  • Informes de laboratorio oficiales
  • Protocolos y procedimientos
  • Publicaciones científicas
  • Documentación regulatoria

Herramienta 1: LibreOffice para PDF

Crear PDF desde Calc:

1. Abrir BD_pacientes.csv en LibreOffice Calc
2. Crear hoja resumen con estadísticas
3. Archivo → Exportar como PDF
4. Configurar:
   ✓ Calidad: Alta (300 dpi)
   ✓ PDF/A-1a (archivo permanente)

Editar PDF existente:

1. Clic derecho en archivo.pdf → Abrir con LibreOffice Draw
2. Editar texto, imágenes o anotaciones
3. Archivo → Exportar como PDF

Herramienta 2: Smallpdf (Online)

URL: https://smallpdf.com

Funciones útiles:

  • Comprimir PDF (reducir tamaño)
  • Combinar múltiples PDFs
  • Dividir PDF por páginas
  • Convertir Word/Excel → PDF

⚠️ ADVERTENCIA: No usar con datos de pacientes (privacidad)


Ejercicio Rápido 1 (5 min)

Tarea: Exportar análisis de BD_pacientes como PDF

  1. Crear tabla resumen en Calc con:

    • Estadísticas por grupo (Normal, Riesgo, Alto)
    • Gráfico de distribución
  2. Exportar como Informe_Pacientes.pdf


Herramientas de Captura de Pantalla

Herramientas Nativas de Windows

Recortes de Windows

Atajos rápidos:
Win + Shift + S  → Abrir herramienta de recorte
Win + Impr Pant → Captura completa (guarda en Imágenes)
Alt + Impr Pant → Ventana activa

Tipos de recorte:

  • Rectangular
  • Forma libre
  • Ventana
  • Pantalla completa

ShareX (Recomendado - Gratuito)

Descarga: https://getsharex.com

Ventajas:

  • Anotaciones integradas (flechas, texto, resaltado)
  • Numeración automática
  • Exportación directa
  • Difuminado para datos sensibles

Buenas Prácticas para Capturas Científicas

Formato PNG para gráficos y texto (sin pérdida de calidad)
Anonimizar datos de pacientes (difuminar nombres/DNI)
Nomenclatura descriptiva:
- ❌ captura1.png
- ✅ grafico_correlacion_COL-LDL_2025-03-15.png

Agregar anotaciones (flechas, círculos, texto explicativo)


Ejercicio Rápido 2 (5 min)

Tarea: Capturar y anotar un gráfico

  1. Crear gráfico de dispersión COL vs LDL en Calc
  2. Capturar con Win+Shift+S
  3. Pegar en Paint o ShareX
  4. Agregar anotación: “R² = 0.92”
  5. Guardar como correlacion_anotada.png

Conversores de Formato

Conversión de Documentos

Herramientas Online:

Necesidad Herramienta URL
Cualquier formato CloudConvert cloudconvert.com
PDF ↔︎ Word Smallpdf smallpdf.com
Imágenes Convertio convertio.co

Conversión de Imágenes en Windows

Usar Paint (nativo):

1. Abrir imagen en Paint
2. Archivo → Guardar como
3. Seleccionar formato deseado (PNG, JPG, BMP)

Conversiones comunes:

  • PNG → JPG: Reducir tamaño (para enviar por email)
  • JPG → PNG: Mejor calidad (para publicaciones)
  • Cualquier formato → PDF: Archivo → Imprimir → Microsoft Print to PDF

Ejercicio Rápido 3 (5 min)

Tarea: Convertir formatos

  1. Tomar captura anterior (correlacion_anotada.png)
  2. Convertir a JPG (Paint → Guardar como JPG)
  3. Crear PDF con la imagen:
    • Insertar la imagen JPG en un documento de LibreOffice Writer
    • Archivo → Guardar como PDF

Introducción a los LLM

¿Qué es un LLM (Large Language Model)?

Un Modelo de Lenguaje de Gran Escala es una inteligencia artificial entrenada con millones de textos para:

  • Comprender lenguaje natural
  • Responder preguntas complejas
  • Generar texto coherente
  • Asistir en análisis y redacción

Analogía simple: > Es como un asistente muy estudiado que leyó millones de libros y puede ayudarte a entender, analizar y crear contenido científico.


Principales LLM Disponibles

LLM Características Ideal Para Acceso
ChatGPT Versátil, muy popular Uso general, aprendizaje chat.openai.com
Claude Contexto extenso, preciso Papers largos, análisis detallado claude.ai
Gemini Integrado con Google Búsqueda actualizada gemini.google.com
DeepSeek Gratuito, open source Matemática, privacidad chat.deepseek.com

Recomendación: Empezar con ChatGPT (gratuito) o Gemini (gratis, integrado)


Lo que los LLM PUEDEN hacer:

✅ Explicar conceptos complejos de bioquímica
✅ Ayudar a interpretar datos de laboratorio
✅ Sugerir análisis estadísticos apropiados
✅ Redactar borradores de informes
✅ Revisar gramática y estructura
✅ Generar ideas para investigación

Lo que los LLM NO DEBEN hacer:

❌ Reemplazar tu juicio profesional
❌ Tomar decisiones clínicas por ti
❌ Sustituir la verificación de fuentes
❌ Manejar datos reales de pacientes sin anonimizar


Ingeniería de Prompts Básica

¿Qué es un Prompt?

Un prompt es la instrucción que le das al LLM. La calidad de la respuesta depende de la calidad del prompt.

Fórmula básica:

PROMPT = [CONTEXTO] + [TAREA] + [FORMATO]

Técnica 1: Ser Específico

Vago:

"Explica el colesterol"

Específico:

"Explica la diferencia entre LDL y HDL colesterol a un paciente 
de 50 años con educación secundaria, usando analogías simples 
en 3 párrafos cortos."

Técnica 2: Dar Contexto

Sin contexto:

"Analiza estos valores: COL 280, HDL 35, LDL 195"

Con contexto:

"Soy estudiante de bioquímica analizando resultados de un paciente 
masculino de 55 años:
- Colesterol total: 280 mg/dL
- HDL: 35 mg/dL
- LDL: 195 mg/dL
- Triglicéridos: 250 mg/dL

¿Qué factores de riesgo cardiovascular identificas según 
criterios ATP III?"

Técnica 3: Especificar Formato

"Explica el síndrome metabólico.

Formato requerido:
1. Definición en 1 párrafo
2. Lista de 5 criterios diagnósticos
3. Tabla de valores de referencia
4. Recomendaciones de tratamiento (3 puntos)"

Técnica 4: Asignar un Rol

"Actúa como un bioquímico clínico especializado en lipidología 
con 15 años de experiencia.

Un paciente de 45 años presenta un perfil lipídico inusual:
COL: 180 mg/dL (normal)
LDL: 90 mg/dL (bajo)
HDL: 25 mg/dL (muy bajo)
TG: 325 mg/dL (muy alto)

Proporciona un diagnóstico diferencial y estudios adicionales 
recomendados."

Prompts Listos para Bioquímica

Prompt 1: Análisis de Resultados

"Interpreta estos resultados de laboratorio:

Paciente: Masculino, 62 años
Perfil lipídico:
- Colesterol total: 285 mg/dL
- HDL: 38 mg/dL
- LDL: 195 mg/dL
- Triglicéridos: 260 mg/dL

Proporciona:
1. Factores de riesgo identificados
2. Cálculo de índices aterogénicos (COL/HDL, LDL/HDL)
3. Clasificación de riesgo cardiovascular
4. Sugerencias de estudios adicionales"

Prompt 2: Explicación para Estudio

"Soy estudiante de bioquímica preparando un examen sobre 
metabolismo lipídico.

Explica el transporte reverso de colesterol:
- Mecanismo paso a paso
- Lipoproteínas involucradas
- Importancia clínica
- Relación con aterosclerosis

Usa lenguaje técnico pero didáctico, con ejemplos."

Prompt 3: Análisis Estadístico

"Tengo datos de 102 pacientes con perfil lipídico completo.
Variables: Edad, COL, HDL, LDL, TG, Glucosa
Grupos: Normal (n=45), Riesgo (n=38), Alto (n=19)

Guíame paso a paso para:
1. Calcular estadística descriptiva por grupo
2. Elegir test apropiado para comparar grupos
3. Interpretar resultados clínicamente

Usa LibreOffice Calc, proporciona fórmulas exactas."

Prompt 4: Redacción de Informe

"Redacta un informe de laboratorio clínico profesional:

Paciente: [ID anonimizado]
Estudio: Perfil lipídico
Resultados:
- Colesterol total: 220 mg/dL
- HDL: 55 mg/dL
- LDL: 145 mg/dL
- TG: 100 mg/dL

Incluye:
- Valores de referencia
- Interpretación técnica
- Índices calculados
- Comentario clínico breve

Formato: ISO 15189"

Ejercicio Práctico 4 (10 min)

Tarea: Usar ChatGPT o Gemini para analizar datos

  1. Abrir ChatGPT (https://chat.openai.com) o Gemini (https://gemini.google.com)
  2. Copiar primeras 10 filas de BD_pacientes.csv
  3. Usar este prompt:
"Analiza estos datos de pacientes con perfiles lipídicos:

[PEGAR DATOS AQUÍ]

Calcula:
1. Media y desviación estándar de COL, HDL, LDL, TG
2. Identifica los 2 pacientes con mayor riesgo cardiovascular
3. Explica qué correlación esperas entre COL y LDL y por qué"
  1. Evaluar la respuesta:

    • ¿Son correctos los cálculos?
    • ¿La interpretación tiene sentido?
    • ¿Identificó bien los pacientes de riesgo?

Uso Ético de IA en Bioquímica

Principio 1: Transparencia

Siempre declarar el uso de IA:

Ejemplo en trabajo académico:
"En la elaboración de este informe se utilizó ChatGPT para 
asistencia en la estructuración del documento y revisión 
gramatical. Todo el análisis de datos, interpretación de 
resultados y conclusiones son responsabilidad del autor."

Nunca:

  • Copiar respuestas de IA sin citar
  • Presentar texto de IA como completamente propio
  • Usar IA para exámenes donde no está permitido

Principio 2: Verificación Obligatoria

🔴 CRÍTICO: Siempre verificar información de la IA

Qué verificar:

  • ✅ Referencias bibliográficas (pueden estar inventadas)
  • ✅ Datos numéricos y cálculos
  • ✅ Dosis de medicamentos
  • ✅ Valores de referencia
  • ✅ Guías clínicas citadas

Regla de oro: > Si es crítico para salud o académico → verificar con fuente confiable


Principio 3: Privacidad de Pacientes

🚨 MUY IMPORTANTE: Proteger datos sensibles

NUNCA compartir con IA:

  • Nombres de pacientes
  • Números de DNI/documento
  • Historias clínicas completas
  • Datos que permitan identificación

SIEMPRE anonimizar:

❌ Malo:
"Juan Pérez, DNI 12345678, 55 años, presenta COL 280..."

✅ Bueno:
"Paciente masculino de 55 años presenta COL 280 mg/dL..."

Motivo: Los LLM pueden almacenar conversaciones para entrenamiento futuro.


Principio 4: Responsabilidad Profesional

Recuerda:

  • La IA es una herramienta, no un reemplazo
  • Las decisiones clínicas son siempre humanas
  • La firma de un informe implica responsabilidad legal
  • El criterio profesional es insustituible

Limitaciones de los LLM

1. Alucinaciones

Los LLM pueden inventar información con total confianza.

Ejemplos:

  • Referencias bibliográficas que no existen
  • Fórmulas con constantes incorrectas
  • Datos estadísticos falsos

Solución: Verificar siempre información crítica


2. Conocimiento Desactualizado

Cada modelo tiene una fecha de corte de conocimiento, conocer esto sirve para tomar decisiones sobre la información brindada.

Problema: Información posterior puede estar desactualizada

Solución: Verificar en fuentes actuales cuando sea crítico


3. No Razonamiento Real

Los LLM predicen palabras, no “piensan”:

  • No entienden causalmente
  • No tienen criterio clínico
  • Solo identifican patrones estadísticos

Implicación: Útil para sugerencias, insuficiente para diagnóstico


4. Sesgos

Los modelos reflejan sesgos de sus datos de entrenamiento:

  • Geográficos (más info de países angloparlantes)
  • Demográficos (estudios históricamente en hombres blancos)
  • Temporales (teorías antiguas sobrerrepresentadas)

Solución: Ser crítico y contextualizar


Matriz de Confianza

Tarea ¿Confiar en IA? Verificación
Brainstorming ideas ✅ Alta Mínima
Explicar conceptos ✅ Alta Media
Borradores de texto ✅ Alta Alta
Análisis estadístico ⚠️ Media Alta
Referencias ❌ Baja CRÍTICA
Dosificación ❌ Muy baja NUNCA usar sin verificar
Diagnósticos ❌ Muy baja CRÍTICA

Ejercicio Práctico Integrado

Ejercicio Final: Workflow Completo (10 min)

Escenario: Crear un mini-informe sobre perfiles lipídicos

Tareas:

1. Análisis en Calc (3 min)

  • Abrir BD_pacientes.csv
  • Calcular promedios de COL por grupo
  • Crear gráfico de columnas

2. Captura y edición (2 min)

  • Capturar gráfico con Win+Shift+S
  • Agregar anotación en Paint
  • Guardar como grafico_grupos.png

3. Consulta a IA (3 min)

  • Usar ChatGPT/Gemini con este prompt:
"Tengo datos de 102 pacientes clasificados en 3 grupos:
- Normal: COL promedio 180 mg/dL
- Riesgo: COL promedio 220 mg/dL
- Alto: COL promedio 260 mg/dL

Redacta 2 párrafos breves interpretando estos resultados:
1. Significado clínico de las diferencias
2. Implicaciones para manejo de pacientes

Estilo: profesional pero conciso."

4. Documento final (2 min)

  • Abrir Word o Writer
  • Pegar imagen del gráfico
  • Pegar texto generado por IA
  • Agregar nota: “Análisis asistido por ChatGPT/Gemini”
  • Exportar como PDF: Informe_Final.pdf

Resumen y Conclusiones

Lo que Aprendiste Hoy

Utilitarios:

  • Crear y gestionar PDFs con LibreOffice
  • Capturar pantallas con herramientas de Windows
  • Convertir formatos de archivos

Inteligencia Artificial:

  • Qué son los LLM y cuáles usar
  • Escribir prompts efectivos (específicos, con contexto, con formato)
  • Aplicar IA para análisis bioquímico
  • Reconocer limitaciones y actuar éticamente

Principios Clave para Recordar

🔑 Sobre Utilitarios:

  1. PDF es estándar profesional
  2. Capturas deben ser claras y anotadas
  3. Siempre anonimizar datos de pacientes

🔑 Sobre IA:

  1. Verificar siempre información crítica
  2. Declarar el uso de IA en trabajos
  3. Nunca compartir datos sensibles sin anonimizar
  4. La IA asiste, no reemplaza tu criterio

Aplicación Inmediata

En el laboratorio:

  • Crear informes PDF profesionales
  • Documentar procedimientos con capturas
  • Consultar IA para dudas conceptuales

En formación:

  • Usar IA para estudiar y autoevaluarse
  • Redactar borradores de trabajos (con verificación)
  • Analizar datos con asistencia de IA

En investigación:

  • Explorar literatura con IA
  • Diseñar experimentos consultando IA
  • Redactar manuscritos (revisión humana final)

Recursos para Continuar

LLMs principales:

Herramientas útiles:


Reflexión Final

“La inteligencia artificial no reemplazará a los bioquímicos. Pero los bioquímicos que usen IA efectivamente tendrán ventaja sobre los que no lo hagan.”

Tu compromiso:

  • ⚖️ Usar IA éticamente
  • 🔍 Verificar información crítica
  • 🔒 Proteger privacidad de pacientes
  • 📚 Seguir aprendiendo sobre nuevas herramientas

Evaluación Rápida

Autoevaluación (responde mentalmente):

  1. ¿Cómo exporto un análisis de Calc como PDF?
  2. ¿Qué atajo uso para capturar pantalla en Windows?
  3. ¿Cuál es la fórmula básica de un buen prompt?
  4. ¿Puedo copiar resultados de pacientes reales en ChatGPT?
  5. ¿Debo verificar las referencias que me da la IA?

Respuestas esperadas: 1. Archivo → Exportar como PDF 2. Win + Shift + S 3. [CONTEXTO] + [TAREA] + [FORMATO] 4. NO, solo datos anonimizados 5. SÍ, siempre


Anexo: Prompts de Referencia Rápida

Análisis de Datos

"Tengo [N] pacientes con datos de [variables].
Calcula estadística descriptiva (media, DE, rango).
Sugiere test estadístico para comparar [grupos].
Proporciona fórmulas para LibreOffice Calc."

Interpretación Clínica

"Interpreta este perfil lipídico:
Paciente: [edad/sexo]
Resultados: [valores]
Incluye: factores de riesgo, índices, clasificación,
estudios adicionales sugeridos."

Explicación Educativa

"Explica [concepto bioquímico] para estudiante 
de 2do año de bioquímica.
Incluye: definición, mecanismo, importancia clínica.
Formato: 3 párrafos, lenguaje técnico pero accesible."

Revisión de Texto

"Revisa este párrafo para informe de laboratorio:
[TEXTO]
Mejora: claridad, precisión técnica, gramática.
Mantén estilo profesional ISO 15189."