Teoria

Agrupamiento o clustering es una tecnica de aprendizaje automatico no supervisado que agrupa datos en funcion de su similitud.

Algunos usos tipicos de esta tecnica son:

  • Segmentacion de clientes
  • Deteccion de anormalidades
  • Categorizacion de documentos

Instalar paquetes y llamar librerias

#install.packages("cluster") # Analisis de Agrupamiento
library(cluster)
#install.packages("ggplot2") # Graficar
library(ggplot2)
#install.packages("data.table") # Manejo de muchos datos
library(data.table)
#install.packages("factoextra") # Grafica optimizacion de numero de clusters
library(factoextra)
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Paso 2: Obtener los datos

df1 <- data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9))

Paso 3: Entender los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4: Escalar los datos

# Solo si los datos no estan en la misma escala.
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5: Determinar el numero de grupos

# Siempre es un valor inicial "cualquiera", luego se optimiza.
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <- 3

Paso 6: Generar los grupos

set.seed(123)

clusters1 <- kmeans(df1,grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7: Optimizar el numero grupos

set.seed(123)
optimizacion1 <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
# El k.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 datos se dejo en 7.
plot(optimizacion1, xlab="Numero de clusters k")

# Se selecciona como optimo el primer punto mas alto.

Paso 8: Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9: Agregar Clusters a la Base de Datos

df1_cluster <- cbind(df1, cluster = clusters1$cluster)
head(df1_cluster)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       1
## 3 8  4       3
## 4 5  8       2
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La tecnica de clustering permite indentificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesitad de etiquetas previas.

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