Ejemplo 2 de RMarkdown
Isaac Alvarez
8/11/2021
- El texto (en Rmarkdown)
- Esto es un título de nivel 1
- Adición de código de R en
RMarkdown
- Ejemplo de gráfico de barras
- Ejemplo de gráfico de barras centrado
- Ejemplo de gráfico de series de tiempo animado
- Insertando una imagen en un chunk
- Insertando una tabla
- Mostrando los datos
- Opciones de resultados con código en R
- Insertando Código de R dentro de un texto
- Insertando código en Python
- Temas disponibles
El texto (en Rmarkdown)
Un documento de Markdown permite escribir texto donde se le puede insertar código de R.
Encabezados / Títulos
# Esto es un título de nivel 1
Esto es un título de nivel 1
Esto es un título de nivel 2
Esto es un título de nivel 3
Esto es un título de nivel 4
Esto es un título de nivel 5
Esto es un título de nivel 6
Párrafos / Saltos de línea
Para crear párrafos, se deja una línea en blanco entre cada párrafo, por ejemplo:
Este es el primer párrafo.
Este es el segundo párrafo
Por otra parte, para crear un salto de línea dentro de un párrafo, se dejan dos espacios al final de la última palabra de esa línea, de este modo:
Esta es la primera línea
y este es el salto de línea.
Nota: también se puede forzar el salto de línea
usando el símbolo del backslash \ con un salto de línea o también usando
la etiqueta HTML
este ultimo es mas efectivo y permite saltos en la
misma oracion.
Esta es la primera línea
y este es el salto de línea.
Para poner un texto como comentario se usa Ctr-Shift-C
Formato del texto
- Negrita: Para colocar una palabra, oración o párrafo en negritas se debe usar doble ** asteriscos sin espacios entre la palabra de inicio y cerrar con doble asterisco al final sin dejar espacios.
- Cursiva o itálica: Coloca una palabra, letra, oración o párrafo en letra inclinada itálico al usar un solo asterisco * al comienzo son espacio y terminar con un asterisco sin espacio.
- Negrita + cursiva: La combinación de ambos se puede lograr usando como símbolo tres asteriscos *** seguido de la palabra u oración que se desea remarcar sin usar espacios, al final se debe colocar otra vez los tres asteriscos para indicar que se ha cerrado la marcación.
Algunos formatos básicos de texto son: bold,
cursiva, tachado y la combinación de estos. Por
ejemplo:
**Esto es bold** se verá Esto es bold
*Esto es cursiva* se verá Esto es cursiva
_Esto es cursiva_ se verá Esto es cursiva
~~Esto es tachado~~ se verá Esto es
tachado
***Esto es cursiva bold*** se verá Esto es
cursiva bold
~~*Esto es cursiva tachado*~~ se verá Esto es
cursiva tachado
<u>Esto es un texto subrayado</u> se verá
Esto es un texto subrayado
subíndice F~2~ se verá subíndice F2
Superíndice F^2^ se verá Superíndice F2
Línea divisora / Regla Línea Horizontal
Listas
Lista ordenada
Esta lista consiste en la numeración progresiva de los ítems y se realiza colocando el número seguido de un punto separado por un espacio y después se coloca el texto.
- Primero
- Segundo
- Tercero
- Cuarto
Lista no ordenada
Se puede usar los símbolos *, +, -.
- Un elemento de la lista
- El siguiente elemento de la lista
- Otro elemento de la lista
Lista ordenada y no ordenada
- Esto es una lista ordenada
- Segundo elemento de la lista ordenada
- Lista ordenada anidada dentro de otra
- Lista no ordenada anidada a 3er nivel
- 2do elemento de esta lista
- Segundo elemento de la lista ordenada anidada
- Lista ordenada anidada dentro de otra
Citas
Para citar se debe usar el signo mayor que > separado por un espacio y luego seguido de la oración que tendrá la cita. Se puede anidar varias citas repitiendo el mismo signo con lo cual se incrementa la tabulación. Al hacer doble salto de línea al final del texto rompemos el bloque de la cita.
El símbolo > se usa para poner una cita.
“Hay tres clases de mentiras: las mentiras, las malditas mentiras y las estadísticas.”
Mark Twain
“Democracia: es una superstición muy difundida, un abuso de la estadística.”
Jorge Luis Borges
“Hay tres clases de mentiras: las mentiras, las malditas mentiras y las estadísticas.”
Mark Twain 1
Insertando imágenes
Para insertar una imagen se usa el signo de exclamación ! seguido de los corchetes para indicar el título y luego de paréntesis () para la ruta. En el caso de varias imágenes se puede colocar entre corchetes una numeración como marcador para vincular esa imagen al final del contenido del documento.
Para centrar una imagen se usa HTML
Otra forma de insertar imágenes:
Insertando hipervínculos
Para insertar hipervínculos o enlaces webs su sintaxis es similar al empleado para insertar imágenes, la única diferencia es que no se incluye el signo de exclamación.
R para Ciencia de Datos es
la traducción del libro de R for Data Science
Link del libro: https://r4ds.had.co.nz/
R para Ciencia de
Datos
Tablas
Para la elaboración de una tabla primero se debe crear el encabezado, el cual esta conformado por los títulos de las columna que están separados con símbolo pipe | , luego se debe hacer un salto de línea con dos espaciados y colocar una línea divisora con el signo menos - , la cual indica el uso de un encabezado con lo que este texto estará en negritas y centrado. Para el contenido se van colocando los datos separándolos con el signo de pipe | al principio y final.
Adicionalmente se tiene lo siguiente:
* :—- margen izquierdo
* :—-: margen central
* —–: margen derecho
| Género | Porcentaje |
|---|---|
| Masculino | 49.63 |
| Femenino | 50.37 |
| Total | 100.00 |
Ver publicación en: Estado de la población peruana 2020
Ecuaciones
\(y_{i} = \beta _{0}+\beta _{1}X_{i} + \varepsilon _{i}\)
https://www.codecogs.com/latex/eqneditor.php
El modelo de regresión lineal simple es \(Y = \beta _{0}+\beta _{1}+\varepsilon\). La ecuación queda en la misma línea que el texto.
El modelo de regresión lineal simple es \[Y = \beta _{0}+\beta _{1}+\varepsilon\].La ecuación queda en otra línea.
La función de densidad de la distribución normal es: \[f(x)=\frac{1}{\sigma \sqrt{2\pi }}e^{-\frac{(x-u)^{2}}{2\sigma ^{2}}}\]
Anulando sintaxis Markdown
Cuando necesitamos emplear los caracteres de comandos empleados por Rmarkdown debemos usar el símbolo de escape para indicarle que no ejecute este como comando y solo se muestre como un símbolo, por lo cual usamos es el backslash \.
Markdown utiliza los siguiente símbolos para el marcado:
- Asterisco: *
- Guion: -
- Guion bajo: _
- Paréntesis: ()
- Corchetes: []
- Llaves: {}
- Punto: .
- Signo de exclamación: !
- Almohadilla: #
- Acento grave: `
- Barra invertida: \
Para utilizar estos caracteres en un texto, se debe insertar una barra invertida delante de cada uno de ellos.
# Esto no es un título
*Esto no sale en cursiva*
*Esto no sale en cursiva*
Insertando emojis
Se debe instalar el paquete emo desde github
install.packages(“devtools”)
devtools::install_github(“hadley/emo”)
Para ver la lista de emojis usar View(emo::jis)
Para insertar un emoji 📊
Pie de página
Adición de código de R en RMarkdown
Ejemplo de gráfico de barras
Ejemplo de gráfico de barras centrado
Ejemplo de gráfico de series de tiempo animado
Insertando una imagen en un chunk
Insertando una tabla
Cambiando el formato de tabla con kable y kableExtra
paises %>% filter(anio == 2007, continente == "Américas") %>% group_by(pais) %>%
summarise(media = mean(esperanza_de_vida)) -> tabla
tabla## # A tibble: 25 × 2
## pais media
## <fct> <dbl>
## 1 Argentina 75.3
## 2 Bolivia 65.6
## 3 Brasil 72.4
## 4 Canadá 80.7
## 5 Chile 78.6
## 6 Colombia 72.9
## 7 Costa Rica 78.8
## 8 Cuba 78.3
## 9 República Dominicana 72.2
## 10 Ecuador 75.0
## # ℹ 15 more rowsknitr::kable(tabla)| pais | media |
|---|---|
| Argentina | 75.3 |
| Bolivia | 65.6 |
| Brasil | 72.4 |
| Canadá | 80.7 |
| Chile | 78.6 |
| Colombia | 72.9 |
| Costa Rica | 78.8 |
| Cuba | 78.3 |
| República Dominicana | 72.2 |
| Ecuador | 75.0 |
| El Salvador | 71.9 |
| Guatemala | 70.3 |
| Haití | 60.9 |
| Honduras | 70.2 |
| Jamaica | 72.6 |
| México | 76.2 |
| Nicaragua | 72.9 |
| Panamá | 75.5 |
| Paraguay | 71.8 |
| Perú | 71.4 |
| Puerto Rico | 78.7 |
| Trinidad y Tobago | 69.8 |
| Estados Unidos | 78.2 |
| Uruguay | 76.4 |
| Venezuela | 73.7 |
knitr::kable(tabla, digits = 2)| pais | media |
|---|---|
| Argentina | 75.3 |
| Bolivia | 65.5 |
| Brasil | 72.4 |
| Canadá | 80.7 |
| Chile | 78.5 |
| Colombia | 72.9 |
| Costa Rica | 78.8 |
| Cuba | 78.3 |
| República Dominicana | 72.2 |
| Ecuador | 75.0 |
| El Salvador | 71.9 |
| Guatemala | 70.3 |
| Haití | 60.9 |
| Honduras | 70.2 |
| Jamaica | 72.6 |
| México | 76.2 |
| Nicaragua | 72.9 |
| Panamá | 75.5 |
| Paraguay | 71.8 |
| Perú | 71.4 |
| Puerto Rico | 78.8 |
| Trinidad y Tobago | 69.8 |
| Estados Unidos | 78.2 |
| Uruguay | 76.4 |
| Venezuela | 73.8 |
# Usando el paquete kableExtra
knitr::kable(tabla, digits = 3) %>% kable_styling()| pais | media |
|---|---|
| Argentina | 75.3 |
| Bolivia | 65.6 |
| Brasil | 72.4 |
| Canadá | 80.7 |
| Chile | 78.6 |
| Colombia | 72.9 |
| Costa Rica | 78.8 |
| Cuba | 78.3 |
| República Dominicana | 72.2 |
| Ecuador | 75.0 |
| El Salvador | 71.9 |
| Guatemala | 70.3 |
| Haití | 60.9 |
| Honduras | 70.2 |
| Jamaica | 72.6 |
| México | 76.2 |
| Nicaragua | 72.9 |
| Panamá | 75.5 |
| Paraguay | 71.8 |
| Perú | 71.4 |
| Puerto Rico | 78.7 |
| Trinidad y Tobago | 69.8 |
| Estados Unidos | 78.2 |
| Uruguay | 76.4 |
| Venezuela | 73.7 |
knitr::kable(tabla, digits = 3) %>% kable_styling(bootstrap_options = c("striped", "hover",
"condensed"),
full_width = F)| pais | media |
|---|---|
| Argentina | 75.3 |
| Bolivia | 65.6 |
| Brasil | 72.4 |
| Canadá | 80.7 |
| Chile | 78.6 |
| Colombia | 72.9 |
| Costa Rica | 78.8 |
| Cuba | 78.3 |
| República Dominicana | 72.2 |
| Ecuador | 75.0 |
| El Salvador | 71.9 |
| Guatemala | 70.3 |
| Haití | 60.9 |
| Honduras | 70.2 |
| Jamaica | 72.6 |
| México | 76.2 |
| Nicaragua | 72.9 |
| Panamá | 75.5 |
| Paraguay | 71.8 |
| Perú | 71.4 |
| Puerto Rico | 78.7 |
| Trinidad y Tobago | 69.8 |
| Estados Unidos | 78.2 |
| Uruguay | 76.4 |
| Venezuela | 73.7 |
# striped (estilo cebra), hover (destacar la fila)
knitr::kable(tabla,digits = 3, caption = "Esperanza de vida en 2007") %>%
kable_styling(bootstrap_options = c("striped", "hover",
"condensed"),
full_width = F) %>%
scroll_box(width = "800px", height = "200px")| pais | media |
|---|---|
| Argentina | 75.3 |
| Bolivia | 65.6 |
| Brasil | 72.4 |
| Canadá | 80.7 |
| Chile | 78.6 |
| Colombia | 72.9 |
| Costa Rica | 78.8 |
| Cuba | 78.3 |
| República Dominicana | 72.2 |
| Ecuador | 75.0 |
| El Salvador | 71.9 |
| Guatemala | 70.3 |
| Haití | 60.9 |
| Honduras | 70.2 |
| Jamaica | 72.6 |
| México | 76.2 |
| Nicaragua | 72.9 |
| Panamá | 75.5 |
| Paraguay | 71.8 |
| Perú | 71.4 |
| Puerto Rico | 78.7 |
| Trinidad y Tobago | 69.8 |
| Estados Unidos | 78.2 |
| Uruguay | 76.4 |
| Venezuela | 73.7 |
tabla %>% top_n(5) %>% ggplot() + aes(pais,media, fill= pais) + geom_col(show.legend = F) + labs(title = "Países en América con mayor esperanza de vida promedio en 2007", y= "Esperanza de vida media", x = "País") + theme_bw() +
theme(plot.title = element_text(face = "bold", size = 12,
hjust = 0.5)) 
Cambiando el formato de tabla con flextable
paises %>% filter(anio == 2007, continente == "Américas") %>% group_by(pais) %>%
summarise(Promedio = mean(esperanza_de_vida)) -> tabla1
tabla1## # A tibble: 25 × 2
## pais Promedio
## <fct> <dbl>
## 1 Argentina 75.3
## 2 Bolivia 65.6
## 3 Brasil 72.4
## 4 Canadá 80.7
## 5 Chile 78.6
## 6 Colombia 72.9
## 7 Costa Rica 78.8
## 8 Cuba 78.3
## 9 República Dominicana 72.2
## 10 Ecuador 75.0
## # ℹ 15 more rowstabla2 <- flextable(tabla1) ; tabla2pais | Promedio |
|---|---|
Argentina | 75.3 |
Bolivia | 65.6 |
Brasil | 72.4 |
Canadá | 80.7 |
Chile | 78.6 |
Colombia | 72.9 |
Costa Rica | 78.8 |
Cuba | 78.3 |
República Dominicana | 72.2 |
Ecuador | 75.0 |
El Salvador | 71.9 |
Guatemala | 70.3 |
Haití | 60.9 |
Honduras | 70.2 |
Jamaica | 72.6 |
México | 76.2 |
Nicaragua | 72.9 |
Panamá | 75.5 |
Paraguay | 71.8 |
Perú | 71.4 |
Puerto Rico | 78.7 |
Trinidad y Tobago | 69.8 |
Estados Unidos | 78.2 |
Uruguay | 76.4 |
Venezuela | 73.7 |
tabla3 <- autofit(tabla2) ; tabla3pais | Promedio |
|---|---|
Argentina | 75.3 |
Bolivia | 65.6 |
Brasil | 72.4 |
Canadá | 80.7 |
Chile | 78.6 |
Colombia | 72.9 |
Costa Rica | 78.8 |
Cuba | 78.3 |
República Dominicana | 72.2 |
Ecuador | 75.0 |
El Salvador | 71.9 |
Guatemala | 70.3 |
Haití | 60.9 |
Honduras | 70.2 |
Jamaica | 72.6 |
México | 76.2 |
Nicaragua | 72.9 |
Panamá | 75.5 |
Paraguay | 71.8 |
Perú | 71.4 |
Puerto Rico | 78.7 |
Trinidad y Tobago | 69.8 |
Estados Unidos | 78.2 |
Uruguay | 76.4 |
Venezuela | 73.7 |
tabla4 <- add_header_lines(tabla3, values = "Esperanza de vida promedio en América en 2007") ; tabla4Esperanza de vida promedio en América en 2007 | |
|---|---|
pais | Promedio |
Argentina | 75.3 |
Bolivia | 65.6 |
Brasil | 72.4 |
Canadá | 80.7 |
Chile | 78.6 |
Colombia | 72.9 |
Costa Rica | 78.8 |
Cuba | 78.3 |
República Dominicana | 72.2 |
Ecuador | 75.0 |
El Salvador | 71.9 |
Guatemala | 70.3 |
Haití | 60.9 |
Honduras | 70.2 |
Jamaica | 72.6 |
México | 76.2 |
Nicaragua | 72.9 |
Panamá | 75.5 |
Paraguay | 71.8 |
Perú | 71.4 |
Puerto Rico | 78.7 |
Trinidad y Tobago | 69.8 |
Estados Unidos | 78.2 |
Uruguay | 76.4 |
Venezuela | 73.7 |
Resaltando partes de la tabla con flextable
## # A tibble: 25 × 2
## País Promedio
## <fct> <dbl>
## 1 Argentina 75.3
## 2 Bolivia 65.6
## 3 Brasil 72.4
## 4 Canadá 80.7
## 5 Chile 78.6
## 6 Colombia 72.9
## 7 Costa Rica 78.8
## 8 Cuba 78.3
## 9 República Dominicana 72.2
## 10 Ecuador 75.0
## # ℹ 15 more rowsPaís | Promedio |
|---|---|
Argentina | 75.3 |
Bolivia | 65.6 |
Brasil | 72.4 |
Canadá | 80.7 |
Chile | 78.6 |
Colombia | 72.9 |
Costa Rica | 78.8 |
Cuba | 78.3 |
República Dominicana | 72.2 |
Ecuador | 75.0 |
El Salvador | 71.9 |
Guatemala | 70.3 |
Haití | 60.9 |
Honduras | 70.2 |
Jamaica | 72.6 |
México | 76.2 |
Nicaragua | 72.9 |
Panamá | 75.5 |
Paraguay | 71.8 |
Perú | 71.4 |
Puerto Rico | 78.7 |
Trinidad y Tobago | 69.8 |
Estados Unidos | 78.2 |
Uruguay | 76.4 |
Venezuela | 73.7 |
Esperanza de vida promedio en América en 2007 | |
|---|---|
País | Promedio |
Argentina | 75.3 |
Bolivia | 65.6 |
Brasil | 72.4 |
Canadá | 80.7 |
Chile | 78.6 |
Colombia | 72.9 |
Costa Rica | 78.8 |
Cuba | 78.3 |
República Dominicana | 72.2 |
Ecuador | 75.0 |
El Salvador | 71.9 |
Guatemala | 70.3 |
Haití | 60.9 |
Honduras | 70.2 |
Jamaica | 72.6 |
México | 76.2 |
Nicaragua | 72.9 |
Panamá | 75.5 |
Paraguay | 71.8 |
Perú | 71.4 |
Puerto Rico | 78.7 |
Trinidad y Tobago | 69.8 |
Estados Unidos | 78.2 |
Uruguay | 76.4 |
Venezuela | 73.7 |
Mostrando los datos
Opciones de resultados con código en R
mean(paises$pib_per_capita)[1] 7215mean(paises$esperanza_de_vida)[1] 59.5mean(paises$poblacion)[1] 29601212mean(paises$pib_per_capita)
mean(paises$esperanza_de_vida)
mean(paises$poblacion)## [1] 7215
## [1] 59.5
## [1] 29601212Insertando Código de R dentro de un texto
Es posible poner una estadística o un resultado dentro de un texto(generalmente tiene que ser una fncion basica y no elaboradad como dplyr o ggplot). Por ejemplo, la edad promedio es de 45.27 años.
Insertando código en Python
Temas disponibles
Nacido el 30 de noviembre de 1835, en la Florida, Missouri, Samuel L. Clemens escribió bajo el seudónimo de Mark Twain y escribió varias novelas, incluyendo dos grandes clásicos de la literatura americana, “Las aventuras de Tom Sawyer” y “Las aventuras de Huckleberry Finn”. También fue un piloto de barco, un periodista, un conferencista, un empresario y un inventor. Twain murió el 21 de abril de 1910, en Redding, Connecticut.↩︎