sc-homework2(filtered data)
Yi Jie Chen
2025.05.05
library(dplyr)##
## Attaching package: 'dplyr'## The following objects are masked from 'package:stats':
##
## filter, lag## The following objects are masked from 'package:base':
##
## intersect, setdiff, setequal, unionlibrary(Seurat)## Loading required package: SeuratObject## Loading required package: sp##
## Attaching package: 'SeuratObject'## The following objects are masked from 'package:base':
##
## intersect, tlibrary(patchwork)
library(ggplot2)
library(Matrix)
library(irlba)Step 1: Load the count matrix
Note that the echo = FALSE parameter was added to the
code chunk to prevent printing of the R code that generated the
plot.
count_matrix <- readMM("matrix.mtx.gz")
dim(count_matrix)## [1] 36601 10985rownames(count_matrix) <- read.table("features.tsv.gz")$V2
colnames(count_matrix) <- read.table("barcodes.tsv.gz")$V1
head(colnames(count_matrix), 5)## [1] "AAACCCAGTATATGGA-1" "AAACCCAGTATCGTAC-1" "AAACCCAGTCGGTGAA-1"
## [4] "AAACCCAGTTAGAAAC-1" "AAACCCAGTTATCTTC-1"cell_totals <- colSums(count_matrix)
head(cell_totals, 5)## AAACCCAGTATATGGA-1 AAACCCAGTATCGTAC-1 AAACCCAGTCGGTGAA-1 AAACCCAGTTAGAAAC-1
## 887 1628 6591 17318
## AAACCCAGTTATCTTC-1
## 3527Step 2: Histogram of the cell totals
hist(cell_totals,
breaks = 100,
main = "Histogram of Total Reads per Cell",
xlab = "Total Reads per Cell",
col = "skyblue")
There is a long-tail situation in the raw data distribution, it’s hard
to tell the distribution of cells
log_totals <- log10(cell_totals + 1) # avoid log(0)
hist(log_totals,
breaks = 100,
main = "Histogram of log10(Total Reads per Cell)",
xlab = "log10(Total Reads + 1)",
col = "salmon")
If we transform the data by applying log10 scale, some extreme values
could be compressed, so that we can know the distribution of the cells’
reads
Step 3: Log-normalize the data
P <- t(t(count_matrix) / cell_totals) # use transpose technique to retain dgCMatrix
head(P, 5)## 5 x 10985 sparse Matrix of class "dgCMatrix"## [[ suppressing 10985 column names 'AAACCCAGTATATGGA-1', 'AAACCCAGTATCGTAC-1', 'AAACCCAGTCGGTGAA-1' ... ]]##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.304758e-05 . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 0.000107446 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 0.0001582529 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6.749005e-05 . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . 8.37942e-05 . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . 5.408036e-05 . . . 0.000108003 . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 1.751406e-05 . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 8.744316e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.200208e-05 . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 0.0001788269 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . 4.317044e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . 5.1717e-05 . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . 0.0001315789 . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6.541934e-05 . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0.0001039177 . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . 3.914048e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . 0.000151699 . . . . . . 8.702463e-05
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . 6.827337e-05 . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 8.660258e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . 5.04261e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 7.27855e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . 6.453278e-05 . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . 5.920663e-05 . . 4.583582e-05 . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . 0.0001481043 . 5.259283e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.735918e-05 . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . 0.0001034982 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . 0.0003353454 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 6.096446e-05 .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 7.70238e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . 0.0003369272 . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 7.827789e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 0.0002908668 . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . 4.750594e-05 . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 0.0001348618 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . 0.0001937984 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 9.823183e-05 . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . 5.185108e-05 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . 0.0002898971 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 5.638886e-05 .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
##
## MIR1302-2HG . . . . . . . .
## FAM138A . . . . . . . .
## OR4F5 . . . . . . . .
## AL627309.1 . . . . . . . .
## AL627309.3 . . . . . . . .S <- 1e4
Y <- log1p(P * S) / log(10) # log1p(x) = log(x + 1), in order to avoid dense matrix, then transfer to 10-basedFind highly variable genes
mu <- rowMeans(P)v <- apply(P, 1, var)## Warning in asMethod(object): sparse->dense coercion: allocating vector of size
## 3.0 GiBPlot
plot(mu, v,
log = "xy", # easier to identify HVGs
xlab = "Mean Expression (μ)",
ylab = "Variance (v)",
main = "Gene Variance vs Mean Expression")## Warning in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log): 10540 x values <= 0 omitted
## from logarithmic plot## Warning in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log): 10540 y values <= 0 omitted
## from logarithmic plot
cv2 <- v / (mu^2)
plot(mu, cv2,
log = "xy",
xlab = "Mean Expression (μ)",
ylab = "CV² = Variance / Mean²",
main = "CV² vs Mean Expression")## Warning in xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log): 10540 x values <= 0 omitted
## from logarithmic plot
v_over_mu <- v / mu
valid <- mu > 0 & v_over_mu > 0
plot(mu[valid], v_over_mu[valid],
log = "xy",
xlab = "gene means",
ylab = "gene variances / gene means",
main = "Mean vs Variance/Mean")
abline(h = median(v_over_mu[valid]), col = "purple")
v_over_mu_filtered <- v_over_mu[valid]
top_genes_idx <- order(v_over_mu_filtered, decreasing = TRUE)[1:1000]
top_genes <- names(v_over_mu_filtered)[top_genes_idx]
head(top_genes, 5)## [1] "IGLC2" "IGKC" "IGHA1" "IGHM" "PPBP"Perform principal component analysis (PCA)
# Y_tilde is the expression matrix of top 1000 HVGs
# Center: minus the row mean of each row
# Scale: divide the row standard deviation of each row
Y_tilde <- Y[top_genes, ]
gene_means <- rowMeans(Y_tilde)
gene_sds <- apply(Y_tilde, 1, sd)
yc <- (Y_tilde - gene_means) / gene_sds # result: centered and scaled matrix Y_cHere, we have called prcomp_irlba, a truncated PCA function for sparse matrices supplied by the irlba package. We instruct the function to not center and scale the matrix as we have already done this manually in the previous step.
For now, we simply inspect the result of the call, which contains some general information and the two matrices R and X:
pca <- irlba::prcomp_irlba(t(yc), n = 30, center = FALSE, scale. = FALSE)
# center = FALSE, we already did it
# scale. = FALSE, we already did it
str(pca)## List of 5
## $ scale : logi FALSE
## $ totalvar: num 1000
## $ sdev : num [1:30] 7.98 6.51 6.18 4.26 4.04 ...
## $ rotation: num [1:1000, 1:30] 0.00811 0.01165 0.00557 0.01635 -0.02892 ...
## ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
## .. ..$ : NULL
## .. ..$ : chr [1:30] "PC1" "PC2" "PC3" "PC4" ...
## $ x : num [1:10985, 1:30] -14.37 -1.35 6.44 -6.66 -11.07 ...
## ..- attr(*, "dimnames")=List of 2
## .. ..$ : NULL
## .. ..$ : chr [1:30] "PC1" "PC2" "PC3" "PC4" ...
## - attr(*, "class")= chr [1:2] "irlba_prcomp" "prcomp"The rotation matrix has one row per gene and 30 columns, as we have requested the top 30 principal components (n=30). The score matrix has one row per cell and 30 columns, i.e., each cell is now represented by a 30-dimensional vector.
For completeness, we set the row names of the two matrices to the gene and cell labels:
rownames(pca$x) <- colnames(yc)
rownames(pca$rotation) <- rownames(yc)
dim(yc)## [1] 1000 10985Yc_reconstructed <- pca$rotation %*% t(pca$x)
dim(Yc_reconstructed)## [1] 1000 10985gene <- "MT-ND2"
# 檢查是否在 rownames 中
if (gene %in% rownames(yc)) {
plot(yc[gene, ], Yc_reconstructed[gene, ],
xlab = "original",
ylab = "reconstructed",
main = gene)
} else {
cat("Gene not found in yc matrix.\n")
}
plot(yc[gene, ], Yc_reconstructed[gene, ],
xlab = "original",
ylab = "reconstructed",
main = gene,
pch = ".", cex = 1) # 跟老師一樣使用實心點且尺寸小
abline(0, 1, col = "red", lty = 2) # 加上 y=x 對角線參考
plot(pca$x[, 1], pca$x[, 2],
xlab = "PC1",
ylab = "PC2",
pch = ".", cex = 1,
xlim = c(-20, 20),
ylim = c(-20, 20),
main = "First two principal components (zoomed)")
ump <- uwot::umap(pca$x) # 使用前幾個 PCA 組件進行 UMAP（預設前 50 PCs）
plot(ump,
cex = 0.1, # 點的大小（0.1 很細緻）
col = "#00000030", # 黑色透明點（30為透明度）
asp = 1) # 保持 X/Y 軸比例一致
#install.packages("sleepwalk")
# library(sleepwalk)
# sleepwalk::sleepwalk(ump, pca$x)