Показать возможность раздельного определения тотального, мономерного и олигомерных форм уромодулина методом иммуноферментного анализа в моче.
Для определения концентрации уромодулина (UMOD) в сыворотке крови и в моче используем ELISA kit Пробоподготовка КРОВЬ
Пробоподготовка МОЧА 1
Пробоподготовка МОЧА 2
Измерение фракционного состава коллоида мочи проводят на анализаторе треков наночастиц NanoSight LM10 (Malvern). Образцы мочи разводят в 40 раз в дистиллированной воде, измерения проводят с использованием кюветы 488 нм. Серия из 3х последовательных измерений длительностью по 60 секунд.
Общеклинический анализ мочи проводился с использованием тест полосок Labstrip U11 Plus GL на анализаторе мочи DocUReader 2 Pro (77 Elektronika Kft, Венгрия). Определяем следующие параметры: билирубин, уробилиноген, кетоны (ацетоуксусная кислота), аскорбиновая кислота, глюкоза, протеин (альбумин), эритроциты (гемоглобин), уровень рН, нитриты, лейкоциты, удельный вес мочи.
Биохимический анализ сыворотки мочи проводили на автоматическом биохимическом анализаторе А-15 (BioSystems, Испания). В образцах мочи определяли концентрацию креатинина (Креатинин-Ново-А, Вектор-Бест, Россия), общий белок (Белок общий, Вектор-Бест, Россия), альбумин (Альбумин, Вектор-Бест, Россия).
Определение массовой концентрации катионов и анионов в моче и сыворотке крови проводили методом капиллярного электрофореза с использованием системы капиллярного электрофореза КАПЕЛЬ-105M (Люмэкс, Россия). Свежесобранные образцы мочи для анализа центрифугировали 1800 x g 5 минут, отбирали супернатант, для анализа разбавляли его в 250 раз. В образцах сыворотки мочи проводили измерение массовой концентрации катионов аммония, калия, натрия, лития, магния, стронция, бария и кальция, а также измерение массовой концентрации анионов хлорид-, нитрит-, сульфат-, нитрат-, фторид- и фосфат-ионов.
В результате исследования полученны данные о биофизических и биохимических свойствах мочи (см. Таблица ?? )
| ID | Spices | Sample | Name | Date | Native | Frozen | Super | Manipulation | Bilirubin | Urobilinogen | Ketones | Asc. acid | Glucose | Protein | Blood | Nitrite | Density | pH | Conductivity | Ions_NH4 | Ions_K | Ions_Na | Ions_Ca | Ions_file | NTA_conc | NTA_conc_sd | NTA_mode | NTA_mode_sd | NTA_mean | NTA_mean_sd | NTA_D10 | NTA_D10_sd | NTA_D50 | NTA_D50_sd | NTA_D90 | NTA_D90_sd | NTA_file | ELISA_UMOD_MEAN | ELISA_UMOD_HDB_MEAN | BioChem_TotalProt | BioChem_Alb | BioChem_Creat | …44 | Protein_ProteOrange | Protein_Bradford |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| s307081x1 | Human | Urine | VerlovNA | 2023-08-08 | TRUE | FALSE | FALSE | none | - | - | - | - | - | 30 (0.3) | - | - | 1.025 | 5.5 | 9.65 | 0.49 | 1.81 | 2.83 | 0.05 | NA | 6.97 | 0.16 | 131 | 10.2 | 198 | 4.6 | 97 | 2.6 | 158 | 3.1 | 346 | 11.5 | NA | 5836 | 10954 | 34.6 | NA | NA | NA | 35.1 | 34.5 |
| s307082x1 | Human | Urine | BurdakovVS | 2023-08-08 | TRUE | FALSE | FALSE | none | - | - | - | 20.0 | - | 30 (0.3) | - | - | 1.015 | 6.5 | 9.44 | 0.34 | 1.78 | 2.23 | 0.11 | NA | 6.60 | 0.48 | 141 | 12.5 | 228 | 6.3 | 111 | 2.2 | 184 | 8.9 | 388 | 13.6 | NA | 7335 | 14440 | 28.6 | NA | NA | NA | 26.3 | 23.5 |
| s307083x1 | Human | Urine | KulakovIA | 2023-08-08 | TRUE | FALSE | FALSE | none | - | - | - | 40.0 | - | 30 (0.3) | - | - | 1.025 | 5.0 | 10.84 | 1.28 | 3.13 | 2.61 | 0.08 | NA | 12.30 | 0.12 | 136 | 5.3 | 240 | 9.5 | 107 | 1.5 | 185 | 3.3 | 465 | 29.8 | NA | 10782 | 23036 | 75.1 | NA | NA | NA | 77.8 | 78.2 |
| s307081x2 | Human | Urine | VerlovNA | 2023-08-08 | FALSE | FALSE | FALSE | filter300KDa | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.015 | 5.5 | 10.90 | 0.42 | 1.58 | 2.46 | 0.04 | NA | 0.92 | 0.02 | 145 | 11.9 | 238 | 33.3 | 113 | 6.4 | 218 | 47.7 | 373 | 57.3 | NA | 626 | 633 | 22.9 | NA | NA | NA | 24.0 | 23.7 |
| s307082x2 | Human | Urine | BurdakovVS | 2023-08-08 | FALSE | FALSE | FALSE | filter300KDa | - | - | - | - | - | - | - | - | 1.010 | 6.5 | 9.17 | 0.35 | 1.82 | 2.19 | 0.11 | NA | 0.54 | 0.10 | 133 | 17.9 | 187 | 39.6 | 100 | 16.6 | 164 | 32.2 | 290 | 70.4 | NA | 640 | 653 | 16.1 | NA | NA | NA | 15.0 | 12.1 |
Данные плотность (ОКА) образцов мочи представлены в Таблице 4.1.
| Manipulation | Среднее | СКО | Мин. | Q1 | Медиана | Q3 | Макс. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| filter300KDa | 1.016 | 0.006 | 1.01 | 1.011 | 1.015 | 1.019 | 1.025 |
| none | 1.018 | 0.006 | 1.01 | 1.015 | 1.018 | 1.024 | 1.025 |
Figure 4.1: Плотность, различия между образцами нативной мочи и фильтрованного образца
Данные pH (ОКА) образцов мочи представлены в Таблице 4.2.
| Manipulation | Среднее | СКО | Мин. | Q1 | Медиана | Q3 | Макс. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| filter300KDa | 1.016 | 0.006 | 1.01 | 1.011 | 1.015 | 1.019 | 1.025 |
| none | 1.018 | 0.006 | 1.01 | 1.015 | 1.018 | 1.024 | 1.025 |
Figure 4.2: pH, различия между образцами нативной мочи и фильтрованного образца
Данные проводимости и концентрации катионов в образцах мочи представлены в Таблице ??.
| Manipulation | N | Mean | SD | Min | Q1 | Median | Q3 | Max | p.value | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Conductivity | filter300KDa | 6 | 9.41 | 1.83 | 6.52 | 8.07 | 9.95 | 10.90 | 11.05 | 0.863 | ||||
| 1.1 | none | 6 | 9.23 | 1.66 | 6.52 | 8.13 | 9.54 | 10.78 | 10.84 | ||||||
| 2 | Ions_Na | filter300KDa | 6 | 2.40 | 0.53 | 1.70 | 2.15 | 2.33 | 2.69 | 3.24 | 0.717 | ||||
| 2.1 | none | 6 | 2.53 | 0.60 | 1.50 | 2.23 | 2.68 | 2.83 | 3.23 | ||||||
| 3 | Ions_K | filter300KDa | 6 | 1.57 | 0.69 | 0.55 | 1.13 | 1.66 | 1.82 | 2.59 | 0.819 | ||||
| 3.1 | none | 6 | 1.68 | 0.87 | 0.58 | 0.99 | 1.77 | 1.81 | 3.13 | ||||||
| 4 | Ions_Ca | filter300KDa | 6 | 0.13 | 0.08 | 0.04 | 0.06 | 0.11 | 0.20 | 0.23 | 0.970 | ||||
| 4.1 | none | 6 | 0.13 | 0.07 | 0.05 | 0.08 | 0.10 | 0.21 | 0.23 | ||||||
| 5 | Ions_NH4 | filter300KDa | 6 | 0.60 | 0.25 | 0.35 | 0.42 | 0.57 | 0.65 | 1.06 | 0.807 | ||||
| 5.1 | none | 6 | 0.65 | 0.34 | 0.34 | 0.43 | 0.58 | 0.68 | 1.28 |
Графики проводимости и концентрации ионов в нативном образце мочи и после фильртации приведены на Рисунке (fig:FigUmod1IonsPval).
Figure 4.3: Сравнение проводимости (мкСм/см) и концентрации катионов (мг/мл) в образцах мочи до и после фильтрации
Измерение концентрации совокупного белка в моче проводили с использованием биохимического анализатора, методом Бредфорда и флуоресцентным методом с использованием ProteOrange. Данные о концентрации белка в обращцах мочи полученные вышеперечисленными мметодами приведены в таблице ??.
| Manipulation | N | Mean | SD | Min | Q1 | Median | Q3 | Max | p.value | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | BioChem_TotalProt | filter300KDa | 6 | 24.32 | 14.33 | 9.60 | 16.1 | 20.20 | 29.70 | 50.1 | 0.193 | ||||
| 1.1 | none | 6 | 38.00 | 19.10 | 20.40 | 28.6 | 33.25 | 37.40 | 75.1 | ||||||
| 2 | Protein_ProteOrange | filter300KDa | 6 | 25.36 | 14.86 | 10.16 | 15.0 | 22.95 | 28.48 | 52.6 | 0.272 | ||||
| 2.1 | none | 6 | 37.60 | 20.91 | 17.43 | 26.3 | 33.67 | 36.70 | 77.8 | ||||||
| 3 | Protein_Bradford | filter300KDa | 6 | 24.77 | 15.16 | 9.60 | 12.1 | 23.30 | 28.30 | 52.0 | 0.292 | ||||
| 3.1 | none | 6 | 36.78 | 21.48 | 17.00 | 23.5 | 33.75 | 34.50 | 78.2 |
Визуальное представление данных относительно концентрации белка в образцах мочи представлены на Рисунке 4.4
Figure 4.4: Сравнение концентриции белка в образцах мочи до и после фильтрации, парные сравнения
Оценку количесвта белка, потерянного при фильрации облразцов на фильтре 300 кДа, проводили по формуле \(K_d=K_{native}-K_{300kDa}\), где \(K_{native}\) - исходная концентрация белка, \(K_{300kDa}\) - концентрация белка после фильтрации образца. Данные об изменении конценратции бекла в образцах мочи представлены в таблице
| N | Mean | SD | Min | Q1 | Median | Q3 | Max | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| BioChem_TotalProt_none | 6 | 38.00 | 19.10 | 20.40 | 28.60 | 33.25 | 37.40 | 75.1 | ||
| BioChem_TotalProt_filter300KDa | 6 | 24.32 | 14.33 | 9.60 | 16.10 | 20.20 | 29.70 | 50.1 | ||
| Protein_ProteOrange_none | 6 | 37.60 | 20.91 | 17.43 | 26.30 | 33.67 | 36.70 | 77.8 | ||
| Protein_ProteOrange_filter300KDa | 6 | 25.36 | 14.86 | 10.16 | 15.00 | 22.95 | 28.48 | 52.6 | ||
| Protein_Bradford_none | 6 | 36.78 | 21.48 | 17.00 | 23.50 | 33.75 | 34.50 | 78.2 | ||
| Protein_Bradford_filter300KDa | 6 | 24.77 | 15.16 | 9.60 | 12.10 | 23.30 | 28.30 | 52.0 | ||
| BioChem_TotalProt_Delta | 6 | 13.68 | 5.97 | 7.70 | 10.80 | 12.10 | 14.40 | 25.0 | ||
| Protein_ProteOrange_Delta | 6 | 12.24 | 6.55 | 7.27 | 8.22 | 10.73 | 11.30 | 25.2 | ||
| Protein_Bradford_Delta | 6 | 12.02 | 7.27 | 5.90 | 7.40 | 10.60 | 11.40 | 26.2 |
Измерение концентрации уромодлина проводили методом ИФА в образцах нативной мочи и после фильтрации 300кДа. Данные уровня уромодулина приведены в Таблице ??
| N | Mean | SD | Min | Q1 | Median | Q3 | Max | |||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ELISA_UMOD_MEAN_none | 6 | 6.43 | 2.62 | 2.74 | 5.83 | 5.94 | 7.34 | 10.78 | ||
| ELISA_UMOD_MEAN_filter300KDa | 6 | 0.69 | 0.15 | 0.58 | 0.63 | 0.64 | 0.67 | 0.99 | ||
| ELISA_UMOD_MEAN_Delta | 6 | 5.74 | 2.61 | 2.17 | 4.84 | 5.31 | 6.70 | 10.11 | ||
| ELISA_UMOD_HDB_MEAN_none | 6 | 12.27 | 6.15 | 4.71 | 9.38 | 11.02 | 14.44 | 23.04 | ||
| ELISA_UMOD_HDB_MEAN_filter300KDa | 6 | 0.71 | 0.22 | 0.52 | 0.53 | 0.64 | 0.83 | 1.10 | ||
| ELISA_UMOD_HDB_MEAN_Delta | 6 | 11.55 | 5.98 | 4.18 | 8.55 | 10.44 | 13.79 | 21.94 |
Парные сравнения потери белка измереннного в моче (биохимический анализатор, метод Бредфорда и флуоресцентный метод) и падение концентрации уромодулина в образцах мочи после фильтрации представлены на Рисунке 4.5
Figure 4.5: Изменение конценртации общего белка и уромодулина в моче, парные сравнения
Для оценки динамики и оценки схожести измеренных показателей на Рисунке 4.6 приведены даннные регрессионного анализа и величина коэффициента корреляции по Пирсону.
Figure 4.6: Изменение конценртации общего белка и уромодулина в моче, парные сравнения