Cargue a RStudio el conjunto de datos “pinguinos” del paquete datos. pinguinos incluye medidas de especies de pingüinos de las islas del Archipiélago de Palmer, incluye tamaño (largo de aleta, masa corporal, dimensiones de pico) y sexo de los pinguinos. Muestre la siguiente tabla donde se visualicen las 5 primeras observaciones del conjunto de datos.
# Muestra las primeras 5 observaciones del conjunto de datos
kable(
head(penguins,5),
caption = "$$Tabla 1. Conjunto de Datos PINGUINOS$$",
)
| species | island | bill_length_mm | bill_depth_mm | flipper_length_mm | body_mass_g | sex | year |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Adelie | Torgersen | 39.1 | 18.7 | 181 | 3750 | male | 2007 |
| Adelie | Torgersen | 39.5 | 17.4 | 186 | 3800 | female | 2007 |
| Adelie | Torgersen | 40.3 | 18.0 | 195 | 3250 | female | 2007 |
| Adelie | Torgersen | NA | NA | NA | NA | NA | 2007 |
| Adelie | Torgersen | 36.7 | 19.3 | 193 | 3450 | female | 2007 |
Revise la estructura del conjunto de datos pinguinos.
str(penguins)
## tibble [344 × 8] (S3: tbl_df/tbl/data.frame)
## $ species : Factor w/ 3 levels "Adelie","Chinstrap",..: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
## $ island : Factor w/ 3 levels "Biscoe","Dream",..: 3 3 3 3 3 3 3 3 3 3 ...
## $ bill_length_mm : num [1:344] 39.1 39.5 40.3 NA 36.7 39.3 38.9 39.2 34.1 42 ...
## $ bill_depth_mm : num [1:344] 18.7 17.4 18 NA 19.3 20.6 17.8 19.6 18.1 20.2 ...
## $ flipper_length_mm: int [1:344] 181 186 195 NA 193 190 181 195 193 190 ...
## $ body_mass_g : int [1:344] 3750 3800 3250 NA 3450 3650 3625 4675 3475 4250 ...
## $ sex : Factor w/ 2 levels "female","male": 2 1 1 NA 1 2 1 2 NA NA ...
## $ year : int [1:344] 2007 2007 2007 2007 2007 2007 2007 2007 2007 2007 ...
Identifique las especies de pinguinos, las islas y los años de la información que contiene “pinguinos”.
unique(penguins$species)
## [1] Adelie Gentoo Chinstrap
## Levels: Adelie Chinstrap Gentoo
unique(penguins$island)
## [1] Torgersen Biscoe Dream
## Levels: Biscoe Dream Torgersen
unique(penguins$year)
## [1] 2007 2008 2009
Hoy aprenderás un nuevo paquete para generar un resumen estadístico de tus datos. Instala la librería modelsummary) y con la función datasummary_skim() genera el siguiente resumen de datos y responde a las siguientes preguntas:
library(modelsummary)
## `modelsummary` 2.0.0 now uses `tinytable` as its default table-drawing
## backend. Learn more at: https://vincentarelbundock.github.io/tinytable/
##
## Revert to `kableExtra` for one session:
##
## options(modelsummary_factory_default = 'kableExtra')
##
## Change the default backend persistently:
##
## config_modelsummary(factory_default = 'gt')
##
## Silence this message forever:
##
## config_modelsummary(startup_message = FALSE)
datasummary_skim(penguins)
| Unique | Missing Pct. | Mean | SD | Min | Median | Max | Histogram | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| bill_length_mm | 165 | 1 | 43.9 | 5.5 | 32.1 | 44.5 | 59.6 | |
| bill_depth_mm | 81 | 1 | 17.2 | 2.0 | 13.1 | 17.3 | 21.5 | |
| flipper_length_mm | 56 | 1 | 200.9 | 14.1 | 172.0 | 197.0 | 231.0 | |
| body_mass_g | 95 | 1 | 4201.8 | 802.0 | 2700.0 | 4050.0 | 6300.0 | |
| year | 3 | 0 | 2008.0 | 0.8 | 2007.0 | 2008.0 | 2009.0 | |
| N | % | |||||||
| species | Adelie | 152 | 44.2 | |||||
| Chinstrap | 68 | 19.8 | ||||||
| Gentoo | 124 | 36.0 | ||||||
| island | Biscoe | 168 | 48.8 | |||||
| Dream | 124 | 36.0 | ||||||
| Torgersen | 52 | 15.1 | ||||||
| sex | female | 165 | 48.0 | |||||
| male | 168 | 48.8 |
Promedio de largo es = 43.9 mm Promedio de alto es = 17.2 mm
Peso corporal máximo es = 6300 g
Recree el código en R para generar la siguiente tabla que muestra el mínimo, el máximo y la media aritmética de las medidas del largo de las aletas de los pinguinos, clasificada por especie.
kable(
penguins %>%
group_by(species) %>%
summarise("minimo" = min(flipper_length_mm, na.rm = TRUE),
"maximo" = max(flipper_length_mm, na.rm = TRUE),
"media" = mean(flipper_length_mm, na.rm = TRUE)),
caption = "$$Tabla 2. Medidas de las aletas de los pinguinos de la muestra por especie$$",
)
| species | minimo | maximo | media |
|---|---|---|---|
| Adelie | 172 | 210 | 189.9536 |
| Chinstrap | 178 | 212 | 195.8235 |
| Gentoo | 203 | 231 | 217.1870 |
Con el paquete modelsummary puede generar tablas con más información que la anterior y con una mejor estructura. Utilice la función datasummary() del paquete modelsummary y recree el código para generar la siguiente tabla. No se olvide consultar la ayuda para conocer los argumentos y parámetros que contiene la función.
datasummary(flipper_length_mm + bill_length_mm + bill_depth_mm + body_mass_g ~ species * (Mean + SD),
data = penguins)
| Adelie | Chinstrap | Gentoo | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Mean | SD | Mean | SD | Mean | SD | |
| flipper_length_mm | 189.95 | 6.54 | 195.82 | 7.13 | 217.19 | 6.48 |
| bill_length_mm | 38.79 | 2.66 | 48.83 | 3.34 | 47.50 | 3.08 |
| bill_depth_mm | 18.35 | 1.22 | 18.42 | 1.14 | 14.98 | 0.98 |
| body_mass_g | 3700.66 | 458.57 | 3733.09 | 384.34 | 5076.02 | 504.12 |
#Ejercicio 7. > Recree el código R para generar la siguiente gráfica que muestra la distribución de los datos sobre la longitud de las aletas de los pinguinos de la muestra clasificado por especie y por isla, puede modificar la estética a su gusto.
penguins %>%
ggplot(aes(x=flipper_length_mm, fill = species)) +
ggtitle("Gráfico 1: Distribucion de la longitud de las aletas de los pinguinos") +
facet_grid(rows = vars(island), margins = FALSE) +
geom_density(alpha = 0.4) +
labs( x = "Longitud de las aletas",
y = " ",
color = "Especie de pinguino")
## Warning: Removed 2 rows containing non-finite outside the scale range
## (`stat_density()`).
#Ejercicio 8. > Si usted desea visualizar la relación que existe entre el largo del pico y el largo de la aleta de los pinguinos por especie. ¿Qué gráficos utilizaría?. Genere el gráfico que usted considere pertinente para cumplir con su objetivo, agregue el tema, colores y estética necesaria.
penguins %>%
ggplot(aes(flipper_length_mm, bill_length_mm, color = species)) +
geom_bar(stat="identity") +
labs(title = "Gráfico: Largo del Pico Vs Largo de aleta",
x = "Largo de Aleta",
y = "Largo de Pico",
color = "Especie de pinguino")
## Warning: Removed 2 rows containing missing values or values outside the scale range
## (`geom_bar()`).