R pill: Instalar paquetes de BioConductor

Bioconductor proporciona herramientas para el análisis y la comprensión de datos genómicos, proteómicos, transcriptómicos, etc. Bioconductor utiliza el lenguaje de programación estadística R, y es de código y desarrollo abiertos.

Visita https://www.bioconductor.org/ y https://www.bioconductor.org/install/ para más información.

Ejemplo: Instalar los paquetes affy y AnnotationDbi para gestionar herramientas para datos de microarrays de Affymetrix. Primero necesitamos tener instalado el paquete BiocManager de CRAN con la función base install.packages() y luego instalamos los paquetes de Bioconductor con la función install() de dicho paquete BiocManager. El condicional if se utiliza para comprobar si ya tenemos un paquete instalado.

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# Install package BiocManager from CRAN to access Bioconductor:
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")

# Install package "affy", "AnnotationDbi"...
if (!requireNamespace(c("affy", "AnnotationDbi"), quietly = TRUE))
  BiocManager::install(c("affy", "AnnotationDbi"))

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