Utiliser Git avec RStudio

  1. Vérifier si Git est déjà installé sur RSTudio dans un terminal (dont RStudio)
git –version

Sinon téléchargement sur le site officiel

  1. S’assurer que RStudio et Git soient bien connectés

Dans un premier temps, indiquez à RStudio où se trouve Git sur votre ordinateur : Tools > Global Options > Git/SVN dans la barre de menu verticale

  1. Associer git à une adresse mail, et accessoirement à votre civilité ou à un avatar. Dans un terminal (Rstudio, invite commande windows,…):
git config --global user.email EMAIL-ADRESSE
git config --global user.name "PRENOM et/NOM"

  1. Ouverture d’un compte sur une plateforme académique (https://gitlab.huma-num.fr, https://gitub.u-bordeaux.fr, …)

  2. Donner à RStudio le droit d’intéragir avec Git

Pour cela, générer une clé SSH dans Rstudio:
Tools > Global Options > Git/SVN dans la barre de menu verticale > Create SSH key (On génère la clé sous la zône d’enregistrement) > View public key (On visualise et récupère la clé SSH en la copiant)

  1. Dans votre instance Giltlab,

• Cliquer sur votre avatar
• Aller sur preference
• Cliquer sur SSH Keys (dans le menu à gauche)
• Cliquer sur Add new key
• Coller votre clé générée dans RStudio
• Ajouter un titre si vous comptez avoir plusieurs clés
• Modifier la date d’expiration (X si aucune expiration)
• Cliquer sur Add key

ou

Dans votre instance Github,

• Cliquer sur l’avatar à droite
• Sur la barre verticale qui s’ouvre, aller sur Settings
• Aller sur la page SSH and GPH keys
• Aller sur New SSH key en haut à droite
• Coller la clé générée dans RStudio (si on ajoute plusieurs clés, renseigner le titre pour identifier son rôle)

Vous pouvez aussi consulter les références suivantes (en utilisant le protocole SSH pour la connexion):

• documentation UtilitR

• ThinkR

• Formation de Marc Thevenin(INED)