El cáncer es una enfermedad en la que las células del cuerpo crecen de
forma descontrolada, se produce cuando una célula se multiplica
anormalmente y descontroladamente, la proliferación celular está
sometida a un control, pero existen mecanismos inhibidores que pueden
fallar, permitiendo que las células crezcan sin control; el cáncer puede
presentarse en cualquier parte del cuerpo y diseminarse a otras partes
mediante el sistema sanguíneo y linfático,los síntomas varían según el
tipo de cáncer; específicamente en el cancer de mama la detección
temprana y el tratamiento personalizado han contribuido a aumentar las
tasas de supervivencia.
Palabras clave: cáncer, mama, enfermedad, células.
Cancer is a disease in which the body cells grow in an uncontrolled
manner, it occurs when a cell multiplies abnormally and uncontrollably,
cell proliferation is subject to control, but there are inhibitory
mechanisms that can fail, allowing cells to grow uncontrollably; cancer
can occur anywhere in the body and spread to other parts through the
blood and lymphatic system, symptoms vary according to the type of
cancer; specifically in breast cancer early detection and personalized
treatment have contributed to increase survival rates.
Key words: cancer, breast, disease, cells.
El cáncer es una enfermedad en la cual las células del cuerpo comienzan
a crecer de forma descontrolada,se produce porque una célula se
multiplica de forma anormal y descontrolada; la multiplicación celular
es un proceso natural y esencial en la vida, puesto que todos los seres
vivos se desarrollan a partir de una única célula.
La proliferación celular está sometida a un estrecho control, el cual
permite a órganos y estructuras del cuerpo alcanzar un tamaño predilecto
y equilibrado; sin embargo, existen mecanismo inhibidores que impiden
que las células se multipliquen arbitraria y desordenadamente, sin
embargo, si se alteran estos mecanismo inhibidores, las células crecen y
se multiplican sin control, dando pie a formación de masas de células
anormales (tumores) los cuales pueden ser benignos o malignos, siendo
los malignos propensos a generar cáncer.
El cáncer puede presentarse en cualquier parte del cuerpo humano y
posteriormente diseminarse a otras partes del cuerpo a través del
sistema sanguíneo y linfático si no se cuenta con un diagnóstico y/o
tratamiento en tiempo adecuado; los síntomas dependen mucho del tipo de
cáncer, pero entre algunos de los destacan:
- Cáncer de pulmón: tos persistente, dificultad respiratoria, dolor
torácico, ronquera.
- Estómago: Dolor abdominal, vómitos, pérdida de peso.
- Mama: nódulo en mama, secreción y retracción del pezón, alteraciones
de la piel.
- Piel: lunar que pica, crece, cambia de color o sangra.
- Próstata: dificultad para la micción, infecciones urinarias de
repetición. En investigacion realizadas rexientemente acerca del cancer
se ha demostrado que la aparicion de nuevos casos varia segun diversos
factores, tales como la edad, sexo, raza y lozalizacion geografica, lo
cual quiere decir que cuando aparece un proceso maligno existe una
predisposicion genetica y factores ambientales, los llamados “factores
cancerigenos”, los cuales son los encargados de determinar el desarrollo
del tumor; algunos de los factores cancerigenos son:
- Radiaciones.
- Tabaco.
- Dieta.
- Fármacos.
- Virus.
El cáncer de mama es una enfermedad en el cual las células de la mama se
multiplican sin control, existen varios tipos de cáncer de mama, entre
los más comunes se encuentran:
- Carcinoma ductal infiltrante:las células cancerígenas se originan en
los conductos y después salen de ellos y se multiplican en otros tejidos
mamarios.
- Carcinoma lobulillar infiltrante: las células cancerígenas se originan
en los lobulillos y después se diseminan de los lobulillos a los tejidos
mamarios cercanos.
Las mamas consisten de tres partes principales:
- Lobulillos: glándulas que producen leche.
- Conductos: tubos que transportan leche al pezón.
- Tejido conectivo: rodea y sostiene las partes de la mama (compuesto
por tejido fibroso y adiposo).
El cáncer de mama es la segunda causa principal de muerte por cáncer entre las mujeres en general y la primera causa de muerte por cáncer en las mujeres hispanas; por lo que la detección temprana y el tratamiento personalizado han contribuido a un aumento en las tasas de supervivencia y es importante que las mujeres se realicen autoexámenes de mamas y mamografías regularmente para detectar cáncer de mama en etapas tempranas.
El cáncer de mama es una enfermedad en la cual las células de la mama se
multiplican sin control. Las mamas constan de tres partes principales:
lobulillos, conductos y tejido conectivo. La mayoría de los cánceres de
mama comienzan en los conductos o en los lobulillos. El cáncer de mama
puede diseminarse fuera de la mama a través de los vasos sanguíneos y
los vasos linfáticos. Cuando el cáncer de mama se disemina a otras
partes del cuerpo, se dice que ha hecho metástasis. Los tipos más
comunes de cáncer de mama son el carcinoma ductal infiltrante y el
carcinoma lobulillar infiltrante, aunque existen otros tipos menos
comunes. El cáncer de mama puede tener un componente hereditario,
asociado a mutaciones en genes como BRCA1 y BRCA2. La identificación de
estos factores genéticos permite estrategias preventivas y un enfoque
más personalizado en el tratamiento. Alrededor del 5-10% de los cánceres
de mama son hereditarios, lo que significa que estos casos son causados
por mutaciones genéticas heredadas de los padres a sus hijos. Los
principales genes relacionados con el cáncer de mama hereditario son
BRCA1 y BRCA2.
El cáncer de mama es una enfermedad con una alta incidencia a nivel
mundial. Según la Organización Mundial de la Salud (OMS), en 2020 se
diagnosticó cáncer de mama a 2.3 millones de mujeres, y 685,000
fallecieron por esta enfermedad a nivel mundial. En México, el cáncer de
mama fue la enfermedad más frecuente (15.3 %) y la primera causa de
muerte en mujeres, con un estimado de 29,929 nuevos casos y 7,931
muertes en 2020. En cuanto a las estadísticas en los Estados Unidos, se
estima que en 2023 se producirán 43,780 muertes (43,250 mujeres y 530
hombres) a causa del cáncer de mama. La anatomía de la mama incluye la
presencia de tejido adiposo, la glándula mamaria, los conductos
galactóforos, el seno galactóforo y el pezón, mientras que la fisiología
de la mama está relacionada con la producción y expulsión de leche
durante la lactancia, así como con la irrigación sanguínea y la
inervación de la mama.
El diagnóstico del cáncer de mama generalmente comienza cuando una
persona o su médico descubren una masa o calcificaciones anormales
mediante una mamografía de detección, o un bulto o un nódulo en la mama
durante un examen clínico o un autoexamen. Las pruebas necesarias para
evaluar un posible cáncer de mama incluyen mamografía, ecografía
mamaria, resonancia magnética de la mama y biopsia. La biopsia es la
única manera de confirmar si una anomalía es cancerosa. Las pruebas por
imágenes, como la mamografía y la resonancia magnética, se utilizan para
determinar la extensión del cáncer una vez que se ha
diagnosticado.
El tratamiento del cáncer de mama depende del estadio del cáncer, del
tipo de cáncer, de si las células cancerosas son sensibles a las
hormonas, de la edad de la paciente y de su estado de salud general. El
tratamiento puede incluir cirugía, radioterapia, quimioterapia, terapia
hormonal y terapia dirigida. En algunos casos, se pueden utilizar
combinaciones de estos tratamientos. El objetivo del tratamiento es
curar el cáncer, controlar su crecimiento o aliviar los síntomas
causados por el cáncer.
Para este artículo se descargó una base de datos de la página Kaggle:
Este artículo habla sobre el cáncer de mama, de este artículo pudimos
rescatar cinco variantes que llamaron nuestra atención. Realizamos cinco
gráficas con ayuda de librerías de Rstudio, referentes a esas cinco
variantes, las cinco gráficas fueron realizadas con el mismo método
ggplot.
1. Tipos de Cirugía: El tipo de cirugía a la que fue sometido el
paciente (mastectomía o conservación de la mama).
2. Tipos de Cáncer: Diferentes tipos de cáncer como: BIDC, BILC, BIMMC,
entre otras.
3. Tipos de Celularidad: Alto, Bajo, Moderado.
4. Tipos de Genes: Basal, Her2, LumA, LumB, entre otros.
5. Edades del diagnóstico: Desde los 21 hasta las 96.
Primeramente se analizaron las dimensiones y columnas que contenia la base de datos, para seleccionar las columnas de interes:
#¿Cuantas filas y columnas tiene la base de datos?
dim(df)
#¿Cuales son los nombres de las columnas?
colnames(df)
attach(df)
#¿Que tipo de datos contienen las columnas elegidas?
class(age_at_diagnosis)
class(type_of_breast_surgery)
class(cancer_type_detailed)
class(cellularity)
class(pam50_._claudin.low_subtype)
#Analisis de datos
table(age_at_diagnosis)
table(type_of_breast_surgery)
table(cancer_type_detailed)
table(cellularity)
table(pam50_._claudin.low_subtype)
Posteriormente a se eligieron las columnas de años, tipo de cancer, tipo de cirujia, tipo de celularidad y los tipos de genes:
#Elaboracion de tablas
df %>% tabyl(type_of_breast_surgery) %>%
adorn_pct_formatting() %>%
flextable() %>%
fontsize(size=14) %>%
autofit () %>%
theme_box()
df %>% tabyl(cancer_type_detailed) %>%
adorn_pct_formatting() %>%
flextable() %>%
fontsize(size=14) %>%
autofit () %>%
theme_box()
df %>% tabyl(cellularity) %>%
adorn_pct_formatting() %>%
flextable() %>%
fontsize(size=14) %>%
autofit () %>%
theme_box()
df %>% tabyl(pam50_._claudin.low_subtype) %>%
adorn_pct_formatting() %>%
flextable() %>%
fontsize(size=14) %>%
autofit () %>%
theme_box()
Ya una vez realizado una anlisis adecuado mediante elaboracion de tablas con porcentajes, se elaboraron sus respectivas graficas mediante el siguiente codigo utilizando el ggplot mediante librerias que contenian estos comandos, donde ademas de mostrar sus graficas tambien mostraian sus respectivos porcentajes de frecuencia:
#Elaboracion de las graficas
df %>% tabyl(type_of_breast_surgery) %>%
ggplot(aes(x=type_of_breast_surgery, y=n,fill=type_of_breast_surgery)) +
geom_col() +
labs(x="Tipos de cirugia", y="Frecuencia", title="Datos con los tipos de cirugia") +
geom_text(aes(label=sprintf("%.2f%%", 100*percent))
,vjust=1.5, col="black", fontface="bold")
df %>% tabyl(cancer_type_detailed) %>%
ggplot(aes(x=cancer_type_detailed, y=n,fill=cancer_type_detailed)) +
geom_col() +
labs(x="Tipos de cancer", y="Frecuencia", title="Datos con los tipos de cancer") +
geom_text(aes(label=sprintf("%.2f%%", 100*percent))
,vjust=1.5, col="black", fontface="bold")
df %>% tabyl(cellularity) %>%
ggplot(aes(x=cellularity, y=n,fill=cellularity)) +
geom_col() +
labs(x="Tipos de celularidad", y="Frecuencia", title="Datos de tipos de celularidad") +
geom_text(aes(label=sprintf("%.2f%%", 100*percent))
,vjust=1.5, col="black", fontface="bold")
df %>% tabyl(pam50_._claudin.low_subtype) %>%
ggplot(aes(x=pam50_._claudin.low_subtype, y=n,fill=pam50_._claudin.low_subtype)) +
geom_col() +
labs(x="Tipos de genes", y="Frecuencia", title="Datos de tipos de genes") +
geom_text(aes(label=sprintf("%.2f%%", 100*percent))
,vjust=1.5, col="black", fontface="bold")
- TABLAS:
type_of_breast_surgery | n | percent |
|---|---|---|
22 | 1.2% | |
BREAST CONSERVING | 755 | 39.7% |
MASTECTOMY | 1,127 | 59.2% |
Tabla 1. En la primera tabla se mostraron principalmente las pecientes que con cancer de mama que tuvieron que realizarse la mastectomía con un 59.2%, mientras que el 39.7 de las pacientes pudieron conservar sus mamas, el 1.2% que se muestra en la tabla es desconocido.
cancer_type_detailed | n | percent |
|---|---|---|
15 | 0.8% | |
BIDC | 1,500 | 78.8% |
BILC | 142 | 7.5% |
BIMMC | 22 | 1.2% |
BMDLC | 207 | 10.9% |
Breast | 17 | 0.9% |
MBC | 1 | 0.1% |
Tabla 2. En la segunda tabla se muestran los tipos de cancer de mamas por medio de inciales que se encontraron en las pacientes siendo mayormente de el Carcinoma ductal invasivo de mama con el 78.78%, el segundo con mayor siendo el tipo de Carcinoma ductal y lobulillar mixto de mama con un 10.87% y el tercero mayor fue el Carcinoma lobulillar invasivo de mama con un porcentaje del 7.46%, el cuarto tipo fue de Carcinoma mucinoso mixto invasivo de mama con el 1.16%.
cellularity | n | percent |
|---|---|---|
54 | 2.8% | |
High | 939 | 49.3% |
Low | 200 | 10.5% |
Moderate | 711 | 37.3% |
Tabla 3. En la tercera tabla se muestran las diferentes cantidades de celulas cancerigenas en las pacientes con cancer de mama siendo mayor las pacientes que tienen una alta prescencia de estas celulas cancerosas con un porcentaje de 49.3%.
pam50_._claudin.low_subtype | n | percent |
|---|---|---|
Basal | 199 | 10.5% |
Her2 | 220 | 11.6% |
LumA | 679 | 35.7% |
LumB | 461 | 24.2% |
NC | 6 | 0.3% |
Normal | 140 | 7.4% |
claudin-low | 199 | 10.5% |
Tabla 4. En la cuarta tabla se muestran los resultados de una prueba llamada pam50 donde se expresan los diferentes tipos de genes que ayudan a determinar los subtipos de cancer de mama siendo mayor LumA con 35-7%.
- GRAFICAS:
Figura 1.
Figura 2. es el tipo de cirujia que se realizó la paciente, mastectomia(se retira la mamá completa) o parcial, siendo más común la mastectomia con un 59.19%.
Figura 3.Los tipos de cancer que se mostraron en los pacientes fueron mayormente de tipo Carcinoma ductal invasivo de mama con un porcentaje total del 78-78%, posteriormente estuvo el Carcinoma ductal y lobulillar mixto de mama con un 10.87% y por ultimo el Carcinoma lobulillar invasivo de mama con un porcentaje del 7.46%.
Figura 4. La celularidad es el porcentaje de células cancerosas que tiene un tumor, teniendo una celularidad elevada las pacientes con cancer de mama.
Figura 5.Prosigna (PAM50) es el único test genético pronóstico que analiza la expresión génica de 50 genes para clasificar el tumor en uno de los 4 subtipos intrínsecos del Cáncer de Mama (Luminal A, Luminal B, Basal, HER2-enriched). Así que en la gráfica se observan los genes que se expresan en un microarreglo siendo el LUMA el más expresado con un 35.66%.
Los datos proporcionados constituyen una valiosa fuente de información que puede tener un impacto significativo en la investigación oncológica. La identificación de biomarcadores a partir de estos datos no solo puede facilitar un diagnóstico más preciso, sino que también ofrece oportunidades para el desarrollo de terapias más efectivas y personalizadas. Este análisis exhaustivo puede arrojar luz sobre las complejas interacciones entre ciertas mutaciones genéticas y la respuesta al tratamiento, proporcionando así conocimientos cruciales para la mejora continua de las estrategias terapéuticas en el campo de la oncología. Estos hallazgos podrían allanar el camino para avances significativos en la comprensión de la progresión de la enfermedad, permitiendo un abordaje más preciso y eficiente en el tratamiento del cáncer.
Para concluir con la elaboracion de este trabajo se debe recapitular el tipo de cáncer más común en mujeres como se mostro durante este analisis siendo el tipo Carcinoma ductal invasivo de mama afectando a mas de 1500 pacientes, y que cada año se estiman millones de nuevos casos en todo el mundo, con un número significativo de fallecimientos. La detección temprana es fundamental para un tratamiento exitoso, y existen factores de riesgo, como antecedentes familiares, que hacen que algunas mujeres sean más propensas a desarrollar la enfermedad.