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SARS-CoV-2 and Host PPI

Drug network with action

提取Omics分析得到的AKI关联基因与SARS2相互作用的部分

Get many other databases’ cross-reference

Genome distribution

Functional enrichment analysis

GOBP enrich

GOBP plot

KEGG enrich

Reactome enrich

Targeted Drug ChEBI enrich

HPO enrich

Curated.MSigDB enrich

Drug Perturbations down

Drug search demo

富集的Reactome通路第一个为Eukaryotic Translation Initiation(eIF)

该通路是真核生物翻译的起始过程中的一个关键步骤。研究表明,COVID-19病毒的复制和繁殖需要利用宿主细胞的翻译机器来合成病毒蛋白质,其中eIF是必不可少的因子之一。具体来说,COVID-19病毒基因组的5’端包含一个称为“冠状病毒帽子结构”的非编码区域(NCR),该结构通过eIF4E和eIF4G结合并招募eIF4A,从而促进翻译机器的组装和病毒基因的翻译。研究表明,COVID-19病毒的NCR区域在结构和功能上与其他冠状病毒不同,这可能解释了为什么COVID-19病毒比其他冠状病毒更具传染性和致病性。

因此,eIF可能成为抗COVID-19药物研发的重要靶点。研究人员已经开始研究利用eIF4A抑制剂来抑制病毒的繁殖,或者使用抗体来阻断eIF4E和eIF4G与NCR的结合,从而阻止病毒蛋白质的合成。

把富集到该生物通路的基因输出到Drugxplore 的Drug-target Network模块, 结果如下:

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提取Omics分析得到的AKI关联基因与SARS2 S protein 相互作用的部分(Only S protein)

Get many other databases’ cross-reference of S

Functional enrichment analysis of S interacted proteins

GOBP enrich

GOBP plot

KEGG enrich

Reactome enrich

Targeted Drug ChEBI enrich

HPO enrich

Curated.MSigDB enrich

Drug Perturbations down