El clima de Cuenca, Ecuador, se caracteriza por ser templado y fresco a lo largo del año.Es un clima isotérmico, con poca diferencia de temperatura entre los meses más fríos y más cálidos. La temperatura promedio anual es de 16.3°C, con variaciones entre los meses más cálidos (diciembre, con 17.1°C) y los más fríos (julio, con 14.9°C).

En Cuenca, la cantidad de precipitaciones varía a lo largo del año, con un promedio anual de aproximadamente 900 mm. Los meses más lluviosos son marzo, con un promedio de 22 días lluviosos, mientras que agosto registra la menor cantidad de días con lluvia, con un promedio de 10 días. La precipitación promedio mensual es de alrededor de 75 mm.

En Cuenca, los veranos son frescos y nublados y los inviernos son cortos, fríos, secos y parcialmente nublados. Durante el transcurso del año, la temperatura generalmente varía de 7 °C a 17 °C y rara vez baja a menos de 5 °C o sube a más de 19 °C.

En base a la puntuación de turismo, la mejor época del año para visitar Cuenca para actividades de tiempo caluroso es desde mediados de marzo hasta mediados de mayo