Análisis del ERIE

Author

Conabio

ERIE

La evaluación rápida de integridad ecosistémica (ERIE), se llevó acabo por cada uno de los socios del proyecto SIPECAM.

Los datos fueron capturados con la plataforma de KoboCollect y los siguientes análisis son los correspondientes a estos datos

Análisis y métodos

Se explicará paso a paso lo que se hizo para obtener los resultados

Descarga de los datos

Los datos fueron descargados a través del API de KoboToolbox. todo el proceso se encuentra en el archivo download_data.R. De todos los datos que contenía el cuestionario se seleccionaron los siguientes:

id. Corresponde al id que se crea en koboCollect para cada registro
nombre. El nombre capturado por el socio
apellido. El apellido capturado por el socio
equipo. El equipo con el que se capturaron las coordenadas geográficas. Puede ser un gps o un celular.
ecosistema. El ecosistema en el que se capturaron los datos.
latitud_gps. a pesar de tener la palabra gps, en esta columna ya se tiene la latitud tanto de los celulares como de los gps.
longitud_gps. al igual que la latitud_gps, en esta columna ya se tiene la longitud tanto de los celulares como de los gps.
submitted. El nombre del socio que capturó los datos. Este campo esta ligado al nodo que se le asignó, por lo que si dice sipecam17 se refiere al cúmulo 17.
transeco. El valor del transecto que se capturó, que va de 1 a 5. Sin embargo, este valor puede estar mal capturado.
variable. Es igual que la columna ecosistema.
valor. El valor del ERIE en porcentaje

Adición de los datos de Integridad Ecosistémica

En base a las coordenadas geográficas se hizo el cruce de los datos del ERIE con las coverturas de integridad ecosistémica. Estos datos se pudieron llevar acabo con el apoyo de Everardo

Análisis de los datos obtenidos

la tabla final tiene los siguientes campos:

 [1] "id"                   "nombre"               "apellido"            
 [4] "equipo"               "ecosistema"           "latitud_gps"         
 [7] "longitud_gps"         "submitted"            "transecto"           
[10] "variable"             "valor"                "geometry"            
[13] "integrity_1000m_2014" "integrity_250m_2014"  "integrity_250m_2018"

Valor de integridad ecosistémica

A cada columna de la Integridad ecosistema: integrity_1000m_2014, integrity_2500m_2014 e integrity_2500m_2018 se les asignó un valor categórico de acuerdo a si el valor era mayor a 0.75 se nombró como íntegro o menor a 0.75 se nombró como degradado. Además el valor del ERIE se dividió entre 100 para tener un valor entre 0 y 1.

Número de registros en la tabla

A continuación se muestra el número de registros en la tabla de acuerdo a los tres tipos de integridad. La columna llamada integridad corresponde al corte de 0.75 que se explicó anteriormente

Número de registros en la tabla de acuerdo a los tres tipos de integridad
submitted	integridad	integrity_1000m_2014	integrity_250m_2014	integrity_250m_2018
sipecam05	degradado	16	2	15
sipecam05	integro	32	46	33
sipecam06	degradado	17	15	16
sipecam06	integro	12	14	13
sipecam13	degradado	69	72	34
sipecam13	integro	9	6	44
sipecam16	degradado	1	7	6
sipecam16	integro	15	9	10
sipecam17	degradado	11	10	4
sipecam17	integro	20	21	27
sipecam18	degradado	17	13	23
sipecam18	integro	11	15	5
sipecam22	degradado	2	0	2
sipecam22	integro	12	14	12
sipecam31	degradado	5	5	1
sipecam31	integro	15	15	19
sipecam32	degradado	25	49	43
sipecam32	integro	25	1	7
sipecam33	degradado	17	18	12
sipecam33	integro	54	53	59
sipecam36	degradado	5	9	2
sipecam36	integro	38	34	41
sipecam37	degradado	5	4	7
sipecam37	integro	4	5	2
sipecam50	degradado	23	26	21
sipecam50	integro	17	14	19
sipecam81	degradado	22	15	3
sipecam81	integro	5	12	24
sipecam92	degradado	15	5	2
sipecam92	integro	24	34	37
sipecam93	degradado	14	14	14
sipecam93	integro	6	6	6
sipecam96	degradado	8	0	1
sipecam96	integro	33	41	40
sipecam97	degradado	21	12	15
sipecam97	integro	28	37	34
sipecam98	degradado	16	5	6
sipecam98	integro	25	36	35
sipecam99	degradado	23	18	4
sipecam99	integro	29	34	48

La metodología estaba diseñada para hacer 5 mediciones (transectos), por cada nodo. Por ejemplo en un Cúmulo que tiene 5 nodos en íntegro y 5 nodos en degradado, se deberían de tener 50 registros: 25 en íntegro y 25 en degradado. Se tienen un total de 20 cúmulos, por lo que deberíamos tener un total de 1000 registros. Sí sumamos todos los resgistros de la columna de integrity_100m_2014 se tiene un total de 746 registros. La diferencia entre estos dos valores es de 254 registros. Hay que mencionar que algunos cúmulos se tienen más de 50 registros.

Valor del ERIE

De aquí en adelante se analizará el valor del ERIE solo con respecto a la columna de integriy_1000m_2014.

Boxplot y Violin plot

Análisis de varianza

Se empezará hacer un análisis global para los datos de integro y degradado con respecto al valor del ERIE. hacemos un Anova simple con:

model1 <- aov(valor_ERIE ~ integrity_1000m_2014_cat, data = tabla2)

y después una prueba post-hoc par el modelo elavorado (model1):

posthoc <- HSD.test(model1, "integrity_1000m_2014_cat", group = TRUE)

En el Anova se obtuvo el siguiente resultado:

                          Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
integrity_1000m_2014_cat   1  0.464  0.4637    17.5 3.22e-05 ***
Residuals                744 19.716  0.0265                     
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

Hay diferncias significativas entre los grupos integro y degradado con respecto al valor del ERIE. Se puede decir de forma global que este tipo de puede dar resultados semejantes al concepto de Integridad Ecosistémica.

Análisis Post-hoc

Análisis Post-hoc
integridad	media	std	r	groups
degradado	0.6201928	0.1802597	332	b
integro	0.6703623	0.1473008	414	a

Análisis por cada cúmulo

Ahora se analizará cada cúmulo de forma individual para el valor del ERIE