Bienvenidos

En el curso vamos a usar R con algunos de sus paquetes. Además, usaremos JAGS para MCMC. Antes de llegar al primer día del curso asegúrense de tener instalada una versión de R mayor o igual 3.5. Se puede descargar desde cran

También es necesario instalar JAGS. Pueden descargarlo desde aquí

Paquetes para `R`

Copiar y pegar este script en R para instalar algunos paquetes que vamos a usar durante el curso

get.packages <- function () 
{
    pkglist = c("knitr", "jagsUI", "coda", "rstan", "brms","circular","bbmle","momentuHMM")
    inst.pkgs = rownames(installed.packages())
    newpkgs <- pkglist[!pkglist %in% inst.pkgs]
    if (length(newpkgs) > 0) {
        do.call("install.packages", list(pkglist))
    }
}

get.packages()

Normalmente usamos algún editor para escribir comandos y pasárselos a R. Recomendamos que usen RStudio.

Para ver antes de venir:

Recomendamos que antes de arrancar con el curso, vean la breve intro a R que preparamos aquí. Si bien esperamos que muchos de ustedes ya sean usuarios de R, quizás no hayan visto todavía como hacer loops o escribir funciones.

Por último, sería bueno que lean el artículo de Clark 2005. La idea es que para cuando terminen con el curso, todo lo que dice Clark tenga sentido…

Juan Manuel Morales . 6 de Septiembre del 2015. Última actualización: 2021-12-02

Bienvenidos

Paquetes para R

Para ver antes de venir:

Paquetes para `R`