Análises Estatísticas - Trabalho 02 (Ana Paula)
Edneide Ramalho
19/05/2023
1 To-do list
Análise comparativa para resposta do medicamento cinacalcete.
Gostaríamos de saber se alguma dessas variáveis avaliadas na admissão (B, C, D, E,F, G,H, I,J, R,S, T, U, V ,W,X, Y) são preditoras da resposta ao cinacalcete.
Análise de medidas repetidas ao longo do tempo (admissão , terceiro mês, sexto mês e 1ano) para exames laboratoriais
cálcio
fósforo
FA
PTH
Cr
TFG
Gostaria de saber também se o cálcio e o PTH da admissão foram diferentes dos últimos cálcio e PTH (para alguns pacientes o ultimo foi com 3, 6 e a maioria o ultimo foi com 1 ano).
2 Descritiva Geral
Os dados numéricos são apresentados como mediana (intervalo interquartil), e os dados categóricos como número de observações (percentual).
| Characteristic | N = 201 |
|---|---|
| resposta_cinacalcete | |
| Sim | 15 (75.00%) |
| Não | 5 (25.00%) |
| idade | 57 (49, 60) |
| sexo | |
| Feminino | 12 (60.00%) |
| Masculino | 8 (40.00%) |
| drc_conservador | |
| Sim | 6 (30.00%) |
| Não | 14 (70.00%) |
| tempo_de_drc_conservador | 0 (0, 4) |
| tempo_de_dialise | 59 (33, 111) |
| tipo_de_tx | |
| 1 | 14 (70.00%) |
| 2 | 6 (30.00%) |
| tempo_de_tx | 108 (80, 210) |
| calcio | 11.00 (10.50, 11.43) |
| fosforo | 2.50 (2.10, 3.08) |
| fa | 108 (76, 178) |
| vit_d | 34 (28, 46) |
| alb | 4.10 (3.93, 4.28) |
| pth | 224 (198, 422) |
| cr | 1.05 (0.94, 1.53) |
| tfg | 63 (45, 77) |
| tempo_acompanhamento | 12.00 (10.50, 12.00) |
| dose_media_cinacalcete | 30 (30, 35) |
| 1 n (%); Median (IQR) | |
3 Resposta ao cinacalcete
| Characteristic | Sim, N = 151 | Não, N = 51 | p-value2 |
|---|---|---|---|
| idade | 58 (52, 63) | 53 (49, 54) | 0.2 |
| sexo | >0.9 | ||
| Feminino | 9 (60.00%) | 3 (60.00%) | |
| Masculino | 6 (40.00%) | 2 (40.00%) | |
| drc_conservador | 0.6 | ||
| Sim | 4 (26.67%) | 2 (40.00%) | |
| Não | 11 (73.33%) | 3 (60.00%) | |
| tempo_de_drc_conservador | 0 (0, 2) | 0 (0, 5) | 0.7 |
| tempo_de_dialise | 70 (30, 113) | 42 (38, 108) | 0.8 |
| tipo_de_tx | 0.6 | ||
| 1 | 11 (73.33%) | 3 (60.00%) | |
| 2 | 4 (26.67%) | 2 (40.00%) | |
| tempo_de_tx | 108 (84, 209) | 108 (57, 204) | 0.7 |
| calcio | 10.70 (10.50, 11.50) | 11.10 (11.00, 11.40) | 0.5 |
| fosforo | 2.40 (2.10, 3.20) | 2.60 (2.30, 3.00) | >0.9 |
| fa | 109 (76, 178) | 83 (77, 139) | >0.9 |
| vit_d | 34 (28, 40) | 47 (30, 47) | 0.8 |
| alb | 4.05 (3.88, 4.23) | 4.30 (4.20, 4.40) | 0.4 |
| pth | 216 (182, 245) | 494 (404, 529) | 0.067 |
| cr | 1.00 (0.90, 1.40) | 1.40 (1.10, 1.50) | 0.3 |
| tfg | 69 (42, 80) | 62 (48, 63) | 0.7 |
| tempo_acompanhamento | 12.00 (12.00, 12.00) | 12.00 (6.00, 12.00) | 0.5 |
| dose_media_cinacalcete | 30 (30, 33) | 30 (30, 35) | 0.8 |
| 1 Median (IQR); n (%) | |||
| 2 Wilcoxon rank sum test; Fisher’s exact test; Wilcoxon rank sum exact test | |||
Nenhuma das variáveis acima se mostrou significativa para a resposta ao tratamento com cinacalcete. Um dos motivos que podem ter gerado este resultado é o baixo valor de n.
3.1 Modelo multivariável para resposta ao cinacalcete
Usando o threshold de p \(\leq\) 0.20 para selecionar variáveis para um modelo de regressão logística multivariável, apenas idade e pth entram no modelo.
No modelo multivariável de pth combinado com idade tem-se que a cada 1 unidade de aumento no pth equivale a um aumento de 1.01 vezes a chance de ter uma resposta positiva ao cinacalcete com IC 95% de 1.00-1.02 (p = 0.038).
| Characteristic | OR1 | 95% CI1 | p-value |
|---|---|---|---|
| idade | 0.84 | 0.64, 1.01 | 0.11 |
| pth | 1.01 | 1.00, 1.02 | 0.038 |
| 1 OR = Odds Ratio, CI = Confidence Interval | |||
4 Análise de medidas repetidas ao longo do tempo para exames laboratoriais
O cálcio apresentou diferença estatisticamente significativa entre admissão e 1 ano (p = 0.033), e entre admissão e sexto mês (p = 0.00074).
cr, fa e tfg não apresentaram diferença significativa entre os diferentes tempos.
O pth apresentou diferença estatisticamente significativa entre admissão e 1 ano (p = 0.014).
Na tabela abaixo podemos ver todas as estatísticas para os diferentes exames ao longo do tempo.
4.0.1 Comparação dentro dos grupos: respondedor e não respondedor
- Respondedor:
Não respondedor:
5 Cálcio na admissão vs. último cálcio
5.1 Estatística descritiva
5.2 Visualização (Boxplot)
Houve diferença significa entre os valores de cálcio na admissão e a última medida (teste T, p < 0.0001). Os valores de cálcio na admissão foram maiores (10.94 \(\pm\) 0.61) que os últimos valores observados (9.85 \(\pm\) 0.92).
6 PTH na admissão vs. último PTH
6.1 Estatística descritiva
6.2 Visualização
Houve diferença estatisticamente significativa entre os valores de PTH na admissão (224 (IQR: 197.75-421.5)) e o último valor (104 (76.60-334)) (Teste de Wilcoxon (W = 262), p = 0.044).1
Aqui foi utilizado o teste de Wilcoxon ao invés do test T porque os dados de PTH não apresentaram normalidade, daí o uso de um teste não paramétrico. IQR: variação interquartil (primeiro quartil (25%) - terceiro quartil (75%)).↩︎