第五章 变量间关系可视化
1 解释原始数据
1.1 mtcars
mtcars
是R自带的数据集,该数据集摘自 1974年《美国汽车趋势》杂志,包括32款汽车(1973~74款)的油耗、汽车设计和性能等共11个指标。根据该数据集绘制本次练习图形。
指标解释:cyl、vs、am、gear和carb作为因子变量,其余可看作数值变量。
mpg: 燃油效率(英里/加仑),数值越高越省油。
cyl: 发动机气缸数(4/6/8缸),缸数越多通常动力越强。
disp: 发动机排量(立方英寸),排量越大动力越强,油耗越高。
hp: 发动机马力(马力),数值越高动力越强。
drat: 后轴传动比(比值),影响加速和燃油经济性。
wt: 车重(千磅),重量轻的车通常更省油。
qsec: 1/4英里加速时间(秒),时间越短动力越强。
vs: 发动机类型(0=V型,1=直列),V型多见于高性能车。
am: 变速器类型(0=自动,1=手动),手动挡通常更省油。
gear: 前进挡位数(3/4/5挡),挡位多可能更平顺省油。
carb: 化油器数量(1-8个),数量多可能提升动力。
1.2 diamonds
diamonds
是R中ggplot2包内置的经典数据集,记录了约 54,000 颗钻石的物理属性和价格信息。数据集包含 10 个变量,4个分类变量,6个数值变量。
- 指标解释:cut、color、clarity为因子变量,其余可看作数值变量。
- carat: 钻石重量,单位是克拉(1克拉=0.2克),数值越大钻石越大越贵。
- cut: 切工质量,分为5个等级:Fair(一般)、Good(良好)、Very Good(很好)、Premium(优质)、Ideal(完美),切工越好钻石光泽越强。
- color: 颜色等级,从D(无色,最佳)到J(浅黄色),颜色越接近无色价值越高。
- clarity: 净度等级,分为8级:I1(内含物明显)、SI1-SI2(小内含物)、VS1-VS2(极小内含物)、VVS1-VVS2(极微小内含物)、IF(内部无瑕),净度越高钻石越纯净。
- depth: 总深度百分比(%),计算公式为z/(x+y)/2*100,影响钻石的光反射效果。
- table: 台面宽度百分比(%),指钻石顶部平面相对于平均宽度的比例,影响钻石的外观比例。
- x: 钻石长度(毫米),物理尺寸之一。
- y: 钻石宽度(毫米),物理尺寸之一。
- z: 钻石高度(毫米),物理尺寸之一。
- price: 钻石价格(美元),反映其综合价值,受carat、cut、color、clarity等因素影响。
2 两变量散点图
2.1 绘图要求
利用
ggplot(data,aes(x,y))+geom_point()
绘制燃油效率(mpg,横轴)和车重(wt,纵轴)两个变量的散点图;利用
geom_rug()
为横轴和纵轴绘制地毯图;利用
stat_smooth()
为散点图添加拟合直线;利用
geom_point()
为散点图添加均值点;利用
ggMarginal(type="densigram")
为散点图添加边际核密度直方图;利用
ggtitle()
将图标题改为散点图+地毯图+线性拟合+边际图
。
2.2 作图代码
2.3 图形观察和代码编写的心得体会
多元素整合:该图巧妙整合了多种可视化元素,既展示了变量间关系,又呈现了各自的分布特征。
视觉层次:通过颜色和大小区分不同元素(蓝色散点、红色拟合线、黄色均值点),使图形信息丰富但不混乱。
边际图价值:边缘的密度直方图能直观展示单变量分布,帮助识别偏态或异常值。
统计量展示:均值点的添加提供了数据中心的直观参考。
图层叠加:ggplot2的图层思想体现得很好,通过
+
逐步添加不同图形元素。美学控制:
使用shape=21实现可填充的圆形点
精心选择的颜色(“deepskyblue”, “steelblue”)使图形专业美观
alpha参数控制边际图的透明度
统计函数整合:
stat_smooth()
方便地添加了统计模型结果。扩展包使用:
ggMarginal()
来自ggExtra包,轻松实现边际图添加。
3 散点图矩阵和相关系数矩阵图
3.1 绘图要求
利用
GGally::ggpairs(columns)
绘制除cyl、vs、am、gear和carb外6个变量的散点图矩阵;修改参数
upper=list(continuous = "density")
,将上三角图形改为二维核密度等高线图;利用
ggiraphExtra::ggCor()
绘制除cyl、vs、am、gear和carb外6个变量的相关系数矩阵图。
3.2 散点图矩阵
3.3 相关系数矩阵图代码
3.4 图形观察和代码编写的心得体会
- 散点图矩阵:
全面性:一次性展示所有数值变量间关系,效率极高。
对角线设计:默认显示变量分布直方图或密度曲线。
模式识别:容易发现线性/非线性关系和异常值。
比较优势:不同变量组合的关系一目了然。
- 相关系数矩阵:
量化展示:精确显示相关系数值和显著性。
视觉编码:颜色深浅直观反映相关性强弱。
紧凑性:半角矩阵节省空间,避免冗余信息。
统计严谨:包含P值信息,区分统计显著性和实际显著性。
4 大数据集的散点图
4.1 绘图要求
利用
diamonds
数据,绘制carat
: 钻石重量
和price
: 钻石价格
两个变量的散点图;利用geom_hex(bins=30,size=0.3,color="black")
,将散点图转化为六边形分箱散点图;利用
stat_density_2d(geom="raster",aes(fill=..density..),contour=FALSE)
,将散点图转化为二维核密度图;利用
geom_density_2d()
,在散点图上添加核密度等高线;利用
geom_density_2d_filled(alpha=0.8)
,对核密度等高线区域填充颜色。
4.2 六边形分箱散点图
4.3 二维核密度图
4.4 散点图+密度等高线
4.5 散点图+密度等高线带
4.6 图形观察和代码编写的心得体会
六边形分箱图:
有效解决高密度区域点重叠问题。
颜色深浅直观反映数据点密度。
六边形比正方形分箱更自然美观。
二维核密度图:
提供连续平滑的密度分布。
特别适合大数据集模式识别。
热图形式突出高密度区域。
等高线变体:
散点+等高线保留原始数据点。
填充等高线增强视觉冲击力。
多图层叠加展示丰富信息。
共同优势:
都有效处理了高密度散点图的过度绘制问题。
揭示数据分布的整体模式和局部特征。
颜色使用科学专业,考虑色盲用户。
5 3D散点图和气泡图
5.1 绘图要求
绘制hp发动机马力、mpg燃油效率和wt车重三个变量的 3D 散点图和气泡图。
采用
scatterplot3d(x=hp,y=wt,z=mpg)
绘制3D散点图,并添加回归平面。采用
ggplot(df,aes(x=hp,y=mpg,color=wt,size=wt))
绘制气泡图
5.2 3D散点图代码
5.3 气泡图代码
5.4 图形观察和代码编写的心得体会
5.4.1 3D散点图立体优势:
立体优势:直观展示三维关系,特别适合工程和科学数据
回归平面价值:清晰显示两个预测变量对响应变量的联合影响
深度感知:垂直线和颜色渐变有效解决3D图形的深度模糊问题
交互局限:静态图像难以全面展示三维结构,需配合旋转查看
5.4.2 气泡图:
高维编码:成功展示四维数据而不显拥挤
视觉层次:大小和颜色双重编码强化了车重变量的表达
平衡艺术:透明度、大小范围和颜色梯度的平衡使图形美观实用
自解释性:内置标注减少额外说明需求
6 分组散点图
6.1 绘图要求
以气缸数(cy1)为因子,绘制车重(wt)和燃油效率(mpg)的分组散点图,添加回归直线;
利用
facet_grid(~cy1,scale="free_x")
,按因子变量分面;利用
ggplot(data=df,aes(x=wt,y=mpg,shape=cyl,color=cyl))
,按形状和颜色分组
6.2 按因子变量分面代码
- 注意分组变量cyl需要转化为因子
6.3 按形状和颜色分组代码
6.4 图形观察和代码编写的心得体会
6.4.1 分面散点图优势
组间比较:并排展示使差异对比一目了然
模式识别:可同时观察组内关系和组间差异
节省空间:共享y轴避免重复标签
统计增强:每个子图独立拟合反映组内关系
6.4.2 形状颜色分组价值
双通道编码:冗余编码增强变量识别可靠性
单图优势:保持数据整体感,适合较少分组
视觉区分:精心选择的形状和颜色组合避免混淆
美学控制:专业配色方案提升图形质量