Descriptive analysis

Le soglie e i valori per la divisione in classi sono gli stessi usati nel cross-sectional.

Di seguito la tabella con le analisi descrittive. Il nostro campione è composto da 258 osservazioni.

Descriptive analysis cohort sample

Characteristic

N = 2581

Sex

Female

170 (66%)

Male

88 (34%)

Age (years)

39 (29, 46)

Syphilis

NEGATIVE

209 (98%)

POSITIVE

5 (2.3%)

Unknown

44

Epatitis B

False

221 (98%)

True

4 (1.8%)

Unknown

33

Epatitis C

NEGATIVE

216 (100%)

POSITIVE

1 (0.5%)

Unknown

41

Tuberculosis

NEGATIVE

182 (72%)

On TB Rx

17 (6.7%)

POSITIVE

55 (22%)

Unknown

4

BMI

Underweight

66 (27%)

Normal weight

136 (56%)

Overweight

32 (13%)

Obese

8 (3.3%)

Unknown

16

BMI at enrollment

20.4 (18.3, 23.3)

Unknown

5

Blood pressure

Optimal

110 (44%)

Normal

84 (34%)

High normal

39 (16%)

Grade 1 hypertension

9 (3.6%)

Grade 2 hypertension

6 (2.4%)

Grade 3 hypertension

0 (0%)

Unknown

10

GPT Abnormal

0 (0%)

Unknown

14

GOT Abnormal

0 (0%)

Unknown

12

Diabetes

0 (0%)

Unknown

40

Hypertension

15 (5.8%)

Dislipidemia

159 (70%)

Unknown

31

Overweight/Obese

32 (13%)

Unknown

16

Underweight

66 (27%)

Unknown

16

Hemoglobin

Normal

210 (83%)

Mild anemia

0 (0%)

Moderate anemia

32 (13%)

Severe anemia

11 (4.3%)

Unknown

5

Cholesterol

Normal

194 (87%)

Borderline

18 (8.1%)

Elevated

11 (4.9%)

Unknown

35

Triglycerides

Normal

66 (30%)

Borderline

40 (18%)

Elevated

116 (52%)

Unknown

36

Creatinine

Normal

214 (86%)

Elevated

36 (14%)

Unknown

8

Viral load

Over 200

14 (5.4%)

Undetectable

209 (81%)

awaiting result

0 (0%)

NOT DONE

35 (14%)

Mortality outcome

1 (0.4%)

LTFU

7 (2.7%)

1n (%); Median (IQR)

Prevalence

Le patologie (e comorbidità) indagate nel campione hanno rispettato gli stessi criteri diagnostici utilizzati nello studio cross-sectional.

Il seguente grafico mostrala prevalenza delle malattie. I baffi rappresentano l’intervallo di confidenza al 95% calcolato con il metodo dello standard error.

Il colore di ogni comorbidità serve a classificarle in una delle categorie tra NCDs e “Communicable, maternal, neonatal e nutritional diseases” in base alla classificazione del global burden of disease.

In questo grafico e nel seguente le persone possono essere contate più volte se hanno più di una patologia. Bisogna tener presente che nel nostro campione il ha più di una comorbidità.

Un’analisi di prevalenza di ogni patologia è stata effettuata anche per fasce d’età.

Categories

Questa è la divisione in categorie del campione, in cui ogni soggetto questa volta è contato una volta sola ed inserito esclusivamente nella categoria di appartenenza, ovvero solo HIV positivi, solo NCDs, solo Communicable, maternal, neonatal e nutritional diseases o categoria multipla (NCDs + communicable).

Comorbidities

Anche per i pazienti della cohorte state indagati il numero di patologie per ogni paziente.

Univariate analysis

E’ stata effettuata un’analisi univariata per ognuno dei tre outcome principali: viral load, anemia e bmi. Tra gli outcome ci sarebbe da aggiungere anche il decesso ma abbiamo solo un caso.

Viral load

Dal momento che alcuni soggetti avevano più di un valore di viral load è stato scelto di utilizzare il valore di viral load più recente, ovvero l’ultimo rispetto alla data di arruolamento.

Alcuni soggetti tuttavia hanno una viral load a meno di 150 giorni dalla data di inizio assistenza, poi decideremo come fare.

## x <lgl> 
## # total N=258 valid N=222 mean=0.41 sd=0.49
## 
## Value |   N | Raw % | Valid % | Cum. %
## --------------------------------------
## FALSE | 131 | 50.78 |   59.01 |  59.01
## TRUE  |  91 | 35.27 |   40.99 | 100.00
## <NA>  |  36 | 13.95 |    <NA> |   <NA>

L’analisi logistica univariata ha considerato come Fallimento = TRUE i soggetti con un valore di carica virale > 200 e come Fallimento FALSE, i soggetti con un valore di carica = Undetectable, che include i < 200 e LDL.

## x <categorical> 
## # total N=258 valid N=258 mean=2.22 sd=0.74
## 
## Value           |   N | Raw % | Valid % | Cum. %
## ------------------------------------------------
## Over 200        |  14 |  5.43 |    5.43 |   5.43
## Undetectable    | 209 | 81.01 |   81.01 |  86.43
## awaiting result |   0 |  0.00 |    0.00 |  86.43
## NOT DONE        |  35 | 13.57 |   13.57 | 100.00
## <NA>            |   0 |  0.00 |    <NA> |   <NA>
Univariate analysis viral load

Characteristic

OR1

95% CI1

p-value

sex

F

—

—

M

1.43

0.45, 4.26

0.5

age_at_enrollment

0.96

0.91, 1.01

0.14

hypertension_pos

FALSE

—

—

TRUE

10.0

2.37, 38.2

<0.001

diabetes_pos

FALSE

—

—

TRUE

overweight_pos

FALSE

—

—

TRUE

1.32

0.20, 5.39

0.7

underweight_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.23

0.01, 1.23

0.2

dislipidemia_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.77

0.23, 2.97

0.7

tb_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.63

0.10, 2.42

0.6

hbv_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

hcvag_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

syphilis_pos

FALSE

—

—

TRUE

3.82

0.19, 28.7

0.2

category

Communicable, maternal, neonatal and nutritional

—

—

NCDs

8,958,709

0.00, NA

>0.9

only HIV

9,912,754

0.00, NA

>0.9

1OR = Odds Ratio, CI = Confidence Interval

Anemia

Nell’analisi logistica univariata riguardante i valori di emoglobina, è stata considerato come Fallimento = TRUE l’aver avuto primo valore di emoglobina > 10 e l’ultimo < 10.

Sono risultati essere fallimentari

## x <lgl> 
## # total N=258 valid N=223 mean=0.03 sd=0.17
## 
## Value |   N | Raw % | Valid % | Cum. %
## --------------------------------------
## FALSE | 216 | 83.72 |   96.86 |  96.86
## TRUE  |   7 |  2.71 |    3.14 | 100.00
## <NA>  |  35 | 13.57 |    <NA> |   <NA>
Univariate analysis anemia

Characteristic

OR1

95% CI1

p-value

sex

F

—

—

M

0.31

0.02, 1.88

0.3

age_at_enrollment

0.98

0.91, 1.04

0.5

hypertension_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

diabetes_pos

FALSE

—

—

TRUE

overweight_pos

FALSE

—

—

TRUE

5.25

0.67, 33.3

0.078

underweight_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.60

0.03, 4.16

0.7

dislipidemia_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.42

0.08, 2.35

0.3

tb_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.54

0.03, 3.26

0.6

hbv_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

hcvag_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

syphilis_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

category

Communicable, maternal, neonatal and nutritional

—

—

NCDs

0.97

0.14, 19.3

>0.9

only HIV

1.89

0.17, 41.8

0.6

1OR = Odds Ratio, CI = Confidence Interval

BMI

E’ stato considerato anche per il BMI il Fallimento = TRUE per quei soggetti che avevano un primo valore di BMI > 18.5 e l’ultimo valore di BMI < 18.5.

Sono risultati essere fallimentari

## x <lgl> 
## # total N=258 valid N=245 mean=0.04 sd=0.19
## 
## Value |   N | Raw % | Valid % | Cum. %
## --------------------------------------
## FALSE | 236 | 91.47 |   96.33 |  96.33
## TRUE  |   9 |  3.49 |    3.67 | 100.00
## <NA>  |  13 |  5.04 |    <NA> |   <NA>
Univariate analysis BMI

Characteristic

OR1

95% CI1

p-value

sex

F

—

—

M

0.96

0.20, 3.73

>0.9

age_at_enrollment

0.96

0.90, 1.02

0.2

hypertension_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

diabetes_pos

FALSE

—

—

TRUE

overweight_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

underweight_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

dislipidemia_pos

FALSE

—

—

TRUE

2.99

0.52, 56.6

0.3

tb_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.42

0.02, 2.39

0.4

hbv_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

hcvag_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

syphilis_pos

FALSE

—

—

TRUE

0.00

>0.9

category

Communicable, maternal, neonatal and nutritional

—

—

NCDs

13,668,088

0.00, NA

>0.9

only HIV

16,545,580

0.00, NA

>0.9

1OR = Odds Ratio, CI = Confidence Interval

Pur non essendo risultato niente particolarmente significativo, eccetto la viral load con l’ipertensione, è interessante notare come la maggior parte dei fallimenti in tutti gli outcome (seppur pochi casi) siano nel gruppo delle NCDs.

Di seguito tabelle di contingenza con numero di fallimenti per categoria.

Contingency viral load

##                                                   
##                                                    FALSE TRUE
##   Communicable, maternal, neonatal and nutritional    32    0
##   NCDs                                               142   11
##   only HIV                                            35    3

Contingency anemia

##                                                   
##                                                    FALSE TRUE
##   Communicable, maternal, neonatal and nutritional    35    1
##   NCDs                                               144    4
##   only HIV                                            37    2

Contingency BMI

##                                                   
##                                                    FALSE TRUE
##   Communicable, maternal, neonatal and nutritional    37    0
##   NCDs                                               161    7
##   only HIV                                            38    2