第五章 变量间关系可视化
1 解释原始数据
1.1 mtcars
mtcars是R自带的数据集,该数据集摘自 1974年《美国汽车趋势》杂志,包括32款汽车(1973~74款)的油耗、汽车设计和性能等共11个指标。根据该数据集绘制本次练习图形。
指标解释:cyl、vs、am、gear和carb作为因子变量,其余可看作数值变量。
mpg: 燃油效率(英里/加仑),数值越高越省油。
cyl: 发动机气缸数(4/6/8缸),缸数越多通常动力越强。
disp: 发动机排量(立方英寸),排量越大动力越强,油耗越高。
hp: 发动机马力(马力),数值越高动力越强。
drat: 后轴传动比(比值),影响加速和燃油经济性。
wt: 车重(千磅),重量轻的车通常更省油。
qsec: 1/4英里加速时间(秒),时间越短动力越强。
vs: 发动机类型(0=V型,1=直列),V型多见于高性能车。
am: 变速器类型(0=自动,1=手动),手动挡通常更省油。
gear: 前进挡位数(3/4/5挡),挡位多可能更平顺省油。
carb: 化油器数量(1-8个),数量多可能提升动力。
1.2 diamonds
diamonds是R中ggplot2包内置的经典数据集,记录了约 54,000 颗钻石的物理属性和价格信息。数据集包含 10 个变量,4个分类变量,6个数值变量。
- 指标解释:cut、color、clarity为因子变量,其余可看作数值变量。
- carat: 钻石重量,单位是克拉(1克拉=0.2克),数值越大钻石越大越贵。
- cut: 切工质量,分为5个等级:Fair(一般)、Good(良好)、Very Good(很好)、Premium(优质)、Ideal(完美),切工越好钻石光泽越强。
- color: 颜色等级,从D(无色,最佳)到J(浅黄色),颜色越接近无色价值越高。
- clarity: 净度等级,分为8级:I1(内含物明显)、SI1-SI2(小内含物)、VS1-VS2(极小内含物)、VVS1-VVS2(极微小内含物)、IF(内部无瑕),净度越高钻石越纯净。
- depth: 总深度百分比(%),计算公式为z/(x+y)/2*100,影响钻石的光反射效果。
- table: 台面宽度百分比(%),指钻石顶部平面相对于平均宽度的比例,影响钻石的外观比例。
- x: 钻石长度(毫米),物理尺寸之一。
- y: 钻石宽度(毫米),物理尺寸之一。
- z: 钻石高度(毫米),物理尺寸之一。
- price: 钻石价格(美元),反映其综合价值,受carat、cut、color、clarity等因素影响。
2 两变量散点图
2.1 绘图要求
利用
ggplot(data,aes(x,y))+geom_point()绘制燃油效率(mpg,横轴)和车重(wt,纵轴)两个变量的散点图;利用
geom_rug()为横轴和纵轴绘制地毯图;利用
stat_smooth()为散点图添加拟合直线;利用
geom_point()为散点图添加均值点;利用
ggMarginal(type="densigram")为散点图添加边际核密度直方图;利用
ggtitle()将图标题改为散点图+地毯图+线性拟合+边际图。
2.2 作图代码
2.3 图形观察和代码编写的心得体会
图形观察:图形由散点图、地毯图、线性拟合和边际图组成,能够更多面的分析数据。
代码编写:代码采用清晰的图层叠加结构,每个geom_或stat_函数代表一个可视化层,从基础散点图开始,逐步添加地毯图、拟合线、均值点等元素,stat_smooth实现统计拟合线+置信区间,直接嵌入mean()计算均值点,ggMarginal添加边缘分布图。
3 散点图矩阵和相关系数矩阵图
3.1 绘图要求
利用
GGally::ggpairs(columns)绘制除cyl、vs、am、gear和carb外6个变量的散点图矩阵;修改参数
upper=list(continuous = "density"),将上三角图形改为二维核密度等高线图;利用
ggiraphExtra::ggCor()绘制除cyl、vs、am、gear和carb外6个变量的相关系数矩阵图。
3.2 散点图矩阵
3.3 相关系数矩阵图代码
3.4 图形观察和代码编写的心得体会
散点图矩阵:对角线上方绘制二维核密度图,对角线下方绘制点,对角线为单变量的核密度图。
相关系数矩阵图代码:半角矩阵只显示下三角部分,避免冗余,提高可读性。默认的热力图颜色梯度能直观反映相关性强弱。
label=3灵活选择显示内容,mode=2指定矩阵显示模式,避免冗余。
4 大数据集的散点图
4.1 绘图要求
利用
diamonds数据,绘制carat: 钻石重量和price: 钻石价格两个变量的散点图;利用geom_hex(bins=30,size=0.3,color="black"),将散点图转化为六边形分箱散点图;利用
stat_density_2d(geom="raster",aes(fill=..density..),contour=FALSE),将散点图转化为二维核密度图;利用
geom_density_2d(),在散点图上添加核密度等高线;利用
geom_density_2d_filled(alpha=0.8),对核密度等高线区域填充颜色。
4.2 六边形分箱散点图
4.3 二维核密度图
4.4 散点图+密度等高线
4.5 散点图+密度等高线带
4.6 图形观察和代码编写的心得体会
图形观察:使用
alpha=0.8使填充色半透明,避免遮挡散点,guides(fill="none")移除填充图例,使图形更简洁;bins=30控制六边形数量,平衡细节与计算效率,size=0.3, color="black"使六边形边框清晰但不突兀;contour=FALSE直接显示平滑密度,避免等高线干扰,fl=density..映射颜色到密度值,直观反映数据集中区域;最简洁的密度可视化方式,仅显示等高线,不填充颜色,适用于叠加在其他图形上(如散点图)。代码编写:所有图形均基于
p(基础ggplot对象),通过+逐步叠加图层,符合 ggplot2 的语法风格,每个geom_*或stat_*函数独立控制一个可视化元素,便于调整。
5 3D散点图和气泡图
5.1 绘图要求
绘制hp发动机马力、mpg燃油效率和wt车重三个变量的 3D 散点图和气泡图。
采用
scatterplot3d(x=hp,y=wt,z=mpg)绘制3D散点图,并添加回归平面。采用
ggplot(df,aes(x=hp,y=mpg,color=wt,size=wt))绘制气泡图
5.2 3D散点图代码
5.3 气泡图代码
5.4 图形观察和代码编写的心得体会
图形观察:highlight.3d=TRUE 用颜色梯度强调深度(Z轴),type=“h” 添加垂直线,辅助定位点的高度,col.axis=“blue” 和 col.grid=“lightblue” 提升坐标轴可视性,plane3d(fit) 直观显示二元线性回归的拟合效果;通过 color=wt 和 size=wt 将第三维(车重)映射到视觉元素,避免3D视角问题,对连续变量分箱,增强颜色区分度。
代码编写:先拟合模型
lm(mpg~hp+wt),再通过s3d$plane3d()叠加平面,逻辑清晰;基础映射aes(x=hp, y=mpg)定义核心坐标系,color和size作为附加美学。
6 分组散点图
6.1 绘图要求
以气缸数(cy1)为因子,绘制车重(wt)和燃油效率(mpg)的分组散点图,添加回归直线;
利用
facet_grid(~cy1,scale="free_x"),按因子变量分面;利用
ggplot(data=df,aes(x=wt,y=mpg,shape=cyl,color=cyl)),按形状和颜色分组
6.2 按因子变量分面代码
- 注意分组变量cyl需要转化为因子
6.3 按形状和颜色分组代码
6.4 图形观察和代码编写的心得体会
图形观察:分面清晰,按气缸数(
cyl)分组,每个子图独立显示wt和mpg的关系,避免重叠;自定义形状,明确指定形状(如三角形、圆形等),避免默认形状重复。代码编写:因子化分类变量,
mutate(cyl=factor(cyl))确保cyl被视为分类变量,避免连续变量误解,先定义基础映射(aes(x=wt, y=mpg, color=cyl)),再叠加geom_point和stat_smooth,facet_grid(~cyl)严格按单变量分面,scale="free_x"灵活调整坐标轴。