Agrupamiento o clustering es una tecnica de aprendizaje automatico no supervisado que agrupa datos en funcion de su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:

Instalar paquetes y llamar librerías 

#install.packages("cluster") # Análisis de Agrupamiento 
library(cluster) 
#install.packages("ggplot2") # Graficar 
library(ggplot2) 
#install.packages("data.table") #Manejo de muchos datos 
library(data.table) 
#install.packages("factoextra") # Grafica optimizacion de numero de clusters 
library(factoextra)
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Paso 2. Obtener los datos 

df1 <- data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9))

Paso 3. Entender los datos 

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos 

# Sólo si los datos no estan en la misma escala.
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar numeros de grupos 

# Siempre es un valor inicial cualquiera, luego se optimiza.
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6. Generar los grupos 

set.seed(123)
clusters1 <- kmeans(df1, grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el numero de grupos 

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
# El K.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejo en 7.
plot(optimizacion1, xlab="Número de clusters k", main="Optimización de clusters")

# Se selecciona como óptimo el primer punto mas alto.

Paso 8. Graficar los grupos 

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9. Agregar grupos ala base de datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster = clusters1$cluster)
head(df1_clusters)

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.