Reporte Mieles

Author

Carlos J. Gómez

Published

August 27, 2024

1 Análisis con todos los datos sin diferenciar por origen botanico

A continuación se muestran los análisis comparativos del efecto de la dosis de radiación en distintos compuestos indicadores de actividad antioxidante (supongo eso es lo que se quiere mostrar).

La comparación se llevó a cabo mediante Análisis de Varianza utilizando el software estadístico R

referencia: R Core Team (2024). R: A Language and Environment for Statistical Computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. https://www.R-project.org/.

1.1 Fenoles vs radiación

Important

Este gráfico me deja varias dudas: ¿es posible que un aumento en la dosis de radiación genere un aumento en el contenido de fenoles?

Una cosa es que no cambie; otra, es que aumenten.

Los gráficos muestran el promedio \(\pm\) intervalo de confianza al 95%.

             Df Sum Sq Mean Sq F value  Pr(>F)   
Radiacion     2  0.712  0.3561   4.809 0.00952 **
Residuals   144 10.664  0.0741                   
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

El p-value del Anova es 0.0095153 lo que indica fuerte evidencia en contra de la hipótesis nula de igualdad de medias en el contenido de fenoles para las distintas dosis. La siguente tabla muestra los estadísticos de resumen:

Radiacion n Promedio SD IC
1 kGy 49 0.7869413 0.2504224 0.0719297
5 kGy 49 0.8613868 0.2965226 0.0851712
No treatment 49 0.6913278 0.2674453 0.0768193
Important

Eventualmente, podrían cuestionar este análisis debido a que en rigor el p-value es menor que el famoso 0,05 y hay diferencias estadísticamente signficativas, sin embargo, la diferencia observada ¿es realmente importante?¿cambia las conclusiones?¿o es irrelevante?

1.1.1 Corrección paper

1.2 FRAP vs radiación

             Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
Radiacion     2   10.3   5.128   0.967  0.383
Residuals   144  763.5   5.302               

Todo ok

Radiacion n Promedio SD IC
1 kGy 49 4.855816 2.118291 0.6084443
5 kGy 49 5.047183 2.036919 0.5850715
No treatment 49 5.486769 2.696266 0.7744581

1.2.1 Corrección paper

2 DPPH vs radiación

             Df Sum Sq Mean Sq F value Pr(>F)
Radiacion     2    222  110.89   1.144  0.322
Residuals   144  13964   96.97               

Todo OK a pesar de que visualmente se oberva que disminuye el DPPH con la dosis. Pero el pvalue es mayor que 0,05.

Radiacion n Promedio SD IC
1 kGy 49 16.91394 2.118291 0.6084443
5 kGy 49 17.44996 2.036919 0.5850715
No treatment 49 19.74583 2.696266 0.7744581

2.0.1 Corrección paper

3 Gráficos de correlación sin irradación

Todas las correlaciones positivas y estadísticamente significativas

3.1 Fenoles vs FRAP

3.2 Fenoles vs DPPH

3.3 FRAP vs DPPH

4 Análisis de mieles monoflorales (> 45%)

(Sólo se muestran aquellas especies presentes en más de tres muestras)

4.1 ¿Cuáles son las especies más frecuentes en las muestras?

\(n\) es el número de muestras que contienen la especie, sin considerar el porcentaje de la composición. Por ejemplo, de las 24 muestras: 21 de ellas contienen la especie Lotus pedunculatus

4.2 ¿Cuáles son las principales especies monoflorales presentes en las muestras?

4.3 Análisis de variables en las muestras monoflorales

Este análisis fue realizado con ANOVA con dos factores: origen botánico y dosis.

4.3.1 Análisis de radiación sobre Fenoles en base a origen botánico

(No se consideran muestras 17, 34 y la especie Aristotelia/Crinodendron)

                   Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
Radiacion           2  0.707  0.3534   5.624  0.00482 ** 
Especie            12  3.370  0.2808   4.470 9.84e-06 ***
Radiacion:Especie  24  0.627  0.0261   0.416  0.99204    
Residuals         102  6.409  0.0628                     
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
6 observations deleted due to missingness
                   Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
Radiacion           2  0.707  0.3534   5.624  0.00482 ** 
Especie            12  3.370  0.2808   4.470 9.84e-06 ***
Radiacion:Especie  24  0.627  0.0261   0.416  0.99204    
Residuals         102  6.409  0.0628                     
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
6 observations deleted due to missingness

Obviamente iba a aparecer significativa la Especie debido al “outlier” Luma apiculata. No hay interacción entre los dos factores.

4.3.2 Análisis de radiación sobre FRAP en base a origen botánico

                   Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
Radiacion           2   10.5   5.245   1.176    0.313    
Especie            12  208.6  17.385   3.897 6.41e-05 ***
Radiacion:Especie  24   70.0   2.917   0.654    0.884    
Residuals         102  455.1   4.461                     
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
6 observations deleted due to missingness

Confirma el análisis anterior que no existen diferencias en el cotenido de FRAP a medida que aumenta la dosis, sin embargo, si hay diferencias entre las Especies (¿lo que era esperable?)

4.3.3 Análisis de radiación sobre DPPH en base a origen botánico

                   Df Sum Sq Mean Sq F value   Pr(>F)    
Radiacion           2    211   105.7   1.587    0.209    
Especie            12   5562   463.5   6.960 4.49e-09 ***
Radiacion:Especie  24    269    11.2   0.168    1.000    
Residuals         102   6792    66.6                     
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
6 observations deleted due to missingness

Hay datos perdidos (no medidos lo que hace más difícil la interpretación) Confirma el análisis anterior (con sólo radiación como factor). Existen diferencias en el DPPH entre las especies (¿era esperable?)