Info2
maurus
2023-06-06
Introducción
El conjunto de datos a estudiar proviene de muestras de heces de guanacos provenientes de diferentes sitios:
Cueva Milodón norte 1 (CMN1-81,82,83)
Salitroso (S-88,92,97) Se observa que cada uno de estos sitios presentan características diferentes en relación con la presencia de diferentes plantas.
La consulta que se presentó es la de poder determinar si existe manera de identificar o encontrar un proxi entre los morfotipos de las plantas presentes en cada sitio y los registrados en las heces de cada sitios.
Analisis de PCA
El analisis se realiza con una matriz de correlacion, ya que se busca preservar las relaciones entre las varaibles involucradas (que en este caso son los morfotipos presentes en cada una de las muestras).
Plantas
| prop | |
|---|---|
| BIL_Stypa.type | 0.9920089 |
| CRE | 0.9937247 |
| ELO_COL.CLA | 0.9970728 |
| ELO_DEN | 0.9979870 |
| RON | 0.9958890 |
| TRA | 0.9958890 |
| STO_MON | 0.9920089 |
| prop | |
|---|---|
| Festuca | 0.9978199 |
| Pappostipa | 0.9965703 |
En este plano coordenado, los individuos Papostipa y Festuca(tabla de individuos) tiene un nivel alto de representatividad, llevandose la mayor parte de la varianza. Desde la tabla de datos crudos se observa una clara diferencia que se observa en el plano coordenado.
Como consecuencia y para tener un mayor detalle del subgrupo de plantas que no se llega a ser reconstruido, se realizó un nuevo PCA, sin estos 2 plantas.
Sin Festuca y Papostipa
| prop | |
|---|---|
| BIL_Stypa.type | Inf |
| CRE | Inf |
| ELO_COL.CLA | Inf |
| ELO_DEN | Inf |
| ELO_ENT.to.OBL_ENT | 0.8042212 |
| SPH | 0.9827511 |
| TAB | 0.9992649 |
| ELO_ARC.TRAC | 0.8353440 |
| prop | |
|---|---|
| Colliguaja | 0.9683218 |
| Mullinum | 0.9607325 |
| Nardophylum | 0.9061429 |
| Lycium | 0.9949441 |
En este nuevo plano se distingue que Nardophylum Lycium y Colliguaja estan caracterizados principalmente con el morfotipo TAB mientras que Millinum tiene los morfotipos ELO_ENT to OBL_ENT y ELO_ARC.TRAC. Nassauvia se carateriza principalmento por tener valores bajos en todos los morfotipos que tienen Festuca y Pappostipa.
PCA solo de muestras de Heces
| prop | |
|---|---|
| BIL_Stypa.type | 0.6821532 |
| ELO_DEN | 0.8960933 |
| RON | 0.9253292 |
| TRA | 0.9332583 |
| STO_MON | 0.9224822 |
| SPH | 0.8610828 |
| ELO_ARC.TRAC | 0.7288005 |
| prop | |
|---|---|
| CMN1 (82) | 0.6932856 |
| S (92) | 0.9685387 |
| S (97) | 0.6699632 |
del plano coordenado PC1-2 se observa que las muestras 81 y 82 tienen una composicion similar, destacandose que son las muestras con los valores mas altos en el morfotipo RON, a su vez tiene registros bajos en las variables SPH y ELO_COL.CLA. Las muestras de la zona salitrosa presentan caracteristicas distintas entre ellas, no teniendo un claro patron en sus composiciones. Cada una de ellas se ubica en diferentes cuadrantes del plano coordenado.
PCA para muestras de Polen
Del plano coordenado se observa que la mayoría de las variables e
individuos tienen una reconstrucción superior al 50%, excepto la muestra
S92. En terminos de composicion de cada una de las muestras se obeserva
que las que pertenecen a la zona Salitrosa tienen como caracteristica
principal tener Nassauvia presente. En cambio para las de la cueva son
variadas sus composiciones. Para la 83 es Nardophyllum y Nothofagus,
para CMN82 Colliguaja y Cerastium mientras que para CMN81 Azorella y
Fabaceae.
| prop | |
|---|---|
| Nardophyllum | 0.8691176 |
| Cerastium | 0.7634199 |
| Fabaceae | 0.8525261 |
| Asteraceae.tipo.Senecio | 0.8703338 |
| Nothofagus | 0.7689203 |
| Azorella | 0.8675511 |
| Nassauvia | 0.8169284 |
| Apiaceae.tipo.Mulinum | 0.8781823 |
| Colliguaja | 0.9151580 |
| prop | |
|---|---|
| CMN81 | 0.9218549 |
| CMN82 | 0.6644742 |
| CMN83 | 0.7583897 |
| S88 | 0.5489419 |
| S97 | 0.6133361 |
| prop | |
|---|---|
| Atriplex.sp. | 0.7074684 |
| Nardophyllum.bryoides | 0.7664282 |
| Colobanthus.lycopodioides | 0.9697524 |
| Cerastium.arvense | 0.9751288 |
| Erodium.cicutarium | 0.9806285 |
| Clinopodium.darwini | 0.8412417 |
| Asteraceae | 0.9751288 |
| Otras.Dicotiledóneas | 0.5886855 |
| Rytidosperma.sp. | 0.9751288 |
| Deschampsia.antarctica | 0.6435269 |
| Distichlis.sp. | 0.9074471 |
| Poa.ligularis | 0.5963529 |
| Festuca.pallescens | 0.9774912 |
| Pappostipa.sp. | 0.6602176 |
| prop | |
|---|---|
| CMN81 | 0.9917589 |
| CMN82 | 0.6085284 |
| CMN83 | 0.7989945 |
| S97 | 0.6036657 |
| prop | |
|---|---|
| Ephedra.sp. | 0.8892528 |
| Atriplex.sp. | 0.6415281 |
| Colliguaja.integerrima | 0.8311243 |
| Colobanthus.lycopodioides | 0.9519950 |
| Cerastium.arvense | 0.8530345 |
| Erodium.cicutarium | 0.8919299 |
| Asteraceae | 0.8530345 |
| Otras.Dicotiledóneas | 0.7461583 |
| Rytidosperma.sp. | 0.8530345 |
| Festuca.pallescens | 0.9408889 |
| Pappostipa.humilis | 0.9161206 |
| prop | |
|---|---|
| CMN81 | 0.9029383 |
| S88 | 0.8858969 |
| S97 | 0.5850119 |