library(rio)
sust= import("V-Dem-2024 - V-Dem-2024.csv")
sust
##                         country_name v2x_polyarchy v2x_liberal v2x_partip
## 1                             Mexico          0.53        0.48       0.65
## 2                           Suriname          0.75        0.84       0.57
## 3                             Sweden          0.88        0.98       0.65
## 4                        Switzerland          0.89        0.96       0.88
## 5                              Ghana          0.66        0.86       0.38
## 6                       South Africa          0.69        0.85       0.56
## 7                              Japan          0.82        0.90       0.57
## 8                      Burma/Myanmar          0.08        0.04       0.31
## 9                             Russia          0.19        0.15       0.38
## 10                           Albania          0.51        0.75       0.56
## 11                             Egypt          0.19        0.39       0.21
## 12                             Yemen          0.13        0.14       0.22
## 13                          Colombia          0.70        0.79       0.65
## 14                            Poland          0.59        0.73       0.56
## 15                            Brazil          0.78        0.89       0.64
## 16          United States of America          0.85        0.92       0.66
## 17                          Portugal          0.85        0.89       0.61
## 18                       El Salvador          0.39        0.15       0.47
## 19                        Bangladesh          0.25        0.22       0.30
## 20                           Bolivia          0.59        0.53       0.63
## 21                             Haiti          0.21        0.15       0.26
## 22                          Honduras          0.53        0.70       0.54
## 23                              Mali          0.23        0.41       0.58
## 24                          Pakistan          0.34        0.48       0.55
## 25                              Peru          0.70        0.82       0.62
## 26                           Senegal          0.62        0.72       0.58
## 27                       South Sudan          0.14        0.19       0.23
## 28                             Sudan          0.14        0.13       0.28
## 29                           Vietnam          0.15        0.37       0.56
## 30                       Afghanistan          0.08        0.10       0.03
## 31                         Argentina          0.84        0.80       0.62
## 32                          Ethiopia          0.28        0.24       0.39
## 33                             India          0.38        0.62       0.51
## 34                             Kenya          0.56        0.79       0.60
## 35                       North Korea          0.08        0.04       0.15
## 36                       South Korea          0.70        0.86       0.61
## 37                            Kosovo          0.67        0.70       0.52
## 38                           Lebanon          0.36        0.53       0.47
## 39                           Nigeria          0.49        0.60       0.61
## 40                       Philippines          0.43        0.58       0.57
## 41                          Tanzania          0.44        0.84       0.53
## 42                            Taiwan          0.82        0.88       0.75
## 43                          Thailand          0.29        0.60       0.39
## 44                            Uganda          0.28        0.58       0.39
## 45                         Venezuela          0.21        0.12       0.48
## 46                             Benin          0.50        0.58       0.49
## 47                            Bhutan          0.53        0.82       0.56
## 48                      Burkina Faso          0.21        0.56       0.42
## 49                          Cambodia          0.20        0.13       0.37
## 50                         Indonesia          0.54        0.60       0.60
## 51                        Mozambique          0.35        0.50       0.54
## 52                             Nepal          0.68        0.74       0.61
## 53                         Nicaragua          0.17        0.04       0.28
## 54                             Niger          0.39        0.60       0.60
## 55                            Zambia          0.53        0.77       0.65
## 56                          Zimbabwe          0.29        0.44       0.53
## 57                            Guinea          0.18        0.25       0.42
## 58                       Ivory Coast          0.45        0.46       0.61
## 59                        Mauritania          0.36        0.37       0.52
## 60                            Canada          0.86        0.88       0.65
## 61                         Australia          0.85        0.96       0.70
## 62                          Botswana          0.56        0.75       0.43
## 63                           Burundi          0.19        0.15       0.18
## 64                        Cape Verde          0.75        0.86       0.54
## 65          Central African Republic          0.30        0.19       0.31
## 66                             Chile          0.84        0.96       0.66
## 67                        Costa Rica          0.87        0.95       0.65
## 68                       Timor-Leste          0.70        0.69       0.55
## 69                           Ecuador          0.65        0.69       0.76
## 70                            France          0.88        0.93       0.63
## 71                           Germany          0.86        0.97       0.66
## 72                         Guatemala          0.51        0.54       0.49
## 73                              Iran          0.16        0.25       0.08
## 74                              Iraq          0.37        0.45       0.46
## 75                           Ireland          0.90        0.93       0.63
## 76                             Italy          0.84        0.91       0.75
## 77                            Jordan          0.26        0.73       0.28
## 78                            Latvia          0.85        0.91       0.67
## 79                           Lesotho          0.64        0.76       0.53
## 80                           Liberia          0.64        0.64       0.47
## 81                            Malawi          0.58        0.83       0.57
## 82                          Maldives          0.60        0.73       0.49
## 83                          Mongolia          0.53        0.73       0.40
## 84                           Morocco          0.26        0.71       0.41
## 85                       Netherlands          0.85        0.95       0.62
## 86                            Panama          0.73        0.76       0.52
## 87                  Papua New Guinea          0.48        0.76       0.53
## 88                             Qatar          0.09        0.31       0.04
## 89                      Sierra Leone          0.50        0.73       0.59
## 90                             Spain          0.84        0.90       0.65
## 91                             Syria          0.15        0.15       0.14
## 92                           Tunisia          0.47        0.56       0.55
## 93                           Türkiye          0.29        0.25       0.42
## 94                           Ukraine          0.42        0.50       0.58
## 95                    United Kingdom          0.85        0.91       0.66
## 96                           Uruguay          0.85        0.92       0.77
## 97                           Algeria          0.27        0.29       0.23
## 98                            Angola          0.35        0.36       0.18
## 99                           Armenia          0.63        0.61       0.44
## 100                       Azerbaijan          0.19        0.16       0.12
## 101                          Belarus          0.16        0.08       0.16
## 102                         Cameroon          0.30        0.29       0.25
## 103                             Chad          0.15        0.13       0.34
## 104                            China          0.07        0.13       0.12
## 105 Democratic Republic of the Congo          0.32        0.24       0.40
## 106            Republic of the Congo          0.25        0.31       0.55
## 107                         Djibouti          0.25        0.30       0.40
## 108               Dominican Republic          0.69        0.58       0.60
## 109                          Eritrea          0.07        0.03       0.03
## 110                            Gabon          0.29        0.43       0.56
## 111                       The Gambia          0.64        0.80       0.59
## 112                          Georgia          0.60        0.76       0.54
## 113                    Guinea-Bissau          0.42        0.43       0.35
## 114                          Jamaica          0.80        0.85       0.59
## 115                       Kazakhstan          0.28        0.35       0.30
## 116                       Kyrgyzstan          0.36        0.43       0.39
## 117                             Laos          0.13        0.31       0.39
## 118                            Libya          0.19        0.30       0.45
## 119                       Madagascar          0.47        0.40       0.50
## 120                          Moldova          0.71        0.86       0.67
## 121                          Namibia          0.65        0.79       0.49
## 122              Palestine/West Bank          0.25        0.36       0.42
## 123                           Rwanda          0.21        0.25       0.42
## 124                          Somalia          0.17        0.43       0.25
## 125                        Sri Lanka          0.58        0.69       0.55
## 126                         Eswatini          0.12        0.32       0.25
## 127                       Tajikistan          0.17        0.09       0.16
## 128                             Togo          0.42        0.41       0.48
## 129              Trinidad and Tobago          0.75        0.84       0.58
## 130                     Turkmenistan          0.15        0.08       0.07
## 131                   Palestine/Gaza          0.14        0.22       0.36
## 132                       Somaliland          0.40        0.51       0.51
## 133                       Uzbekistan          0.22        0.20       0.17
## 134                          Austria          0.84        0.93       0.65
## 135                          Bahrain          0.13        0.17       0.12
## 136                         Barbados          0.80        0.85       0.30
## 137                          Belgium          0.90        0.91       0.65
## 138           Bosnia and Herzegovina          0.51        0.62       0.53
## 139                         Bulgaria          0.67        0.90       0.66
## 140                          Comoros          0.28        0.23       0.53
## 141                          Croatia          0.73        0.88       0.63
## 142                             Cuba          0.18        0.15       0.24
## 143                           Cyprus          0.77        0.82       0.57
## 144                          Czechia          0.87        0.93       0.59
## 145                          Denmark          0.92        0.98       0.72
## 146                Equatorial Guinea          0.18        0.14       0.11
## 147                          Estonia          0.90        0.96       0.64
## 148                             Fiji          0.50        0.78       0.43
## 149                          Finland          0.86        0.97       0.64
## 150                           Greece          0.75        0.75       0.64
## 151                           Guyana          0.51        0.58       0.51
## 152                        Hong Kong          0.15        0.40       0.13
## 153                          Iceland          0.83        0.90       0.66
## 154                           Israel          0.72        0.89       0.60
## 155                           Kuwait          0.33        0.80       0.19
## 156                        Lithuania          0.80        0.94       0.69
## 157                       Luxembourg          0.88        0.91       0.58
## 158                  North Macedonia          0.56        0.58       0.61
## 159                         Malaysia          0.51        0.66       0.53
## 160                            Malta          0.78        0.81       0.65
## 161                        Mauritius          0.48        0.70       0.57
## 162                       Montenegro          0.58        0.79       0.56
## 163                      New Zealand          0.89        0.95       0.70
## 164                           Norway          0.89        0.96       0.66
## 165                             Oman          0.17        0.44       0.39
## 166                         Paraguay          0.58        0.70       0.54
## 167                          Romania          0.67        0.72       0.66
## 168            Sao Tome and Principe          0.68        0.84       0.56
## 169                     Saudi Arabia          0.02        0.18       0.09
## 170                           Serbia          0.36        0.58       0.55
## 171                       Seychelles          0.74        0.89       0.29
## 172                        Singapore          0.40        0.74       0.13
## 173                         Slovakia          0.82        0.91       0.69
## 174                         Slovenia          0.76        0.86       0.71
## 175                  Solomon Islands          0.62        0.76       0.51
## 176                          Vanuatu          0.80        0.87       0.56
## 177             United Arab Emirates          0.10        0.27       0.10
## 178                          Hungary          0.44        0.67       0.57
## 179                         Zanzibar          0.29        0.61       0.46
##     v2xdl_delib v2x_egal
## 1          0.55     0.45
## 2          0.77     0.71
## 3          0.91     0.90
## 4          0.98     0.93
## 5          0.85     0.68
## 6          0.87     0.63
## 7          0.90     0.93
## 8          0.22     0.21
## 9          0.20     0.40
## 10         0.44     0.71
## 11         0.30     0.32
## 12         0.18     0.11
## 13         0.70     0.53
## 14         0.72     0.88
## 15         0.93     0.59
## 16         0.84     0.65
## 17         0.87     0.80
## 18         0.26     0.32
## 19         0.30     0.24
## 20         0.54     0.60
## 21         0.60     0.13
## 22         0.68     0.39
## 23         0.72     0.61
## 24         0.53     0.24
## 25         0.51     0.52
## 26         0.84     0.69
## 27         0.08     0.08
## 28         0.16     0.21
## 29         0.61     0.66
## 30         0.09     0.11
## 31         0.70     0.77
## 32         0.61     0.52
## 33         0.61     0.43
## 34         0.83     0.59
## 35         0.04     0.32
## 36         0.84     0.86
## 37         0.60     0.69
## 38         0.67     0.50
## 39         0.61     0.49
## 40         0.75     0.33
## 41         0.78     0.71
## 42         0.90     0.91
## 43         0.34     0.47
## 44         0.69     0.42
## 45         0.07     0.29
## 46         0.52     0.73
## 47         0.92     0.83
## 48         0.70     0.62
## 49         0.19     0.22
## 50         0.82     0.45
## 51         0.56     0.51
## 52         0.56     0.59
## 53         0.03     0.31
## 54         0.79     0.61
## 55         0.88     0.58
## 56         0.54     0.36
## 57         0.22     0.39
## 58         0.82     0.52
## 59         0.55     0.34
## 60         0.82     0.78
## 61         0.92     0.83
## 62         0.59     0.66
## 63         0.20     0.31
## 64         0.70     0.73
## 65         0.37     0.28
## 66         0.94     0.72
## 67         0.95     0.89
## 68         0.72     0.56
## 69         0.54     0.49
## 70         0.94     0.81
## 71         0.98     0.94
## 72         0.46     0.29
## 73         0.19     0.50
## 74         0.59     0.45
## 75         0.91     0.88
## 76         0.91     0.90
## 77         0.69     0.57
## 78         0.83     0.86
## 79         0.69     0.73
## 80         0.84     0.56
## 81         0.75     0.48
## 82         0.78     0.61
## 83         0.77     0.61
## 84         0.73     0.57
## 85         0.94     0.89
## 86         0.74     0.54
## 87         0.52     0.49
## 88         0.39     0.38
## 89         0.91     0.64
## 90         0.83     0.84
## 91         0.06     0.17
## 92         0.77     0.81
## 93         0.20     0.53
## 94         0.76     0.65
## 95         0.84     0.81
## 96         0.85     0.82
## 97         0.43     0.72
## 98         0.37     0.29
## 99         0.69     0.81
## 100        0.12     0.37
## 101        0.04     0.73
## 102        0.23     0.50
## 103        0.33     0.22
## 104        0.38     0.32
## 105        0.63     0.35
## 106        0.56     0.34
## 107        0.39     0.53
## 108        0.84     0.46
## 109        0.11     0.44
## 110        0.53     0.63
## 111        0.73     0.66
## 112        0.80     0.78
## 113        0.40     0.45
## 114        0.81     0.83
## 115        0.45     0.60
## 116        0.37     0.58
## 117        0.18     0.44
## 118        0.70     0.45
## 119        0.44     0.31
## 120        0.93     0.80
## 121        0.71     0.43
## 122        0.39     0.62
## 123        0.59     0.55
## 124        0.73     0.29
## 125        0.61     0.63
## 126        0.16     0.22
## 127        0.15     0.20
## 128        0.74     0.63
## 129        0.93     0.79
## 130        0.04     0.29
## 131        0.20     0.58
## 132        0.51     0.28
## 133        0.45     0.45
## 134        0.83     0.89
## 135        0.21     0.39
## 136        0.89     0.83
## 137        0.91     0.93
## 138        0.68     0.66
## 139        0.91     0.76
## 140        0.48     0.59
## 141        0.68     0.77
## 142        0.30     0.77
## 143        0.84     0.87
## 144        0.88     0.91
## 145        0.97     0.97
## 146        0.10     0.33
## 147        0.85     0.89
## 148        0.78     0.64
## 149        0.94     0.90
## 150        0.87     0.84
## 151        0.38     0.69
## 152        0.17     0.72
## 153        0.85     0.87
## 154        0.76     0.76
## 155        0.66     0.58
## 156        0.82     0.87
## 157        0.98     0.94
## 158        0.64     0.60
## 159        0.66     0.73
## 160        0.80     0.89
## 161        0.81     0.73
## 162        0.76     0.77
## 163        0.83     0.87
## 164        0.99     0.96
## 165        0.20     0.58
## 166        0.49     0.32
## 167        0.35     0.67
## 168        0.68     0.67
## 169        0.25     0.45
## 170        0.49     0.75
## 171        0.94     0.83
## 172        0.74     0.81
## 173        0.58     0.79
## 174        0.87     0.88
## 175        0.50     0.52
## 176        0.75     0.76
## 177        0.29     0.49
## 178        0.36     0.63
## 179        0.70     0.70
total_na <- sum(is.na(sust))
print(paste("Total de valores NA:", total_na))
## [1] "Total de valores NA: 0"

#Se proponen la siguiente hipótesis: El componente participativo, (v2x_partip), el deliberativo (v2xdl_delib), el igualitario (v2x_egal) y elliberal (v2x_liberal) explican el índice de democracia electoral (v2x_polyarchy).

H1=formula(v2x_polyarchy ~ v2x_partip + v2xdl_delib + v2x_egal + v2x_liberal)
regre1=lm(H1,data = sust)
summary(regre1)
## 
## Call:
## lm(formula = H1, data = sust)
## 
## Residuals:
##      Min       1Q   Median       3Q      Max 
## -0.27888 -0.06142  0.01883  0.06897  0.19187 
## 
## Coefficients:
##             Estimate Std. Error t value Pr(>|t|)    
## (Intercept) -0.09343    0.02400  -3.893 0.000141 ***
## v2x_partip   0.34928    0.06361   5.491 1.39e-07 ***
## v2xdl_delib -0.01623    0.05634  -0.288 0.773587    
## v2x_egal     0.12920    0.05385   2.399 0.017474 *  
## v2x_liberal  0.60183    0.06025   9.989  < 2e-16 ***
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.09657 on 174 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.8663, Adjusted R-squared:  0.8632 
## F-statistic: 281.9 on 4 and 174 DF,  p-value: < 2.2e-16

#VIF

library(car)
## Loading required package: carData
# Calcular los VIF
vif(regre1)
##  v2x_partip v2xdl_delib    v2x_egal v2x_liberal 
##    2.559903    4.307858    2.646367    5.652958
library(lm.beta)

modelo_estandarizado <- lm.beta(regre1)
summary(modelo_estandarizado)
## 
## Call:
## lm(formula = H1, data = sust)
## 
## Residuals:
##      Min       1Q   Median       3Q      Max 
## -0.27888 -0.06142  0.01883  0.06897  0.19187 
## 
## Coefficients:
##             Estimate Standardized Std. Error t value Pr(>|t|)    
## (Intercept) -0.09343           NA    0.02400  -3.893 0.000141 ***
## v2x_partip   0.34928      0.24355    0.06361   5.491 1.39e-07 ***
## v2xdl_delib -0.01623     -0.01658    0.05634  -0.288 0.773587    
## v2x_egal     0.12920      0.10820    0.05385   2.399 0.017474 *  
## v2x_liberal  0.60183      0.65838    0.06025   9.989  < 2e-16 ***
## ---
## Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1
## 
## Residual standard error: 0.09657 on 174 degrees of freedom
## Multiple R-squared:  0.8663, Adjusted R-squared:  0.8632 
## F-statistic: 281.9 on 4 and 174 DF,  p-value: < 2.2e-16

#LINEALIDAD

# linea roja debe tender a horizontal
plot(regre1, 1)

#HOMOCEDASTICIDAD

# linea roja debe tender a horizontal
plot(regre1, 3)

library(lmtest)
## Loading required package: zoo
## 
## Attaching package: 'zoo'
## The following objects are masked from 'package:base':
## 
##     as.Date, as.Date.numeric
library(kableExtra)
# null: modelo homocedastico
resBP=bptest(regre1)
data.frame(list('BP'=resBP$statistic,
             'df'=resBP$parameter,
             "p-value"=resBP$p.value))%>%
    kable(caption = resBP$method)%>%kable_styling(full_width = F)
studentized Breusch-Pagan test
BP df p.value
BP 6.27892 4 0.1792642

#NORMALIDAD DE RESIDUOS

# puntos cerca a la diagonal?
plot(regre1, 2)

#NULL: Datos se distribuyen de manera normal
resSW=shapiro.test(regre1$residuals)
data.frame(list('SW'=resSW$statistic,
             "p-value"=resSW$p.value))%>%
    kable(caption = resSW$method)%>%kable_styling(full_width = F)
Shapiro-Wilk normality test
SW p.value
W 0.9622271 9.37e-05

#COX

library(rio)
sust2= import("cancer.xlsx - Sheet1.csv")
sust2
##     cod_institucion tiempo_dias estado edad sexo rendimiento puntuacion_medico
## 1                 3         306      2   74    1           1                90
## 2                 3         455      2   68    1           0                90
## 3                 3        1010      1   56    1           0                90
## 4                 5         210      2   57    1           1                90
## 5                 1         883      2   60    1           0               100
## 6                12        1022      1   74    1           1                50
## 7                 7         310      2   68    2           2                70
## 8                11         361      2   71    2           2                60
## 9                 1         218      2   53    1           1                70
## 10                7         166      2   61    1           2                70
## 11                6         170      2   57    1           1                80
## 12               16         654      2   68    2           2                70
## 13               11         728      2   68    2           1                90
## 14               21          71      2   60    1          NA                60
## 15               12         567      2   57    1           1                80
## 16                1         144      2   67    1           1                80
## 17               22         613      2   70    1           1                90
## 18               16         707      2   63    1           2                50
## 19                1          61      2   56    2           2                60
## 20               21          88      2   57    1           1                90
## 21               11         301      2   67    1           1                80
## 22                6          81      2   49    2           0               100
## 23               11         624      2   50    1           1                70
## 24               15         371      2   58    1           0                90
## 25               12         394      2   72    1           0                90
## 26               12         520      2   70    2           1                90
## 27                4         574      2   60    1           0               100
## 28               13         118      2   70    1           3                60
## 29               13         390      2   53    1           1                80
## 30                1          12      2   74    1           2                70
## 31               12         473      2   69    2           1                90
## 32                1          26      2   73    1           2                60
## 33                7         533      2   48    1           2                60
## 34               16         107      2   60    2           2                50
## 35               12          53      2   61    1           2                70
## 36                1         122      2   62    2           2                50
## 37               22         814      2   65    1           2                70
## 38               15         965      1   66    2           1                70
## 39                1          93      2   74    1           2                50
## 40                1         731      2   64    2           1                80
## 41                5         460      2   70    1           1                80
## 42               11         153      2   73    2           2                60
## 43               10         433      2   59    2           0                90
## 44               12         145      2   60    2           2                70
## 45                7         583      2   68    1           1                60
## 46                7          95      2   76    2           2                60
## 47                1         303      2   74    1           0                90
## 48                3         519      2   63    1           1                80
## 49               13         643      2   74    1           0                90
## 50               22         765      2   50    2           1                90
## 51                3         735      2   72    2           1                90
## 52               12         189      2   63    1           0                80
## 53               21          53      2   68    1           0                90
## 54                1         246      2   58    1           0               100
## 55                6         689      2   59    1           1                90
## 56                1          65      2   62    1           0                90
## 57                5           5      2   65    2           0               100
## 58               22         132      2   57    1           2                70
## 59                3         687      2   58    2           1                80
## 60                1         345      2   64    2           1                90
## 61               22         444      2   75    2           2                70
## 62               12         223      2   48    1           1                90
## 63               21         175      2   73    1           1                80
## 64               11          60      2   65    2           1                90
## 65                3         163      2   69    1           1                80
## 66                3          65      2   68    1           2                70
## 67               16         208      2   67    2           2                70
## 68                5         821      1   64    2           0                90
## 69               22         428      2   68    1           0               100
## 70                6         230      2   67    1           1                80
## 71               13         840      1   63    1           0                90
## 72                3         305      2   48    2           1                80
## 73                5          11      2   74    1           2                70
## 74                2         132      2   40    1           1                80
## 75               21         226      2   53    2           1                90
## 76               12         426      2   71    2           1                90
## 77                1         705      2   51    2           0               100
## 78                6         363      2   56    2           1                80
## 79                3          11      2   81    1           0                90
## 80                1         176      2   73    1           0                90
## 81                4         791      2   59    1           0               100
## 82               13          95      2   55    1           1                70
## 83               11         196      1   42    1           1                80
## 84               21         167      2   44    2           1                80
## 85               16         806      1   44    1           1                80
## 86                6         284      2   71    1           1                80
## 87               22         641      2   62    2           1                80
## 88               21         147      2   61    1           0               100
## 89               13         740      1   44    2           1                90
## 90                1         163      2   72    1           2                70
## 91               11         655      2   63    1           0               100
## 92               22         239      2   70    1           1                80
## 93                5          88      2   66    1           1                90
## 94               10         245      2   57    2           1                80
## 95                1         588      1   69    2           0               100
## 96               12          30      2   72    1           2                80
## 97                3         179      2   69    1           1                80
## 98               12         310      2   71    1           1                90
## 99               11         477      2   64    1           1                90
## 100               3         166      2   70    2           0                90
## 101               1         559      1   58    2           0               100
## 102               6         450      2   69    2           1                80
## 103              13         364      2   56    1           1                70
## 104               6         107      2   63    1           1                90
## 105              13         177      2   59    1           2                50
## 106              12         156      2   66    1           1                80
## 107              26         529      1   54    2           1                80
## 108               1          11      2   67    1           1                90
## 109              21         429      2   55    1           1               100
## 110               3         351      2   75    2           2                60
## 111              13          15      2   69    1           0                90
## 112               1         181      2   44    1           1                80
## 113              10         283      2   80    1           1                80
## 114               3         201      2   75    2           0                90
## 115               6         524      2   54    2           1                80
## 116               1          13      2   76    1           2                70
## 117               3         212      2   49    1           2                70
## 118               1         524      2   68    1           2                60
## 119              16         288      2   66    1           2                70
## 120              15         363      2   80    1           1                80
## 121              22         442      2   75    1           0                90
## 122              26         199      2   60    2           2                70
## 123               3         550      2   69    2           1                70
## 124              11          54      2   72    1           2                60
## 125               1         558      2   70    1           0                90
## 126              22         207      2   66    1           1                80
## 127               7          92      2   50    1           1                80
## 128              12          60      2   64    1           1                80
## 129              16         551      1   77    2           2                80
## 130              12         543      1   48    2           0                90
## 131               4         293      2   59    2           1                80
## 132              16         202      2   53    1           1                80
## 133               6         353      2   47    1           0               100
## 134              13         511      1   55    2           1                80
## 135               1         267      2   67    1           0                90
## 136              22         511      1   74    2           2                60
## 137              12         371      2   58    2           1                80
## 138              13         387      2   56    1           2                80
## 139               1         457      2   54    1           1                90
## 140               5         337      2   56    1           0               100
## 141              21         201      2   73    2           2                70
## 142               3         404      1   74    1           1                80
## 143              26         222      2   76    1           2                70
## 144               1          62      2   65    2           1                80
## 145              11         458      1   57    1           1                80
## 146              26         356      1   53    2           1                90
## 147              16         353      2   71    1           0               100
## 148              16         163      2   54    1           1                90
## 149              12          31      2   82    1           0               100
## 150              13         340      2   59    2           0               100
## 151              13         229      2   70    1           1                70
## 152              22         444      1   60    1           0                90
## 153               5         315      1   62    2           0                90
## 154              16         182      2   53    2           1                80
## 155              32         156      2   55    1           2                70
## 156              NA         329      2   69    1           2                70
## 157              26         364      1   68    2           1                90
## 158               4         291      2   62    1           2                70
## 159              12         179      2   63    1           1                80
## 160               1         376      1   56    2           1                80
## 161              32         384      1   62    2           0                90
## 162              10         268      2   44    2           1                90
## 163              11         292      1   69    1           2                60
## 164               6         142      2   63    1           1                90
## 165               7         413      1   64    1           1                80
## 166              16         266      1   57    2           0                90
## 167              11         194      2   60    2           1                80
## 168              21         320      2   46    1           0               100
## 169               6         181      2   61    1           1                90
## 170              12         285      2   65    1           0               100
## 171              13         301      1   61    1           1                90
## 172               2         348      2   58    2           0                90
## 173               2         197      2   56    1           1                90
## 174              16         382      1   43    2           0               100
## 175               1         303      1   53    1           1                90
## 176              13         296      1   59    2           1                80
## 177               1         180      2   56    1           2                60
## 178              13         186      2   55    2           1                80
## 179               1         145      2   53    2           1                80
## 180               7         269      1   74    2           0               100
## 181              13         300      1   60    1           0               100
## 182               1         284      1   39    1           0               100
## 183              16         350      2   66    2           0                90
## 184              32         272      1   65    2           1                80
## 185              12         292      1   51    2           0                90
## 186              12         332      1   45    2           0                90
## 187               2         285      2   72    2           2                70
## 188               3         259      1   58    1           0                90
## 189              15         110      2   64    1           1                80
## 190              22         286      2   53    1           0                90
## 191              16         270      2   72    1           1                80
## 192              16          81      2   52    1           2                60
## 193              12         131      2   50    1           1                90
## 194               1         225      1   64    1           1                90
## 195              22         269      2   71    1           1                90
## 196              12         225      1   70    1           0               100
## 197              32         243      1   63    2           1                80
## 198              21         279      1   64    1           1                90
## 199               1         276      1   52    2           0               100
## 200              32         135      2   60    1           1                90
## 201              15          79      2   64    2           1                90
## 202              22          59      2   73    1           1                60
## 203              32         240      1   63    2           0                90
## 204               3         202      1   50    2           0               100
## 205              26         235      1   63    2           0               100
## 206              33         105      2   62    1           2                NA
## 207               5         224      1   55    2           0                80
## 208              13         239      2   50    2           2                60
## 209              21         237      1   69    1           1                80
## 210              33         173      1   59    2           1                90
## 211               1         252      1   60    2           0               100
## 212               6         221      1   67    1           1                80
## 213              15         185      1   69    1           1                90
## 214              11          92      1   64    2           2                70
## 215              11          13      2   65    1           1                80
## 216              11         222      1   65    1           1                90
## 217              13         192      1   41    2           1                90
## 218              21         183      2   76    1           2                80
## 219              11         211      1   70    2           2                70
## 220               2         175      1   57    2           0                80
## 221              22         197      1   67    1           1                80
## 222              11         203      1   71    2           1                80
## 223               1         116      2   76    1           1                80
## 224               1         188      1   77    1           1                80
## 225              13         191      1   39    1           0                90
## 226              32         105      1   75    2           2                60
## 227               6         174      1   66    1           1                90
## 228              22         177      1   58    2           1                80
##     puntuacion_paciente calorias perdida_peso
## 1                   100     1175           NA
## 2                    90     1225           15
## 3                    90       NA           15
## 4                    60     1150           11
## 5                    90       NA            0
## 6                    80      513            0
## 7                    60      384           10
## 8                    80      538            1
## 9                    80      825           16
## 10                   70      271           34
## 11                   80     1025           27
## 12                   70       NA           23
## 13                   90       NA            5
## 14                   70     1225           32
## 15                   70     2600           60
## 16                   90       NA           15
## 17                  100     1150           -5
## 18                   70     1025           22
## 19                   60      238           10
## 20                   80     1175           NA
## 21                   80     1025           17
## 22                   70     1175           -8
## 23                   80       NA           16
## 24                  100      975           13
## 25                   80       NA            0
## 26                   80      825            6
## 27                  100     1025          -13
## 28                   70     1075           20
## 29                   70      875           -7
## 30                   50      305           20
## 31                   90     1025           -1
## 32                   70      388           20
## 33                   80       NA          -11
## 34                   60      925          -15
## 35                  100     1075           10
## 36                   50     1025           NA
## 37                   60      513           28
## 38                   90      875            4
## 39                   40     1225           24
## 40                  100     1175           15
## 41                   60      975           10
## 42                   70     1075           11
## 43                   90      363           27
## 44                   60       NA           NA
## 45                   70     1025            7
## 46                   60      625          -24
## 47                   70      463           30
## 48                   70     1025           10
## 49                   90     1425            2
## 50                  100     1175            4
## 51                   90       NA            9
## 52                   70       NA            0
## 53                  100     1025            0
## 54                   90     1175            7
## 55                   80     1300           15
## 56                   80      725           NA
## 57                   80      338            5
## 58                   60       NA           18
## 59                   80     1225           10
## 60                   80     1075           -3
## 61                   70      438            8
## 62                   80     1300           68
## 63                  100     1025           NA
## 64                   80     1025            0
## 65                   60     1125            0
## 66                   50      825            8
## 67                   NA      538            2
## 68                   70     1025            3
## 69                   80     1039            0
## 70                  100      488           23
## 71                   90     1175           -1
## 72                   90      538           29
## 73                  100     1175            0
## 74                   80       NA            3
## 75                   80      825            3
## 76                   90     1075           19
## 77                   80     1300            0
## 78                   70     1225           -2
## 79                   NA      731           15
## 80                   70      169           30
## 81                   80      768            5
## 82                   90     1500           15
## 83                   80     1425            8
## 84                   90      588           -1
## 85                   80     1025            1
## 86                   90     1100           14
## 87                   80     1150            1
## 88                   90     1175            4
## 89                   80      588           39
## 90                   70      910            2
## 91                   90      975           -1
## 92                  100       NA           23
## 93                   80      875            8
## 94                   60      280           14
## 95                   90       NA           13
## 96                   60      288            7
## 97                   80       NA           25
## 98                  100       NA            0
## 99                  100      910            0
## 100                  70       NA           10
## 101                 100      710           15
## 102                  90     1175            3
## 103                  80       NA            4
## 104                  70       NA            0
## 105                  NA       NA           32
## 106                  90      875           14
## 107                 100      975           -3
## 108                  90      925           NA
## 109                  80      975            5
## 110                  50      925           11
## 111                  70      575           10
## 112                  90     1175            5
## 113                 100     1030            6
## 114                 100       NA            1
## 115                 100       NA           15
## 116                  70      413           20
## 117                  60      675           20
## 118                  70     1300           30
## 119                  60      613           24
## 120                  90      346           11
## 121                  90       NA            0
## 122                  80      675           10
## 123                  80      910            0
## 124                  60      768           -3
## 125                  90     1025           17
## 126                  80      925           20
## 127                  60     1075           13
## 128                  90      993            0
## 129                  60      750           28
## 130                  60       NA            4
## 131                  80      925           52
## 132                  80       NA           20
## 133                  90     1225            5
## 134                  70       NA           49
## 135                  70      313            6
## 136                  40       96           37
## 137                  70       NA            0
## 138                  60     1075           NA
## 139                  90      975           -5
## 140                 100     1500           15
## 141                  60     1225          -16
## 142                  70      413           38
## 143                  70     1500            8
## 144                  90     1075            0
## 145                 100      513           30
## 146                  90       NA            2
## 147                  80      775            2
## 148                  80     1225           13
## 149                  90      413           27
## 150                  90       NA            0
## 151                  60     1175           -2
## 152                 100       NA            7
## 153                  90       NA            0
## 154                  60       NA            4
## 155                  30     1025           10
## 156                  80      713           20
## 157                  90       NA            7
## 158                  60      475           27
## 159                  70      538           -2
## 160                  90      825           17
## 161                  90      588            8
## 162                 100     2450            2
## 163                  70     2450           36
## 164                  80      875            2
## 165                  70      413           16
## 166                  90     1075            3
## 167                  60       NA           33
## 168                 100      860            4
## 169                  90      730            0
## 170                  90     1025            0
## 171                 100      825            2
## 172                  80     1225           10
## 173                  60      768           37
## 174                  90      338            6
## 175                  80     1225           12
## 176                 100     1025            0
## 177                  80     1225           -2
## 178                  70       NA           NA
## 179                  90      588           13
## 180                 100      588            0
## 181                 100      975            5
## 182                  90     1225           -5
## 183                 100     1025           NA
## 184                  90       NA           -1
## 185                  80     1225            0
## 186                 100      975            5
## 187                  90      463           20
## 188                  80     1300            8
## 189                  60     1025           12
## 190                  90     1225            8
## 191                  90      488           14
## 192                  70     1075           NA
## 193                  80      513           NA
## 194                  80      825           33
## 195                  90     1300           -2
## 196                 100     1175            6
## 197                  90      825            0
## 198                  90       NA            4
## 199                  80      975            0
## 200                  70     1275            0
## 201                  90      488           37
## 202                  60     2200            5
## 203                 100     1025            0
## 204                 100      635            1
## 205                  90      413            0
## 206                  70       NA           NA
## 207                  90       NA           23
## 208                  60     1025           -3
## 209                  70       NA           NA
## 210                  80       NA           10
## 211                  90      488           -2
## 212                  70      413           23
## 213                  70     1075            0
## 214                 100       NA           31
## 215                  90       NA           10
## 216                  70     1025           18
## 217                  80       NA          -10
## 218                  60      825            7
## 219                  30      131            3
## 220                  80      725           11
## 221                  90     1500            2
## 222                  90     1025            0
## 223                  80       NA            0
## 224                  60       NA            3
## 225                  90     2350           -5
## 226                  70     1025            5
## 227                 100     1075            1
## 228                  90     1060            0

#H1: El sexo influye en la probabilidad de sobrevivir. #H2: Además del sexo, ser más joven y perder menos peso durante el tratamiento aumenta las probabilidades de sobrevivir.

library(survival)
# note que necesito el factor como numérico
sust2$survival=with(sust2,Surv(time = tiempo_dias,event =  as.numeric(estado)))
# que es:

library(magrittr) # needed for pipe %>% 
sust2%>%
    rmarkdown::paged_table()
COX_H1 = formula(survival ~ sexo)
COX_H2 = formula(survival ~ sexo + edad + perdida_peso )
library(survival)
#regression
rcox1 <- coxph(COX_H1,data=sust2)
modelcox=list('Riesgo - morir'=rcox1,'Riesgo- morir (exponenciado)'=rcox1)

#f <- function(x) format(x, digits = 4, scientific = FALSE)
library(modelsummary)
## `modelsummary` 2.0.0 now uses `tinytable` as its default table-drawing
##   backend. Learn more at: https://vincentarelbundock.github.io/tinytable/
## 
## Revert to `kableExtra` for one session:
## 
##   options(modelsummary_factory_default = 'kableExtra')
## 
## Change the default backend persistently:
## 
##   config_modelsummary(factory_default = 'gt')
## 
## Silence this message forever:
## 
##   config_modelsummary(startup_message = FALSE)
modelsummary(modelcox,
             #fmt=f,
             exponentiate = c(F,T), 
             statistic = 'conf.int',
             title = "Regresión Cox",
             stars = TRUE,
             output = "kableExtra")
Regresión Cox
Riesgo - morir Riesgo- morir (exponenciado)
sexo -0.531** 0.588**
[-0.859, -0.203] [0.424, 0.816]
Num.Obs. 228 228
AIC 1491.2 1491.2
BIC 1494.6 1494.6
RMSE 0.86 0.86
+ p < 0.1, * p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001
library(survival)
#regression
rcox1 <- coxph(COX_H2,data=sust2)
modelcox=list('Riesgo - morir'=rcox1,'Riesgo- morir (exponenciado)'=rcox1)

#f <- function(x) format(x, digits = 4, scientific = FALSE)
library(modelsummary)
modelsummary(modelcox,
             #fmt=f,
             exponentiate = c(F,T), 
             statistic = 'conf.int',
             title = "Regresión Cox",
             stars = TRUE,
             output = "kableExtra")
Regresión Cox
Riesgo - morir Riesgo- morir (exponenciado)
sexo -0.521** 0.594**
[-0.863, -0.179] [0.422, 0.836]
edad 0.020* 1.020*
[0.001, 0.039] [1.001, 1.040]
perdida_peso 0.001 1.001
[-0.011, 0.013] [0.989, 1.013]
Num.Obs. 214 214
AIC 1352.1 1352.1
BIC 1362.2 1362.2
RMSE 0.85 0.85
+ p < 0.1, * p < 0.05, ** p < 0.01, *** p < 0.001