R Markdown

Simple linear regression

setwd("C:/Users/karar alshikh/Desktop/R")
getwd()
## [1] "C:/Users/karar alshikh/Desktop/R"
data2<-read.csv("C:/Users/karar alshikh/Desktop/R/karpur.csv")

plot(data2$phi.N,data2$phi.core.fraction)

porosity_model <- lm(data2$phi.core.fraction~data2$phi.N,data=data2)
summary(porosity_model)
## 
## Call:
## lm(formula = data2$phi.core.fraction ~ data2$phi.N, data = data2)
## 
## Residuals:
##       Min        1Q    Median        3Q       Max 
## -0.135237 -0.030779  0.009432  0.033563  0.104025 
## 
## Coefficients:
##             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
## (Intercept)  0.30962    0.00485  63.846   <2e-16 ***
## data2$phi.N -0.18207    0.02080  -8.753   <2e-16 ***
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.04368 on 817 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.08573,    Adjusted R-squared:  0.08462 
## F-statistic: 76.61 on 1 and 817 DF,  p-value: < 2.2e-16
corrected_porosity <- predict(porosity_model)

head(cbind(data2$phi.core.fraction,predict(porosity_model)))
##       [,1]      [,2]
## 1 0.339000 0.2349747
## 2 0.334131 0.2537279
## 3 0.331000 0.2726631
## 4 0.349000 0.2879570
## 5 0.350644 0.2970604
## 6 0.353152 0.3008839
permeability_model <- lm(data2$k.core~corrected_porosity,data=data2)

summary(permeability_model)
## 
## Call:
## lm(formula = data2$k.core ~ corrected_porosity, data = data2)
## 
## Residuals:
##     Min      1Q  Median      3Q     Max 
## -3187.3 -1406.4  -768.6   971.2 13338.4 
## 
## Coefficients:
##                    Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
## (Intercept)           -8852       1529  -5.789 1.01e-08 ***
## corrected_porosity    41228       5670   7.271 8.38e-13 ***
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 2168 on 817 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.06077,    Adjusted R-squared:  0.05962 
## F-statistic: 52.86 on 1 and 817 DF,  p-value: 8.376e-13
# porosity corrected to log scale
print(corrected_porosity)
##         1         2         3         4         5         6         7         8 
## 0.2349747 0.2537279 0.2726631 0.2879570 0.2970604 0.3008839 0.3010660 0.2996094 
##         9        10        11        12        13        14        15        16 
## 0.2976066 0.2961501 0.2950577 0.2966963 0.2992453 0.3007018 0.3008839 0.3005198 
##        17        18        19        20        21        22        23        24 
## 0.2990632 0.2972425 0.2954218 0.2936011 0.2903239 0.2874107 0.2874107 0.2890494 
##        25        26        27        28        29        30        31        32 
## 0.2895956 0.2886852 0.2883211 0.2879570 0.2852259 0.2812204 0.2801280 0.2835873 
##        33        34        35        36        37        38        39        40 
## 0.2879570 0.2915983 0.2943294 0.2954218 0.2965142 0.2954218 0.2934190 0.2923266 
##        41        42        43        44        45        46        47        48 
## 0.2919625 0.2914163 0.2905059 0.2885032 0.2844976 0.2859542 0.2874107 0.2915983 
##        49        50        51        52        53        54        55        56 
## 0.2941473 0.2952397 0.2956039 0.2963322 0.2965142 0.2965142 0.2963322 0.2956039 
##        57        58        59        60        61        62        63        64 
## 0.2954218 0.2959680 0.2963322 0.2957859 0.2950577 0.2945115 0.2943294 0.2939653 
##        65        66        67        68        69        70        71        72 
## 0.2934190 0.2930549 0.2925087 0.2923266 0.2932370 0.2941473 0.2946935 0.2948756 
##        73        74        75        76        77        78        79        80 
## 0.2948756 0.2950577 0.2952397 0.2954218 0.2956039 0.2957859 0.2957859 0.2956039 
##        81        82        83        84        85        86        87        88 
## 0.2959680 0.2959680 0.2956039 0.2957859 0.2959680 0.2961501 0.2961501 0.2961501 
##        89        90        91        92        93        94        95        96 
## 0.2961501 0.2961501 0.2959680 0.2959680 0.2961501 0.2961501 0.2961501 0.2961501 
##        97        98        99       100       101       102       103       104 
## 0.2959680 0.2957859 0.2957859 0.2961501 0.2965142 0.2968784 0.2966963 0.2956039 
##       105       106       107       108       109       110       111       112 
## 0.2943294 0.2932370 0.2897777 0.2865004 0.2855901 0.2870466 0.2894135 0.2901418 
##       113       114       115       116       117       118       119       120 
## 0.2885032 0.2850438 0.2783073 0.2693859 0.2633776 0.2606465 0.2579155 0.2577334 
##       121       122       123       124       125       126       127       128 
## 0.2606465 0.2633776 0.2648341 0.2661086 0.2662907 0.2664727 0.2666548 0.2662907 
##       129       130       131       132       133       134       135       136 
## 0.2642879 0.2610107 0.2568231 0.2533637 0.2528175 0.2540920 0.2551844 0.2555486 
##       137       138       139       140       141       142       143       144 
## 0.2562768 0.2577334 0.2590079 0.2597362 0.2611927 0.2637417 0.2650162 0.2644700 
##       145       146       147       148       149       150       151       152 
## 0.2637417 0.2608286 0.2570051 0.2539099 0.2522713 0.2535458 0.2573693 0.2617389 
##       153       154       155       156       157       158       159       160 
## 0.2644700 0.2666548 0.2688397 0.2708424 0.2717528 0.2721169 0.2722990 0.2721169 
##       161       162       163       164       165       166       167       168 
## 0.2708424 0.2686576 0.2673831 0.2672010 0.2670190 0.2666548 0.2664727 0.2668369 
##       169       170       171       172       173       174       175       176 
## 0.2670190 0.2661086 0.2642879 0.2622851 0.2599182 0.2571872 0.2560948 0.2584617 
##       177       178       179       180       181       182       183       184 
## 0.2624672 0.2650162 0.2664727 0.2684755 0.2730273 0.2810383 0.2832231 0.2852259 
##       185       186       187       188       189       190       191       192 
## 0.2844976 0.2792176 0.2730273 0.2697500 0.2675652 0.2655624 0.2637417 0.2630134 
##       193       194       195       196       197       198       199       200 
## 0.2641058 0.2637417 0.2644700 0.2682934 0.2688397 0.2688397 0.2710245 0.2775790 
##       201       202       203       204       205       206       207       208 
## 0.2874107 0.2952397 0.2974246 0.2996094 0.3016122 0.3005198 0.2965142 0.2899597 
##       209       210       211       212       213       214       215       216 
## 0.2823128 0.2753942 0.2712066 0.2688397 0.2677472 0.2675652 0.2675652 0.2673831 
##       217       218       219       220       221       222       223       224 
## 0.2673831 0.2672010 0.2666548 0.2655624 0.2641058 0.2626493 0.2624672 0.2621031 
##       225       226       227       228       229       230       231       232 
## 0.2630134 0.2659265 0.2712066 0.2773969 0.2817666 0.2824949 0.2797638 0.2761224 
##       233       234       235       236       237       238       239       240 
## 0.2726631 0.2701141 0.2681114 0.2670190 0.2659265 0.2646520 0.2637417 0.2637417 
##       241       242       243       244       245       246       247       248 
## 0.2641058 0.2642879 0.2642879 0.2637417 0.2630134 0.2626493 0.2622851 0.2619210 
##       249       250       251       252       253       254       255       256 
## 0.2615569 0.2615569 0.2621031 0.2628314 0.2633776 0.2631955 0.2630134 0.2624672 
##       257       258       259       260       261       262       263       264 
## 0.2617389 0.2611927 0.2610107 0.2601003 0.2577334 0.2571872 0.2568231 0.2575513 
##       265       266       267       268       269       270       271       272 
## 0.2573693 0.2570051 0.2571872 0.2577334 0.2584617 0.2593720 0.2601003 0.2610107 
##       273       274       275       276       277       278       279       280 
## 0.2615569 0.2619210 0.2619210 0.2617389 0.2622851 0.2653803 0.2712066 0.2773969 
##       281       282       283       284       285       286       287       288 
## 0.2792176 0.2808562 0.2821307 0.2837694 0.2861363 0.2886852 0.2914163 0.2941473 
##       289       290       291       292       293       294       295       296 
## 0.2966963 0.2988811 0.3005198 0.3017942 0.3028867 0.3039791 0.3048894 0.3057998 
##       297       298       299       300       301       302       303       304 
## 0.3065281 0.3068922 0.3068922 0.3067101 0.3061639 0.3056177 0.3034329 0.2994273 
##       305       306       307       308       309       310       311       312 
## 0.2936011 0.2848618 0.2744838 0.2662907 0.2626493 0.2613748 0.2626493 0.2648341 
##       313       314       315       316       317       318       319       320 
## 0.2664727 0.2690217 0.2715707 0.2728452 0.2733914 0.2735735 0.2735735 0.2741197 
##       321       322       323       324       325       326       327       328 
## 0.2748479 0.2752121 0.2752121 0.2748479 0.2743017 0.2743017 0.2746659 0.2750300 
##       329       330       331       332       333       334       335       336 
## 0.2753942 0.2755762 0.2759404 0.2763045 0.2761224 0.2744838 0.2724810 0.2719348 
##       337       338       339       340       341       342       343       344 
## 0.2719348 0.2704783 0.2693859 0.2701141 0.2712066 0.2719348 0.2721169 0.2715707 
##       345       346       347       348       349       350       351       352 
## 0.2704783 0.2692038 0.2684755 0.2686576 0.2688397 0.2684755 0.2686576 0.2710245 
##       353       354       355       356       357       358       359       360 
## 0.2732093 0.2746659 0.2744838 0.2715707 0.2668369 0.2619210 0.2575513 0.2559127 
##       361       362       363       364       365       366       367       368 
## 0.2542741 0.2531817 0.2542741 0.2571872 0.2597362 0.2608286 0.2611927 0.2615569 
##       369       370       371       372       373       374       375       376 
## 0.2621031 0.2635596 0.2653803 0.2668369 0.2684755 0.2692038 0.2693859 0.2692038 
##       377       378       379       380       381       382       383       384 
## 0.2686576 0.2681114 0.2673831 0.2662907 0.2657445 0.2651983 0.2650162 0.2659265 
##       385       386       387       388       389       390       391       392 
## 0.2661086 0.2653803 0.2650162 0.2642879 0.2635596 0.2631955 0.2633776 0.2637417 
##       393       394       395       396       397       398       399       400 
## 0.2639238 0.2641058 0.2637417 0.2628314 0.2615569 0.2611927 0.2617389 0.2621031 
##       401       402       403       404       405       406       407       408 
## 0.2622851 0.2624672 0.2633776 0.2648341 0.2653803 0.2650162 0.2648341 0.2653803 
##       409       410       411       412       413       414       415       416 
## 0.2666548 0.2672010 0.2673831 0.2679293 0.2688397 0.2695679 0.2706603 0.2713886 
##       417       418       419       420       421       422       423       424 
## 0.2712066 0.2717528 0.2717528 0.2710245 0.2693859 0.2672010 0.2664727 0.2662907 
##       425       426       427       428       429       430       431       432 
## 0.2644700 0.2631955 0.2621031 0.2599182 0.2571872 0.2550024 0.2535458 0.2526355 
##       433       434       435       436       437       438       439       440 
## 0.2519072 0.2515430 0.2515430 0.2515430 0.2504506 0.2488120 0.2480837 0.2480837 
##       441       442       443       444       445       446       447       448 
## 0.2455347 0.2402547 0.2377058 0.2377058 0.2366133 0.2364313 0.2362492 0.2364313 
##       449       450       451       452       453       454       455       456 
## 0.2377058 0.2397085 0.2420754 0.2446244 0.2477196 0.2499044 0.2515430 0.2533637 
##       457       458       459       460       461       462       463       464 
## 0.2559127 0.2582796 0.2588258 0.2588258 0.2584617 0.2586438 0.2582796 0.2573693 
##       465       466       467       468       469       470       471       472 
## 0.2568231 0.2570051 0.2575513 0.2580975 0.2590079 0.2606465 0.2622851 0.2635596 
##       473       474       475       476       477       478       479       480 
## 0.2641058 0.2646520 0.2653803 0.2659265 0.2657445 0.2653803 0.2648341 0.2633776 
##       481       482       483       484       485       486       487       488 
## 0.2617389 0.2610107 0.2608286 0.2611927 0.2615569 0.2615569 0.2615569 0.2615569 
##       489       490       491       492       493       494       495       496 
## 0.2613748 0.2615569 0.2615569 0.2624672 0.2619210 0.2619210 0.2617389 0.2619210 
##       497       498       499       500       501       502       503       504 
## 0.2628314 0.2648341 0.2681114 0.2708424 0.2724810 0.2728452 0.2732093 0.2733914 
##       505       506       507       508       509       510       511       512 
## 0.2739376 0.2746659 0.2753942 0.2763045 0.2770328 0.2770328 0.2759404 0.2737555 
##       513       514       515       516       517       518       519       520 
## 0.2713886 0.2697500 0.2692038 0.2690217 0.2688397 0.2675652 0.2662907 0.2653803 
##       521       522       523       524       525       526       527       528 
## 0.2650162 0.2651983 0.2655624 0.2657445 0.2648341 0.2639238 0.2633776 0.2635596 
##       529       530       531       532       533       534       535       536 
## 0.2641058 0.2641058 0.2639238 0.2641058 0.2641058 0.2639238 0.2639238 0.2633776 
##       537       538       539       540       541       542       543       544 
## 0.2622851 0.2611927 0.2604644 0.2602824 0.2608286 0.2626493 0.2646520 0.2653803 
##       545       546       547       548       549       550       551       552 
## 0.2650162 0.2646520 0.2644700 0.2641058 0.2639238 0.2635596 0.2633776 0.2628314 
##       553       554       555       556       557       558       559       560 
## 0.2624672 0.2628314 0.2626493 0.2615569 0.2602824 0.2588258 0.2580975 0.2579155 
##       561       562       563       564       565       566       567       568 
## 0.2579155 0.2579155 0.2579155 0.2580975 0.2584617 0.2588258 0.2591900 0.2595541 
##       569       570       571       572       573       574       575       576 
## 0.2599182 0.2608286 0.2613748 0.2615569 0.2608286 0.2601003 0.2601003 0.2604644 
##       577       578       579       580       581       582       583       584 
## 0.2602824 0.2599182 0.2593720 0.2586438 0.2582796 0.2582796 0.2584617 0.2580975 
##       585       586       587       588       589       590       591       592 
## 0.2582796 0.2586438 0.2590079 0.2599182 0.2601003 0.2599182 0.2602824 0.2611927 
##       593       594       595       596       597       598       599       600 
## 0.2630134 0.2661086 0.2688397 0.2688397 0.2662907 0.2633776 0.2622851 0.2622851 
##       601       602       603       604       605       606       607       608 
## 0.2617389 0.2604644 0.2593720 0.2588258 0.2590079 0.2595541 0.2597362 0.2601003 
##       609       610       611       612       613       614       615       616 
## 0.2599182 0.2595541 0.2586438 0.2570051 0.2557306 0.2557306 0.2560948 0.2566410 
##       617       618       619       620       621       622       623       624 
## 0.2570051 0.2570051 0.2564589 0.2555486 0.2550024 0.2550024 0.2553665 0.2557306 
##       625       626       627       628       629       630       631       632 
## 0.2564589 0.2573693 0.2586438 0.2602824 0.2619210 0.2628314 0.2635596 0.2635596 
##       633       634       635       636       637       638       639       640 
## 0.2630134 0.2624672 0.2622851 0.2624672 0.2622851 0.2621031 0.2622851 0.2624672 
##       641       642       643       644       645       646       647       648 
## 0.2622851 0.2617389 0.2615569 0.2615569 0.2619210 0.2621031 0.2619210 0.2615569 
##       649       650       651       652       653       654       655       656 
## 0.2610107 0.2602824 0.2595541 0.2593720 0.2595541 0.2602824 0.2608286 0.2610107 
##       657       658       659       660       661       662       663       664 
## 0.2608286 0.2610107 0.2611927 0.2617389 0.2619210 0.2617389 0.2621031 0.2630134 
##       665       666       667       668       669       670       671       672 
## 0.2637417 0.2642879 0.2646520 0.2644700 0.2637417 0.2633776 0.2630134 0.2621031 
##       673       674       675       676       677       678       679       680 
## 0.2617389 0.2617389 0.2617389 0.2617389 0.2615569 0.2611927 0.2608286 0.2604644 
##       681       682       683       684       685       686       687       688 
## 0.2602824 0.2601003 0.2601003 0.2602824 0.2606465 0.2611927 0.2615569 0.2615569 
##       689       690       691       692       693       694       695       696 
## 0.2615569 0.2615569 0.2613748 0.2604644 0.2593720 0.2586438 0.2582796 0.2579155 
##       697       698       699       700       701       702       703       704 
## 0.2575513 0.2573693 0.2577334 0.2580975 0.2580975 0.2580975 0.2584617 0.2593720 
##       705       706       707       708       709       710       711       712 
## 0.2606465 0.2615569 0.2630134 0.2644700 0.2641058 0.2631955 0.2630134 0.2635596 
##       713       714       715       716       717       718       719       720 
## 0.2635596 0.2633776 0.2628314 0.2630134 0.2631955 0.2628314 0.2624672 0.2630134 
##       721       722       723       724       725       726       727       728 
## 0.2641058 0.2651983 0.2657445 0.2657445 0.2650162 0.2639238 0.2624672 0.2619210 
##       729       730       731       732       733       734       735       736 
## 0.2626493 0.2635596 0.2641058 0.2641058 0.2641058 0.2642879 0.2648341 0.2650162 
##       737       738       739       740       741       742       743       744 
## 0.2644700 0.2644700 0.2679293 0.2743017 0.2788535 0.2792176 0.2753942 0.2695679 
##       745       746       747       748       749       750       751       752 
## 0.2677472 0.2672010 0.2679293 0.2692038 0.2686576 0.2684755 0.2686576 0.2690217 
##       753       754       755       756       757       758       759       760 
## 0.2695679 0.2701141 0.2708424 0.2733914 0.2755762 0.2761224 0.2741197 0.2710245 
##       761       762       763       764       765       766       767       768 
## 0.2686576 0.2675652 0.2673831 0.2675652 0.2675652 0.2670190 0.2661086 0.2657445 
##       769       770       771       772       773       774       775       776 
## 0.2672010 0.2677472 0.2679293 0.2682934 0.2686576 0.2686576 0.2688397 0.2684755 
##       777       778       779       780       781       782       783       784 
## 0.2672010 0.2659265 0.2659265 0.2670190 0.2692038 0.2708424 0.2706603 0.2688397 
##       785       786       787       788       789       790       791       792 
## 0.2673831 0.2675652 0.2679293 0.2675652 0.2673831 0.2677472 0.2681114 0.2692038 
##       793       794       795       796       797       798       799       800 
## 0.2692038 0.2677472 0.2659265 0.2644700 0.2637417 0.2642879 0.2686576 0.2695679 
##       801       802       803       804       805       806       807       808 
## 0.2697500 0.2702962 0.2717528 0.2726631 0.2708424 0.2702962 0.2695679 0.2693859 
##       809       810       811       812       813       814       815       816 
## 0.2695679 0.2690217 0.2684755 0.2686576 0.2697500 0.2717528 0.2706603 0.2681114 
##       817       818       819 
## 0.2653803 0.2630134 0.2613748