Teoría

Agrupamiento o clustering es una técnica de aprendizaje automático no supervisado que agrupa datos en función a su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:

  • Segmentación de clientes
  • Detección de anormalidades
  • Categorización de documentos

Paso 1. Instalar paquetes y llamar librerías

#install.packages("cluster") #Agrupamiento
library(cluster)
#install.packages("ggplot2") #Graficar
library(ggplot2)
#install.packages("data.table") #Manejo de muchos datos
library(data.table)
#install.packages("factoextra") #Grafica de optimización de numero de clusters
library(factoextra)
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Paso 2. Obtener los datos

df1 <- data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9))

Paso 3. Entender los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos

# Sólo si los datos no están en la misma escala
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar números de grupos

# Siempre es un valor inicial cualquiera, luego se optimiza. 
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6. Generar los grupos

clusters1 <- kmeans(df1,grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 1, 5
## 
## Cluster means:
##     x    y
## 1 4.5  8.5
## 2 2.0 10.0
## 3 4.8  4.0
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 3 3 1 3 3 3 1
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1]  1.0  0.0 44.8
##  (between_SS / total_SS =  54.5 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el número de grupos

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
# Normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejo en 7.
plot(optimizacion1, xlab="Número de clusters k")

# Se selecciona como óptimo el numero más cerca al techo de la gráfica.

Paso 8. Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9. Agregar clusters a la base de datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster=clusters1$cluster)
head(df1_clusters)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       3
## 3 8  4       3
## 4 5  8       1
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.

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