Em um grande quadrado desenhado no chão foi considerado uma “ilha ficticia”. Foram usados alimentos, jogadas aleatoriamente no chão, para serem considerados animais. foram utilizados dois metodos, os transectos que são retangulos demarcados no chão de forma estrategicas para a captação de especies dentro do retangulo e os quadrantes que são pequenos quadrados que foram espalhadas de forma aleatoria. Nesse experimento foram utilizados estes dois metodos do mesmo quadrado para identifcar o que será mais eficaz para a identificação do maior numeros de animais.
## Carregando pacotes exigidos: permute## Carregando pacotes exigidos: lattice## This is vegan 2.6-4## ── Attaching packages ─────────────────────────────────────── tidyverse 1.3.2 ──
## ✔ ggplot2 3.4.0 ✔ purrr 1.0.0
## ✔ tibble 3.1.8 ✔ dplyr 1.0.10
## ✔ tidyr 1.2.1 ✔ stringr 1.5.0
## ✔ readr 2.1.3 ✔ forcats 0.5.2
## ── Conflicts ────────────────────────────────────────── tidyverse_conflicts() ──
## ✖ dplyr::filter() masks stats::filter()
## ✖ dplyr::lag() masks stats::lag()## q1 q2 q3 q4 q5 q6 q7 q8 q9 q10 t1 t2 t3 t4 t5 t6 t7 t8 t9 t10
## arroz_c 0 1 7 6 1 4 4 1 1 5 3 8 5 6 3 0 0 0 0 3
## arroz_e 1 0 0 1 0 0 8 4 0 3 0 1 8 1 1 0 0 0 1 0
## milho 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## ervilha 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
## feijao_preto 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0
## carioca_c 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1
## carioca_e 0 0 0 2 2 0 0 0 0 8 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## mac_paraf 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
## mac_tubo 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## mac_espag 0 0 0 3 1 0 0 0 6 4 16 9 0 0 0 0 2 2 1 0## q1 q2 q3 q4 q5 q6 q7 q8 q9 q10
## arroz_c 0 1 7 6 1 4 4 1 1 5
## arroz_e 1 0 0 1 0 0 8 4 0 3
## milho 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## ervilha 0 0 1 0 0 0 1 0 0 0
## feijao_preto 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## carioca_c 0 0 1 1 0 0 0 0 0 0
## carioca_e 0 0 0 2 2 0 0 0 0 8
## mac_paraf 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## mac_tubo 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## mac_espag 0 0 0 3 1 0 0 0 6 4## t1 t2 t3 t4 t5 t6 t7 t8 t9 t10
## arroz_c 3 8 5 6 3 0 0 0 0 3
## arroz_e 0 1 8 1 1 0 0 0 1 0
## milho 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## ervilha 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0
## feijao_preto 0 0 6 0 0 0 0 0 0 0
## carioca_c 0 0 0 0 0 2 0 0 0 1
## carioca_e 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## mac_paraf 0 0 0 0 0 0 1 0 0 0
## mac_tubo 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
## mac_espag 16 9 0 0 0 0 2 2 1 0Aqui temos os resultados da quantidade de especies e de individuos de cada especie por metodos, quadrantes e transectos. Os transectos identificaram 7 especies e 81 individuos enquanto os quadrantes identificou 6 especies e 77 individuos.
## q1 q2 q3 q4 q5 q6 q7 q8 q9 q10
## 1 1 3 5 3 1 3 2 2 4## t1 t2 t3 t4 t5 t6 t7 t8 t9 t10
## 2 3 4 2 2 1 2 1 2 2## n
## 1 6## n
## 1 7No resultado acimaé só enfatizando o que eu tinha dito antes, transectos identificou 7 especies diferente dos quadrantes que identificou 6 especies.
Foi plotado o grafico (Q) que é o dos quadrantes. Aqui é visto a abudancia das especies do maior ao menor (arroz claro,arroz escuro,macarrão espaguete,carioca escuro,ervilha e carioca claro).No grafico é usado o eixo X as especies e no eixo Y a abudancias delas.
Foi plotado o grafico (T) que é o transectos. Nele é observado a abudancia das especies do maior ao menor ( macarrão espaguet,arroz claro,arroz escuro,feijão preto,carioca claro,ervilha e macarrão parafuso).No grafico é usado o eixo X as especies e no eixo Y a abudancias delas.
Plotados os dois gráficos agora podemos comparar-los. No grafico um são visto duas quedas, entre o primeiro e segundo e entre o quarto e quinto. Isso é notado pois tem especies com muitos individuos e especies com poucos individuos fazendo com que haja uma queda muito grande entre as especies.No grafio 2 já é visto algo diferente pois só a uma queda entre a segunda e terceira especie.A maioria dos individuos retirados nos transectos tem a mesma quantidade.
Para a melhor vizualiação e identificação eu juntei os dois gráficos.
Os graficos a baixo é para ver se as amostras atingiral ou não o
número real de especie?
As amostras dos graficos abaixo não foram muito significativas pois não obtivemos a resposta de um platô, pois o platô é que traz a confiaça do resultado junto com os dados amostrados. É necessario mais amostras para que os dados sejam mais confiantes. Apesar que nenhum dos dois seja confiaveis, pois nenhum chegou a um nível de platô, porém o priemrio gráfico chegu mais perto de um inicio de um platô deixando ele mais confiante.
Esses são as estimativas de riqueza usados para esse projeto
## Species chao chao.se jack1 jack1.se jack2 boot boot.se n
## All 10 12.025 3.089144 12.7 2.056696 13.67778 11.35255 1.588261 10Essa é o resultado das estimativas de riqueza no trabalho dos quadrantes.
## Species chao chao.se jack1 jack1.se jack2 boot boot.se n
## All 10 10.3 0.7035624 11.8 1.272792 9.133333 11.3759 1.480355 10Essa é o resultado das estimativas de riqueza no trabalho dos transectos.
Por final iremos mostrar a diversidade de shannon e simpson para ambos os trabalhos.
índicie de shannon mede o grau de incertezas em prever se as especies pertence a um individuo escolhido ou ao acaso.
## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 1.9508816 1.3345930 0.0000000 0.6931472 0.0000000 0.6931472
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 0.8675632 0.0000000 0.0000000 1.2396594## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 1.7136049 1.0986123 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.6365142
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 0.0000000 0.0000000 0.0000000 1.1708964Comparando a base q e t do índice de shannon podemos notar que tirando o milho, feijão preto, macarrão parafuso e macarrão de tubo, que em ambas os testes deu 0, podemos notas que todas as amostras da base t teve a diversidade de amostra abaixo que na base q.
É o indice de dominancia e reflete a probabilidade de dois individuos escolhidos ao acaso pertencer a mesma espécie
## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 0.8377778 0.6851211 1.0000000 0.5000000 1.0000000 0.5000000
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 0.5000000 1.0000000 1.0000000 0.6836735## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 0.8061224 0.5277778 1.0000000 0.0000000 0.0000000 0.4444444
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 1.0000000 0.0000000 1.0000000 0.6155556Tirando o milho e o macarrão tubo que ambos são 0. Todos as espécies menos o carioca escuro da base q tem uma abudancia maiores que a base t, consequentemente a diversidade é menor.
Por fim irei calcular o númer de Hill que permite calcular a diversidade colocando pesos diferentes de acordo com sua abudancia.
## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 15 10 0 3 1 4
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 3 1 0 9Não considera a frequência das espécies e representa a riqueza observada.
## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 12.539539 6.787992 1.000000 3.000000 1.000000 3.789291
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 2.381102 1.000000 1.000000 6.161171Equivale a transformação do índice de Shannon e atribui pesos as espécies com base na proporção de suas frequências
## arroz_c arroz_e milho ervilha feijao_preto carioca_c
## 11.288591 5.289308 Inf 3.000000 1.000000 3.571429
## carioca_e mac_paraf mac_tubo mac_espag
## 2.000000 1.000000 Inf 4.745098Equivale a tranformação do índice de Simpson e atribui peso as espécies mais comuns