1 SIR practice model

# Parameters
beta <- 4.0706 # Calculated nls montly
gama <- 2.7941 # Calculated nls montly

#Number of animals in the model
n <- 1000

# Initial state of the population compartments
u0 <- data.frame(S=rep(999,n), I=rep(1,n), R=rep(0,n))

# time
tspan <- seq(1,180,1)

1.1 Run the model

set.seed(555) 
model <- SIR(u0=u0, tspan = tspan, beta = beta, gamma = gama)

result <- run(model=model, threads = 1)
result
## Model: SIR
## Number of nodes: 1000
## Number of transitions: 2
## Number of scheduled events: 0
## 
## Local data
## ----------
##  Parameter Value 
##  beta      4.0706
##  gamma     2.7941
## 
## Compartments
## ------------
##      Min. 1st Qu. Median   Mean 3rd Qu.   Max.
##  S 302.00  491.00 997.00 825.53  999.00 999.00
##  I   0.00    0.00   0.00   0.35    0.00 119.00
##  R   0.00    1.00   3.00 174.12  503.00 698.00

1.2 Plot results

plot(result)

plot(result, range = FALSE, cex=0.1)

plot(prevalence(result, I~S+I+R), cex=0.1, col="red")

## Running on differente time scale (days)

# Parameters
beta <- 4.0706/30 # Calculated nls montly
gama <- 2.7941/30 # Calculated nls montly

#Number of animals in the model
n <- 1000

# Initial state of the population compartments
u0 <- data.frame(S=rep(999,n), I=rep(1,n), R=rep(0,n))

# time
tspan <- seq(1,180*30,30)

1.3 Running on days

set.seed(555) 
model <- SIR(u0=u0, tspan = tspan, beta = beta, gamma = gama)

result <- run(model=model, threads = 1)
result
## Model: SIR
## Number of nodes: 1000
## Number of transitions: 2
## Number of scheduled events: 0
## 
## Local data
## ----------
##  Parameter Value     
##  beta      0.13568667
##  gamma     0.09313667
## 
## Compartments
## ------------
##       Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max.
##  S 317.000 497.000 998.000 830.207 999.000 999.000
##  I   0.000   0.000   0.000   0.347   0.000 104.000
##  R   0.000   1.000   2.000 169.445 503.000 683.000

1.4 Ploting on days

plot(result)

plot(result, range = FALSE, cex=0.1)

plot(prevalence(result, I~S+I+R), cex=0.1, col="red")

2 Second model SIR

# Example 2 Giving te equations (transitions)
model2  <- mparse(transitions = c("S -> beta*S*I/(S+I+R) -> I", "I -> gamma*I -> R"),
                 compartments = c("S", "I", "R"),
                 gdata = c(beta = 0.16, gamma = 0.077),
                 u0 = data.frame(S = 100, I = 1, R = 0),
                 tspan = 1:1000)

2.1 Run and plot

set.seed(123)
result2 <- run(model=model2, threads = 1)
result2
## Model: SimInf_model
## Number of nodes: 1
## Number of transitions: 2
## Number of scheduled events: 0
## 
## Global data
## -----------
##  Parameter Value
##  beta      0.160
##  gamma     0.077
## 
## Compartments
## ------------
##      Min. 1st Qu. Median   Mean 3rd Qu.   Max.
##  S  13.00   13.00  13.00  18.06   13.00 100.00
##  I   0.00    0.00   0.00   1.24    0.00  21.00
##  R   0.00   88.00  88.00  81.70   88.00  88.00
plot(result2)

plot(result2, node = 1:10, range = FALSE)
## Warning in plot.window(...): "node" is not a graphical parameter
## Warning in plot.xy(xy, type, ...): "node" is not a graphical parameter
## Warning in axis(side = side, at = at, labels = labels, ...): "node" is not a
## graphical parameter

## Warning in axis(side = side, at = at, labels = labels, ...): "node" is not a
## graphical parameter
## Warning in title(...): "node" is not a graphical parameter
## Warning in plot.xy(xy.coords(x, y), type = type, ...): "node" is not a
## graphical parameter

## Warning in plot.xy(xy.coords(x, y), type = type, ...): "node" is not a
## graphical parameter

plot(prevalence(result2, I~.), cex=0.3, col="red")

3 Third model SEIR

# Example 2 Giving te equations (transitions)
model3  <- mparse(transitions = c("S -> alpha*S -> E",
                                  "E -> tau*E -> I",
                                  "I -> beta*S*I/(S+I+R) -> R",
                                  "R -> gamma*R -> S"),
                 compartments = c("S", "E", "I", "R"),
                 gdata = c(alpha = 0.05, tau= 0.002, beta = 0.16, gamma = 0.077),
                 u0 = data.frame(S = 100, E= 20, I = 5, R = 0),
                 tspan = 1:1000)

result3 <- run(model=model3, threads = 1)
result3
## Model: SimInf_model
## Number of nodes: 1
## Number of transitions: 4
## Number of scheduled events: 0
## 
## Global data
## -----------
##  Parameter Value
##  alpha     0.050
##  tau       0.002
##  beta      0.160
##  gamma     0.077
## 
## Compartments
## ------------
##      Min. 1st Qu. Median   Mean 3rd Qu.   Max.
##  S   0.00    0.00   2.00   4.83    5.00  96.00
##  E  24.00   95.00 109.00 100.99  115.00 121.00
##  I   0.00    3.00   7.00  17.33   24.00  71.00
##  R   0.00    0.00   2.00   1.85    3.00   8.00
plot(result3)

plot(prevalence(result3, I~.), cex=0.3, col="red")

t <- data.frame(trajectory(result3))
t$N <- t$S + t$E + t$I + t$R
t
##      node time  S   E  I R   N
## 1       1    1 96  24  5 0 125
## 2       1    2 93  27  3 2 125
## 3       1    3 91  29  3 2 125
## 4       1    4 89  31  3 2 125
## 5       1    5 85  35  3 2 125
## 6       1    6 85  36  3 1 125
## 7       1    7 79  41  4 1 125
## 8       1    8 70  50  4 1 125
## 9       1    9 67  53  3 2 125
## 10      1   10 65  56  2 2 125
## 11      1   11 60  60  2 3 125
## 12      1   12 56  63  3 3 125
## 13      1   13 55  64  3 3 125
## 14      1   14 51  68  2 4 125
## 15      1   15 49  71  2 3 125
## 16      1   16 46  74  2 3 125
## 17      1   17 43  78  2 2 125
## 18      1   18 42  79  2 2 125
## 19      1   19 41  80  2 2 125
## 20      1   20 42  80  2 1 125
## 21      1   21 41  81  2 1 125
## 22      1   22 41  81  2 1 125
## 23      1   23 39  84  1 1 125
## 24      1   24 38  85  1 1 125
## 25      1   25 35  88  1 1 125
## 26      1   26 34  88  1 2 125
## 27      1   27 32  90  1 2 125
## 28      1   28 31  91  1 2 125
## 29      1   29 30  92  1 2 125
## 30      1   30 28  94  1 2 125
## 31      1   31 25  97  1 2 125
## 32      1   32 23  98  2 2 125
## 33      1   33 22  99  2 2 125
## 34      1   34 23  98  3 1 125
## 35      1   35 24  98  3 0 125
## 36      1   36 24  98  3 0 125
## 37      1   37 24  98  3 0 125
## 38      1   38 22 100  1 2 125
## 39      1   39 22 100  1 2 125
## 40      1   40 20 102  1 2 125
## 41      1   41 18 103  0 4 125
## 42      1   42 16 105  0 4 125
## 43      1   43 16 106  0 3 125
## 44      1   44 15 107  0 3 125
## 45      1   45 15 107  0 3 125
## 46      1   46 14 108  0 3 125
## 47      1   47 14 108  0 3 125
## 48      1   48 13 109  0 3 125
## 49      1   49 14 109  0 2 125
## 50      1   50 13 109  1 2 125
## 51      1   51 11 110  2 2 125
## 52      1   52 11 110  2 2 125
## 53      1   53 11 111  2 1 125
## 54      1   54 10 112  2 1 125
## 55      1   55  7 114  3 1 125
## 56      1   56  5 116  3 1 125
## 57      1   57  4 118  3 0 125
## 58      1   58  4 118  3 0 125
## 59      1   59  4 118  3 0 125
## 60      1   60  3 119  3 0 125
## 61      1   61  3 119  3 0 125
## 62      1   62  3 118  4 0 125
## 63      1   63  3 118  3 1 125
## 64      1   64  3 118  3 1 125
## 65      1   65  3 118  3 1 125
## 66      1   66  3 118  3 1 125
## 67      1   67  3 117  4 1 125
## 68      1   68  3 117  3 2 125
## 69      1   69  3 117  3 2 125
## 70      1   70  3 117  3 2 125
## 71      1   71  3 117  3 2 125
## 72      1   72  3 118  3 1 125
## 73      1   73  3 118  3 1 125
## 74      1   74  2 119  2 2 125
## 75      1   75  2 119  2 2 125
## 76      1   76  1 120  2 2 125
## 77      1   77  2 120  2 1 125
## 78      1   78  2 119  3 1 125
## 79      1   79  2 119  3 1 125
## 80      1   80  2 119  3 1 125
## 81      1   81  2 119  3 1 125
## 82      1   82  2 119  3 1 125
## 83      1   83  2 119  3 1 125
## 84      1   84  2 119  2 2 125
## 85      1   85  2 119  2 2 125
## 86      1   86  2 119  2 2 125
## 87      1   87  2 117  4 2 125
## 88      1   88  2 117  4 2 125
## 89      1   89  2 117  4 2 125
## 90      1   90  2 117  4 2 125
## 91      1   91  2 117  4 2 125
## 92      1   92  2 117  4 2 125
## 93      1   93  2 116  5 2 125
## 94      1   94  2 116  5 2 125
## 95      1   95  2 116  5 2 125
## 96      1   96  2 116  5 2 125
## 97      1   97  2 116  5 2 125
## 98      1   98  2 116  5 2 125
## 99      1   99  2 115  6 2 125
## 100     1  100  2 115  6 2 125
## 101     1  101  1 116  5 3 125
## 102     1  102  1 116  4 4 125
## 103     1  103  3 116  2 4 125
## 104     1  104  3 117  2 3 125
## 105     1  105  3 117  0 5 125
## 106     1  106  3 117  0 5 125
## 107     1  107  3 117  0 5 125
## 108     1  108  3 117  0 5 125
## 109     1  109  3 117  0 5 125
## 110     1  110  3 117  0 5 125
## 111     1  111  3 116  1 5 125
## 112     1  112  3 114  3 5 125
## 113     1  113  2 115  3 5 125
## 114     1  114  2 115  3 5 125
## 115     1  115  2 114  4 5 125
## 116     1  116  2 114  4 5 125
## 117     1  117  2 114  4 5 125
## 118     1  118  2 114  4 5 125
## 119     1  119  2 114  4 5 125
## 120     1  120  2 114  4 5 125
## 121     1  121  2 114  4 5 125
## 122     1  122  2 114  4 5 125
## 123     1  123  2 114  4 5 125
## 124     1  124  3 114  4 4 125
## 125     1  125  3 114  4 4 125
## 126     1  126  2 114  5 4 125
## 127     1  127  2 113  6 4 125
## 128     1  128  2 113  6 4 125
## 129     1  129  3 113  5 4 125
## 130     1  130  4 113  3 5 125
## 131     1  131  4 113  2 6 125
## 132     1  132  6 112  3 4 125
## 133     1  133  5 113  3 4 125
## 134     1  134  3 115  3 4 125
## 135     1  135  5 115  3 2 125
## 136     1  136  5 115  3 2 125
## 137     1  137  5 115  3 2 125
## 138     1  138  6 115  3 1 125
## 139     1  139  6 114  3 2 125
## 140     1  140  6 114  3 2 125
## 141     1  141  6 114  2 3 125
## 142     1  142  5 116  2 2 125
## 143     1  143  5 116  2 2 125
## 144     1  144  5 115  3 2 125
## 145     1  145  5 115  3 2 125
## 146     1  146  5 115  3 2 125
## 147     1  147  4 115  4 2 125
## 148     1  148  4 115  4 2 125
## 149     1  149  3 116  4 2 125
## 150     1  150  3 116  3 3 125
## 151     1  151  3 116  3 3 125
## 152     1  152  2 117  3 3 125
## 153     1  153  4 117  3 1 125
## 154     1  154  4 116  4 1 125
## 155     1  155  4 116  4 1 125
## 156     1  156  4 115  5 1 125
## 157     1  157  5 114  6 0 125
## 158     1  158  5 114  5 1 125
## 159     1  159  5 113  6 1 125
## 160     1  160  5 113  6 1 125
## 161     1  161  5 113  5 2 125
## 162     1  162  5 113  4 3 125
## 163     1  163  5 110  7 3 125
## 164     1  164  4 110  8 3 125
## 165     1  165  3 111  8 3 125
## 166     1  166  3 111  8 3 125
## 167     1  167  3 110  9 3 125
## 168     1  168  3 110  9 3 125
## 169     1  169  3 110  7 5 125
## 170     1  170  3 110  6 6 125
## 171     1  171  4 110  5 6 125
## 172     1  172  4 110  5 6 125
## 173     1  173  4 110  5 6 125
## 174     1  174  5 110  5 5 125
## 175     1  175  7 110  5 3 125
## 176     1  176  8 110  5 2 125
## 177     1  177  8 110  3 4 125
## 178     1  178  7 111  3 4 125
## 179     1  179  8 111  1 5 125
## 180     1  180  8 111  1 5 125
## 181     1  181  7 112  1 5 125
## 182     1  182  6 113  1 5 125
## 183     1  183  6 113  1 5 125
## 184     1  184  5 113  2 5 125
## 185     1  185  6 113  2 4 125
## 186     1  186  7 112  3 3 125
## 187     1  187  7 112  3 3 125
## 188     1  188  6 112  4 3 125
## 189     1  189  6 111  5 3 125
## 190     1  190  5 112  4 4 125
## 191     1  191  5 111  5 4 125
## 192     1  192  5 111  5 4 125
## 193     1  193  4 111  6 4 125
## 194     1  194  5 111  6 3 125
## 195     1  195  5 111  6 3 125
## 196     1  196  6 111  6 2 125
## 197     1  197  6 111  6 2 125
## 198     1  198  6 110  6 3 125
## 199     1  199  5 111  6 3 125
## 200     1  200  6 110  6 3 125
## 201     1  201  6 110  6 3 125
## 202     1  202  5 111  5 4 125
## 203     1  203  5 110  6 4 125
## 204     1  204  5 110  6 4 125
## 205     1  205  5 110  6 4 125
## 206     1  206  5 110  4 6 125
## 207     1  207  6 109  5 5 125
## 208     1  208  6 109  4 6 125
## 209     1  209  7 109  4 5 125
## 210     1  210  7 109  4 5 125
## 211     1  211  7 109  3 6 125
## 212     1  212  6 110  2 7 125
## 213     1  213  7 109  3 6 125
## 214     1  214  6 110  3 6 125
## 215     1  215  5 111  3 6 125
## 216     1  216  4 112  3 6 125
## 217     1  217  3 113  3 6 125
## 218     1  218  3 113  3 6 125
## 219     1  219  4 113  3 5 125
## 220     1  220  5 112  4 4 125
## 221     1  221  4 111  6 4 125
## 222     1  222  4 111  6 4 125
## 223     1  223  4 111  6 4 125
## 224     1  224  4 111  6 4 125
## 225     1  225  4 111  6 4 125
## 226     1  226  5 110  7 3 125
## 227     1  227  5 110  7 3 125
## 228     1  228  5 111  6 3 125
## 229     1  229  5 111  5 4 125
## 230     1  230  6 111  5 3 125
## 231     1  231  6 111  5 3 125
## 232     1  232  7 111  5 2 125
## 233     1  233  7 111  4 3 125
## 234     1  234  7 112  4 2 125
## 235     1  235  7 112  3 3 125
## 236     1  236  7 112  2 4 125
## 237     1  237  8 112  2 3 125
## 238     1  238  9 112  3 1 125
## 239     1  239  8 113  3 1 125
## 240     1  240  7 114  3 1 125
## 241     1  241  7 114  3 1 125
## 242     1  242  6 115  1 3 125
## 243     1  243  6 115  1 3 125
## 244     1  244  6 115  1 3 125
## 245     1  245  6 115  1 3 125
## 246     1  246  7 115  1 2 125
## 247     1  247  7 115  1 2 125
## 248     1  248  7 115  1 2 125
## 249     1  249  7 115  1 2 125
## 250     1  250  6 117  1 1 125
## 251     1  251  5 118  1 1 125
## 252     1  252  5 118  1 1 125
## 253     1  253  5 118  1 1 125
## 254     1  254  5 118  1 1 125
## 255     1  255  5 118  1 1 125
## 256     1  256  5 118  1 1 125
## 257     1  257  5 119  0 1 125
## 258     1  258  5 118  1 1 125
## 259     1  259  5 118  1 1 125
## 260     1  260  5 118  1 1 125
## 261     1  261  5 117  1 2 125
## 262     1  262  5 117  0 3 125
## 263     1  263  5 117  0 3 125
## 264     1  264  5 117  0 3 125
## 265     1  265  4 118  0 3 125
## 266     1  266  4 118  0 3 125
## 267     1  267  3 119  0 3 125
## 268     1  268  3 119  0 3 125
## 269     1  269  2 120  0 3 125
## 270     1  270  1 121  0 3 125
## 271     1  271  1 121  0 3 125
## 272     1  272  1 121  0 3 125
## 273     1  273  1 121  0 3 125
## 274     1  274  2 121  0 2 125
## 275     1  275  2 121  0 2 125
## 276     1  276  2 120  1 2 125
## 277     1  277  2 120  1 2 125
## 278     1  278  2 120  1 2 125
## 279     1  279  2 120  1 2 125
## 280     1  280  2 120  1 2 125
## 281     1  281  2 120  1 2 125
## 282     1  282  3 120  1 1 125
## 283     1  283  3 120  1 1 125
## 284     1  284  2 120  2 1 125
## 285     1  285  2 120  2 1 125
## 286     1  286  2 119  3 1 125
## 287     1  287  2 119  3 1 125
## 288     1  288  1 120  3 1 125
## 289     1  289  1 120  3 1 125
## 290     1  290  1 120  3 1 125
## 291     1  291  1 120  3 1 125
## 292     1  292  1 120  3 1 125
## 293     1  293  1 120  3 1 125
## 294     1  294  1 120  3 1 125
## 295     1  295  2 120  3 0 125
## 296     1  296  2 120  3 0 125
## 297     1  297  2 120  2 1 125
## 298     1  298  1 121  2 1 125
## 299     1  299  1 121  2 1 125
## 300     1  300  2 121  2 0 125
## 301     1  301  2 121  1 1 125
## 302     1  302  1 121  2 1 125
## 303     1  303  1 121  2 1 125
## 304     1  304  1 121  2 1 125
## 305     1  305  1 120  3 1 125
## 306     1  306  1 120  3 1 125
## 307     1  307  1 120  3 1 125
## 308     1  308  1 120  3 1 125
## 309     1  309  1 120  3 1 125
## 310     1  310  1 119  4 1 125
## 311     1  311  1 119  4 1 125
## 312     1  312  1 119  4 1 125
## 313     1  313  1 118  5 1 125
## 314     1  314  1 118  5 1 125
## 315     1  315  1 118  5 1 125
## 316     1  316  1 118  5 1 125
## 317     1  317  1 117  6 1 125
## 318     1  318  1 117  6 1 125
## 319     1  319  1 116  7 1 125
## 320     1  320  1 115  8 1 125
## 321     1  321  1 115  8 1 125
## 322     1  322  1 115  8 1 125
## 323     1  323  1 115  8 1 125
## 324     1  324  1 114  9 1 125
## 325     1  325  1 112 11 1 125
## 326     1  326  1 113 11 0 125
## 327     1  327  1 112 12 0 125
## 328     1  328  1 111 13 0 125
## 329     1  329  1 111 13 0 125
## 330     1  330  1 111 13 0 125
## 331     1  331  1 111 13 0 125
## 332     1  332  1 111 13 0 125
## 333     1  333  1 111 13 0 125
## 334     1  334  1 111 13 0 125
## 335     1  335  1 111 13 0 125
## 336     1  336  1 111 12 1 125
## 337     1  337  2 111 12 0 125
## 338     1  338  2 111 12 0 125
## 339     1  339  2 111 12 0 125
## 340     1  340  2 110 13 0 125
## 341     1  341  2 109 13 1 125
## 342     1  342  2 109 13 1 125
## 343     1  343  2 109 13 1 125
## 344     1  344  2 109 13 1 125
## 345     1  345  2 109 13 1 125
## 346     1  346  2 109 13 1 125
## 347     1  347  2 109 13 1 125
## 348     1  348  3 108 14 0 125
## 349     1  349  3 108 13 1 125
## 350     1  350  3 108 12 2 125
## 351     1  351  3 108 12 2 125
## 352     1  352  2 108 13 2 125
## 353     1  353  2 108 13 2 125
## 354     1  354  2 108 13 2 125
## 355     1  355  2 107 14 2 125
## 356     1  356  2 107 14 2 125
## 357     1  357  2 107 14 2 125
## 358     1  358  2 107 14 2 125
## 359     1  359  3 107 13 2 125
## 360     1  360  3 107 13 2 125
## 361     1  361  3 107 13 2 125
## 362     1  362  3 107 13 2 125
## 363     1  363  3 107 12 3 125
## 364     1  364  3 107 12 3 125
## 365     1  365  3 107 12 3 125
## 366     1  366  3 107 12 3 125
## 367     1  367  3 107 12 3 125
## 368     1  368  4 107 12 2 125
## 369     1  369  4 106 12 3 125
## 370     1  370  4 106 12 3 125
## 371     1  371  4 107 10 4 125
## 372     1  372  4 106 11 4 125
## 373     1  373  4 105 11 5 125
## 374     1  374  4 105 10 6 125
## 375     1  375  4 105 10 6 125
## 376     1  376  4 105 10 6 125
## 377     1  377  4 104 11 6 125
## 378     1  378  4 104  9 8 125
## 379     1  379  6 103 10 6 125
## 380     1  380  6 103 10 6 125
## 381     1  381  6 103  9 7 125
## 382     1  382  6 103  8 8 125
## 383     1  383  7 102  9 7 125
## 384     1  384  8 101  9 7 125
## 385     1  385  8 101  9 7 125
## 386     1  386 10 101  8 6 125
## 387     1  387  9 102  8 6 125
## 388     1  388  9 102  7 7 125
## 389     1  389  8 103  7 7 125
## 390     1  390  8 103  7 7 125
## 391     1  391  8 103  7 7 125
## 392     1  392  8 104  7 6 125
## 393     1  393  8 104  7 6 125
## 394     1  394  7 104  8 6 125
## 395     1  395  8 104  9 4 125
## 396     1  396  7 105  9 4 125
## 397     1  397  8 104 10 3 125
## 398     1  398  8 104  9 4 125
## 399     1  399  7 105  9 4 125
## 400     1  400  7 105  9 4 125
## 401     1  401  7 105  9 4 125
## 402     1  402  6 105 10 4 125
## 403     1  403  6 105 10 4 125
## 404     1  404  7 104  8 6 125
## 405     1  405  7 104  8 6 125
## 406     1  406  6 105  8 6 125
## 407     1  407  6 106  8 5 125
## 408     1  408  7 106  7 5 125
## 409     1  409  7 105  8 5 125
## 410     1  410  7 106  8 4 125
## 411     1  411  8 106  7 4 125
## 412     1  412  8 106  7 4 125
## 413     1  413  8 106  6 5 125
## 414     1  414  8 106  6 5 125
## 415     1  415  9 106  5 5 125
## 416     1  416  8 107  5 5 125
## 417     1  417  9 107  4 5 125
## 418     1  418 10 105  5 5 125
## 419     1  419 10 105  5 5 125
## 420     1  420 10 105  4 6 125
## 421     1  421 10 106  4 5 125
## 422     1  422  9 107  4 5 125
## 423     1  423  8 107  5 5 125
## 424     1  424  9 107  4 5 125
## 425     1  425  8 107  5 5 125
## 426     1  426  9 108  4 4 125
## 427     1  427  8 109  2 6 125
## 428     1  428 11 109  2 3 125
## 429     1  429 11 109  2 3 125
## 430     1  430 11 109  2 3 125
## 431     1  431 11 109  2 3 125
## 432     1  432 11 109  1 4 125
## 433     1  433 12 109  1 3 125
## 434     1  434 11 110  1 3 125
## 435     1  435 11 110  1 3 125
## 436     1  436 13 109  2 1 125
## 437     1  437 13 109  2 1 125
## 438     1  438 14 109  2 0 125
## 439     1  439 13 110  2 0 125
## 440     1  440 12 111  1 1 125
## 441     1  441 11 112  1 1 125
## 442     1  442 12 112  1 0 125
## 443     1  443 11 113  1 0 125
## 444     1  444 10 113  2 0 125
## 445     1  445 10 113  1 1 125
## 446     1  446 10 113  0 2 125
## 447     1  447 11 113  0 1 125
## 448     1  448  9 115  0 1 125
## 449     1  449  9 115  0 1 125
## 450     1  450  8 115  1 1 125
## 451     1  451  8 115  1 1 125
## 452     1  452  7 116  0 2 125
## 453     1  453  7 116  0 2 125
## 454     1  454  7 114  2 2 125
## 455     1  455  7 114  2 2 125
## 456     1  456  7 115  1 2 125
## 457     1  457  7 115  1 2 125
## 458     1  458  7 115  1 2 125
## 459     1  459  7 115  1 2 125
## 460     1  460  7 115  1 2 125
## 461     1  461  8 115  1 1 125
## 462     1  462  8 115  1 1 125
## 463     1  463  7 116  0 2 125
## 464     1  464  7 116  0 2 125
## 465     1  465  7 116  0 2 125
## 466     1  466  6 116  1 2 125
## 467     1  467  6 116  1 2 125
## 468     1  468  5 117  1 2 125
## 469     1  469  4 118  1 2 125
## 470     1  470  4 117  2 2 125
## 471     1  471  4 117  1 3 125
## 472     1  472  4 117  1 3 125
## 473     1  473  4 117  1 3 125
## 474     1  474  4 117  1 3 125
## 475     1  475  5 116  2 2 125
## 476     1  476  6 116  2 1 125
## 477     1  477  6 116  2 1 125
## 478     1  478  5 116  3 1 125
## 479     1  479  6 116  2 1 125
## 480     1  480  5 117  2 1 125
## 481     1  481  5 116  3 1 125
## 482     1  482  5 115  4 1 125
## 483     1  483  6 115  4 0 125
## 484     1  484  6 114  3 2 125
## 485     1  485  6 114  3 2 125
## 486     1  486  6 114  3 2 125
## 487     1  487  6 114  3 2 125
## 488     1  488  6 115  3 1 125
## 489     1  489  6 115  3 1 125
## 490     1  490  6 114  4 1 125
## 491     1  491  6 114  4 1 125
## 492     1  492  6 114  4 1 125
## 493     1  493  5 115  4 1 125
## 494     1  494  5 115  4 1 125
## 495     1  495  4 116  4 1 125
## 496     1  496  4 116  4 1 125
## 497     1  497  5 116  3 1 125
## 498     1  498  6 116  3 0 125
## 499     1  499  6 115  4 0 125
## 500     1  500  5 116  4 0 125
## 501     1  501  5 116  4 0 125
## 502     1  502  5 116  4 0 125
## 503     1  503  5 116  4 0 125
## 504     1  504  5 116  4 0 125
## 505     1  505  4 117  4 0 125
## 506     1  506  4 116  5 0 125
## 507     1  507  4 116  4 1 125
## 508     1  508  3 117  3 2 125
## 509     1  509  3 116  4 2 125
## 510     1  510  4 116  3 2 125
## 511     1  511  4 115  4 2 125
## 512     1  512  4 115  4 2 125
## 513     1  513  4 114  5 2 125
## 514     1  514  4 113  6 2 125
## 515     1  515  4 113  6 2 125
## 516     1  516  4 113  5 3 125
## 517     1  517  3 114  5 3 125
## 518     1  518  3 113  5 4 125
## 519     1  519  3 113  5 4 125
## 520     1  520  3 113  5 4 125
## 521     1  521  4 113  5 3 125
## 522     1  522  4 113  5 3 125
## 523     1  523  3 113  6 3 125
## 524     1  524  2 114  6 3 125
## 525     1  525  2 114  6 3 125
## 526     1  526  2 114  6 3 125
## 527     1  527  2 114  6 3 125
## 528     1  528  2 114  6 3 125
## 529     1  529  2 114  6 3 125
## 530     1  530  2 114  6 3 125
## 531     1  531  2 114  5 4 125
## 532     1  532  2 113  6 4 125
## 533     1  533  3 112  7 3 125
## 534     1  534  3 112  7 3 125
## 535     1  535  4 112  7 2 125
## 536     1  536  4 111  8 2 125
## 537     1  537  4 111  8 2 125
## 538     1  538  4 111  7 3 125
## 539     1  539  3 111  8 3 125
## 540     1  540  3 111  7 4 125
## 541     1  541  3 111  7 4 125
## 542     1  542  3 111  7 4 125
## 543     1  543  3 111  6 5 125
## 544     1  544  3 111  6 5 125
## 545     1  545  5 111  6 3 125
## 546     1  546  5 110  6 4 125
## 547     1  547  4 111  6 4 125
## 548     1  548  5 111  6 3 125
## 549     1  549  5 111  6 3 125
## 550     1  550  5 111  6 3 125
## 551     1  551  4 112  6 3 125
## 552     1  552  4 112  6 3 125
## 553     1  553  4 111  7 3 125
## 554     1  554  4 111  7 3 125
## 555     1  555  4 111  7 3 125
## 556     1  556  3 112  7 3 125
## 557     1  557  3 111  8 3 125
## 558     1  558  2 112  8 3 125
## 559     1  559  2 111  9 3 125
## 560     1  560  2 110 10 3 125
## 561     1  561  3 110 10 2 125
## 562     1  562  2 110 10 3 125
## 563     1  563  2 109 11 3 125
## 564     1  564  2 108 12 3 125
## 565     1  565  2 108 11 4 125
## 566     1  566  3 108 11 3 125
## 567     1  567  3 108 11 3 125
## 568     1  568  3 107 11 4 125
## 569     1  569  3 107 10 5 125
## 570     1  570  3 107 10 5 125
## 571     1  571  4 107  9 5 125
## 572     1  572  4 108  7 6 125
## 573     1  573  6 108  7 4 125
## 574     1  574  6 108  7 4 125
## 575     1  575  5 109  7 4 125
## 576     1  576  4 109  7 5 125
## 577     1  577  4 109  7 5 125
## 578     1  578  5 109  7 4 125
## 579     1  579  4 110  7 4 125
## 580     1  580  4 110  7 4 125
## 581     1  581  4 110  7 4 125
## 582     1  582  6 110  6 3 125
## 583     1  583  5 111  7 2 125
## 584     1  584  5 111  6 3 125
## 585     1  585  5 111  6 3 125
## 586     1  586  5 110  7 3 125
## 587     1  587  6 109  8 2 125
## 588     1  588  6 109  7 3 125
## 589     1  589  6 109  5 5 125
## 590     1  590  5 110  5 5 125
## 591     1  591  5 109  6 5 125
## 592     1  592  6 108  7 4 125
## 593     1  593  6 107  8 4 125
## 594     1  594  7 106  8 4 125
## 595     1  595  8 106  7 4 125
## 596     1  596  6 107  8 4 125
## 597     1  597  7 107  8 3 125
## 598     1  598  6 108  8 3 125
## 599     1  599  5 109  8 3 125
## 600     1  600  3 111  8 3 125
## 601     1  601  3 111  8 3 125
## 602     1  602  3 111  8 3 125
## 603     1  603  4 111  8 2 125
## 604     1  604  5 111  8 1 125
## 605     1  605  5 111  7 2 125
## 606     1  606  5 111  7 2 125
## 607     1  607  6 109  9 1 125
## 608     1  608  6 109  7 3 125
## 609     1  609  7 109  7 2 125
## 610     1  610  5 111  7 2 125
## 611     1  611  6 111  7 1 125
## 612     1  612  6 111  6 2 125
## 613     1  613  6 111  5 3 125
## 614     1  614  7 111  5 2 125
## 615     1  615  7 111  5 2 125
## 616     1  616  7 109  7 2 125
## 617     1  617  6 110  6 3 125
## 618     1  618  6 109  5 5 125
## 619     1  619  6 109  4 6 125
## 620     1  620  6 109  4 6 125
## 621     1  621  7 109  4 5 125
## 622     1  622  7 108  5 5 125
## 623     1  623  7 107  5 6 125
## 624     1  624  6 108  5 6 125
## 625     1  625  6 109  4 6 125
## 626     1  626  6 109  4 6 125
## 627     1  627  6 109  4 6 125
## 628     1  628  7 109  4 5 125
## 629     1  629  4 112  4 5 125
## 630     1  630  5 112  4 4 125
## 631     1  631  5 111  5 4 125
## 632     1  632  4 112  5 4 125
## 633     1  633  4 112  4 5 125
## 634     1  634  3 113  4 5 125
## 635     1  635  3 112  5 5 125
## 636     1  636  1 114  5 5 125
## 637     1  637  4 114  5 2 125
## 638     1  638  4 114  5 2 125
## 639     1  639  4 114  5 2 125
## 640     1  640  4 114  4 3 125
## 641     1  641  3 115  4 3 125
## 642     1  642  2 116  4 3 125
## 643     1  643  2 116  4 3 125
## 644     1  644  1 117  4 3 125
## 645     1  645  1 117  4 3 125
## 646     1  646  1 116  5 3 125
## 647     1  647  1 116  5 3 125
## 648     1  648  1 116  5 3 125
## 649     1  649  1 116  5 3 125
## 650     1  650  1 117  5 2 125
## 651     1  651  1 117  5 2 125
## 652     1  652  2 117  5 1 125
## 653     1  653  2 116  6 1 125
## 654     1  654  2 116  6 1 125
## 655     1  655  3 116  6 0 125
## 656     1  656  2 117  6 0 125
## 657     1  657  2 117  6 0 125
## 658     1  658  2 116  7 0 125
## 659     1  659  2 116  7 0 125
## 660     1  660  2 116  7 0 125
## 661     1  661  2 116  7 0 125
## 662     1  662  2 116  7 0 125
## 663     1  663  2 115  7 1 125
## 664     1  664  2 114  8 1 125
## 665     1  665  2 114  8 1 125
## 666     1  666  1 115  8 1 125
## 667     1  667  1 115  7 2 125
## 668     1  668  1 115  7 2 125
## 669     1  669  1 115  7 2 125
## 670     1  670  1 115  7 2 125
## 671     1  671  1 115  7 2 125
## 672     1  672  1 115  7 2 125
## 673     1  673  1 115  7 2 125
## 674     1  674  1 114  8 2 125
## 675     1  675  0 115  8 2 125
## 676     1  676  0 115  8 2 125
## 677     1  677  0 115  8 2 125
## 678     1  678  1 115  8 1 125
## 679     1  679  1 115  8 1 125
## 680     1  680  1 115  8 1 125
## 681     1  681  1 114  9 1 125
## 682     1  682  1 114  8 2 125
## 683     1  683  1 114  8 2 125
## 684     1  684  1 114  8 2 125
## 685     1  685  1 114  8 2 125
## 686     1  686  1 113  9 2 125
## 687     1  687  1 112 10 2 125
## 688     1  688  1 112 10 2 125
## 689     1  689  1 112 10 2 125
## 690     1  690  1 111 11 2 125
## 691     1  691  1 111 11 2 125
## 692     1  692  1 111 11 2 125
## 693     1  693  1 111 11 2 125
## 694     1  694  1 109 13 2 125
## 695     1  695  1 109 13 2 125
## 696     1  696  1 108 14 2 125
## 697     1  697  1 108 14 2 125
## 698     1  698  1 108 14 2 125
## 699     1  699  1 109 14 1 125
## 700     1  700  1 109 14 1 125
## 701     1  701  1 109 14 1 125
## 702     1  702  1 108 15 1 125
## 703     1  703  2 107 16 0 125
## 704     1  704  2 107 16 0 125
## 705     1  705  2 107 16 0 125
## 706     1  706  2 106 17 0 125
## 707     1  707  2 105 18 0 125
## 708     1  708  2 105 18 0 125
## 709     1  709  1 106 18 0 125
## 710     1  710  1 106 18 0 125
## 711     1  711  1 105 19 0 125
## 712     1  712  1 105 19 0 125
## 713     1  713  1 105 19 0 125
## 714     1  714  0 105 20 0 125
## 715     1  715  0 104 21 0 125
## 716     1  716  0 104 21 0 125
## 717     1  717  0 103 22 0 125
## 718     1  718  0 103 22 0 125
## 719     1  719  0 103 22 0 125
## 720     1  720  0 103 22 0 125
## 721     1  721  0 103 22 0 125
## 722     1  722  0 103 22 0 125
## 723     1  723  0 103 22 0 125
## 724     1  724  0 103 22 0 125
## 725     1  725  0 102 23 0 125
## 726     1  726  0 102 23 0 125
## 727     1  727  0 102 23 0 125
## 728     1  728  0 102 23 0 125
## 729     1  729  0 102 23 0 125
## 730     1  730  0 102 23 0 125
## 731     1  731  0 102 23 0 125
## 732     1  732  0 102 23 0 125
## 733     1  733  0 102 23 0 125
## 734     1  734  0 102 23 0 125
## 735     1  735  0 102 23 0 125
## 736     1  736  0 102 23 0 125
## 737     1  737  0 102 23 0 125
## 738     1  738  0 101 24 0 125
## 739     1  739  0 101 24 0 125
## 740     1  740  0 101 24 0 125
## 741     1  741  0 101 24 0 125
## 742     1  742  0 101 24 0 125
## 743     1  743  0 101 24 0 125
## 744     1  744  0 101 24 0 125
## 745     1  745  0 101 24 0 125
## 746     1  746  0 101 24 0 125
## 747     1  747  0 101 24 0 125
## 748     1  748  0 101 24 0 125
## 749     1  749  0 101 24 0 125
## 750     1  750  0 101 24 0 125
## 751     1  751  0 101 24 0 125
## 752     1  752  0 100 25 0 125
## 753     1  753  0 100 25 0 125
## 754     1  754  0 100 25 0 125
## 755     1  755  0 100 25 0 125
## 756     1  756  0 100 25 0 125
## 757     1  757  0 100 25 0 125
## 758     1  758  0 100 25 0 125
## 759     1  759  0  99 26 0 125
## 760     1  760  0  99 26 0 125
## 761     1  761  0  99 26 0 125
## 762     1  762  0  99 26 0 125
## 763     1  763  0  99 26 0 125
## 764     1  764  0  99 26 0 125
## 765     1  765  0  99 26 0 125
## 766     1  766  0  99 26 0 125
## 767     1  767  0  99 26 0 125
## 768     1  768  0  98 27 0 125
## 769     1  769  0  98 27 0 125
## 770     1  770  0  97 28 0 125
## 771     1  771  0  97 28 0 125
## 772     1  772  0  96 29 0 125
## 773     1  773  0  96 29 0 125
## 774     1  774  0  96 29 0 125
## 775     1  775  0  95 30 0 125
## 776     1  776  0  95 30 0 125
## 777     1  777  0  95 30 0 125
## 778     1  778  0  95 30 0 125
## 779     1  779  0  95 30 0 125
## 780     1  780  0  95 30 0 125
## 781     1  781  0  95 30 0 125
## 782     1  782  0  94 31 0 125
## 783     1  783  0  94 31 0 125
## 784     1  784  0  94 31 0 125
## 785     1  785  0  93 32 0 125
## 786     1  786  0  93 32 0 125
## 787     1  787  0  93 32 0 125
## 788     1  788  0  93 32 0 125
## 789     1  789  0  93 32 0 125
## 790     1  790  0  93 32 0 125
## 791     1  791  0  93 32 0 125
## 792     1  792  0  93 32 0 125
## 793     1  793  0  93 32 0 125
## 794     1  794  0  93 32 0 125
## 795     1  795  0  93 32 0 125
## 796     1  796  0  93 32 0 125
## 797     1  797  0  93 32 0 125
## 798     1  798  0  91 34 0 125
## 799     1  799  0  91 34 0 125
## 800     1  800  0  89 36 0 125
## 801     1  801  0  89 36 0 125
## 802     1  802  0  88 37 0 125
## 803     1  803  0  88 37 0 125
## 804     1  804  0  88 37 0 125
## 805     1  805  0  88 37 0 125
## 806     1  806  0  88 37 0 125
## 807     1  807  0  87 38 0 125
## 808     1  808  0  87 38 0 125
## 809     1  809  0  86 39 0 125
## 810     1  810  0  85 40 0 125
## 811     1  811  0  85 40 0 125
## 812     1  812  0  85 40 0 125
## 813     1  813  0  84 41 0 125
## 814     1  814  0  84 41 0 125
## 815     1  815  0  84 41 0 125
## 816     1  816  0  84 41 0 125
## 817     1  817  0  83 42 0 125
## 818     1  818  0  82 43 0 125
## 819     1  819  0  82 43 0 125
## 820     1  820  0  82 43 0 125
## 821     1  821  0  82 43 0 125
## 822     1  822  0  82 43 0 125
## 823     1  823  0  82 43 0 125
## 824     1  824  0  82 43 0 125
## 825     1  825  0  82 43 0 125
## 826     1  826  0  82 43 0 125
## 827     1  827  0  82 43 0 125
## 828     1  828  0  82 43 0 125
## 829     1  829  0  82 43 0 125
## 830     1  830  0  82 43 0 125
## 831     1  831  0  82 43 0 125
## 832     1  832  0  82 43 0 125
## 833     1  833  0  82 43 0 125
## 834     1  834  0  81 44 0 125
## 835     1  835  0  80 45 0 125
## 836     1  836  0  80 45 0 125
## 837     1  837  0  80 45 0 125
## 838     1  838  0  80 45 0 125
## 839     1  839  0  80 45 0 125
## 840     1  840  0  80 45 0 125
## 841     1  841  0  80 45 0 125
## 842     1  842  0  79 46 0 125
## 843     1  843  0  79 46 0 125
## 844     1  844  0  79 46 0 125
## 845     1  845  0  79 46 0 125
## 846     1  846  0  79 46 0 125
## 847     1  847  0  78 47 0 125
## 848     1  848  0  78 47 0 125
## 849     1  849  0  78 47 0 125
## 850     1  850  0  78 47 0 125
## 851     1  851  0  78 47 0 125
## 852     1  852  0  77 48 0 125
## 853     1  853  0  76 49 0 125
## 854     1  854  0  76 49 0 125
## 855     1  855  0  76 49 0 125
## 856     1  856  0  76 49 0 125
## 857     1  857  0  76 49 0 125
## 858     1  858  0  75 50 0 125
## 859     1  859  0  75 50 0 125
## 860     1  860  0  75 50 0 125
## 861     1  861  0  75 50 0 125
## 862     1  862  0  75 50 0 125
## 863     1  863  0  75 50 0 125
## 864     1  864  0  75 50 0 125
## 865     1  865  0  75 50 0 125
## 866     1  866  0  75 50 0 125
## 867     1  867  0  75 50 0 125
## 868     1  868  0  75 50 0 125
## 869     1  869  0  74 51 0 125
## 870     1  870  0  73 52 0 125
## 871     1  871  0  72 53 0 125
## 872     1  872  0  72 53 0 125
## 873     1  873  0  71 54 0 125
## 874     1  874  0  70 55 0 125
## 875     1  875  0  70 55 0 125
## 876     1  876  0  70 55 0 125
## 877     1  877  0  69 56 0 125
## 878     1  878  0  69 56 0 125
## 879     1  879  0  69 56 0 125
## 880     1  880  0  69 56 0 125
## 881     1  881  0  69 56 0 125
## 882     1  882  0  69 56 0 125
## 883     1  883  0  69 56 0 125
## 884     1  884  0  69 56 0 125
## 885     1  885  0  69 56 0 125
## 886     1  886  0  68 57 0 125
## 887     1  887  0  68 57 0 125
## 888     1  888  0  68 57 0 125
## 889     1  889  0  68 57 0 125
## 890     1  890  0  68 57 0 125
## 891     1  891  0  68 57 0 125
## 892     1  892  0  68 57 0 125
## 893     1  893  0  68 57 0 125
## 894     1  894  0  66 59 0 125
## 895     1  895  0  66 59 0 125
## 896     1  896  0  66 59 0 125
## 897     1  897  0  66 59 0 125
## 898     1  898  0  66 59 0 125
## 899     1  899  0  66 59 0 125
## 900     1  900  0  66 59 0 125
## 901     1  901  0  66 59 0 125
## 902     1  902  0  66 59 0 125
## 903     1  903  0  66 59 0 125
## 904     1  904  0  66 59 0 125
## 905     1  905  0  66 59 0 125
## 906     1  906  0  66 59 0 125
## 907     1  907  0  66 59 0 125
## 908     1  908  0  66 59 0 125
## 909     1  909  0  66 59 0 125
## 910     1  910  0  66 59 0 125
## 911     1  911  0  65 60 0 125
## 912     1  912  0  65 60 0 125
## 913     1  913  0  65 60 0 125
## 914     1  914  0  64 61 0 125
## 915     1  915  0  64 61 0 125
## 916     1  916  0  64 61 0 125
## 917     1  917  0  64 61 0 125
## 918     1  918  0  64 61 0 125
## 919     1  919  0  64 61 0 125
## 920     1  920  0  64 61 0 125
## 921     1  921  0  64 61 0 125
## 922     1  922  0  64 61 0 125
## 923     1  923  0  63 62 0 125
## 924     1  924  0  62 63 0 125
## 925     1  925  0  62 63 0 125
## 926     1  926  0  62 63 0 125
## 927     1  927  0  62 63 0 125
## 928     1  928  0  62 63 0 125
## 929     1  929  0  61 64 0 125
## 930     1  930  0  61 64 0 125
## 931     1  931  0  61 64 0 125
## 932     1  932  0  61 64 0 125
## 933     1  933  0  61 64 0 125
## 934     1  934  0  61 64 0 125
## 935     1  935  0  61 64 0 125
## 936     1  936  0  60 65 0 125
## 937     1  937  0  60 65 0 125
## 938     1  938  0  60 65 0 125
## 939     1  939  0  60 65 0 125
## 940     1  940  0  60 65 0 125
## 941     1  941  0  60 65 0 125
## 942     1  942  0  60 65 0 125
## 943     1  943  0  60 65 0 125
## 944     1  944  0  60 65 0 125
## 945     1  945  0  60 65 0 125
## 946     1  946  0  60 65 0 125
## 947     1  947  0  60 65 0 125
## 948     1  948  0  60 65 0 125
## 949     1  949  0  60 65 0 125
## 950     1  950  0  60 65 0 125
## 951     1  951  0  60 65 0 125
## 952     1  952  0  60 65 0 125
## 953     1  953  0  60 65 0 125
## 954     1  954  0  60 65 0 125
## 955     1  955  0  60 65 0 125
## 956     1  956  0  60 65 0 125
## 957     1  957  0  60 65 0 125
## 958     1  958  0  60 65 0 125
## 959     1  959  0  60 65 0 125
## 960     1  960  0  60 65 0 125
## 961     1  961  0  60 65 0 125
## 962     1  962  0  60 65 0 125
## 963     1  963  0  60 65 0 125
## 964     1  964  0  60 65 0 125
## 965     1  965  0  60 65 0 125
## 966     1  966  0  60 65 0 125
## 967     1  967  0  60 65 0 125
## 968     1  968  0  60 65 0 125
## 969     1  969  0  60 65 0 125
## 970     1  970  0  59 66 0 125
## 971     1  971  0  59 66 0 125
## 972     1  972  0  59 66 0 125
## 973     1  973  0  59 66 0 125
## 974     1  974  0  59 66 0 125
## 975     1  975  0  59 66 0 125
## 976     1  976  0  59 66 0 125
## 977     1  977  0  59 66 0 125
## 978     1  978  0  58 67 0 125
## 979     1  979  0  58 67 0 125
## 980     1  980  0  58 67 0 125
## 981     1  981  0  57 68 0 125
## 982     1  982  0  57 68 0 125
## 983     1  983  0  57 68 0 125
## 984     1  984  0  57 68 0 125
## 985     1  985  0  57 68 0 125
## 986     1  986  0  57 68 0 125
## 987     1  987  0  57 68 0 125
## 988     1  988  0  57 68 0 125
## 989     1  989  0  57 68 0 125
## 990     1  990  0  57 68 0 125
## 991     1  991  0  56 69 0 125
## 992     1  992  0  56 69 0 125
## 993     1  993  0  56 69 0 125
## 994     1  994  0  55 70 0 125
## 995     1  995  0  54 71 0 125
## 996     1  996  0  54 71 0 125
## 997     1  997  0  54 71 0 125
## 998     1  998  0  54 71 0 125
## 999     1  999  0  54 71 0 125
## 1000    1 1000  0  54 71 0 125

3.1 Trajectory

3.2 ? What the index is refering to

trajectory(result3, compartments = "I", index = 1)
##      node time  I
## 1       1    1  5
## 2       1    2  3
## 3       1    3  3
## 4       1    4  3
## 5       1    5  3
## 6       1    6  3
## 7       1    7  4
## 8       1    8  4
## 9       1    9  3
## 10      1   10  2
## 11      1   11  2
## 12      1   12  3
## 13      1   13  3
## 14      1   14  2
## 15      1   15  2
## 16      1   16  2
## 17      1   17  2
## 18      1   18  2
## 19      1   19  2
## 20      1   20  2
## 21      1   21  2
## 22      1   22  2
## 23      1   23  1
## 24      1   24  1
## 25      1   25  1
## 26      1   26  1
## 27      1   27  1
## 28      1   28  1
## 29      1   29  1
## 30      1   30  1
## 31      1   31  1
## 32      1   32  2
## 33      1   33  2
## 34      1   34  3
## 35      1   35  3
## 36      1   36  3
## 37      1   37  3
## 38      1   38  1
## 39      1   39  1
## 40      1   40  1
## 41      1   41  0
## 42      1   42  0
## 43      1   43  0
## 44      1   44  0
## 45      1   45  0
## 46      1   46  0
## 47      1   47  0
## 48      1   48  0
## 49      1   49  0
## 50      1   50  1
## 51      1   51  2
## 52      1   52  2
## 53      1   53  2
## 54      1   54  2
## 55      1   55  3
## 56      1   56  3
## 57      1   57  3
## 58      1   58  3
## 59      1   59  3
## 60      1   60  3
## 61      1   61  3
## 62      1   62  4
## 63      1   63  3
## 64      1   64  3
## 65      1   65  3
## 66      1   66  3
## 67      1   67  4
## 68      1   68  3
## 69      1   69  3
## 70      1   70  3
## 71      1   71  3
## 72      1   72  3
## 73      1   73  3
## 74      1   74  2
## 75      1   75  2
## 76      1   76  2
## 77      1   77  2
## 78      1   78  3
## 79      1   79  3
## 80      1   80  3
## 81      1   81  3
## 82      1   82  3
## 83      1   83  3
## 84      1   84  2
## 85      1   85  2
## 86      1   86  2
## 87      1   87  4
## 88      1   88  4
## 89      1   89  4
## 90      1   90  4
## 91      1   91  4
## 92      1   92  4
## 93      1   93  5
## 94      1   94  5
## 95      1   95  5
## 96      1   96  5
## 97      1   97  5
## 98      1   98  5
## 99      1   99  6
## 100     1  100  6
## 101     1  101  5
## 102     1  102  4
## 103     1  103  2
## 104     1  104  2
## 105     1  105  0
## 106     1  106  0
## 107     1  107  0
## 108     1  108  0
## 109     1  109  0
## 110     1  110  0
## 111     1  111  1
## 112     1  112  3
## 113     1  113  3
## 114     1  114  3
## 115     1  115  4
## 116     1  116  4
## 117     1  117  4
## 118     1  118  4
## 119     1  119  4
## 120     1  120  4
## 121     1  121  4
## 122     1  122  4
## 123     1  123  4
## 124     1  124  4
## 125     1  125  4
## 126     1  126  5
## 127     1  127  6
## 128     1  128  6
## 129     1  129  5
## 130     1  130  3
## 131     1  131  2
## 132     1  132  3
## 133     1  133  3
## 134     1  134  3
## 135     1  135  3
## 136     1  136  3
## 137     1  137  3
## 138     1  138  3
## 139     1  139  3
## 140     1  140  3
## 141     1  141  2
## 142     1  142  2
## 143     1  143  2
## 144     1  144  3
## 145     1  145  3
## 146     1  146  3
## 147     1  147  4
## 148     1  148  4
## 149     1  149  4
## 150     1  150  3
## 151     1  151  3
## 152     1  152  3
## 153     1  153  3
## 154     1  154  4
## 155     1  155  4
## 156     1  156  5
## 157     1  157  6
## 158     1  158  5
## 159     1  159  6
## 160     1  160  6
## 161     1  161  5
## 162     1  162  4
## 163     1  163  7
## 164     1  164  8
## 165     1  165  8
## 166     1  166  8
## 167     1  167  9
## 168     1  168  9
## 169     1  169  7
## 170     1  170  6
## 171     1  171  5
## 172     1  172  5
## 173     1  173  5
## 174     1  174  5
## 175     1  175  5
## 176     1  176  5
## 177     1  177  3
## 178     1  178  3
## 179     1  179  1
## 180     1  180  1
## 181     1  181  1
## 182     1  182  1
## 183     1  183  1
## 184     1  184  2
## 185     1  185  2
## 186     1  186  3
## 187     1  187  3
## 188     1  188  4
## 189     1  189  5
## 190     1  190  4
## 191     1  191  5
## 192     1  192  5
## 193     1  193  6
## 194     1  194  6
## 195     1  195  6
## 196     1  196  6
## 197     1  197  6
## 198     1  198  6
## 199     1  199  6
## 200     1  200  6
## 201     1  201  6
## 202     1  202  5
## 203     1  203  6
## 204     1  204  6
## 205     1  205  6
## 206     1  206  4
## 207     1  207  5
## 208     1  208  4
## 209     1  209  4
## 210     1  210  4
## 211     1  211  3
## 212     1  212  2
## 213     1  213  3
## 214     1  214  3
## 215     1  215  3
## 216     1  216  3
## 217     1  217  3
## 218     1  218  3
## 219     1  219  3
## 220     1  220  4
## 221     1  221  6
## 222     1  222  6
## 223     1  223  6
## 224     1  224  6
## 225     1  225  6
## 226     1  226  7
## 227     1  227  7
## 228     1  228  6
## 229     1  229  5
## 230     1  230  5
## 231     1  231  5
## 232     1  232  5
## 233     1  233  4
## 234     1  234  4
## 235     1  235  3
## 236     1  236  2
## 237     1  237  2
## 238     1  238  3
## 239     1  239  3
## 240     1  240  3
## 241     1  241  3
## 242     1  242  1
## 243     1  243  1
## 244     1  244  1
## 245     1  245  1
## 246     1  246  1
## 247     1  247  1
## 248     1  248  1
## 249     1  249  1
## 250     1  250  1
## 251     1  251  1
## 252     1  252  1
## 253     1  253  1
## 254     1  254  1
## 255     1  255  1
## 256     1  256  1
## 257     1  257  0
## 258     1  258  1
## 259     1  259  1
## 260     1  260  1
## 261     1  261  1
## 262     1  262  0
## 263     1  263  0
## 264     1  264  0
## 265     1  265  0
## 266     1  266  0
## 267     1  267  0
## 268     1  268  0
## 269     1  269  0
## 270     1  270  0
## 271     1  271  0
## 272     1  272  0
## 273     1  273  0
## 274     1  274  0
## 275     1  275  0
## 276     1  276  1
## 277     1  277  1
## 278     1  278  1
## 279     1  279  1
## 280     1  280  1
## 281     1  281  1
## 282     1  282  1
## 283     1  283  1
## 284     1  284  2
## 285     1  285  2
## 286     1  286  3
## 287     1  287  3
## 288     1  288  3
## 289     1  289  3
## 290     1  290  3
## 291     1  291  3
## 292     1  292  3
## 293     1  293  3
## 294     1  294  3
## 295     1  295  3
## 296     1  296  3
## 297     1  297  2
## 298     1  298  2
## 299     1  299  2
## 300     1  300  2
## 301     1  301  1
## 302     1  302  2
## 303     1  303  2
## 304     1  304  2
## 305     1  305  3
## 306     1  306  3
## 307     1  307  3
## 308     1  308  3
## 309     1  309  3
## 310     1  310  4
## 311     1  311  4
## 312     1  312  4
## 313     1  313  5
## 314     1  314  5
## 315     1  315  5
## 316     1  316  5
## 317     1  317  6
## 318     1  318  6
## 319     1  319  7
## 320     1  320  8
## 321     1  321  8
## 322     1  322  8
## 323     1  323  8
## 324     1  324  9
## 325     1  325 11
## 326     1  326 11
## 327     1  327 12
## 328     1  328 13
## 329     1  329 13
## 330     1  330 13
## 331     1  331 13
## 332     1  332 13
## 333     1  333 13
## 334     1  334 13
## 335     1  335 13
## 336     1  336 12
## 337     1  337 12
## 338     1  338 12
## 339     1  339 12
## 340     1  340 13
## 341     1  341 13
## 342     1  342 13
## 343     1  343 13
## 344     1  344 13
## 345     1  345 13
## 346     1  346 13
## 347     1  347 13
## 348     1  348 14
## 349     1  349 13
## 350     1  350 12
## 351     1  351 12
## 352     1  352 13
## 353     1  353 13
## 354     1  354 13
## 355     1  355 14
## 356     1  356 14
## 357     1  357 14
## 358     1  358 14
## 359     1  359 13
## 360     1  360 13
## 361     1  361 13
## 362     1  362 13
## 363     1  363 12
## 364     1  364 12
## 365     1  365 12
## 366     1  366 12
## 367     1  367 12
## 368     1  368 12
## 369     1  369 12
## 370     1  370 12
## 371     1  371 10
## 372     1  372 11
## 373     1  373 11
## 374     1  374 10
## 375     1  375 10
## 376     1  376 10
## 377     1  377 11
## 378     1  378  9
## 379     1  379 10
## 380     1  380 10
## 381     1  381  9
## 382     1  382  8
## 383     1  383  9
## 384     1  384  9
## 385     1  385  9
## 386     1  386  8
## 387     1  387  8
## 388     1  388  7
## 389     1  389  7
## 390     1  390  7
## 391     1  391  7
## 392     1  392  7
## 393     1  393  7
## 394     1  394  8
## 395     1  395  9
## 396     1  396  9
## 397     1  397 10
## 398     1  398  9
## 399     1  399  9
## 400     1  400  9
## 401     1  401  9
## 402     1  402 10
## 403     1  403 10
## 404     1  404  8
## 405     1  405  8
## 406     1  406  8
## 407     1  407  8
## 408     1  408  7
## 409     1  409  8
## 410     1  410  8
## 411     1  411  7
## 412     1  412  7
## 413     1  413  6
## 414     1  414  6
## 415     1  415  5
## 416     1  416  5
## 417     1  417  4
## 418     1  418  5
## 419     1  419  5
## 420     1  420  4
## 421     1  421  4
## 422     1  422  4
## 423     1  423  5
## 424     1  424  4
## 425     1  425  5
## 426     1  426  4
## 427     1  427  2
## 428     1  428  2
## 429     1  429  2
## 430     1  430  2
## 431     1  431  2
## 432     1  432  1
## 433     1  433  1
## 434     1  434  1
## 435     1  435  1
## 436     1  436  2
## 437     1  437  2
## 438     1  438  2
## 439     1  439  2
## 440     1  440  1
## 441     1  441  1
## 442     1  442  1
## 443     1  443  1
## 444     1  444  2
## 445     1  445  1
## 446     1  446  0
## 447     1  447  0
## 448     1  448  0
## 449     1  449  0
## 450     1  450  1
## 451     1  451  1
## 452     1  452  0
## 453     1  453  0
## 454     1  454  2
## 455     1  455  2
## 456     1  456  1
## 457     1  457  1
## 458     1  458  1
## 459     1  459  1
## 460     1  460  1
## 461     1  461  1
## 462     1  462  1
## 463     1  463  0
## 464     1  464  0
## 465     1  465  0
## 466     1  466  1
## 467     1  467  1
## 468     1  468  1
## 469     1  469  1
## 470     1  470  2
## 471     1  471  1
## 472     1  472  1
## 473     1  473  1
## 474     1  474  1
## 475     1  475  2
## 476     1  476  2
## 477     1  477  2
## 478     1  478  3
## 479     1  479  2
## 480     1  480  2
## 481     1  481  3
## 482     1  482  4
## 483     1  483  4
## 484     1  484  3
## 485     1  485  3
## 486     1  486  3
## 487     1  487  3
## 488     1  488  3
## 489     1  489  3
## 490     1  490  4
## 491     1  491  4
## 492     1  492  4
## 493     1  493  4
## 494     1  494  4
## 495     1  495  4
## 496     1  496  4
## 497     1  497  3
## 498     1  498  3
## 499     1  499  4
## 500     1  500  4
## 501     1  501  4
## 502     1  502  4
## 503     1  503  4
## 504     1  504  4
## 505     1  505  4
## 506     1  506  5
## 507     1  507  4
## 508     1  508  3
## 509     1  509  4
## 510     1  510  3
## 511     1  511  4
## 512     1  512  4
## 513     1  513  5
## 514     1  514  6
## 515     1  515  6
## 516     1  516  5
## 517     1  517  5
## 518     1  518  5
## 519     1  519  5
## 520     1  520  5
## 521     1  521  5
## 522     1  522  5
## 523     1  523  6
## 524     1  524  6
## 525     1  525  6
## 526     1  526  6
## 527     1  527  6
## 528     1  528  6
## 529     1  529  6
## 530     1  530  6
## 531     1  531  5
## 532     1  532  6
## 533     1  533  7
## 534     1  534  7
## 535     1  535  7
## 536     1  536  8
## 537     1  537  8
## 538     1  538  7
## 539     1  539  8
## 540     1  540  7
## 541     1  541  7
## 542     1  542  7
## 543     1  543  6
## 544     1  544  6
## 545     1  545  6
## 546     1  546  6
## 547     1  547  6
## 548     1  548  6
## 549     1  549  6
## 550     1  550  6
## 551     1  551  6
## 552     1  552  6
## 553     1  553  7
## 554     1  554  7
## 555     1  555  7
## 556     1  556  7
## 557     1  557  8
## 558     1  558  8
## 559     1  559  9
## 560     1  560 10
## 561     1  561 10
## 562     1  562 10
## 563     1  563 11
## 564     1  564 12
## 565     1  565 11
## 566     1  566 11
## 567     1  567 11
## 568     1  568 11
## 569     1  569 10
## 570     1  570 10
## 571     1  571  9
## 572     1  572  7
## 573     1  573  7
## 574     1  574  7
## 575     1  575  7
## 576     1  576  7
## 577     1  577  7
## 578     1  578  7
## 579     1  579  7
## 580     1  580  7
## 581     1  581  7
## 582     1  582  6
## 583     1  583  7
## 584     1  584  6
## 585     1  585  6
## 586     1  586  7
## 587     1  587  8
## 588     1  588  7
## 589     1  589  5
## 590     1  590  5
## 591     1  591  6
## 592     1  592  7
## 593     1  593  8
## 594     1  594  8
## 595     1  595  7
## 596     1  596  8
## 597     1  597  8
## 598     1  598  8
## 599     1  599  8
## 600     1  600  8
## 601     1  601  8
## 602     1  602  8
## 603     1  603  8
## 604     1  604  8
## 605     1  605  7
## 606     1  606  7
## 607     1  607  9
## 608     1  608  7
## 609     1  609  7
## 610     1  610  7
## 611     1  611  7
## 612     1  612  6
## 613     1  613  5
## 614     1  614  5
## 615     1  615  5
## 616     1  616  7
## 617     1  617  6
## 618     1  618  5
## 619     1  619  4
## 620     1  620  4
## 621     1  621  4
## 622     1  622  5
## 623     1  623  5
## 624     1  624  5
## 625     1  625  4
## 626     1  626  4
## 627     1  627  4
## 628     1  628  4
## 629     1  629  4
## 630     1  630  4
## 631     1  631  5
## 632     1  632  5
## 633     1  633  4
## 634     1  634  4
## 635     1  635  5
## 636     1  636  5
## 637     1  637  5
## 638     1  638  5
## 639     1  639  5
## 640     1  640  4
## 641     1  641  4
## 642     1  642  4
## 643     1  643  4
## 644     1  644  4
## 645     1  645  4
## 646     1  646  5
## 647     1  647  5
## 648     1  648  5
## 649     1  649  5
## 650     1  650  5
## 651     1  651  5
## 652     1  652  5
## 653     1  653  6
## 654     1  654  6
## 655     1  655  6
## 656     1  656  6
## 657     1  657  6
## 658     1  658  7
## 659     1  659  7
## 660     1  660  7
## 661     1  661  7
## 662     1  662  7
## 663     1  663  7
## 664     1  664  8
## 665     1  665  8
## 666     1  666  8
## 667     1  667  7
## 668     1  668  7
## 669     1  669  7
## 670     1  670  7
## 671     1  671  7
## 672     1  672  7
## 673     1  673  7
## 674     1  674  8
## 675     1  675  8
## 676     1  676  8
## 677     1  677  8
## 678     1  678  8
## 679     1  679  8
## 680     1  680  8
## 681     1  681  9
## 682     1  682  8
## 683     1  683  8
## 684     1  684  8
## 685     1  685  8
## 686     1  686  9
## 687     1  687 10
## 688     1  688 10
## 689     1  689 10
## 690     1  690 11
## 691     1  691 11
## 692     1  692 11
## 693     1  693 11
## 694     1  694 13
## 695     1  695 13
## 696     1  696 14
## 697     1  697 14
## 698     1  698 14
## 699     1  699 14
## 700     1  700 14
## 701     1  701 14
## 702     1  702 15
## 703     1  703 16
## 704     1  704 16
## 705     1  705 16
## 706     1  706 17
## 707     1  707 18
## 708     1  708 18
## 709     1  709 18
## 710     1  710 18
## 711     1  711 19
## 712     1  712 19
## 713     1  713 19
## 714     1  714 20
## 715     1  715 21
## 716     1  716 21
## 717     1  717 22
## 718     1  718 22
## 719     1  719 22
## 720     1  720 22
## 721     1  721 22
## 722     1  722 22
## 723     1  723 22
## 724     1  724 22
## 725     1  725 23
## 726     1  726 23
## 727     1  727 23
## 728     1  728 23
## 729     1  729 23
## 730     1  730 23
## 731     1  731 23
## 732     1  732 23
## 733     1  733 23
## 734     1  734 23
## 735     1  735 23
## 736     1  736 23
## 737     1  737 23
## 738     1  738 24
## 739     1  739 24
## 740     1  740 24
## 741     1  741 24
## 742     1  742 24
## 743     1  743 24
## 744     1  744 24
## 745     1  745 24
## 746     1  746 24
## 747     1  747 24
## 748     1  748 24
## 749     1  749 24
## 750     1  750 24
## 751     1  751 24
## 752     1  752 25
## 753     1  753 25
## 754     1  754 25
## 755     1  755 25
## 756     1  756 25
## 757     1  757 25
## 758     1  758 25
## 759     1  759 26
## 760     1  760 26
## 761     1  761 26
## 762     1  762 26
## 763     1  763 26
## 764     1  764 26
## 765     1  765 26
## 766     1  766 26
## 767     1  767 26
## 768     1  768 27
## 769     1  769 27
## 770     1  770 28
## 771     1  771 28
## 772     1  772 29
## 773     1  773 29
## 774     1  774 29
## 775     1  775 30
## 776     1  776 30
## 777     1  777 30
## 778     1  778 30
## 779     1  779 30
## 780     1  780 30
## 781     1  781 30
## 782     1  782 31
## 783     1  783 31
## 784     1  784 31
## 785     1  785 32
## 786     1  786 32
## 787     1  787 32
## 788     1  788 32
## 789     1  789 32
## 790     1  790 32
## 791     1  791 32
## 792     1  792 32
## 793     1  793 32
## 794     1  794 32
## 795     1  795 32
## 796     1  796 32
## 797     1  797 32
## 798     1  798 34
## 799     1  799 34
## 800     1  800 36
## 801     1  801 36
## 802     1  802 37
## 803     1  803 37
## 804     1  804 37
## 805     1  805 37
## 806     1  806 37
## 807     1  807 38
## 808     1  808 38
## 809     1  809 39
## 810     1  810 40
## 811     1  811 40
## 812     1  812 40
## 813     1  813 41
## 814     1  814 41
## 815     1  815 41
## 816     1  816 41
## 817     1  817 42
## 818     1  818 43
## 819     1  819 43
## 820     1  820 43
## 821     1  821 43
## 822     1  822 43
## 823     1  823 43
## 824     1  824 43
## 825     1  825 43
## 826     1  826 43
## 827     1  827 43
## 828     1  828 43
## 829     1  829 43
## 830     1  830 43
## 831     1  831 43
## 832     1  832 43
## 833     1  833 43
## 834     1  834 44
## 835     1  835 45
## 836     1  836 45
## 837     1  837 45
## 838     1  838 45
## 839     1  839 45
## 840     1  840 45
## 841     1  841 45
## 842     1  842 46
## 843     1  843 46
## 844     1  844 46
## 845     1  845 46
## 846     1  846 46
## 847     1  847 47
## 848     1  848 47
## 849     1  849 47
## 850     1  850 47
## 851     1  851 47
## 852     1  852 48
## 853     1  853 49
## 854     1  854 49
## 855     1  855 49
## 856     1  856 49
## 857     1  857 49
## 858     1  858 50
## 859     1  859 50
## 860     1  860 50
## 861     1  861 50
## 862     1  862 50
## 863     1  863 50
## 864     1  864 50
## 865     1  865 50
## 866     1  866 50
## 867     1  867 50
## 868     1  868 50
## 869     1  869 51
## 870     1  870 52
## 871     1  871 53
## 872     1  872 53
## 873     1  873 54
## 874     1  874 55
## 875     1  875 55
## 876     1  876 55
## 877     1  877 56
## 878     1  878 56
## 879     1  879 56
## 880     1  880 56
## 881     1  881 56
## 882     1  882 56
## 883     1  883 56
## 884     1  884 56
## 885     1  885 56
## 886     1  886 57
## 887     1  887 57
## 888     1  888 57
## 889     1  889 57
## 890     1  890 57
## 891     1  891 57
## 892     1  892 57
## 893     1  893 57
## 894     1  894 59
## 895     1  895 59
## 896     1  896 59
## 897     1  897 59
## 898     1  898 59
## 899     1  899 59
## 900     1  900 59
## 901     1  901 59
## 902     1  902 59
## 903     1  903 59
## 904     1  904 59
## 905     1  905 59
## 906     1  906 59
## 907     1  907 59
## 908     1  908 59
## 909     1  909 59
## 910     1  910 59
## 911     1  911 60
## 912     1  912 60
## 913     1  913 60
## 914     1  914 61
## 915     1  915 61
## 916     1  916 61
## 917     1  917 61
## 918     1  918 61
## 919     1  919 61
## 920     1  920 61
## 921     1  921 61
## 922     1  922 61
## 923     1  923 62
## 924     1  924 63
## 925     1  925 63
## 926     1  926 63
## 927     1  927 63
## 928     1  928 63
## 929     1  929 64
## 930     1  930 64
## 931     1  931 64
## 932     1  932 64
## 933     1  933 64
## 934     1  934 64
## 935     1  935 64
## 936     1  936 65
## 937     1  937 65
## 938     1  938 65
## 939     1  939 65
## 940     1  940 65
## 941     1  941 65
## 942     1  942 65
## 943     1  943 65
## 944     1  944 65
## 945     1  945 65
## 946     1  946 65
## 947     1  947 65
## 948     1  948 65
## 949     1  949 65
## 950     1  950 65
## 951     1  951 65
## 952     1  952 65
## 953     1  953 65
## 954     1  954 65
## 955     1  955 65
## 956     1  956 65
## 957     1  957 65
## 958     1  958 65
## 959     1  959 65
## 960     1  960 65
## 961     1  961 65
## 962     1  962 65
## 963     1  963 65
## 964     1  964 65
## 965     1  965 65
## 966     1  966 65
## 967     1  967 65
## 968     1  968 65
## 969     1  969 65
## 970     1  970 66
## 971     1  971 66
## 972     1  972 66
## 973     1  973 66
## 974     1  974 66
## 975     1  975 66
## 976     1  976 66
## 977     1  977 66
## 978     1  978 67
## 979     1  979 67
## 980     1  980 67
## 981     1  981 68
## 982     1  982 68
## 983     1  983 68
## 984     1  984 68
## 985     1  985 68
## 986     1  986 68
## 987     1  987 68
## 988     1  988 68
## 989     1  989 68
## 990     1  990 68
## 991     1  991 69
## 992     1  992 69
## 993     1  993 69
## 994     1  994 70
## 995     1  995 71
## 996     1  996 71
## 997     1  997 71
## 998     1  998 71
## 999     1  999 71
## 1000    1 1000 71

3.3 Prevalence

prevalence(result3, I~.)
##      time prevalence
## 1       1      0.040
## 2       2      0.024
## 3       3      0.024
## 4       4      0.024
## 5       5      0.024
## 6       6      0.024
## 7       7      0.032
## 8       8      0.032
## 9       9      0.024
## 10     10      0.016
## 11     11      0.016
## 12     12      0.024
## 13     13      0.024
## 14     14      0.016
## 15     15      0.016
## 16     16      0.016
## 17     17      0.016
## 18     18      0.016
## 19     19      0.016
## 20     20      0.016
## 21     21      0.016
## 22     22      0.016
## 23     23      0.008
## 24     24      0.008
## 25     25      0.008
## 26     26      0.008
## 27     27      0.008
## 28     28      0.008
## 29     29      0.008
## 30     30      0.008
## 31     31      0.008
## 32     32      0.016
## 33     33      0.016
## 34     34      0.024
## 35     35      0.024
## 36     36      0.024
## 37     37      0.024
## 38     38      0.008
## 39     39      0.008
## 40     40      0.008
## 41     41      0.000
## 42     42      0.000
## 43     43      0.000
## 44     44      0.000
## 45     45      0.000
## 46     46      0.000
## 47     47      0.000
## 48     48      0.000
## 49     49      0.000
## 50     50      0.008
## 51     51      0.016
## 52     52      0.016
## 53     53      0.016
## 54     54      0.016
## 55     55      0.024
## 56     56      0.024
## 57     57      0.024
## 58     58      0.024
## 59     59      0.024
## 60     60      0.024
## 61     61      0.024
## 62     62      0.032
## 63     63      0.024
## 64     64      0.024
## 65     65      0.024
## 66     66      0.024
## 67     67      0.032
## 68     68      0.024
## 69     69      0.024
## 70     70      0.024
## 71     71      0.024
## 72     72      0.024
## 73     73      0.024
## 74     74      0.016
## 75     75      0.016
## 76     76      0.016
## 77     77      0.016
## 78     78      0.024
## 79     79      0.024
## 80     80      0.024
## 81     81      0.024
## 82     82      0.024
## 83     83      0.024
## 84     84      0.016
## 85     85      0.016
## 86     86      0.016
## 87     87      0.032
## 88     88      0.032
## 89     89      0.032
## 90     90      0.032
## 91     91      0.032
## 92     92      0.032
## 93     93      0.040
## 94     94      0.040
## 95     95      0.040
## 96     96      0.040
## 97     97      0.040
## 98     98      0.040
## 99     99      0.048
## 100   100      0.048
## 101   101      0.040
## 102   102      0.032
## 103   103      0.016
## 104   104      0.016
## 105   105      0.000
## 106   106      0.000
## 107   107      0.000
## 108   108      0.000
## 109   109      0.000
## 110   110      0.000
## 111   111      0.008
## 112   112      0.024
## 113   113      0.024
## 114   114      0.024
## 115   115      0.032
## 116   116      0.032
## 117   117      0.032
## 118   118      0.032
## 119   119      0.032
## 120   120      0.032
## 121   121      0.032
## 122   122      0.032
## 123   123      0.032
## 124   124      0.032
## 125   125      0.032
## 126   126      0.040
## 127   127      0.048
## 128   128      0.048
## 129   129      0.040
## 130   130      0.024
## 131   131      0.016
## 132   132      0.024
## 133   133      0.024
## 134   134      0.024
## 135   135      0.024
## 136   136      0.024
## 137   137      0.024
## 138   138      0.024
## 139   139      0.024
## 140   140      0.024
## 141   141      0.016
## 142   142      0.016
## 143   143      0.016
## 144   144      0.024
## 145   145      0.024
## 146   146      0.024
## 147   147      0.032
## 148   148      0.032
## 149   149      0.032
## 150   150      0.024
## 151   151      0.024
## 152   152      0.024
## 153   153      0.024
## 154   154      0.032
## 155   155      0.032
## 156   156      0.040
## 157   157      0.048
## 158   158      0.040
## 159   159      0.048
## 160   160      0.048
## 161   161      0.040
## 162   162      0.032
## 163   163      0.056
## 164   164      0.064
## 165   165      0.064
## 166   166      0.064
## 167   167      0.072
## 168   168      0.072
## 169   169      0.056
## 170   170      0.048
## 171   171      0.040
## 172   172      0.040
## 173   173      0.040
## 174   174      0.040
## 175   175      0.040
## 176   176      0.040
## 177   177      0.024
## 178   178      0.024
## 179   179      0.008
## 180   180      0.008
## 181   181      0.008
## 182   182      0.008
## 183   183      0.008
## 184   184      0.016
## 185   185      0.016
## 186   186      0.024
## 187   187      0.024
## 188   188      0.032
## 189   189      0.040
## 190   190      0.032
## 191   191      0.040
## 192   192      0.040
## 193   193      0.048
## 194   194      0.048
## 195   195      0.048
## 196   196      0.048
## 197   197      0.048
## 198   198      0.048
## 199   199      0.048
## 200   200      0.048
## 201   201      0.048
## 202   202      0.040
## 203   203      0.048
## 204   204      0.048
## 205   205      0.048
## 206   206      0.032
## 207   207      0.040
## 208   208      0.032
## 209   209      0.032
## 210   210      0.032
## 211   211      0.024
## 212   212      0.016
## 213   213      0.024
## 214   214      0.024
## 215   215      0.024
## 216   216      0.024
## 217   217      0.024
## 218   218      0.024
## 219   219      0.024
## 220   220      0.032
## 221   221      0.048
## 222   222      0.048
## 223   223      0.048
## 224   224      0.048
## 225   225      0.048
## 226   226      0.056
## 227   227      0.056
## 228   228      0.048
## 229   229      0.040
## 230   230      0.040
## 231   231      0.040
## 232   232      0.040
## 233   233      0.032
## 234   234      0.032
## 235   235      0.024
## 236   236      0.016
## 237   237      0.016
## 238   238      0.024
## 239   239      0.024
## 240   240      0.024
## 241   241      0.024
## 242   242      0.008
## 243   243      0.008
## 244   244      0.008
## 245   245      0.008
## 246   246      0.008
## 247   247      0.008
## 248   248      0.008
## 249   249      0.008
## 250   250      0.008
## 251   251      0.008
## 252   252      0.008
## 253   253      0.008
## 254   254      0.008
## 255   255      0.008
## 256   256      0.008
## 257   257      0.000
## 258   258      0.008
## 259   259      0.008
## 260   260      0.008
## 261   261      0.008
## 262   262      0.000
## 263   263      0.000
## 264   264      0.000
## 265   265      0.000
## 266   266      0.000
## 267   267      0.000
## 268   268      0.000
## 269   269      0.000
## 270   270      0.000
## 271   271      0.000
## 272   272      0.000
## 273   273      0.000
## 274   274      0.000
## 275   275      0.000
## 276   276      0.008
## 277   277      0.008
## 278   278      0.008
## 279   279      0.008
## 280   280      0.008
## 281   281      0.008
## 282   282      0.008
## 283   283      0.008
## 284   284      0.016
## 285   285      0.016
## 286   286      0.024
## 287   287      0.024
## 288   288      0.024
## 289   289      0.024
## 290   290      0.024
## 291   291      0.024
## 292   292      0.024
## 293   293      0.024
## 294   294      0.024
## 295   295      0.024
## 296   296      0.024
## 297   297      0.016
## 298   298      0.016
## 299   299      0.016
## 300   300      0.016
## 301   301      0.008
## 302   302      0.016
## 303   303      0.016
## 304   304      0.016
## 305   305      0.024
## 306   306      0.024
## 307   307      0.024
## 308   308      0.024
## 309   309      0.024
## 310   310      0.032
## 311   311      0.032
## 312   312      0.032
## 313   313      0.040
## 314   314      0.040
## 315   315      0.040
## 316   316      0.040
## 317   317      0.048
## 318   318      0.048
## 319   319      0.056
## 320   320      0.064
## 321   321      0.064
## 322   322      0.064
## 323   323      0.064
## 324   324      0.072
## 325   325      0.088
## 326   326      0.088
## 327   327      0.096
## 328   328      0.104
## 329   329      0.104
## 330   330      0.104
## 331   331      0.104
## 332   332      0.104
## 333   333      0.104
## 334   334      0.104
## 335   335      0.104
## 336   336      0.096
## 337   337      0.096
## 338   338      0.096
## 339   339      0.096
## 340   340      0.104
## 341   341      0.104
## 342   342      0.104
## 343   343      0.104
## 344   344      0.104
## 345   345      0.104
## 346   346      0.104
## 347   347      0.104
## 348   348      0.112
## 349   349      0.104
## 350   350      0.096
## 351   351      0.096
## 352   352      0.104
## 353   353      0.104
## 354   354      0.104
## 355   355      0.112
## 356   356      0.112
## 357   357      0.112
## 358   358      0.112
## 359   359      0.104
## 360   360      0.104
## 361   361      0.104
## 362   362      0.104
## 363   363      0.096
## 364   364      0.096
## 365   365      0.096
## 366   366      0.096
## 367   367      0.096
## 368   368      0.096
## 369   369      0.096
## 370   370      0.096
## 371   371      0.080
## 372   372      0.088
## 373   373      0.088
## 374   374      0.080
## 375   375      0.080
## 376   376      0.080
## 377   377      0.088
## 378   378      0.072
## 379   379      0.080
## 380   380      0.080
## 381   381      0.072
## 382   382      0.064
## 383   383      0.072
## 384   384      0.072
## 385   385      0.072
## 386   386      0.064
## 387   387      0.064
## 388   388      0.056
## 389   389      0.056
## 390   390      0.056
## 391   391      0.056
## 392   392      0.056
## 393   393      0.056
## 394   394      0.064
## 395   395      0.072
## 396   396      0.072
## 397   397      0.080
## 398   398      0.072
## 399   399      0.072
## 400   400      0.072
## 401   401      0.072
## 402   402      0.080
## 403   403      0.080
## 404   404      0.064
## 405   405      0.064
## 406   406      0.064
## 407   407      0.064
## 408   408      0.056
## 409   409      0.064
## 410   410      0.064
## 411   411      0.056
## 412   412      0.056
## 413   413      0.048
## 414   414      0.048
## 415   415      0.040
## 416   416      0.040
## 417   417      0.032
## 418   418      0.040
## 419   419      0.040
## 420   420      0.032
## 421   421      0.032
## 422   422      0.032
## 423   423      0.040
## 424   424      0.032
## 425   425      0.040
## 426   426      0.032
## 427   427      0.016
## 428   428      0.016
## 429   429      0.016
## 430   430      0.016
## 431   431      0.016
## 432   432      0.008
## 433   433      0.008
## 434   434      0.008
## 435   435      0.008
## 436   436      0.016
## 437   437      0.016
## 438   438      0.016
## 439   439      0.016
## 440   440      0.008
## 441   441      0.008
## 442   442      0.008
## 443   443      0.008
## 444   444      0.016
## 445   445      0.008
## 446   446      0.000
## 447   447      0.000
## 448   448      0.000
## 449   449      0.000
## 450   450      0.008
## 451   451      0.008
## 452   452      0.000
## 453   453      0.000
## 454   454      0.016
## 455   455      0.016
## 456   456      0.008
## 457   457      0.008
## 458   458      0.008
## 459   459      0.008
## 460   460      0.008
## 461   461      0.008
## 462   462      0.008
## 463   463      0.000
## 464   464      0.000
## 465   465      0.000
## 466   466      0.008
## 467   467      0.008
## 468   468      0.008
## 469   469      0.008
## 470   470      0.016
## 471   471      0.008
## 472   472      0.008
## 473   473      0.008
## 474   474      0.008
## 475   475      0.016
## 476   476      0.016
## 477   477      0.016
## 478   478      0.024
## 479   479      0.016
## 480   480      0.016
## 481   481      0.024
## 482   482      0.032
## 483   483      0.032
## 484   484      0.024
## 485   485      0.024
## 486   486      0.024
## 487   487      0.024
## 488   488      0.024
## 489   489      0.024
## 490   490      0.032
## 491   491      0.032
## 492   492      0.032
## 493   493      0.032
## 494   494      0.032
## 495   495      0.032
## 496   496      0.032
## 497   497      0.024
## 498   498      0.024
## 499   499      0.032
## 500   500      0.032
## 501   501      0.032
## 502   502      0.032
## 503   503      0.032
## 504   504      0.032
## 505   505      0.032
## 506   506      0.040
## 507   507      0.032
## 508   508      0.024
## 509   509      0.032
## 510   510      0.024
## 511   511      0.032
## 512   512      0.032
## 513   513      0.040
## 514   514      0.048
## 515   515      0.048
## 516   516      0.040
## 517   517      0.040
## 518   518      0.040
## 519   519      0.040
## 520   520      0.040
## 521   521      0.040
## 522   522      0.040
## 523   523      0.048
## 524   524      0.048
## 525   525      0.048
## 526   526      0.048
## 527   527      0.048
## 528   528      0.048
## 529   529      0.048
## 530   530      0.048
## 531   531      0.040
## 532   532      0.048
## 533   533      0.056
## 534   534      0.056
## 535   535      0.056
## 536   536      0.064
## 537   537      0.064
## 538   538      0.056
## 539   539      0.064
## 540   540      0.056
## 541   541      0.056
## 542   542      0.056
## 543   543      0.048
## 544   544      0.048
## 545   545      0.048
## 546   546      0.048
## 547   547      0.048
## 548   548      0.048
## 549   549      0.048
## 550   550      0.048
## 551   551      0.048
## 552   552      0.048
## 553   553      0.056
## 554   554      0.056
## 555   555      0.056
## 556   556      0.056
## 557   557      0.064
## 558   558      0.064
## 559   559      0.072
## 560   560      0.080
## 561   561      0.080
## 562   562      0.080
## 563   563      0.088
## 564   564      0.096
## 565   565      0.088
## 566   566      0.088
## 567   567      0.088
## 568   568      0.088
## 569   569      0.080
## 570   570      0.080
## 571   571      0.072
## 572   572      0.056
## 573   573      0.056
## 574   574      0.056
## 575   575      0.056
## 576   576      0.056
## 577   577      0.056
## 578   578      0.056
## 579   579      0.056
## 580   580      0.056
## 581   581      0.056
## 582   582      0.048
## 583   583      0.056
## 584   584      0.048
## 585   585      0.048
## 586   586      0.056
## 587   587      0.064
## 588   588      0.056
## 589   589      0.040
## 590   590      0.040
## 591   591      0.048
## 592   592      0.056
## 593   593      0.064
## 594   594      0.064
## 595   595      0.056
## 596   596      0.064
## 597   597      0.064
## 598   598      0.064
## 599   599      0.064
## 600   600      0.064
## 601   601      0.064
## 602   602      0.064
## 603   603      0.064
## 604   604      0.064
## 605   605      0.056
## 606   606      0.056
## 607   607      0.072
## 608   608      0.056
## 609   609      0.056
## 610   610      0.056
## 611   611      0.056
## 612   612      0.048
## 613   613      0.040
## 614   614      0.040
## 615   615      0.040
## 616   616      0.056
## 617   617      0.048
## 618   618      0.040
## 619   619      0.032
## 620   620      0.032
## 621   621      0.032
## 622   622      0.040
## 623   623      0.040
## 624   624      0.040
## 625   625      0.032
## 626   626      0.032
## 627   627      0.032
## 628   628      0.032
## 629   629      0.032
## 630   630      0.032
## 631   631      0.040
## 632   632      0.040
## 633   633      0.032
## 634   634      0.032
## 635   635      0.040
## 636   636      0.040
## 637   637      0.040
## 638   638      0.040
## 639   639      0.040
## 640   640      0.032
## 641   641      0.032
## 642   642      0.032
## 643   643      0.032
## 644   644      0.032
## 645   645      0.032
## 646   646      0.040
## 647   647      0.040
## 648   648      0.040
## 649   649      0.040
## 650   650      0.040
## 651   651      0.040
## 652   652      0.040
## 653   653      0.048
## 654   654      0.048
## 655   655      0.048
## 656   656      0.048
## 657   657      0.048
## 658   658      0.056
## 659   659      0.056
## 660   660      0.056
## 661   661      0.056
## 662   662      0.056
## 663   663      0.056
## 664   664      0.064
## 665   665      0.064
## 666   666      0.064
## 667   667      0.056
## 668   668      0.056
## 669   669      0.056
## 670   670      0.056
## 671   671      0.056
## 672   672      0.056
## 673   673      0.056
## 674   674      0.064
## 675   675      0.064
## 676   676      0.064
## 677   677      0.064
## 678   678      0.064
## 679   679      0.064
## 680   680      0.064
## 681   681      0.072
## 682   682      0.064
## 683   683      0.064
## 684   684      0.064
## 685   685      0.064
## 686   686      0.072
## 687   687      0.080
## 688   688      0.080
## 689   689      0.080
## 690   690      0.088
## 691   691      0.088
## 692   692      0.088
## 693   693      0.088
## 694   694      0.104
## 695   695      0.104
## 696   696      0.112
## 697   697      0.112
## 698   698      0.112
## 699   699      0.112
## 700   700      0.112
## 701   701      0.112
## 702   702      0.120
## 703   703      0.128
## 704   704      0.128
## 705   705      0.128
## 706   706      0.136
## 707   707      0.144
## 708   708      0.144
## 709   709      0.144
## 710   710      0.144
## 711   711      0.152
## 712   712      0.152
## 713   713      0.152
## 714   714      0.160
## 715   715      0.168
## 716   716      0.168
## 717   717      0.176
## 718   718      0.176
## 719   719      0.176
## 720   720      0.176
## 721   721      0.176
## 722   722      0.176
## 723   723      0.176
## 724   724      0.176
## 725   725      0.184
## 726   726      0.184
## 727   727      0.184
## 728   728      0.184
## 729   729      0.184
## 730   730      0.184
## 731   731      0.184
## 732   732      0.184
## 733   733      0.184
## 734   734      0.184
## 735   735      0.184
## 736   736      0.184
## 737   737      0.184
## 738   738      0.192
## 739   739      0.192
## 740   740      0.192
## 741   741      0.192
## 742   742      0.192
## 743   743      0.192
## 744   744      0.192
## 745   745      0.192
## 746   746      0.192
## 747   747      0.192
## 748   748      0.192
## 749   749      0.192
## 750   750      0.192
## 751   751      0.192
## 752   752      0.200
## 753   753      0.200
## 754   754      0.200
## 755   755      0.200
## 756   756      0.200
## 757   757      0.200
## 758   758      0.200
## 759   759      0.208
## 760   760      0.208
## 761   761      0.208
## 762   762      0.208
## 763   763      0.208
## 764   764      0.208
## 765   765      0.208
## 766   766      0.208
## 767   767      0.208
## 768   768      0.216
## 769   769      0.216
## 770   770      0.224
## 771   771      0.224
## 772   772      0.232
## 773   773      0.232
## 774   774      0.232
## 775   775      0.240
## 776   776      0.240
## 777   777      0.240
## 778   778      0.240
## 779   779      0.240
## 780   780      0.240
## 781   781      0.240
## 782   782      0.248
## 783   783      0.248
## 784   784      0.248
## 785   785      0.256
## 786   786      0.256
## 787   787      0.256
## 788   788      0.256
## 789   789      0.256
## 790   790      0.256
## 791   791      0.256
## 792   792      0.256
## 793   793      0.256
## 794   794      0.256
## 795   795      0.256
## 796   796      0.256
## 797   797      0.256
## 798   798      0.272
## 799   799      0.272
## 800   800      0.288
## 801   801      0.288
## 802   802      0.296
## 803   803      0.296
## 804   804      0.296
## 805   805      0.296
## 806   806      0.296
## 807   807      0.304
## 808   808      0.304
## 809   809      0.312
## 810   810      0.320
## 811   811      0.320
## 812   812      0.320
## 813   813      0.328
## 814   814      0.328
## 815   815      0.328
## 816   816      0.328
## 817   817      0.336
## 818   818      0.344
## 819   819      0.344
## 820   820      0.344
## 821   821      0.344
## 822   822      0.344
## 823   823      0.344
## 824   824      0.344
## 825   825      0.344
## 826   826      0.344
## 827   827      0.344
## 828   828      0.344
## 829   829      0.344
## 830   830      0.344
## 831   831      0.344
## 832   832      0.344
## 833   833      0.344
## 834   834      0.352
## 835   835      0.360
## 836   836      0.360
## 837   837      0.360
## 838   838      0.360
## 839   839      0.360
## 840   840      0.360
## 841   841      0.360
## 842   842      0.368
## 843   843      0.368
## 844   844      0.368
## 845   845      0.368
## 846   846      0.368
## 847   847      0.376
## 848   848      0.376
## 849   849      0.376
## 850   850      0.376
## 851   851      0.376
## 852   852      0.384
## 853   853      0.392
## 854   854      0.392
## 855   855      0.392
## 856   856      0.392
## 857   857      0.392
## 858   858      0.400
## 859   859      0.400
## 860   860      0.400
## 861   861      0.400
## 862   862      0.400
## 863   863      0.400
## 864   864      0.400
## 865   865      0.400
## 866   866      0.400
## 867   867      0.400
## 868   868      0.400
## 869   869      0.408
## 870   870      0.416
## 871   871      0.424
## 872   872      0.424
## 873   873      0.432
## 874   874      0.440
## 875   875      0.440
## 876   876      0.440
## 877   877      0.448
## 878   878      0.448
## 879   879      0.448
## 880   880      0.448
## 881   881      0.448
## 882   882      0.448
## 883   883      0.448
## 884   884      0.448
## 885   885      0.448
## 886   886      0.456
## 887   887      0.456
## 888   888      0.456
## 889   889      0.456
## 890   890      0.456
## 891   891      0.456
## 892   892      0.456
## 893   893      0.456
## 894   894      0.472
## 895   895      0.472
## 896   896      0.472
## 897   897      0.472
## 898   898      0.472
## 899   899      0.472
## 900   900      0.472
## 901   901      0.472
## 902   902      0.472
## 903   903      0.472
## 904   904      0.472
## 905   905      0.472
## 906   906      0.472
## 907   907      0.472
## 908   908      0.472
## 909   909      0.472
## 910   910      0.472
## 911   911      0.480
## 912   912      0.480
## 913   913      0.480
## 914   914      0.488
## 915   915      0.488
## 916   916      0.488
## 917   917      0.488
## 918   918      0.488
## 919   919      0.488
## 920   920      0.488
## 921   921      0.488
## 922   922      0.488
## 923   923      0.496
## 924   924      0.504
## 925   925      0.504
## 926   926      0.504
## 927   927      0.504
## 928   928      0.504
## 929   929      0.512
## 930   930      0.512
## 931   931      0.512
## 932   932      0.512
## 933   933      0.512
## 934   934      0.512
## 935   935      0.512
## 936   936      0.520
## 937   937      0.520
## 938   938      0.520
## 939   939      0.520
## 940   940      0.520
## 941   941      0.520
## 942   942      0.520
## 943   943      0.520
## 944   944      0.520
## 945   945      0.520
## 946   946      0.520
## 947   947      0.520
## 948   948      0.520
## 949   949      0.520
## 950   950      0.520
## 951   951      0.520
## 952   952      0.520
## 953   953      0.520
## 954   954      0.520
## 955   955      0.520
## 956   956      0.520
## 957   957      0.520
## 958   958      0.520
## 959   959      0.520
## 960   960      0.520
## 961   961      0.520
## 962   962      0.520
## 963   963      0.520
## 964   964      0.520
## 965   965      0.520
## 966   966      0.520
## 967   967      0.520
## 968   968      0.520
## 969   969      0.520
## 970   970      0.528
## 971   971      0.528
## 972   972      0.528
## 973   973      0.528
## 974   974      0.528
## 975   975      0.528
## 976   976      0.528
## 977   977      0.528
## 978   978      0.536
## 979   979      0.536
## 980   980      0.536
## 981   981      0.544
## 982   982      0.544
## 983   983      0.544
## 984   984      0.544
## 985   985      0.544
## 986   986      0.544
## 987   987      0.544
## 988   988      0.544
## 989   989      0.544
## 990   990      0.544
## 991   991      0.552
## 992   992      0.552
## 993   993      0.552
## 994   994      0.560
## 995   995      0.568
## 996   996      0.568
## 997   997      0.568
## 998   998      0.568
## 999   999      0.568
## 1000 1000      0.568
# Each node
prevalence(result3, I~., level=3)
##      node time prevalence
## 1       1    1      0.040
## 2       1    2      0.024
## 3       1    3      0.024
## 4       1    4      0.024
## 5       1    5      0.024
## 6       1    6      0.024
## 7       1    7      0.032
## 8       1    8      0.032
## 9       1    9      0.024
## 10      1   10      0.016
## 11      1   11      0.016
## 12      1   12      0.024
## 13      1   13      0.024
## 14      1   14      0.016
## 15      1   15      0.016
## 16      1   16      0.016
## 17      1   17      0.016
## 18      1   18      0.016
## 19      1   19      0.016
## 20      1   20      0.016
## 21      1   21      0.016
## 22      1   22      0.016
## 23      1   23      0.008
## 24      1   24      0.008
## 25      1   25      0.008
## 26      1   26      0.008
## 27      1   27      0.008
## 28      1   28      0.008
## 29      1   29      0.008
## 30      1   30      0.008
## 31      1   31      0.008
## 32      1   32      0.016
## 33      1   33      0.016
## 34      1   34      0.024
## 35      1   35      0.024
## 36      1   36      0.024
## 37      1   37      0.024
## 38      1   38      0.008
## 39      1   39      0.008
## 40      1   40      0.008
## 41      1   41      0.000
## 42      1   42      0.000
## 43      1   43      0.000
## 44      1   44      0.000
## 45      1   45      0.000
## 46      1   46      0.000
## 47      1   47      0.000
## 48      1   48      0.000
## 49      1   49      0.000
## 50      1   50      0.008
## 51      1   51      0.016
## 52      1   52      0.016
## 53      1   53      0.016
## 54      1   54      0.016
## 55      1   55      0.024
## 56      1   56      0.024
## 57      1   57      0.024
## 58      1   58      0.024
## 59      1   59      0.024
## 60      1   60      0.024
## 61      1   61      0.024
## 62      1   62      0.032
## 63      1   63      0.024
## 64      1   64      0.024
## 65      1   65      0.024
## 66      1   66      0.024
## 67      1   67      0.032
## 68      1   68      0.024
## 69      1   69      0.024
## 70      1   70      0.024
## 71      1   71      0.024
## 72      1   72      0.024
## 73      1   73      0.024
## 74      1   74      0.016
## 75      1   75      0.016
## 76      1   76      0.016
## 77      1   77      0.016
## 78      1   78      0.024
## 79      1   79      0.024
## 80      1   80      0.024
## 81      1   81      0.024
## 82      1   82      0.024
## 83      1   83      0.024
## 84      1   84      0.016
## 85      1   85      0.016
## 86      1   86      0.016
## 87      1   87      0.032
## 88      1   88      0.032
## 89      1   89      0.032
## 90      1   90      0.032
## 91      1   91      0.032
## 92      1   92      0.032
## 93      1   93      0.040
## 94      1   94      0.040
## 95      1   95      0.040
## 96      1   96      0.040
## 97      1   97      0.040
## 98      1   98      0.040
## 99      1   99      0.048
## 100     1  100      0.048
## 101     1  101      0.040
## 102     1  102      0.032
## 103     1  103      0.016
## 104     1  104      0.016
## 105     1  105      0.000
## 106     1  106      0.000
## 107     1  107      0.000
## 108     1  108      0.000
## 109     1  109      0.000
## 110     1  110      0.000
## 111     1  111      0.008
## 112     1  112      0.024
## 113     1  113      0.024
## 114     1  114      0.024
## 115     1  115      0.032
## 116     1  116      0.032
## 117     1  117      0.032
## 118     1  118      0.032
## 119     1  119      0.032
## 120     1  120      0.032
## 121     1  121      0.032
## 122     1  122      0.032
## 123     1  123      0.032
## 124     1  124      0.032
## 125     1  125      0.032
## 126     1  126      0.040
## 127     1  127      0.048
## 128     1  128      0.048
## 129     1  129      0.040
## 130     1  130      0.024
## 131     1  131      0.016
## 132     1  132      0.024
## 133     1  133      0.024
## 134     1  134      0.024
## 135     1  135      0.024
## 136     1  136      0.024
## 137     1  137      0.024
## 138     1  138      0.024
## 139     1  139      0.024
## 140     1  140      0.024
## 141     1  141      0.016
## 142     1  142      0.016
## 143     1  143      0.016
## 144     1  144      0.024
## 145     1  145      0.024
## 146     1  146      0.024
## 147     1  147      0.032
## 148     1  148      0.032
## 149     1  149      0.032
## 150     1  150      0.024
## 151     1  151      0.024
## 152     1  152      0.024
## 153     1  153      0.024
## 154     1  154      0.032
## 155     1  155      0.032
## 156     1  156      0.040
## 157     1  157      0.048
## 158     1  158      0.040
## 159     1  159      0.048
## 160     1  160      0.048
## 161     1  161      0.040
## 162     1  162      0.032
## 163     1  163      0.056
## 164     1  164      0.064
## 165     1  165      0.064
## 166     1  166      0.064
## 167     1  167      0.072
## 168     1  168      0.072
## 169     1  169      0.056
## 170     1  170      0.048
## 171     1  171      0.040
## 172     1  172      0.040
## 173     1  173      0.040
## 174     1  174      0.040
## 175     1  175      0.040
## 176     1  176      0.040
## 177     1  177      0.024
## 178     1  178      0.024
## 179     1  179      0.008
## 180     1  180      0.008
## 181     1  181      0.008
## 182     1  182      0.008
## 183     1  183      0.008
## 184     1  184      0.016
## 185     1  185      0.016
## 186     1  186      0.024
## 187     1  187      0.024
## 188     1  188      0.032
## 189     1  189      0.040
## 190     1  190      0.032
## 191     1  191      0.040
## 192     1  192      0.040
## 193     1  193      0.048
## 194     1  194      0.048
## 195     1  195      0.048
## 196     1  196      0.048
## 197     1  197      0.048
## 198     1  198      0.048
## 199     1  199      0.048
## 200     1  200      0.048
## 201     1  201      0.048
## 202     1  202      0.040
## 203     1  203      0.048
## 204     1  204      0.048
## 205     1  205      0.048
## 206     1  206      0.032
## 207     1  207      0.040
## 208     1  208      0.032
## 209     1  209      0.032
## 210     1  210      0.032
## 211     1  211      0.024
## 212     1  212      0.016
## 213     1  213      0.024
## 214     1  214      0.024
## 215     1  215      0.024
## 216     1  216      0.024
## 217     1  217      0.024
## 218     1  218      0.024
## 219     1  219      0.024
## 220     1  220      0.032
## 221     1  221      0.048
## 222     1  222      0.048
## 223     1  223      0.048
## 224     1  224      0.048
## 225     1  225      0.048
## 226     1  226      0.056
## 227     1  227      0.056
## 228     1  228      0.048
## 229     1  229      0.040
## 230     1  230      0.040
## 231     1  231      0.040
## 232     1  232      0.040
## 233     1  233      0.032
## 234     1  234      0.032
## 235     1  235      0.024
## 236     1  236      0.016
## 237     1  237      0.016
## 238     1  238      0.024
## 239     1  239      0.024
## 240     1  240      0.024
## 241     1  241      0.024
## 242     1  242      0.008
## 243     1  243      0.008
## 244     1  244      0.008
## 245     1  245      0.008
## 246     1  246      0.008
## 247     1  247      0.008
## 248     1  248      0.008
## 249     1  249      0.008
## 250     1  250      0.008
## 251     1  251      0.008
## 252     1  252      0.008
## 253     1  253      0.008
## 254     1  254      0.008
## 255     1  255      0.008
## 256     1  256      0.008
## 257     1  257      0.000
## 258     1  258      0.008
## 259     1  259      0.008
## 260     1  260      0.008
## 261     1  261      0.008
## 262     1  262      0.000
## 263     1  263      0.000
## 264     1  264      0.000
## 265     1  265      0.000
## 266     1  266      0.000
## 267     1  267      0.000
## 268     1  268      0.000
## 269     1  269      0.000
## 270     1  270      0.000
## 271     1  271      0.000
## 272     1  272      0.000
## 273     1  273      0.000
## 274     1  274      0.000
## 275     1  275      0.000
## 276     1  276      0.008
## 277     1  277      0.008
## 278     1  278      0.008
## 279     1  279      0.008
## 280     1  280      0.008
## 281     1  281      0.008
## 282     1  282      0.008
## 283     1  283      0.008
## 284     1  284      0.016
## 285     1  285      0.016
## 286     1  286      0.024
## 287     1  287      0.024
## 288     1  288      0.024
## 289     1  289      0.024
## 290     1  290      0.024
## 291     1  291      0.024
## 292     1  292      0.024
## 293     1  293      0.024
## 294     1  294      0.024
## 295     1  295      0.024
## 296     1  296      0.024
## 297     1  297      0.016
## 298     1  298      0.016
## 299     1  299      0.016
## 300     1  300      0.016
## 301     1  301      0.008
## 302     1  302      0.016
## 303     1  303      0.016
## 304     1  304      0.016
## 305     1  305      0.024
## 306     1  306      0.024
## 307     1  307      0.024
## 308     1  308      0.024
## 309     1  309      0.024
## 310     1  310      0.032
## 311     1  311      0.032
## 312     1  312      0.032
## 313     1  313      0.040
## 314     1  314      0.040
## 315     1  315      0.040
## 316     1  316      0.040
## 317     1  317      0.048
## 318     1  318      0.048
## 319     1  319      0.056
## 320     1  320      0.064
## 321     1  321      0.064
## 322     1  322      0.064
## 323     1  323      0.064
## 324     1  324      0.072
## 325     1  325      0.088
## 326     1  326      0.088
## 327     1  327      0.096
## 328     1  328      0.104
## 329     1  329      0.104
## 330     1  330      0.104
## 331     1  331      0.104
## 332     1  332      0.104
## 333     1  333      0.104
## 334     1  334      0.104
## 335     1  335      0.104
## 336     1  336      0.096
## 337     1  337      0.096
## 338     1  338      0.096
## 339     1  339      0.096
## 340     1  340      0.104
## 341     1  341      0.104
## 342     1  342      0.104
## 343     1  343      0.104
## 344     1  344      0.104
## 345     1  345      0.104
## 346     1  346      0.104
## 347     1  347      0.104
## 348     1  348      0.112
## 349     1  349      0.104
## 350     1  350      0.096
## 351     1  351      0.096
## 352     1  352      0.104
## 353     1  353      0.104
## 354     1  354      0.104
## 355     1  355      0.112
## 356     1  356      0.112
## 357     1  357      0.112
## 358     1  358      0.112
## 359     1  359      0.104
## 360     1  360      0.104
## 361     1  361      0.104
## 362     1  362      0.104
## 363     1  363      0.096
## 364     1  364      0.096
## 365     1  365      0.096
## 366     1  366      0.096
## 367     1  367      0.096
## 368     1  368      0.096
## 369     1  369      0.096
## 370     1  370      0.096
## 371     1  371      0.080
## 372     1  372      0.088
## 373     1  373      0.088
## 374     1  374      0.080
## 375     1  375      0.080
## 376     1  376      0.080
## 377     1  377      0.088
## 378     1  378      0.072
## 379     1  379      0.080
## 380     1  380      0.080
## 381     1  381      0.072
## 382     1  382      0.064
## 383     1  383      0.072
## 384     1  384      0.072
## 385     1  385      0.072
## 386     1  386      0.064
## 387     1  387      0.064
## 388     1  388      0.056
## 389     1  389      0.056
## 390     1  390      0.056
## 391     1  391      0.056
## 392     1  392      0.056
## 393     1  393      0.056
## 394     1  394      0.064
## 395     1  395      0.072
## 396     1  396      0.072
## 397     1  397      0.080
## 398     1  398      0.072
## 399     1  399      0.072
## 400     1  400      0.072
## 401     1  401      0.072
## 402     1  402      0.080
## 403     1  403      0.080
## 404     1  404      0.064
## 405     1  405      0.064
## 406     1  406      0.064
## 407     1  407      0.064
## 408     1  408      0.056
## 409     1  409      0.064
## 410     1  410      0.064
## 411     1  411      0.056
## 412     1  412      0.056
## 413     1  413      0.048
## 414     1  414      0.048
## 415     1  415      0.040
## 416     1  416      0.040
## 417     1  417      0.032
## 418     1  418      0.040
## 419     1  419      0.040
## 420     1  420      0.032
## 421     1  421      0.032
## 422     1  422      0.032
## 423     1  423      0.040
## 424     1  424      0.032
## 425     1  425      0.040
## 426     1  426      0.032
## 427     1  427      0.016
## 428     1  428      0.016
## 429     1  429      0.016
## 430     1  430      0.016
## 431     1  431      0.016
## 432     1  432      0.008
## 433     1  433      0.008
## 434     1  434      0.008
## 435     1  435      0.008
## 436     1  436      0.016
## 437     1  437      0.016
## 438     1  438      0.016
## 439     1  439      0.016
## 440     1  440      0.008
## 441     1  441      0.008
## 442     1  442      0.008
## 443     1  443      0.008
## 444     1  444      0.016
## 445     1  445      0.008
## 446     1  446      0.000
## 447     1  447      0.000
## 448     1  448      0.000
## 449     1  449      0.000
## 450     1  450      0.008
## 451     1  451      0.008
## 452     1  452      0.000
## 453     1  453      0.000
## 454     1  454      0.016
## 455     1  455      0.016
## 456     1  456      0.008
## 457     1  457      0.008
## 458     1  458      0.008
## 459     1  459      0.008
## 460     1  460      0.008
## 461     1  461      0.008
## 462     1  462      0.008
## 463     1  463      0.000
## 464     1  464      0.000
## 465     1  465      0.000
## 466     1  466      0.008
## 467     1  467      0.008
## 468     1  468      0.008
## 469     1  469      0.008
## 470     1  470      0.016
## 471     1  471      0.008
## 472     1  472      0.008
## 473     1  473      0.008
## 474     1  474      0.008
## 475     1  475      0.016
## 476     1  476      0.016
## 477     1  477      0.016
## 478     1  478      0.024
## 479     1  479      0.016
## 480     1  480      0.016
## 481     1  481      0.024
## 482     1  482      0.032
## 483     1  483      0.032
## 484     1  484      0.024
## 485     1  485      0.024
## 486     1  486      0.024
## 487     1  487      0.024
## 488     1  488      0.024
## 489     1  489      0.024
## 490     1  490      0.032
## 491     1  491      0.032
## 492     1  492      0.032
## 493     1  493      0.032
## 494     1  494      0.032
## 495     1  495      0.032
## 496     1  496      0.032
## 497     1  497      0.024
## 498     1  498      0.024
## 499     1  499      0.032
## 500     1  500      0.032
## 501     1  501      0.032
## 502     1  502      0.032
## 503     1  503      0.032
## 504     1  504      0.032
## 505     1  505      0.032
## 506     1  506      0.040
## 507     1  507      0.032
## 508     1  508      0.024
## 509     1  509      0.032
## 510     1  510      0.024
## 511     1  511      0.032
## 512     1  512      0.032
## 513     1  513      0.040
## 514     1  514      0.048
## 515     1  515      0.048
## 516     1  516      0.040
## 517     1  517      0.040
## 518     1  518      0.040
## 519     1  519      0.040
## 520     1  520      0.040
## 521     1  521      0.040
## 522     1  522      0.040
## 523     1  523      0.048
## 524     1  524      0.048
## 525     1  525      0.048
## 526     1  526      0.048
## 527     1  527      0.048
## 528     1  528      0.048
## 529     1  529      0.048
## 530     1  530      0.048
## 531     1  531      0.040
## 532     1  532      0.048
## 533     1  533      0.056
## 534     1  534      0.056
## 535     1  535      0.056
## 536     1  536      0.064
## 537     1  537      0.064
## 538     1  538      0.056
## 539     1  539      0.064
## 540     1  540      0.056
## 541     1  541      0.056
## 542     1  542      0.056
## 543     1  543      0.048
## 544     1  544      0.048
## 545     1  545      0.048
## 546     1  546      0.048
## 547     1  547      0.048
## 548     1  548      0.048
## 549     1  549      0.048
## 550     1  550      0.048
## 551     1  551      0.048
## 552     1  552      0.048
## 553     1  553      0.056
## 554     1  554      0.056
## 555     1  555      0.056
## 556     1  556      0.056
## 557     1  557      0.064
## 558     1  558      0.064
## 559     1  559      0.072
## 560     1  560      0.080
## 561     1  561      0.080
## 562     1  562      0.080
## 563     1  563      0.088
## 564     1  564      0.096
## 565     1  565      0.088
## 566     1  566      0.088
## 567     1  567      0.088
## 568     1  568      0.088
## 569     1  569      0.080
## 570     1  570      0.080
## 571     1  571      0.072
## 572     1  572      0.056
## 573     1  573      0.056
## 574     1  574      0.056
## 575     1  575      0.056
## 576     1  576      0.056
## 577     1  577      0.056
## 578     1  578      0.056
## 579     1  579      0.056
## 580     1  580      0.056
## 581     1  581      0.056
## 582     1  582      0.048
## 583     1  583      0.056
## 584     1  584      0.048
## 585     1  585      0.048
## 586     1  586      0.056
## 587     1  587      0.064
## 588     1  588      0.056
## 589     1  589      0.040
## 590     1  590      0.040
## 591     1  591      0.048
## 592     1  592      0.056
## 593     1  593      0.064
## 594     1  594      0.064
## 595     1  595      0.056
## 596     1  596      0.064
## 597     1  597      0.064
## 598     1  598      0.064
## 599     1  599      0.064
## 600     1  600      0.064
## 601     1  601      0.064
## 602     1  602      0.064
## 603     1  603      0.064
## 604     1  604      0.064
## 605     1  605      0.056
## 606     1  606      0.056
## 607     1  607      0.072
## 608     1  608      0.056
## 609     1  609      0.056
## 610     1  610      0.056
## 611     1  611      0.056
## 612     1  612      0.048
## 613     1  613      0.040
## 614     1  614      0.040
## 615     1  615      0.040
## 616     1  616      0.056
## 617     1  617      0.048
## 618     1  618      0.040
## 619     1  619      0.032
## 620     1  620      0.032
## 621     1  621      0.032
## 622     1  622      0.040
## 623     1  623      0.040
## 624     1  624      0.040
## 625     1  625      0.032
## 626     1  626      0.032
## 627     1  627      0.032
## 628     1  628      0.032
## 629     1  629      0.032
## 630     1  630      0.032
## 631     1  631      0.040
## 632     1  632      0.040
## 633     1  633      0.032
## 634     1  634      0.032
## 635     1  635      0.040
## 636     1  636      0.040
## 637     1  637      0.040
## 638     1  638      0.040
## 639     1  639      0.040
## 640     1  640      0.032
## 641     1  641      0.032
## 642     1  642      0.032
## 643     1  643      0.032
## 644     1  644      0.032
## 645     1  645      0.032
## 646     1  646      0.040
## 647     1  647      0.040
## 648     1  648      0.040
## 649     1  649      0.040
## 650     1  650      0.040
## 651     1  651      0.040
## 652     1  652      0.040
## 653     1  653      0.048
## 654     1  654      0.048
## 655     1  655      0.048
## 656     1  656      0.048
## 657     1  657      0.048
## 658     1  658      0.056
## 659     1  659      0.056
## 660     1  660      0.056
## 661     1  661      0.056
## 662     1  662      0.056
## 663     1  663      0.056
## 664     1  664      0.064
## 665     1  665      0.064
## 666     1  666      0.064
## 667     1  667      0.056
## 668     1  668      0.056
## 669     1  669      0.056
## 670     1  670      0.056
## 671     1  671      0.056
## 672     1  672      0.056
## 673     1  673      0.056
## 674     1  674      0.064
## 675     1  675      0.064
## 676     1  676      0.064
## 677     1  677      0.064
## 678     1  678      0.064
## 679     1  679      0.064
## 680     1  680      0.064
## 681     1  681      0.072
## 682     1  682      0.064
## 683     1  683      0.064
## 684     1  684      0.064
## 685     1  685      0.064
## 686     1  686      0.072
## 687     1  687      0.080
## 688     1  688      0.080
## 689     1  689      0.080
## 690     1  690      0.088
## 691     1  691      0.088
## 692     1  692      0.088
## 693     1  693      0.088
## 694     1  694      0.104
## 695     1  695      0.104
## 696     1  696      0.112
## 697     1  697      0.112
## 698     1  698      0.112
## 699     1  699      0.112
## 700     1  700      0.112
## 701     1  701      0.112
## 702     1  702      0.120
## 703     1  703      0.128
## 704     1  704      0.128
## 705     1  705      0.128
## 706     1  706      0.136
## 707     1  707      0.144
## 708     1  708      0.144
## 709     1  709      0.144
## 710     1  710      0.144
## 711     1  711      0.152
## 712     1  712      0.152
## 713     1  713      0.152
## 714     1  714      0.160
## 715     1  715      0.168
## 716     1  716      0.168
## 717     1  717      0.176
## 718     1  718      0.176
## 719     1  719      0.176
## 720     1  720      0.176
## 721     1  721      0.176
## 722     1  722      0.176
## 723     1  723      0.176
## 724     1  724      0.176
## 725     1  725      0.184
## 726     1  726      0.184
## 727     1  727      0.184
## 728     1  728      0.184
## 729     1  729      0.184
## 730     1  730      0.184
## 731     1  731      0.184
## 732     1  732      0.184
## 733     1  733      0.184
## 734     1  734      0.184
## 735     1  735      0.184
## 736     1  736      0.184
## 737     1  737      0.184
## 738     1  738      0.192
## 739     1  739      0.192
## 740     1  740      0.192
## 741     1  741      0.192
## 742     1  742      0.192
## 743     1  743      0.192
## 744     1  744      0.192
## 745     1  745      0.192
## 746     1  746      0.192
## 747     1  747      0.192
## 748     1  748      0.192
## 749     1  749      0.192
## 750     1  750      0.192
## 751     1  751      0.192
## 752     1  752      0.200
## 753     1  753      0.200
## 754     1  754      0.200
## 755     1  755      0.200
## 756     1  756      0.200
## 757     1  757      0.200
## 758     1  758      0.200
## 759     1  759      0.208
## 760     1  760      0.208
## 761     1  761      0.208
## 762     1  762      0.208
## 763     1  763      0.208
## 764     1  764      0.208
## 765     1  765      0.208
## 766     1  766      0.208
## 767     1  767      0.208
## 768     1  768      0.216
## 769     1  769      0.216
## 770     1  770      0.224
## 771     1  771      0.224
## 772     1  772      0.232
## 773     1  773      0.232
## 774     1  774      0.232
## 775     1  775      0.240
## 776     1  776      0.240
## 777     1  777      0.240
## 778     1  778      0.240
## 779     1  779      0.240
## 780     1  780      0.240
## 781     1  781      0.240
## 782     1  782      0.248
## 783     1  783      0.248
## 784     1  784      0.248
## 785     1  785      0.256
## 786     1  786      0.256
## 787     1  787      0.256
## 788     1  788      0.256
## 789     1  789      0.256
## 790     1  790      0.256
## 791     1  791      0.256
## 792     1  792      0.256
## 793     1  793      0.256
## 794     1  794      0.256
## 795     1  795      0.256
## 796     1  796      0.256
## 797     1  797      0.256
## 798     1  798      0.272
## 799     1  799      0.272
## 800     1  800      0.288
## 801     1  801      0.288
## 802     1  802      0.296
## 803     1  803      0.296
## 804     1  804      0.296
## 805     1  805      0.296
## 806     1  806      0.296
## 807     1  807      0.304
## 808     1  808      0.304
## 809     1  809      0.312
## 810     1  810      0.320
## 811     1  811      0.320
## 812     1  812      0.320
## 813     1  813      0.328
## 814     1  814      0.328
## 815     1  815      0.328
## 816     1  816      0.328
## 817     1  817      0.336
## 818     1  818      0.344
## 819     1  819      0.344
## 820     1  820      0.344
## 821     1  821      0.344
## 822     1  822      0.344
## 823     1  823      0.344
## 824     1  824      0.344
## 825     1  825      0.344
## 826     1  826      0.344
## 827     1  827      0.344
## 828     1  828      0.344
## 829     1  829      0.344
## 830     1  830      0.344
## 831     1  831      0.344
## 832     1  832      0.344
## 833     1  833      0.344
## 834     1  834      0.352
## 835     1  835      0.360
## 836     1  836      0.360
## 837     1  837      0.360
## 838     1  838      0.360
## 839     1  839      0.360
## 840     1  840      0.360
## 841     1  841      0.360
## 842     1  842      0.368
## 843     1  843      0.368
## 844     1  844      0.368
## 845     1  845      0.368
## 846     1  846      0.368
## 847     1  847      0.376
## 848     1  848      0.376
## 849     1  849      0.376
## 850     1  850      0.376
## 851     1  851      0.376
## 852     1  852      0.384
## 853     1  853      0.392
## 854     1  854      0.392
## 855     1  855      0.392
## 856     1  856      0.392
## 857     1  857      0.392
## 858     1  858      0.400
## 859     1  859      0.400
## 860     1  860      0.400
## 861     1  861      0.400
## 862     1  862      0.400
## 863     1  863      0.400
## 864     1  864      0.400
## 865     1  865      0.400
## 866     1  866      0.400
## 867     1  867      0.400
## 868     1  868      0.400
## 869     1  869      0.408
## 870     1  870      0.416
## 871     1  871      0.424
## 872     1  872      0.424
## 873     1  873      0.432
## 874     1  874      0.440
## 875     1  875      0.440
## 876     1  876      0.440
## 877     1  877      0.448
## 878     1  878      0.448
## 879     1  879      0.448
## 880     1  880      0.448
## 881     1  881      0.448
## 882     1  882      0.448
## 883     1  883      0.448
## 884     1  884      0.448
## 885     1  885      0.448
## 886     1  886      0.456
## 887     1  887      0.456
## 888     1  888      0.456
## 889     1  889      0.456
## 890     1  890      0.456
## 891     1  891      0.456
## 892     1  892      0.456
## 893     1  893      0.456
## 894     1  894      0.472
## 895     1  895      0.472
## 896     1  896      0.472
## 897     1  897      0.472
## 898     1  898      0.472
## 899     1  899      0.472
## 900     1  900      0.472
## 901     1  901      0.472
## 902     1  902      0.472
## 903     1  903      0.472
## 904     1  904      0.472
## 905     1  905      0.472
## 906     1  906      0.472
## 907     1  907      0.472
## 908     1  908      0.472
## 909     1  909      0.472
## 910     1  910      0.472
## 911     1  911      0.480
## 912     1  912      0.480
## 913     1  913      0.480
## 914     1  914      0.488
## 915     1  915      0.488
## 916     1  916      0.488
## 917     1  917      0.488
## 918     1  918      0.488
## 919     1  919      0.488
## 920     1  920      0.488
## 921     1  921      0.488
## 922     1  922      0.488
## 923     1  923      0.496
## 924     1  924      0.504
## 925     1  925      0.504
## 926     1  926      0.504
## 927     1  927      0.504
## 928     1  928      0.504
## 929     1  929      0.512
## 930     1  930      0.512
## 931     1  931      0.512
## 932     1  932      0.512
## 933     1  933      0.512
## 934     1  934      0.512
## 935     1  935      0.512
## 936     1  936      0.520
## 937     1  937      0.520
## 938     1  938      0.520
## 939     1  939      0.520
## 940     1  940      0.520
## 941     1  941      0.520
## 942     1  942      0.520
## 943     1  943      0.520
## 944     1  944      0.520
## 945     1  945      0.520
## 946     1  946      0.520
## 947     1  947      0.520
## 948     1  948      0.520
## 949     1  949      0.520
## 950     1  950      0.520
## 951     1  951      0.520
## 952     1  952      0.520
## 953     1  953      0.520
## 954     1  954      0.520
## 955     1  955      0.520
## 956     1  956      0.520
## 957     1  957      0.520
## 958     1  958      0.520
## 959     1  959      0.520
## 960     1  960      0.520
## 961     1  961      0.520
## 962     1  962      0.520
## 963     1  963      0.520
## 964     1  964      0.520
## 965     1  965      0.520
## 966     1  966      0.520
## 967     1  967      0.520
## 968     1  968      0.520
## 969     1  969      0.520
## 970     1  970      0.528
## 971     1  971      0.528
## 972     1  972      0.528
## 973     1  973      0.528
## 974     1  974      0.528
## 975     1  975      0.528
## 976     1  976      0.528
## 977     1  977      0.528
## 978     1  978      0.536
## 979     1  979      0.536
## 980     1  980      0.536
## 981     1  981      0.544
## 982     1  982      0.544
## 983     1  983      0.544
## 984     1  984      0.544
## 985     1  985      0.544
## 986     1  986      0.544
## 987     1  987      0.544
## 988     1  988      0.544
## 989     1  989      0.544
## 990     1  990      0.544
## 991     1  991      0.552
## 992     1  992      0.552
## 993     1  993      0.552
## 994     1  994      0.560
## 995     1  995      0.568
## 996     1  996      0.568
## 997     1  997      0.568
## 998     1  998      0.568
## 999     1  999      0.568
## 1000    1 1000      0.568

3.4 Plot compartments

plot(result3, range=0.95, type = "p", cex=0.051)

3.5 Plot prevalence

# plot(result3, index= 1:5, range=0.95)
plot(result3, I~.)

4 SIV model translation from dif eq

4.1 Parameters and transitions

# Rate of change
    # dS <- (1 - fc(t)*e) * mu * (S + I + V) - (beta * S * I) / (S + I + V) + w * mu * V - mu * S
    # dV <- fc(t)*e * mu * (S + I + V) - w * mu *  V - mu * V
    # dI <- (beta * S * I) / (S + I + V) - gama * I - mu * I

transitions <- c(
              "@ -> (1-c)*e*mu*(S+I+V)-> S",
              "S -> (beta*S*I)/(S+I+V)-> I",
              "V -> w*mu*V -> S",
              "S -> mu*S -> @",
              "@ -> c*e*mu*(S+I+V)-> V",
              "V -> w*mu*V-> S",
              "V -> mu*V -> @",
              "S -> (beta*S*I)/(S+I+V)-> I",
              "I -> gama*I -> @",
              "I -> mu*I -> @")

compartments <- c("S", "V", "I")

gdata <- c(beta = 4.0706,
          gama= 2.7941,
          e = 0.95,
          mu = (1/(350/30)),
          w = 1/(180/30),
          c = 0.84)

u0 <- data.frame(S = 1418861, I = 1604, V = 579535)

n <- 2000000

# Initial state of the population compartments
# u0 <- data.frame(S=rep(999,n), I=rep(1,n), R=rep(0,n))

# time
tspan <- seq(1,180,1)

4.2 Define the model

SIV <- mparse(transitions = transitions,
                compartments = compartments,
                u0 = u0,
                gdata = gdata,
                tspan = tspan)

4.3 Run the SIV

set.seed(555) 
result4 <- run(model=SIV, threads = 1)

4.4 Plots of SIV

co <-c("#E69F00", "#009E73", "red")

result4
## Model: SimInf_model
## Number of nodes: 1
## Number of transitions: 10
## Number of scheduled events: 0
## 
## Global data
## -----------
##  Parameter Value     
##  beta      4.07060000
##  gama      2.79410000
##  e         0.95000000
##  mu        0.08571429
##  w         0.16666667
##  c         0.84000000
## 
## Compartments
## ------------
##       Min. 1st Qu.  Median    Mean 3rd Qu.    Max.
##  S  129175  170384  203582  213492  240030 1299321
##  V  234653  286188  345384  367673  420747  713061
##  I       0       0       0    2309       0  171052
plot(result4, col=co)

plot(result4, range= FALSE)

plot(prevalence(result4, I~.), cex=0.3, col="red")

trajectory(result4)
##     node time       S      V      I
## 1      1    1 1299321 645088  23649
## 2      1    2  860523 696390 171052
## 3      1    3  261719 713061 169490
## 4      1    4  134315 698894  40956
## 5      1    5  129175 677605   8077
## 6      1    6  141692 657189   1717
## 7      1    7  156478 637785    452
## 8      1    8  170408 619490    125
## 9      1    9  182925 603121     42
## 10     1   10  193836 588479     30
## 11     1   11  203438 575377     25
## 12     1   12  211797 563531     11
## 13     1   13  219303 552919     15
## 14     1   14  225806 543459     10
## 15     1   15  231618 534616      1
## 16     1   16  236819 526670      0
## 17     1   17  241059 519103      0
## 18     1   18  244940 512099      0
## 19     1   19  248281 505250      0
## 20     1   20  251243 499075      0
## 21     1   21  253513 493362      0
## 22     1   22  255229 488530      0
## 23     1   23  257169 483028      0
## 24     1   24  259064 478262      0
## 25     1   25  260211 474354      0
## 26     1   26  261095 470819      0
## 27     1   27  261889 466865      0
## 28     1   28  262068 463568      0
## 29     1   29  262295 460512      0
## 30     1   30  262285 457481      0
## 31     1   31  262083 454454      0
## 32     1   32  261844 452092      0
## 33     1   33  261453 449394      0
## 34     1   34  260689 446579      0
## 35     1   35  260207 443930      0
## 36     1   36  259691 441419      0
## 37     1   37  258865 439210      0
## 38     1   38  257986 437031      0
## 39     1   39  257677 434928      0
## 40     1   40  256960 432808      0
## 41     1   41  256257 429865      0
## 42     1   42  255705 427883      0
## 43     1   43  254828 426001      0
## 44     1   44  253637 424497      0
## 45     1   45  253108 422665      0
## 46     1   46  252239 420108      0
## 47     1   47  251269 417828      0
## 48     1   48  250225 415306      0
## 49     1   49  249524 413136      0
## 50     1   50  248566 411412      0
## 51     1   51  247404 409196      0
## 52     1   52  246152 407355      0
## 53     1   53  245245 405595      0
## 54     1   54  244186 403654      0
## 55     1   55  243375 401909      0
## 56     1   56  242536 399761      0
## 57     1   57  241732 397467      0
## 58     1   58  240532 396325      0
## 59     1   59  239863 394422      0
## 60     1   60  238698 393203      0
## 61     1   61  237642 392085      0
## 62     1   62  236596 390192      0
## 63     1   63  236034 388005      0
## 64     1   64  234850 386020      0
## 65     1   65  233857 384538      0
## 66     1   66  232992 383014      0
## 67     1   67  231834 381593      0
## 68     1   68  230822 380371      0
## 69     1   69  229856 379106      0
## 70     1   70  229066 377304      0
## 71     1   71  228082 375563      0
## 72     1   72  227038 374331      0
## 73     1   73  226134 372745      0
## 74     1   74  225451 371146      0
## 75     1   75  224422 369397      0
## 76     1   76  223279 367962      0
## 77     1   77  222569 366498      0
## 78     1   78  221814 365544      0
## 79     1   79  221107 363617      0
## 80     1   80  220430 362028      0
## 81     1   81  219421 361082      0
## 82     1   82  218347 359240      0
## 83     1   83  216774 357777      0
## 84     1   84  215842 356105      0
## 85     1   85  214840 354904      0
## 86     1   86  214001 352969      0
## 87     1   87  213206 351266      0
## 88     1   88  212783 349694      0
## 89     1   89  211608 347842      0
## 90     1   90  210504 346161      0
## 91     1   91  209635 344606      0
## 92     1   92  208535 343247      0
## 93     1   93  207830 342108      0
## 94     1   94  207069 340923      0
## 95     1   95  206275 339254      0
## 96     1   96  205506 337757      0
## 97     1   97  204634 336439      0
## 98     1   98  203727 335024      0
## 99     1   99  202711 333653      0
## 100    1  100  201926 332438      0
## 101    1  101  200475 331049      0
## 102    1  102  199771 329692      0
## 103    1  103  199045 328321      0
## 104    1  104  198356 326753      0
## 105    1  105  197753 325424      0
## 106    1  106  196900 324251      0
## 107    1  107  196035 323158      0
## 108    1  108  195600 321547      0
## 109    1  109  194767 320085      0
## 110    1  110  194002 318737      0
## 111    1  111  193406 316854      0
## 112    1  112  192684 315373      0
## 113    1  113  191541 314113      0
## 114    1  114  190801 313169      0
## 115    1  115  189859 312303      0
## 116    1  116  189060 310881      0
## 117    1  117  188301 309180      0
## 118    1  118  187320 307726      0
## 119    1  119  186255 306891      0
## 120    1  120  185342 305554      0
## 121    1  121  184718 304001      0
## 122    1  122  183554 303124      0
## 123    1  123  182896 301853      0
## 124    1  124  182161 300049      0
## 125    1  125  181532 298944      0
## 126    1  126  180445 297469      0
## 127    1  127  179750 296264      0
## 128    1  128  178955 295181      0
## 129    1  129  178242 293936      0
## 130    1  130  177283 292823      0
## 131    1  131  176589 291738      0
## 132    1  132  175892 290607      0
## 133    1  133  175284 289204      0
## 134    1  134  174691 287693      0
## 135    1  135  173948 286490      0
## 136    1  136  173096 285283      0
## 137    1  137  172473 283860      0
## 138    1  138  171649 282437      0
## 139    1  139  170778 281624      0
## 140    1  140  170312 280150      0
## 141    1  141  169547 278638      0
## 142    1  142  168960 277728      0
## 143    1  143  168024 276540      0
## 144    1  144  167436 275617      0
## 145    1  145  166813 274282      0
## 146    1  146  166220 272954      0
## 147    1  147  165553 271842      0
## 148    1  148  164704 270150      0
## 149    1  149  164111 269173      0
## 150    1  150  163372 268368      0
## 151    1  151  162655 267053      0
## 152    1  152  161633 266001      0
## 153    1  153  160701 264742      0
## 154    1  154  160104 263830      0
## 155    1  155  159388 262589      0
## 156    1  156  158827 261238      0
## 157    1  157  158295 260104      0
## 158    1  158  157952 259010      0
## 159    1  159  157412 257830      0
## 160    1  160  156720 257009      0
## 161    1  161  155710 256429      0
## 162    1  162  155095 255574      0
## 163    1  163  154339 254461      0
## 164    1  164  153498 253242      0
## 165    1  165  152805 252122      0
## 166    1  166  151886 250900      0
## 167    1  167  151435 249652      0
## 168    1  168  150664 248537      0
## 169    1  169  150133 247325      0
## 170    1  170  149724 246100      0
## 171    1  171  148932 245384      0
## 172    1  172  148388 244000      0
## 173    1  173  147905 242890      0
## 174    1  174  147457 241843      0
## 175    1  175  146622 240619      0
## 176    1  176  146044 239529      0
## 177    1  177  145337 237919      0
## 178    1  178  144607 236678      0
## 179    1  179  143683 235772      0
## 180    1  180  143173 234653      0