1. Introducción al Test de McNemar

El Test de McNemar es una prueba estadística no paramétrica fundamental en la investigación clínica y epidemiológica. Se utiliza para analizar la diferencia entre proporciones cuando los datos provienen de muestras pareadas.

Su principal aplicación es en diseños de tipo: - Antes y después: Se mide una característica en los mismos sujetos antes y después de una intervención (ej. un tratamiento, un programa educativo). - Casos y controles pareados: Cada caso con una enfermedad se empareja con uno o más controles sanos que comparten características clave (ej. edad, sexo). - Concordancia diagnóstica: Se compara la clasificación de dos pruebas diagnósticas aplicadas a los mismos individuos.

La pregunta clave que responde el test es: ¿Ha ocurrido un cambio o una diferencia significativa en la proporción de una característica dicotómica entre las dos mediciones/condiciones pareadas?

2. Conceptos Teóricos

A diferencia del test Chi-cuadrado de independencia, que compara proporciones en grupos independientes, el Test de McNemar se enfoca en los pares discordantes. Estos son los sujetos que cambian de categoría entre la primera y la segunda medición.

Tabla de Contingencia 2x2 para Datos Pareados

Los resultados se organizan en una tabla de contingencia 2x2 de la siguiente manera:

Condición 2: Positivo (+) Condición 2: Negativo (-) Total (Condición 1)
Condición 1: Positivo (+) a b a + b
Condición 1: Negativo (-) c d c + d
Total (Condición 2) a + c b + d n
  • a y d: Pares concordantes. No cambiaron de categoría.
  • b y c: Pares discordantes. Sí cambiaron de categoría.
    • b: Sujetos que pasaron de positivo a negativo.
    • c: Sujetos que pasaron de negativo a positivo.

Hipótesis y Estadístico de Prueba

  • Hipótesis Nula (H₀): No hay un cambio significativo. Las proporciones marginales son homogéneas. En otras palabras, la probabilidad de cambiar en una dirección (de + a -) es igual a la probabilidad de cambiar en la otra (de - a +). Matemáticamente, P(b) = P(c).
  • Hipótesis Alternativa (H₁): Hay un cambio significativo. Las proporciones marginales no son homogéneas (P(b) ≠ P(c)).

El estadístico de prueba se calcula únicamente con los pares discordantes (b y c) y sigue una distribución Chi-cuadrado (χ²) con 1 grado de libertad.

Fórmula (con corrección de continuidad de Yates): \[\chi^2 = \frac{(|b - c| - 1)^2}{b + c}\] La corrección -1 se usa para mejorar la aproximación cuando el número de pares discordantes (b+c) es pequeño.

3. Ejercicio Clínico: Eficacia de una Terapia Cognitivo-Conductual

Contexto

Un equipo de psicólogos clínicos quiere evaluar la eficacia de una nueva terapia breve para tratar el insomnio. Para ello, reclutan a 120 pacientes. Se evalúa la presencia de insomnio clínico (Sí/No) en cada paciente antes de iniciar la terapia y después de 6 semanas de tratamiento.

Datos Recopilados

  • 30 pacientes tenían insomnio antes y después.
  • 15 pacientes no tenían insomnio ni antes ni después.
  • 55 pacientes que tenían insomnio antes, ya no lo tenían después.
  • 20 pacientes que no tenían insomnio antes, lo desarrollaron después.

Objetivo: Determinar si la terapia produjo un cambio estadísticamente significativo en la proporción de pacientes con insomnio.

4. Solución con Cálculos Manuales

Paso 1: Organizar los datos en la tabla de contingencia 2x2

Después: Sin Insomnio Después: Con Insomnio Total (Antes)
Antes: Con Insomnio 55 (c) 30 (a) 85
Antes: Sin Insomnio 15 (d) 20 (b) 35
Total (Después) 70 50 120

Identificamos los pares discordantes: - b = 20 (Pacientes que empeoraron: pasaron de “Sin Insomnio” a “Con Insomnio”) - c = 55 (Pacientes que mejoraron: pasaron de “Con Insomnio” a “Sin Insomnio”)

Paso 2: Calcular el estadístico de McNemar

Aplicamos la fórmula: \[\chi^2 = \frac{(|20 - 55| - 1)^2}{20 + 55}\] \[\chi^2 = \frac{(|-35| - 1)^2}{75}\] \[\chi^2 = \frac{(35 - 1)^2}{75}\] \[\chi^2 = \frac{34^2}{75}\] \[\chi^2 = \frac{1156}{75} \approx 15.41\]

Paso 3: Interpretar el resultado

Comparamos nuestro valor calculado (15.41) con el valor crítico de la distribución Chi-cuadrado con 1 grado de libertad para un nivel de significancia α = 0.05. El valor crítico es 3.84.

Dado que 15.41 > 3.84, rechazamos la hipótesis nula.

Conclusión: Existe evidencia estadística suficiente para concluir que la terapia cognitivo-conductual produjo un cambio significativo en la presencia de insomnio. El número de pacientes que mejoraron (55) es significativamente mayor que el número de pacientes que empeoraron (20).

5. Solución Utilizando R

Ahora, realizaremos el mismo análisis en R.

Paso 1: Crear la matriz de contingencia

El paso más importante es construir la matriz correctamente. La función matrix() en R se llena por columnas por defecto.

# Creamos la matriz 2x2 con los datos del ejemplo
# La estructura es:
#         Después(Sí)  Después(No)
# Antes(Sí)      a           b
# Antes(No)      c           d
# Pero en nuestro problema, "Sí" es "Con Insomnio" y "No" es "Sin Insomnio"
# Lo que R espera:
#         Después(+)  Después(-)
# Antes(+)     30          55
# Antes(-)     20          15

# Lo ingresamos por columnas: c(a, c, b, d) -> c(30, 20, 55, 15)
datos_insomnio <- matrix(c(30, 20, 55, 15), 
                         nrow = 2,
                         dimnames = list(
                           "Antes" = c("Con Insomnio", "Sin Insomnio"),
                           "Después" = c("Con Insomnio", "Sin Insomnio")
                         ))

# Imprimimos la matriz para verificar que esté correcta
cat("Tabla de Contingencia en R:\n")
## Tabla de Contingencia en R:
print(datos_insomnio)
##               Después
## Antes          Con Insomnio Sin Insomnio
##   Con Insomnio           30           55
##   Sin Insomnio           20           15

Paso 2: Ejecutar la prueba de McNemar

Usamos la función mcnemar.test(). Por defecto, aplica la corrección de continuidad.

# Ejecutar el test
resultado_test <- mcnemar.test(datos_insomnio)

# Mostrar los resultados
cat("\nResultados del Test de McNemar en R:\n")
## 
## Resultados del Test de McNemar en R:
print(resultado_test)
## 
##  McNemar's Chi-squared test with continuity correction
## 
## data:  datos_insomnio
## McNemar's chi-squared = 15.413, df = 1, p-value = 8.638e-05

Interpretación de la Salida de R

  • McNemar’s chi-squared = 15.413: Este es el valor del estadístico de prueba, que coincide con nuestro cálculo manual.
  • df = 1: Grados de libertad, siempre es 1 en este test.
  • p-value = 8.632e-05: Este es el valor p. Se escribe como 0.00008632.

Como el p-valor (≈ 0.000086) es mucho menor que el nivel de significancia estándar (α = 0.05), rechazamos la hipótesis nula. La conclusión es la misma: el cambio observado es estadísticamente significativo. La terapia fue efectiva en reducir el insomnio en la muestra estudiada.