Visualisation des points dans EcobioSoil avec coordonnées GPS

## Reading layer `regions-version-simplifiee' from data source 
##   `https://raw.githubusercontent.com/gregoiredavid/france-geojson/master/regions-version-simplifiee.geojson' 
##   using driver `GeoJSON'
## Simple feature collection with 13 features and 2 fields
## Geometry type: MULTIPOLYGON
## Dimension:     XY
## Bounding box:  xmin: -5.103601 ymin: 41.36705 xmax: 9.559721 ymax: 51.0884
## Geodetic CRS:  WGS 84

Programmes dans Ecobisoil + suppression SOERE

unique(filtered_data_clean$Programme)
##  [1] "AgrInnov"             "AF"                   "VITTEL - AGRIVAIR"   
##  [4] "Bio2_ANDRA"           "BIO2"                 "VADETOX-Biotechnosol"
##  [7] "Breizh Sukr"          "CEREMA"               "Cerema / ARB"        
## [10] "CN"                   "Macon-Davayé"         "Dephy Bio"           
## [13] "Dephy"                "ECLAS"                "ECO_IMPACT"          
## [16] "HOP!"                 "JASSUR"               "Kerguéhennec"        
## [19] "SOERE-ACBB-Lusignan"  "MONS"                 "OBL"                 
## [22] "OPVT_BZH"             "OPVT_IDF"             "OPVT"                
## [25] "Life-PTD"             "REVA"                 "CA_41"               
## [28] "CA_45"                "DATASOL"              "RMQS_BioDiv"         
## [31] "SBT-ENI-M"            "SBT-ENI-TB"           "SHR"                 
## [34] "Beaujolais-SICAREX"   "Sols de Bretagne"     "SUSTAIN reseau"      
## [37] "Theix"                "TIGA"                 "TRAMBIOSOIL"         
## [40] "TSE"                  "Vadebio"              "VineDivers"          
## [43] "VitiEcobioSol-CIBC"   "AGRIVAIR-VITTEL"      "ZAA"                 
## [46] "ZAA_HR"
filtered_data_clean <- filtered_data_clean %>%
  filter(!(Programme %in% c("SOERE-ACBB-Lusignan", "MONS", "Theix")))

Observations par année et protocole

Tableau de synthèse du nombre de lignes par Protocole et Annee
Protocole 1990 1991 1992 1993 1994 1995 1996 1997 1998 1999 2000 2001 2002 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020 2021 2022 2023
F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 34 17 0 0 0 0 0 0
F_HS 19 23 22 15 29 6 7 8 15 30 24 10 20 9 47 57 78 24 16 48 71 9 36 77 9 48 0 9 0 0 0 0 0
HS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77 218 72 180 104 210 516 359 880 342 50
HS_biodiv 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 4 9 0 0 0 0 0 0 0
M 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 82 212 177 180 221 153 141 0 0 0 0 0
M_HS 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 19 0 0 0 0 0 25 13 12 0 0 0 0 0

Observations par région

## Reading layer `regions-version-simplifiee' from data source 
##   `https://raw.githubusercontent.com/gregoiredavid/france-geojson/master/regions-version-simplifiee.geojson' 
##   using driver `GeoJSON'
## Simple feature collection with 13 features and 2 fields
## Geometry type: MULTIPOLYGON
## Dimension:     XY
## Bounding box:  xmin: -5.103601 ymin: 41.36705 xmax: 9.559721 ymax: 51.0884
## Geodetic CRS:  WGS 84
Nombre de prélèvements par région
region n
Bretagne 880
Bourgogne-Franche-Comté 875
Nouvelle-Aquitaine 805
Île-de-France 647
Grand Est 588
Hauts-de-France 398
Auvergne-Rhône-Alpes 294
Occitanie 183
Centre-Val de Loire 140
Provence-Alpes-Côte d’Azur 100
Pays de la Loire 94
Normandie 28
NA 24
Corse 17

IDF

Attention ces chiffres vont être différents de ceux d’Albin, pas les mêmes programmes

Tableau de synthèse du nombre de lignes en IDF par Protocole et Annee
Protocole 2009 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020 2021 2022
F_HS 5 0 0 0 0 0 0 0 0 0
HS 0 20 3 28 66 116 140 111 50 82
M 0 0 0 9 2 0 0 0 0 0
M_HS 0 0 0 14 1 0 0 0 0 0

Bretagne

Attention ces chiffres vont être différents de ceux d’Albin, pas les mêmes programmes

Tableau de synthèse du nombre de lignes en Bretagne par Protocole et Annee
Protocole 2005 2006 2007 2010 2013 2014 2015 2016 2017 2018 2019 2020 2021
F 0 0 0 0 0 0 0 34 17 0 0 0 0
F_HS 24 57 60 2 0 29 0 48 0 0 0 0 0
HS 0 0 0 0 3 0 20 111 38 59 117 79 90
HS_biodiv 0 0 0 0 0 0 0 7 0 0 0 0 0
M 0 0 0 0 23 22 21 0 0 0 0 0 0
M_HS 0 0 0 19 0 0 0 0 0 0 0 0 0

Nombre de vers de terre passé au laboratoire

## [1] 371978

Nombre de vers de terre pesé

Attention ce chiffre est approximatif car contient également les lignes avec pesé multiple… On a pas de colonne qui nous dit si c’est une pesé individuelle ou globale

## [1] 268001

Combien d’observations conservées dans la BDD Landworm / au total disponible

Ecobiosoil = 5600 observations

LandWorm (avec Ecobiosoil) = 8100 observations

Attention, qu’est ce qu’on appelle “observation” ? un plot avec des répétitions ? un seul test-bêche biodiv ?