今回、
1班はThalassiosira属の珪藻を暗条件で培養したものを
2班はPhaeodmctylum属の珪藻を暗条件で培養したものを
3班はThalassiosira属の珪藻を明条件で培養したものを
4班はPhaeodmctylum属の珪藻を明条件で培養したものを
測定してもらいました。
クロロフィルの測定時に希釈している場合は、それが反映されていない可能性があるので、教えてください。
# コードを一つだけ示す。汚コード。
nitrite_data <- read_excel(path = "./teaching_assistant/data_student.xlsx",
sheet = "data") %>%
filter(nutrient == "nitrite") %>%
select(-one_of("f/2"))
nitrite_data <- nitrite_data %>%
pivot_longer(cols = 3:6,
names_to = "date",
values_to = "Abs") %>%
mutate(date = as.Date(date, format = "%Y%m%d")) %>%
mutate(concentration = 23.357 * Abs + 0.3968) %>%
group_by(group, date) %>%
summarise(.groups = "drop",
mean_concentration_nitrite = mean(concentration),
std_error = sd(concentration) / sqrt(n()))
g_nitrite <- ggplot(data = nitrite_data,
aes(x = date,
y = mean_concentration_nitrite,
group = group,
color = group)) +
geom_point() +
geom_errorbar(aes(ymin = mean_concentration_nitrite - std_error, ymax = mean_concentration_nitrite + std_error), width = 0.2) +
labs(title = "亜硝酸態窒素",
x = "日付",
y = "濃度 (μmol/L)") +
scale_color_hue(labels = c(group1 = "T 暗", group2 = "P 暗", group3 = "T 明", group4 = "P 明")) +
theme_bw(base_family = "HiraKakuProN-W3")
g_nitrite