Teoría

Agrupamiento o Clustering es una técnica de aprendizaje automático no supervisado que agrupa datos en función de su similitud.

Algunos usos típicos de esta técnica son:
* Segmentación de clientes
* Detección de anormalidades
* Categorización de documentos

Paso 1. Instalar paquetes y llamar librerías

#install.packages("cluster") #Análisis de agrupamiento
library(cluster)
#install.packages("ggplot2") #Graficar
library(ggplot2)
#install.packages("data.table") #Manejo de muchos datos
library(data.table)
#install.packages("factoextra") #Gráfica optimización de número de clusters
library(factoextra)
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Paso 2. Crear DataFrame

df1<-data.frame(x=c(2,2,8,5,7,6,1,4), y=c(10,5,4,8,5,4,2,9))

Paso 3. Revisar los datos

summary(df1)
##        x               y         
##  Min.   :1.000   Min.   : 2.000  
##  1st Qu.:2.000   1st Qu.: 4.000  
##  Median :4.500   Median : 5.000  
##  Mean   :4.375   Mean   : 5.875  
##  3rd Qu.:6.250   3rd Qu.: 8.250  
##  Max.   :8.000   Max.   :10.000
str(df1)
## 'data.frame':    8 obs. of  2 variables:
##  $ x: num  2 2 8 5 7 6 1 4
##  $ y: num  10 5 4 8 5 4 2 9

Paso 4. Escalar los datos

#Solo si los datos no están en la misma escala
# datos_escalados <- scale(datos_originales)

Paso 5. Determinar el número de grupos

#Siempre es un valor inicial "cualquiera", luego se optimiza.
plot(df1$x,df1$y)

grupos1 <-3

Paso 6. Generar los grupos

set.seed(123)
clusters1 <- kmeans(df1,grupos1)
clusters1
## K-means clustering with 3 clusters of sizes 2, 3, 3
## 
## Cluster means:
##          x        y
## 1 1.500000 3.500000
## 2 3.666667 9.000000
## 3 7.000000 4.333333
## 
## Clustering vector:
## [1] 2 1 3 2 3 3 1 2
## 
## Within cluster sum of squares by cluster:
## [1] 5.000000 6.666667 2.666667
##  (between_SS / total_SS =  85.8 %)
## 
## Available components:
## 
## [1] "cluster"      "centers"      "totss"        "withinss"     "tot.withinss"
## [6] "betweenss"    "size"         "iter"         "ifault"

Paso 7. Optimizar el número de grupos

set.seed(123)
optimizacion <- clusGap(df1, FUN=kmeans, nstart=1, K.max=7)
#El k.max normalmente es 10, en este ejercicio al ser 8 se dejó en 7.
plot(optimizacion,xlab="Número de clusters", main="Optimización de clusters")

# Se selecciona como óptimo el primer punto más alto

Paso 8. Graficar los grupos

fviz_cluster(clusters1, data=df1)

Paso 9. Agregar clusters a la base de datos

df1_clusters <- cbind(df1, cluster=clusters1$cluster)
head(df1_clusters)
##   x  y cluster
## 1 2 10       2
## 2 2  5       1
## 3 8  4       3
## 4 5  8       2
## 5 7  5       3
## 6 6  4       3

Conclusiones

La técnica de clustering permite identificar patrones o grupos naturales en los datos sin necesidad de etiquetas previas.

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